早発性パーキンソン病の遺伝的洞察
新しい遺伝子検査が早期発症のパーキンソン病の隠れた原因を明らかにした。
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パーキンソン病(PD)は動きに影響を与える一般的な脳の障害だよ。アルツハイマー病の次に多い神経変性疾患で、世界中で約600万人が影響を受けてる。PDの人は、動きが遅くなったり、硬さや震えといった運動症状と、気分や睡眠の変化みたいな非運動症状の両方を経験することがあるんだ。ケースの中の約5~10%は特定の遺伝子変異が原因とされてて、残りは一般的に原因不明って言われてる。
パーキンソン病の遺伝子
早期発症のPDに関連する重要な遺伝子がPRKN遺伝子だよ。この遺伝子の変異は、若い年齢で始まるPDの一形態に関連してることが多い。PRKN遺伝子は6番染色体にあって、「パーキン」と呼ばれるタンパク質をコードする12の部分がある。このタンパク質は、細胞のミトコンドリアを調整して健康を保つ役割を果たしてるんだ。
PRKNの病原性変異は、孤立したPD症例の中で少数を占めて、家族性早期発症PDの症例の中ではより大きな割合を占めてる。これらの症例では、若い年齢でパーキンソニズムの症状が見られ、薬のレボドパに良い反応を示すことが多い。こういうケースでは、運動症状が通常見られるけど、認知機能の低下みたいな非運動症状はあまり見られないことが多い。
遺伝子検査の進展
最近の遺伝子検査の進展、特にロングリードシーケンシング(LRS)のおかげで、従来の方法では見逃されがちな複雑な遺伝子変異を特定できるようになったよ。この技術は、短い繰り返しDNA配列や遺伝子内の構造的変異の検出を改善するんだ。LRSは、標準的なシーケンシングが失敗する場合に遺伝病の遺伝的原因を特定するのに役立つ。
早期発症PDの2人の兄弟を対象にした研究では、LRSがPRKN遺伝子における複雑な構造変異を明らかにしたんだ。彼らは何年も遺伝子検査を受けてたけど、診断がつかずにいたんだ。でもLRSが、彼らの状態に寄与する遺伝的要因を特定するための洞察を提供したんだ。
研究参加者と方法
この研究は、早期発症PDと診断された2人の白人兄弟に焦点を当てたよ。家族の病歴では他にPDのケースは見つからず、30代前半で症状が現れたんだ。レボドパに良い反応を示すなどの症状から、PRKN変異との遺伝的な関連の可能性が示唆されたんだ。
研究者たちは、既存の臨床基準に基づいて兄弟にPDの診断を下した。その後、同意を得てPRKN遺伝子に異常がないか様々な遺伝子検査を行った。複数の技術を使ったけど、初期の結果は明確じゃなかった。
遺伝子調査と発見
最初の検査では、両方の兄弟がPRKN遺伝子のエクソン4のコピーを1つ持ってることがわかったけど、病原性の変異は検出されなかった。でも結果は、エクソン4に削除があるかもしれないことを示唆してた。他のテストでもエクソン4のカバレッジが低いことが分かり、コピー数に問題がある可能性が示された。
遺伝子の変異をさらに理解するために、研究者たちはロングリードシーケンシングを使って、より包括的なデータを提供したんだ。LRSは、PRKN遺伝子のセクションの重要な重複と削除を特定した。具体的には、エクソン3を含む重複と、エクソン3と4の両方をカバーする削除が見られたよ。
ロングリードシーケンシングの結果
LRSのデータは、エクソン3を含む106,727塩基対の重複と、エクソン3と4の両方に影響を与える178,991塩基対の削除を示した。これらの変化が起こったブレイクポイントは、タンパク質をコードしていないゲノムの領域に位置してるから、標準的なシーケンシング方法では見つけるのが難しいんだ。
この発見を確認するために、研究者たちはPCR(ポリメラーゼ連鎖反応)技術を使って、両方の兄弟に構造変異が存在することを確認した。結果は、2つの異なるけど関連する遺伝的変化が両方にあって、彼らの早期発症PDに大きく寄与してることを示したよ。
従来の遺伝子検査の課題
従来のシーケンシング技術は単純な変異を特定できるけど、遺伝子内の複雑な構造変化には効果的じゃないかもしれない。PRKNに関連するPDの多くの人には、標準的な検査方法では特定されない隠れた遺伝的要因があるかもしれない。これは、現在の遺伝子診断の実践におけるギャップを示してるんだ。
複雑な構造変異を検出するのが難しいのは、その性質や短いリードシーケンシングの限界が原因で、より大きな遺伝的変化を十分にカバーできないことが多い。この研究では、LRSを使用することでゲノムのより徹底的な調査が可能になって、兄弟たちの遺伝的状態の理解が深まったんだ。
今後の研究への影響
この研究の発見は、早期発症PDの理解と診断における高度な遺伝子検査方法の重要性を強調してるよ。ロングリードシーケンシングは、従来の技術では見逃されることが多い複雑な遺伝子変化を特定するのに役立ってる。研究者たちがPDの遺伝子をさらに探求し続ける中で、LRSを取り入れることで、より良い洞察が得られ、病気に関連する追加の候補遺伝子を特定する手助けになるかもしれない。
この兄弟のPRKN遺伝子における構造変異の特定は、医学界全体にとって貴重な知識を提供してる。このことは、研究者や臨床医が困難な診断に直面したときに、高度な検査方法を考慮する必要性を強調してるんだ。
結論
パーキンソン病は、さまざまな遺伝的要因を持つ複雑な障害だよ。ある人にとっては、遺伝的な原因を特定するのが難しいことがあって、特に従来の検査で答えが得られない場合にはね。ロングリードシーケンシングの利用は、PDのような病気における遺伝的変異の複雑さを明らかにするための強力なツールとして浮上してきてる。これらの兄弟の研究は、神経障害の診断と治療の理解を深めるために、遺伝子研究を続けていく重要性を示してるんだ。
タイトル: Long-read sequencing unravels the complexity of structural variants in PRKN in two individuals with early-onset Parkinson's disease
概要: BackgroundPRKN biallelic pathogenic variants are the most common cause of autosomal recessive early-onset Parkinsons disease (PD). However, the variants responsible for suspected PRKN-PD individuals are not always identified with standard genetic testing. ObjectivesIdentify the genetic cause in two siblings with a PRKN-PD phenotype using long-read sequencing (LRS). MethodsThe genetic investigation involved standard testing using successively multiple ligation probe amplification (MLPA), Sanger sequencing, targeted sequencing, whole-exome sequencing and LRS. ResultsMLPA and targeted sequencing identified one copy of exon four in PRKN but no other variants were identified. Subsequently, LRS unveiled a large deletion encompassing exon 3 to 4 on one allele and a duplication of exon 3 on the second allele; explaining the siblings phenotype. MLPA could not identify the balanced rearrangement of exon 3. ConclusionsThis study highlights the potential utility of long-read sequencing in the context of unsolved typical PRKN-PD individuals.
著者: Alexis Brice, G. Cogan, K. Daida, K. Billingsley, C. Tesson, S. Forlani, L. Jornea, L. Arnaud, L. Tissier, E. Leguern, A. Singleton, H. Gervais-Bernard, M. Ferrien, S. Lesage
最終更新: 2024-05-03 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.05.02.24306523
ソースPDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.05.02.24306523.full.pdf
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変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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