海の炭水化物:その役割と持続性
研究では、炭水化物が海の炭素循環の中でどう動くかを探ってるよ。
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空気中の二酸化炭素は光合成というプロセスを通じて海の炭素サイクルに組み込まれて、炭水化物に変わる。これらの炭水化物はエネルギーを貯めたり藻類の構造を形成するのに役立つ。海のバクテリアはこの炭水化物を分解して、炭素を環境に戻す。分解は通常、バクテリアが特別な酵素を使って炭水化物を小さく切るときに起こる。小さくなった部分は、水中にある輸送タンパク質を通じてバクテリアに入ることができる。このタンパク質は海のさまざまな深さに見られ、藻類の炭水化物が異なるレベルで再利用されていることを示唆している。
多くのバクテリアが炭水化物を分解できるにもかかわらず、これらの糖は往々にして予想以上に海に残っている。これは、なぜそれらがバクテリアによってリサイクルされずに持続するのかという疑問を生じさせる。これに答えるために、科学者たちはこれらの炭水化物の構造を分析するためのより良い手法が必要だ。
最近の炭水化物を分析するための手法の発展により、海に残っているさまざまな構造が明らかになっている。たとえば、研究者たちはラムナリンという炭水化物が特定の藻類の有機炭素の重要な部分を占めていることを発見した。他の炭水化物も藻類のブルームの際に一貫して現れた。これらの炭水化物の中には集まって炭素を固定化するのを助けるものもあり、つまり海の粒子に炭素を貯めるのを助ける可能性がある。進んだ技術を使用して、研究者たちは褐藻類が定期的にフコイダンという炭水化物を水中に放出していることを発見した。海底沈殿物におけるこれらの炭水化物の一貫性は、それらが環境中で長期間安定して存在できることを示唆している。
研究者たちは多糖類に関する貴重な洞察を得ているが、より小さな炭水化物を特に分析するための手法はまだ不足している。この小さな炭水化物はおそらく海の溶解した有機炭素の大部分を占めている。いくつかの手法はより複雑な多糖類を特定しているが、どの小さな炭水化物が長持ちし、炭素を貯める可能性があるのかはまだ不明だ。これらの小さな炭水化物が海洋環境でどのように循環するかを理解することは、藻類農場や植物プランクトンのブルームからの溶解有機炭素に関する洞察を提供するかもしれない。
これらの小さな炭水化物についてもっと知るために、研究者たちは海水からそれらを抽出して分析する方法を開発した。彼らは炭水化物を分離するための特別なフィルタリング手法を使い始めた。これは、海水中のこれらの小さな糖の濃度が非常に低いため、重要だ。この方法を使用して、科学者たちは北大西洋での研究航海中に異なる海の深さからサンプルを集めた。彼らの分析は、水柱全体で無傷の小さな炭水化物を確認し、浅い水域と深い水域のサンプルの両方にそれらが存在することを示した。
サンプリングと方法
研究者たちは、海の上層を表す表面水サンプルと、ニューファンドランドの南とアイルランドの北西の二つの場所からの深水サンプルを採取した。彼らは海水の物理的特性を測定するための特殊な機器を使用した。この情報は、異なる深海のタイプから水を集めたことを示した。
航海中、研究者たちは複数の海水サンプルを収集し、それらを使って炭水化物を抽出した。彼らは分析に適した濃縮形式にするためにこれらのサンプルを処理した。特別な技術を使って、彼らは高解像度質量分析法を使用してこれらの炭水化物を分析した。この方法は、サイズや組成に基づいて異なる分子を特定するのに役立つ。
サンプルの分析から大量のデータが生成され、両方の深さで存在する小さな炭水化物の種類に関する洞察を提供した。異なる深さでの炭水化物の特性を比較することで、研究者たちはこれらの化合物が海洋でどのように振る舞うかを示すパターンを推測できた。
結果
抽出された炭水化物を分析した結果、研究者たちはサイズに基づいて異なる特性を持つ炭水化物のグループを発見した。いくつかの大きな炭水化物は主に表面水域で見られ、小さな炭水化物はすべての採取深度で一貫して検出され、これがそれらが表面水から持続しているか、水柱で生成されていることを示している。
炭水化物の濃度は一般的に表面のサンプルが深海のサンプルと比較して高かった。さらなる分析では、これらの炭水化物を構成する糖の種類を特定した。構成は深さによって異なり、たとえば、特定の糖は深海サンプルでより豊富に見られた。
結果はまた、深海の炭水化物がより複雑な糖を含んでいることを強調しており、これらのより耐久性のある炭水化物は環境に長く留まる傾向があることを示唆している。これは、特定の糖が分解に時間がかかるため、海に持続する可能性があることを示している。
サイズ分布と特性
この研究で特定された炭水化物は、そのサイズと濃度に基づいて四つのグループに分けられた。結果は、主に表面水で見つかる大きな炭水化物と、表面と深いサンプルの両方に現れる小さな炭水化物との明確な区別を示唆していた。
最初のグループには、浅い水域に豊富に存在する大きな炭水化物が含まれていたが、深いサンプルではほとんど検出されなかった。第二のグループには、すべてのサンプルで一貫して見られた小さな炭水化物が含まれていた。小さなグループはおそらく、より複雑で多様な糖の範囲を示している。
特に、表面と深いサンプルの間で炭水化物の構成が大きく異なることが見出された。特に、より複雑な糖を含む炭水化物が深海のサンプルでより目立った。これは、より複雑な糖は通常バクテリアによって分解が難しいため、環境に長く留まることが多いことを示している。
単糖の構成
オリゴ糖を特徴付けた後、研究者たちはこれらの炭水化物を構成する単糖を分析した。このステップは、海のサンプルに存在する糖の種類がより明確にわかるため、重要だった。分析の結果、いくつかの一般的な糖が存在する一方で、その比率は深さや場所によって異なることが明らかになった。
表面サンプルは通常、特定の糖の濃度が高かったが、深いサンプルでは異なる構成を示し、特定の糖がより普及していた。たとえば、フコースという糖は深海サンプルで一貫して豊富に見られた。この発見は、いくつかの糖が他の糖よりも環境に長く留まることを示し、特定のタイプの保存が選択的であることを示唆している。
議論
この研究の結果は、海洋環境における炭水化物の動態の理解に大きく寄与する。小さな炭水化物を抽出して分析するために開発された手法は、この分野でさらに研究する可能性を示している。
オリゴ糖が海でどのように振る舞うかを理解することは、いくつかの理由から重要だ。これらの小さな炭水化物は炭素サイクルにおいて重要な役割を果たしており、深海環境におけるその持続は全球的な炭素貯蔵に影響を与える可能性がある。
研究の結果はまた、異なる海域でのこれらの発見の範囲を探るためのさらなる研究が必要であることを強調している。より良いサンプリング技術を開発し、海水サンプルの処理を改善して汚染を避けることで、将来の研究は海洋炭水化物の構成と振る舞いに関するさらなる洞察を提供できるだろう。
結論として、この研究は海に大きなオリゴ糖と小さなオリゴ糖が存在し、さまざまな深さで異なるパターンが観察されることを示した。この研究から得た知見は、科学者たちが海におけるこれらの炭水化物の役割や炭素サイクルへの影響をさらに探るのを助ける。開発された手法は、海洋環境における特定の炭水化物を追跡することに関心のある研究者にとっての道筋を提供し、これらの化合物が全球的な炭素動態にどのように影響を与えるかをより深く理解する手助けとなる。
タイトル: Selective preservation of fucose-rich oligosaccharides in the North Atlantic Ocean
概要: The ocean has a substantial capacity to store carbon dioxide fixed via photosynthesis in dissolved organic molecules. An estimated 20% of the 660 Gt dissolved organic carbon in the ocean pool consists of structurally uncharacterized oligosaccharides, which appear to resist microbial degradation (Aluwihare et al., 1997). Current technologies lack the sensitivity and molecular resolution to identify these oligosaccharides. Here, we adapted graphitized carbon chromatography to extract and separate marine oligosaccharides for liquid chromatography high resolution mass spectrometry analysis. Using a newly-developed de novo annotation tool, we found 110 oligosaccharide structures in surface and deep ocean seawater at two distant locations in the North Atlantic Ocean. One group of the detected oligosaccharides was found only in surface seawater and consisted of larger and more abundant molecules detected by our analysis. A second group of smaller, less abundant oligosaccharides was detected in both the surface and deep ocean seawater of both sampled locations. The composition of oligosaccharides differed between the surface and deep ocean, with deep ocean samples relatively enriched in hard-to-metabolize deoxy-sugars, and xylose, amino sugars and uronic acids compared to simple hexoses. Notably the deoxy-sugar fucose constituted 35-40% of the monomers in deep-sea oligosaccharides, twice the percentage in surface ocean oligosaccharides. The ubiquity of deep ocean oligosaccharides indicates that they represent a preserved fraction of the carbohydrate pool. Their enrichment in specific monosaccharides suggests selective preservation of fucose-rich oligosaccharides in the deep ocean.
著者: Jan-Hendrik Hehemann, M. Bligh, H. Buck-Wiese, A. Sichert, S. K. Bercovici, I. Hellige, H. Marchant, M. Iversen, U. Sauer, T. Dittmar, C. Arnosti, M. Liebeke
最終更新: 2024-09-24 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.20.613644
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.20.613644.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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