遺伝子発現における性差の再評価
新しい発見が、オスとメスの遺伝子発現と自然選択の関係に疑問を投げかけてる。
― 0 分で読む
生物の中で、遺伝子は体が機能するのに必要なタンパク質を作る役割を担ってるんだ。面白いことに、いくつかの遺伝子はオスとメスで違った働きをするんだよ。この性別による遺伝子の発現の違いは、自然選択の影響を受けることがあって、特定の特徴が片方の性別に有利に働くことがあるんだ。特定の遺伝子が一方に利益をもたらすと、その遺伝子の産物の量はその性別で増え、反対の性別では減るかもしれない。この文章では、そうした違いや、遺伝子の発現の仕方が自然選択にどのように影響するかについて話してるよ。
性差による選択って?
性差による選択ってのは、遺伝子がオスとメスで違った利点や欠点を持っているかもしれないって考え方なんだ。これによって、特定の遺伝子のバージョン(アレル)が集団の中でどれくらい出現するかが変わるかもしれない。遺伝子の効果が性別で違うと、遺伝子の発現にばらつきが生まれて、健康状態や特徴、さらには病気にまで影響を与えることがあるんだ。
例えば、生存に影響を与える特徴はこうした違いの影響を受けるかもしれない。もし特定の遺伝子がオスの生存に役立つけど、メスには同じような利点がないなら、その遺伝子の発現パターンは進化していくよ。そういう変化が、オスとメスで明らかに違った特徴、つまり性的二形性の特徴として現れるんだ。
ツインピークスパターン
研究者たちは「ツインピークス」と呼ばれるパターンに興味を持ったんだ。それは遺伝子の発現の性差と、オスとメスの間の遺伝子アレルの違いを結びつけるものだよ。ツインピークスの考え方は、遺伝子の発現の違い(遺伝子がどれだけ活発か)が性別間のアレルの頻度の違いにつながるってことを示唆しているんだ。つまり、両方の性で遺伝子の発現が似てる時は、オスとメスの間の違いが少ないけど、発現が大きく異なる時にはアレル頻度の違いにピークが出るんだ。
このパターンは、遺伝子発現に働きかける性差による選択の信号だと思われてた。科学者たちは、オスとメスの特徴がどのように遺伝的な要因によって形成されるかを理解するのに使ってたんだ。
ツインピークスの再評価
ツインピークスパターンを詳しく見てみると、その元々の解釈が誤解を招く統計的な結果に基づいていることが明らかになったんだ。元のモデルは、遺伝子の発現が性別で異なる時、アレル頻度の違いも特定のパターンに従うべきだと示唆してた。でも、この仮定は、遺伝子の発現とフィットネスに対する影響の関係が単純で、性別間の選択圧が等しいっていう二つの主な考えに基づいてた。
さらに見てみると、これらの仮定は完全には正しくないことがわかったんだよ。特に、一方の性別で極端な遺伝子発現の違いが見られる場合にはね。例えば、ある遺伝子が一方の性では全く活性化してないとしたら、異なる選択圧が働いていて、アレル頻度に予期しない結果をもたらすかもしれない。
統計テストと結果
ツインピークスパターンをよりよく理解するために、研究者たちは以前の研究を異なる方法やデータソースを使って繰り返したんだ。彼らは、このパターンが本当に性差による選択の真の反映かどうかを試そうとしたんだ。複数のヒト組織からの遺伝子発現データを調べた結果、遺伝子発現の性差と性差による選択から期待される結果との関連性を示す明確な証拠は見つからなかったんだ。
彼らは、結果を混乱させる可能性のあるさまざまな要因をコントロールしながらデータを分析するモデルを作った。統計テストを再実行した結果、遺伝子発現と選択との明確な関係として以前に特定されていたものが、実際には他の変数、例えば遺伝子発現のばらつきに影響された統計的な偶然に過ぎなかったことを発見したんだ。
遺伝子発現のばらつきの役割
この分析で浮かび上がった重要な要因は、性別に関係なく、異なる遺伝子間での遺伝子発現のばらつきだったんだ。発現のばらつきが大きい遺伝子は、実際の性差による選択ではなく、ランダムな要因によってオスとメスの間に大きな違いを生む可能性があるんだ。この発現のばらつきは、遺伝子発現と選択の結果との本物の関係を特定するのを難しくしたんだ。
この発見は、遺伝子発現のばらつきとアレル頻度の関係が性差による選択の誤解を招く解釈を引き起こしているかもしれないことを強調した。だから、いくつかの遺伝子が性別間で発現の違いを示していても、必ずしもそれが選択がオスとメスで異なって働いていることを意味するわけではないんだ。
全体的なリンクに対する証拠
ツインピークスパターンやその遺伝子発現と選択の理解への影響に関する初期の興奮にもかかわらず、最近の研究はその妥当性に疑問を投げかけているんだ。研究者たちは、性差による遺伝子発現と性差による選択の全体的な関係を支持するような、一貫した証拠をさまざまな組織の中で見つけられなかったんだ。これは、個々の遺伝子が異なる発現パターンを示すことがあるけど、それがオスとメスで選択圧が異なって働いていることを確実に示すものではないことを示唆しているよ。
さらに、新しい方法と大規模なデータセットを使った研究も、この証拠の欠如をさらに強調したんだ。より多くの組織を含めて、より洗練された統計的手法を使用して分析を拡張した結果、遺伝子発現と選択との直接的な関係を示唆するような予期される関係は観察されなかったんだ。
可能な説明
遺伝子発現に対する性差による選択の強い証拠がないことを考えると、いくつかの代替説明が出てくるんだ。ある性差のある遺伝子発現が特定の特徴に対する選択を示しているかもしれないけど、多くの遺伝子に関しては、これらの違いは他の調節プロセスの副産物に過ぎないかもしれないってことだ。つまり、それらは選択圧の直接的な指標ではないかもしれない。
もう一つの可能性として、過去の選択圧が遺伝子発現パターンを形成してきたかもしれないけど、これらは現在の条件を反映しているわけではないってこと。つまり、特定の遺伝子が選択の歴史的な痕跡を持っているかもしれないけど、現代のダイナミクスはもっと複雑で、性差と簡単には結びつかないってことだね。
結論
要するに、オスとメスの間の遺伝子発現の違いを探ることは、集団の中で選択が特徴を形成する方法についての貴重な洞察を提供してきたんだ。ただし、最近の発見は、確立されたパターンに疑問を投げかけ、もっと深く理解する必要があることを示唆しているよ。元のツインピークスモデルは興味深いけど、生物学的プロセスの確かな表示よりも、統計的なアーティファクトの反映かもしれないんだ。
研究者たちは今後、遺伝子発現や選択に影響を与えるさまざまな要因を考慮し、解釈がしっかりとした証拠に基づいていることを確実にする必要があるよ。そうすることで、遺伝子、特徴、進化的力の複雑な相互作用についての理解を深めて、自然に見られる特性がどのように形成されるのかを明らかにし続けられるんだ。
タイトル: Does Sex-Differential Gene Expression Drive Sex-Differential Selection in Humans?
概要: Sex differences in human transcriptomes have been argued to drive sex-differential natural selection (SDS). Here, we show that previous evidence supporting this hypothesis has been largely unfounded. We develop a new method to test for a genome-wide relationship between sex differences in expression and selection on expression-influencing alleles (eQTLs). We apply it across 39 human tissues and find no evidence for a general relationship. We offer possible explanations for the lack of evidence, including that it is due in part to eQTL ascertainment bias towards sites under weak selection. We conclude that the drivers of ongoing SDS in humans remain to be identified.
著者: Matthew Jiren Ming, C. Cheng, M. Kirkpatrick, A. Harpak
最終更新: 2024-07-24 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.23.604672
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.23.604672.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。