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# 生物学# 生物物理学

バイオ分子凝縮体の相転移におけるアルコールの役割

生きている材料における相転移に対するアルコールの影響を探る。

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アルコールがバイオ分子の相アルコールがバイオ分子の相転移に与える影響るかを調査してる。アルコールが生きた物質の行動にどう影響す
目次

生きた材料は人間の手を借りずに自然に形成され、多くの人工材料よりも優れた特性を持っていることが多い。これらの材料は、液体の基本的な構成要素同士の分子間相互作用によって一緒に集まる。いい例が、膜なしの生体分子凝縮体。これは、電気的な力や生物学的または合成システム内の特定の分子間の相互作用など、いろんなタイプの相互作用によって形成される。これらの凝縮体は、生物学的プロセスを制御するのに役立ち、さまざまな生き物に見られる驚くべき材料を作り出すのが重要だ。

これらの材料の振る舞いは、アルコールや塩、温度の変化など、異なる液体の条件が適用されると変わることがある。特に注目すべき変化は、これらの凝縮体が液体状態からより固体状態に移行する時のことで、この移行は液体から固体への相転移(LSPT)と呼ばれる。研究によれば、この移行は神経変性疾患や癌など、いくつかの病気に関与している可能性がある。また、海洋生物が水中で強力な接着剤を作り出すことを可能にすることもある。しかし、これらの液体と凝縮体内の相互作用との正確な関係はよく理解されていない。これを解明することで、病気の治療薬の新しい創出や、さまざまな用途のための合成材料の設計に役立つかもしれない。

相転移を理解するための課題

科学界では、アルコールがこれらの凝縮体の相転移に与える影響についての不一致な発見が課題となっている。例えば、エタノールを加えると特定のタンパク質の凝集を促進することが示されている一方で、他の研究ではエタノールが実際に凝集を防ぎ、一部のタンパク質の毒性を減少させることを示唆している。この不一致は、凝縮体と溶媒の相互作用の理解が限られていることを示しており、より徹底的な調査が強く求められている。

この問題に対処するためには、研究者はこれらの凝縮体の特定の特性を詳しく調べる必要がある。異なる凝縮体は、細胞内で分子を分離し分配するのを助けるユニークな微小環境を持っている。これらの特異性は、化学的な側鎖の種類や、帯電したグループ間の電気的相互作用などの相互作用によって形成される。特に、研究では、これらの相互作用が温度や塩濃度の変化に対して異なる反応を示すことがわかっている。例えば、塩は電気的相互作用の効果を減少させるかもしれないが、高濃度になると他の相互作用を強化することがある。これは、関与する側鎖化学の種類が、凝縮体が外部の変化にどのように反応するかに重要な役割を果たすことを示唆している。

凝縮体における相転移の調査

この研究は、凝縮体の相転移が関与する側鎖の種類や相互作用に依存するかを体系的に調べることを目的としている。コアセボレートの簡略化されたモデルを使用し、実験やシミュレーションを通じて、主に帯電したグループで構成されるコアセボレートがアルコールの存在下で固化することが示されている。一方で、非極性芳香族グループが豊富なコアセボレートは溶ける。研究者たちは、この原則を生体分子凝縮体に拡張し、相転移がアミノ酸の組成に依存することを示そうとしている。

アルコールの相転移への影響

アルコールに晒されると、凝縮体は液体と固体の状態を切り替えることができる。研究者たちは特に、アルコール分子がこれらの転移にどのように影響するかに興味を持っている。詳細な観点から見ると、凝縮体の物理的特性は、それを構成するポリマー間の集合的な相互作用と、それが存在する溶媒に由来する。これらのポリマーの異なる側鎖は、水との相互作用に関する「疎水性」のレベルが異なることがある。

より帯電した側鎖は、凝縮体を親水性にし、疎水的な芳香族グループが多いと水に対してあまりフレンドリーではなくなる。これらの特性とアルコールとの相互作用は、特定の相転移を生むことがある。

たとえば、負に帯電したデキストラン硫酸ナトリウムと正に帯電したジエチルアミノエチル-デキストランからなるコアセボレートは、アルコールが加えられると変化を示す。最初は液体のような滴として現れるこのコアセボレートは、大量のエタノールを加えると固体形態に移行する。逆に、負に帯電したポリ(ナトリウム4-スチレンスルホン酸)と正に帯電したポリ(ジアリルジメチルアンモニウム塩化物)からなるコアセボレートは、アルコールが加えられると固体の塊から液体のような滴に変化する。

系統的な実験と結果

アルコールがさまざまな種類のコアセボレートに与える影響をさらに理解するために、研究者たちはさまざまな実験を行った。ビノーダ曲線は、コアセボレートの一価の塩に対する安定性を決定するのに役立つ。芳香族グループの有無で2つのコアセボレートシステムを比較したところ、芳香族残基の存在がより大きな安定性と異なる物理的形態をもたらすことが分かった。エタノールの試験では、芳香族残基を含むコアセボレートが固体から液体に移行したのに対し、芳香族残基を持たないものはほとんど変化しなかった。

イソプロパノールやメタノールなど他のアルコールでも類似の結果が観察された。これらの発見は、異なる側鎖を持つコアセボレートがアルコールに直面したときに異なる反応を示し、反対の相転移を示すという考えを支持する。

芳香族側鎖の役割

芳香族グループは、これらの材料の物理的特性がどのように振る舞うかを定義するのに重要だ。これを探るために、研究者たちは芳香族グループの有無でポリアニオンを比較した。芳香族グループを持つコアセボレートの安定性は、その追加の相互作用能力に起因し、アルコールの存在下での物理的な振る舞いにも反映される。

アルコールが芳香族残基を含むコアセボレートに導入されると、固体形態は溶ける傾向があり、芳香族グループなしで作られたものは固化することがある。これは、芳香族側鎖がコアセボレートの疎水性に大きな影響を与え、アルコール濃度の変化に対して一貫した振る舞いをもたらすことを強く示唆している。

相互作用の強さと温度の影響

アルコール曝露によるコアセボレートの特性の変化をさらに探るために、研究者たちは重ね合わせ法を採用した。この技術により、コアセボレート内の相互作用が広範な条件下でどのように変動するかをよりよく理解できるようになった。アルコールの存在により、これらのコアセボレートの振る舞いに大きな変化が見られ、芳香族残基を含むものは貯蔵弾性率と損失弾性率が低下し、より液体のような特性に移行することを示している。

対して、芳香族残基を欠くコアセボレートは、アルコールが加えられると弾性率が増加し、固体のような特性に移行することを示唆している。これは、相互作用の強さが関与する側鎖のタイプに密接に関連していることを支持する。

温度もこれらの転移において重要な役割を果たす。温度が上昇すると、コアセボレートの特性が変化し、溶けやすくなるか、液体のように振る舞う傾向が増す。

熱力学的パラメータと駆動力

コアセボレート形成におけるアルコールの影響を詳しく理解するため、研究者たちは熱量測定を行った。コアセボレート成分の複合化中の熱変化を注意深く監視することで、エンタルピー、エントロピー、ギブズ自由エネルギーといった重要な熱力学的パラメータを抽出することができた。

異なるコアセボレートの転移挙動を批判的に評価した結果、芳香族残基を持つものはアルコールの導入によるエンタルピーの変化が少なかったのに対し、非芳香族コアセボレートは顕著な変化を示した。これは、複合化プロセスの背後にある異なる駆動力の違いを浮き彫りにし、コアセボレート内の相互作用がその化学的構成に大きく依存することを示唆している。

相互作用を理解するための分子シミュレーション

分子動力学シミュレーションは、アルコールがコアセボレート内の相互作用に与える影響についてさらに洞察を与えた。異なる帯電したモノマー間の力を調べることで、シミュレーションはエタノールの存在がこれらの相互作用の強さや性質をどのように変えるかを明らかにした。芳香族側鎖を持つコアセボレートでは、特定の相互作用が弱まり、他の相互作用が強まることが観察され、これが相転移につながった。

これらのシミュレーションにおいて、研究者たちはエタノールがコアセボレート内の分子分布を変える可能性があることを発見し、全体的な振る舞いに影響を与えることを示した。これは、これらの材料内に存在する相互作用の複雑さと、環境要因によってどのように調整可能かを強調している。

アミノ酸組成と生体分子凝縮体

研究結果を拡張して、研究者たちは固有の不規則なタンパク質で作られた生体分子凝縮体を調べた。異なるアミノ酸組成を持つ2つの特定のタンパク質を比較することで、エタノールがそれらの振る舞いにどのように影響するかを見ることができた。一つのタンパク質はより親水性で、もう一つは疎水性が高かった。

結果は、これらのタンパク質の凝縮挙動もエタノールの添加で変動し、単純なコアセボレートで見られるのと同様の相転移が起こることを示した。さらなるテストで、これらのタンパク質の特性がアルコールに対する反応を決定する基盤であることがわかり、構造と機能の重要な関係を明らかにした。

結論

生きた材料とアルコールとの相互作用に関する研究は、化学的特性が相転移にどのように影響するかについて貴重な洞察を提供する。側鎖化学や分子相互作用の影響を理解することは、分野の既存の謎を解決するだけでなく、新しい治療薬や合成材料の設計への道を開く。

科学者たちがさまざまな分子間相互作用の相互作用を探求し続ける中で、これらのシステムの研究から得られた知識は、医学から材料科学に至るまでさまざまな応用に役立つだろう。これらの材料の特性が特定の相互作用を通じて動的に調整できることの発見は、複雑な生物学的システムの振る舞いを形作る上で、側鎖化学や環境条件の重要性を強調している。

この研究は、生きた材料に関する知識をより広い科学的探究と結びつけ、化学と機能性の間の微妙なバランスが生きたシステムの運用方法を決定することを明らかにしている。

オリジナルソース

タイトル: Sidechain chemistry-encoded solid/liquid phase transitions of condensates

概要: Nature effectively leverages multivalent interactions among fundamental building blocks in solvents to create remarkable materials for various purposes. One prominent example is the formation of biomolecular condensates through the phase separation of proteins and nucleic acids. In particular, these condensates play crucial roles in regulating cellular functions and constructing natural materials. During the phase separation, solvents not only provide liquid environments for solvating molecules but play crucial roles in affecting the material properties of condensates. However, it remains controversial in the literature that alcohol molecules, as one type of solvents, can solidify some condensates while also melting others, leading to liquid-to-solid phase transition (LSPT) or solid-to-liquid phase transitions (SLPT), respectively. The mechanism underlying the alcohol-induced solid/liquid phase transitions of condensates remains poorly understood. Here, we combine systematic experimental characterizations with molecular dynamics simulations to demonstrate that the phase transitions of condensates depend on their sidechain chemistry and dominant molecular interactions. Specifically, "hydrophilic" condensates, which consist of many charged sidechains, undergo LSPT by adding alcohols due to strengthened electrostatic interactions. In contrast, "hydrophobic" condensates comprised of abundant aromatic sidechains undergo SLPT with the addition of alcohols because of weakened cation-{pi} and {pi}-{pi} interactions. Importantly, these findings are generally applicable for predicting phase transitions of a wide range of condensates formed by synthetic polyelectrolytes and intrinsically disordered proteins based on their sidechain hydrophobicity or amino acid compositions. Our work not only reconciles a conundrum in the literature but provides a fundamental framework for understanding the responsiveness of condensates to environmental stimuli. These insights are instrumental for developing therapeutic drugs to treat pathological aggregates and engineering stimuli-responsive biomaterials from the perspective of sidechain chemistry and molecular interactions.

著者: Ho Cheung Shum, F. Chen, Y. Han, X. Li, W. Guo, C. Wu, J. Xia, X. Zeng

最終更新: 2024-09-19 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.16.613107

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.16.613107.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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