抗菌薬耐性に対する新たな希望
研究が、薬剤耐性細菌と戦う有望な酵素を明らかにしている。
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抗菌薬耐性は世界中で大きな問題になってる。つまり、いくつかのバイ菌が、それを殺すために使われる薬の効果に耐えられるようになっちゃったんだ。この問題は増えてきてて、主に人間や動物の感染症と戦うための薬が不適切に使われることが原因なんだ。薬が使いすぎたり間違った使い方をされると、環境に残っちゃって、もはやその治療に反応しないバイ菌が発生することに繋がる。
この深刻な問題に対処するために、「ワンヘルス」っていう概念が導入された。人間、動物、環境の健康は全て繋がってるって認識があるんだ。これまでの数年で、バイ菌が一線の薬だけじゃなくて、二線や三線の治療薬にも耐性を持つようになってきた。中には多剤耐性のバイ菌もいて、これがあると利用できる薬での治療が難しくなる。
耐性を持つバイ菌の例には、メチシリン耐性黄色ブドウ球菌やバンコマイシン耐性黄色ブドウ球菌などがある。これらのバイ菌は健康に大きなリスクをもたらし、医療現場での病気や死亡率を高める可能性がある。新しい抗菌治療法の緊急な必要性はまだ満たされていない。
抗菌薬開発への新しいアプローチ
最近、耐性バイ菌と戦うための新しい薬を作る取り組みがたくさん行われてる。これらの新しい治療法は、従来の抗生物質とは異なる方法でバイ菌の異なる部分をターゲットにしてるんだ。例えば、研究者たちはバイ菌の特定の部分に結合して効果を減少させる小さな分子について調べてる。他の戦略にはワクチン、抗体、バイ菌を感染させるウイルスから派生した物質なんかがある。
一部の治療法は体のマイクロバイオームを調整することに焦点を当ててて、他にはバイ菌の有害な特性、例えばバイオフィルムの形成をターゲットにする方法もある。既存の抗生物質の効果を強化する薬を探す取り組みもあるし、別の目的のために作られた薬を新たに使ってバイ菌感染と戦う方法を模索してる研究者もいる。
でも、これらの有望なアプローチにも乗り越えなきゃいけない課題がいっぱいある。特に新しい薬候補を迅速かつ効果的に見つける方法が足りないのが大きな問題。
研究の最近の進展
遺伝子の研究や人工知能、合成生物学の最近の進展が新しい抗菌剤の発見への関心を再燃させてる。研究者たちは隠れた抗菌剤、主にペプチドを探すために高度なアルゴリズムを使ってる。このアルゴリズムは人間のタンパク質や微生物のゲノムを含む大規模なデータセットを分析する。
これらの新しい方法がバイ菌との戦いに与える影響はまだ不確かだけど、バイ菌が耐性を持つ可能性が低い新しい薬剤を見つけることが重要だってのは明らか。
ペプチドグリカンのような細菌成分は、抗生物質の耐性リスクを最小限に抑えるための有望なターゲットとして特定されてる。一つの効果的な例がペプチドグリカンハイドロラーゼ、別名リシンで、バイ菌を感染させるウイルスから得られるもので、最近の研究では特定のバイ菌による感染に対してよく効くことが示されてる。
でも、グラム陰性バイ菌に対して効果的なリシンを見つけるのは難しいことが分かってきた。進展は遅れてるし、ファージの遺伝的構成に関するデータも限られてる。それでも最近の発見では、いくつかのリシンがこれらのバイ菌の外膜に侵入できることが分かって、内部構造をターゲットにする可能性があるんだ。
このため、研究者たちは新しいペプチドグリカンハイドロラーゼを探すためにリシン由来の抗菌ペプチドを使う研究を行ってる。
新しい抗生物質のスクリーニング
この研究で、科学者たちは知られているリシンからの特定の抗菌ペプチドを出発点にして、新しいペプチドグリカンハイドロラーゼを見つけようとした。彼らはバイ菌のタンパク質が入ったデータベースを調べて、いくつかの候補を見つけた。最終的に、二つの有望な酵素を特定した。
これらの新しい酵素は、高温にさらされた後でも驚くほど安定してた。どちらもさまざまなバイ菌に対してラボ試験で効果を示した。この結果は、リシンからのペプチドを使うことで、強い活性と安定性を持つ新しいハイドロラーゼを見つける助けになるって考えられる。
新しい酵素のさらなる分析
候補の酵素を特定した後、研究者たちは彼らの特性をより理解するために追加のテストを行った。彼らは、進化的な関連性や物理的な属性に基づいて特定されたグループごとに一つを選び、合計五つのハイドロラーゼを調べた。
研究者たちはこれらの酵素の配列を化学的に生成し、細菌系で生産できることを確認した。次に、細菌の細胞壁の重要な部分であるペプチドグリカンを分解する酵素の能力をテストした。
五つの酵素全てがそれを行うことができたが、二つは特にその活性が強かった。低濃度でも、ラボ試験で生存可能なバイ菌を大幅に減少させることができて、実用化の可能性を示してる。
新しい酵素のテスト
研究者たちは、二つの最も効果的な酵素がさまざまな条件でどれだけうまく機能するかを調べた。彼らは異なる温度、pH、塩濃度で試験して、どうなるかを見た。
興味深いことに、両方の酵素は過酷な熱にさらされても良好な活性を保ってた。これは多くの既存の抗生物質には見られないことだ。この発見は、これらの酵素が高温が関与する場面、例えばパスチャライゼーションプロセスで実用化できる可能性を示唆してる。
作用機序
これらの新しい酵素がバイ菌をどうやって殺すのかを理解するために、研究者たちはその構造を分析した。彼らは、酵素が二種類のペプチド鎖を含んでいて、一つはバイ菌を分解するのを助け、もう一つはバイ菌の膜を貫通するものだと分かった。
酵素の個々の成分をテストした時、研究者たちはペプチド領域だけが特定のバイ菌に対して効果的だと見つけた。これは、酵素の両方の部分がその全体的な効果に大事な役割を果たすことを示してる。
インビボテスト
新しい酵素が実際の環境でどう機能するかを見るために、研究者たちは耐性バイ菌に感染したマウスでテストを行った。一つのモデルでは、耐性バイ菌に感染したやけどの傷に酵素を適用し、別のモデルでは感染した組織に直接注入した。
どちらのシナリオでも、酵素は対照群と比べて生存可能なバイ菌を大幅に減少させた。これは、新しい酵素が伝統的な抗生物質に耐性のあるバイ菌感染に対する効果的な治療法としての可能性を示唆してる。
影響と今後の方向性
抗菌薬耐性の問題は新しい治療法の緊急の必要性を生み出していて、これらの発見は有望な一歩を示してる。新しいペプチドグリカンハイドロラーゼは耐性バイ菌に対抗するためのツールとして強い可能性を持ってる。
マウスモデルでの酵素の成功は、この研究を患者にとっての効果的な治療に変える道があるかもしれないって示唆してる。これは既存の薬に耐性を示す感染を持つ人に特に有益かもしれない。
将来的には、研究者たちはこれらの酵素をさらに洗練させて、臨床環境での使用を探求するつもりだ。また、既存のデータを使ってバイ菌のタンパク質やその潜在的な脆弱性についての洞察を得ながら、似たようなスクリーニング方法で追加の抗菌剤を発見することも目指してる。
新しい治療法の開発におけるバイ菌ウイルスの役割は大事だ。バイ菌と共進化してきた彼らの遺伝子素材は、抗菌剤の可能性を秘めてる。今後の研究は、これらの遺伝資源を広げることに焦点を当てて、抗菌薬耐性に対抗するための効果的な戦略をさらに発展させるかもしれない。
結論
抗生物質耐性のバイ菌の蔓延は、世界の健康に深刻な挑戦をもたらしてる。しかし、特にファージやその成分から得られる新しい抗菌剤の追求は、治療の希望の道を示してる。これらの新しいペプチドグリカンハイドロラーゼは耐性株に対抗するために大きな期待が寄せられていて、将来的には感染症に対する重要な武器になるかもしれない。抗菌薬耐性の進化する挑戦に対応するために、研究と革新は不可欠だ。
タイトル: Dimer-monomer transition defines a hyper-thermostable peptidoglycan hydrolase mined from bacterial proteome by lysin-derived antimicrobial peptide-primed screening
概要: Phage-derived peptidoglycan hydrolases (i.e., lysins) are considered promising alternatives to conventional antibiotics due to their direct peptidoglycan degradation activity and low risk of resistance development. The discovery of these enzymes is often hampered by the limited availability of phage genomes. Herein, we report a new strategy to mine active peptidoglycan hydrolases from bacterial proteomes by lysin-derived antimicrobial peptide-primed screening. As a proof-of-concept, five peptidoglycan hydrolases from the Acinetobacter baumannii proteome (PHAb7-PHAb11) were identified using PlyF307 lysin-derived peptide as a template. Among them, PHAb10 and PHAb11 showed potent bactericidal activity against multiple pathogens even after treatment at 100{degrees}C for 1 hour, while the other three were thermosensitive. We solved the crystal structures of PHAb8, PHAb10, and PHAb11 and unveiled that hyper-thermostable PHAb10 underwent a unique folding-refolding thermodynamic scheme mediated by a dimer-monomer transition, while thermosensitive PHAb8 formed a monomer. Two mouse models of bacterial infection further demonstrated the safety and efficacy of PHAb10. In conclusion, our antimicrobial peptide-primed strategy provides new clues for the discovery of promising antimicrobial drugs.
著者: Hang Yang, L. Zhang, F. Hu, Z. Zhao, X. Li, M. Zhong, J. He, F. Yao, X. Zhang, Y. Mao, H. Wei
最終更新: 2024-09-17 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.26.591248
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.26.591248.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。
参照リンク
- https://itol.embl.de/
- https://swissmodel.expasy.org/
- https://web.expasy.org/protparam/
- https://protein-sol.manchester.ac.uk/
- https://services.healthtech.dtu.dk/service.php?SignalP-5.0
- https://services.healthtech.dtu.dk/service.php?TMHMM-2.0
- https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.cgi
- https://www.ebi.ac.uk/interpro/search/sequence/
- https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/
- https://phageboost.ku.dk/
- https://www.baamps.it/tools/calculator