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アフリカイチジクハエの適応

この記事では、アフリカイチジクハエが新しい環境にどのように適応し広がるかを調べているよ。

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アフリカイチジクハエの侵入アフリカイチジクハエの侵入調査indianusの遺伝的適応を調べる。新しい生息地におけるZaprionus
目次

気候や国際貿易の変化に伴い、いろんな生物が新しい地域に移動して、異なる環境に適応してる。こういう動きは、病気の拡散を抑えたり、作物の安全を確保したり、地球上の様々な生物を守るために重要なんだ。多くの生物が今まで行ったことのない場所に広がっていて、これまで以上の速さで進んでる。一部の生物は新しい場所で生き残るために遺伝子を調整できるけど、逆に有害な種がさらに広がることもある。

最近、さまざまな生物が新しい環境に適応する方法を理解するための研究がたくさん行われている。微生物から大きい生物まで、いろんな研究がある。侵入が続く中で、科学者たちはこれらの適応がリアルタイムで起こるのを観察するチャンスを得ている。ゲノミクス、つまり生物の全遺伝情報を研究することが、多くの侵入種の歴史を追跡するのに大きな役割を果たしていて、侵入後に遺伝的変化が速やかに起こることが多いことが分かっている。

この文脈で興味深い生物はアフリカイチジクハエトリ、学名でいうとZaprionus indianus。この種はアフリカから来たけど、1970年にインドで初めて見つかった。すぐにいろんな環境に適応して、特にアメリカ大陸全体に広がった。1999年にブラジルで初めて発見されて、イチジクやベリーの作物に被害を与え、今ではアメリカの多くの地域にもいる。

Zaprionus indianusの侵入と適応

アフリカイチジクハエトリは、種が新しい地域に侵入し、遺伝的に適応する方法を研究するためのいい機会を提供している。この種は、広く拡散するのを助けた興味深い特徴を持っている。たとえば、最大80種類の食料源を食べられる能力があり、世代交代も早く、約13日で繁殖できる。この特徴が、世界中での速い拡散を促進したと考えられている。ブラジルに定着した後は、メキシコや中央アメリカ、そしてフロリダへと移動した。

広がるのに成功している一方で、アフリカイチジクハエトリは寒い環境では課題に直面している。この種のオスは15℃以下では繁殖しないから、寒冷地での生存能力が制限される。たとえば、バージニアではZ. indianusの個体数が季節によって大きく変化する。晩夏から秋にかけては多く見られるが、冬の到来と共に個体数が消えてしまう。これは、毎年暖かい場所から再植民地化する必要があることを示している。

Zaprionus indianusの遺伝子研究

Z. indianusの遺伝子についての研究はあるけど、まだ分からないことも多い。研究によると、北アメリカのZ. indianusはアフリカの個体とは遺伝子的に異なり、アメリカ大陸に定着してから遺伝的多様性が減少していることが分かった。興味深いことに、侵入集団でも、侵入しない他の類似種に比べて多様性が高いことがある。

研究者たちは、Z. indianusの遺伝子が新しい環境で広がるだけでなく、生き残るためにどのように機能するのかを理解することに興味を持っている。そのために、科学者たちはZ. indianusの高品質なゲノムアセンブリを作成し、将来の研究のリソースにするために取り組んでいる。

個体群の研究

Z. indianusの遺伝子をよりよく理解するために、研究者たちは数年間にわたってバージニア州とフロリダ州の異なる果樹園からハエを集めた。彼らは、これらの個体群間の遺伝的構造にパターンがあるかどうかを確認したかった。具体的には、ある年に集めた個体群とその後の年に集めた個体群、さらに異なる場所の間での変異を探った。

研究の結果、北アメリカの異なる地点でのZ. indianusの遺伝的構成にはほとんど違いがないことが分かった。バージニアのハエはフロリダのハエと比較して高い遺伝的構造を示さず、多くのハエがいるか、個体群間での移動が続いていて、遺伝的均一性に寄与しているかもしれない。

研究者たちはまた、遺伝的構造の季節的変化の可能性も調べた。驚くべきことに、異なる年がバージニアの個体群にユニークな遺伝的構成を生み出す証拠はほとんど見つからなかった。これは、毎年の発端となる集団が似ている可能性が高いことを示唆している。

構造変異の証拠

この研究の一環として、科学者たちはZ. indianusのゲノム内の構造変異の可能性に興味を持っていた。構造変異は大きなDNAセグメントに影響を及ぼす変化で、生物がどのように行動し、環境に適応するかに大きな影響を与える可能性がある。Z. indianusの遺伝的構成を調べることで、環境に応じた適応や生存の違いに寄与するかもしれない大きな再配置の証拠がいくつかの染色体で発見された。

興味深いことに、いくつかの染色体には連鎖不均衡(LD)と呼ばれる大きなブロックが確認され、逆位や構造変化が存在する可能性がある。この発見は重要で、こういった変化が生物が新しい環境に適応するために重要な役割を果たすことができるからだ。

人口動態と個体数

Z. indianusの個体群の人口動態を理解することは、この種がどのように適応し拡散しているかをつかむために不可欠だ。研究によると、北アメリカの侵入集団は少数の個体から始まった可能性があり、遺伝的ボトルネックを引き起こしている。こういったボトルネックは、通常、個体群の多様性を減少させる。

北アメリカでのZ. indianusの個体数は、時間とともに変動している。最初の導入では小さな発端となる集団が関与していたかもしれず、遺伝的制限をもたらす可能性がある。しかし、証拠はこれらの集団が回復できることを示しており、特にソース集団からの遺伝子流動がある場合にはそうなる。

研究者たちは、北アメリカの遺伝的データを調べて、アフリカに対する効果的な個体数を推定しようとしている。その結果、北アメリカの個体群はボトルネックを経験しているかもしれないが、出所の範囲からの新たな導入があるため、ある程度の遺伝的多様性を保っていることが分かった。

選択の兆候

自然選択の兆候もZ. indianusの個体群に見られ、特にバージニアの温帯環境とフロリダの亜熱帯地域のハエとを比較したときに顕著だった。ゲノムのいくつかの領域で遺伝的分化が高まり、特定の特徴が地元の条件に適応するために進化している可能性がある。

研究者たちは、特定の遺伝子領域の選択的スイープの兆候を分析し、特定の遺伝子変異が特定の環境で好まれていることを示すパターンを特定した。この分析では、新しい食事や環境条件に適応するのに関連する可能性のあるいくつかの遺伝子が特定された。

興味深いことに、これらの候補領域は北アメリカの個体群で低い遺伝的多様性を示しているが、アフリカの個体群では多様性が高いことが分かり、これらの遺伝子は温帯環境では有利である一方で、元の形では存在しなかった可能性がある。

結論

Z. indianusに関する ongoingな研究は、侵入種が新しい環境に適応する複雑さを示している。アフリカイチジクハエトリは、侵入生物学、遺伝学、適応プロセスを研究するためのモデルとして機能している。

主要な発見として、遺伝的多様性、構造変異、人口動態の歴史の重要性が際立っており、侵入種の成功を形作る要因として重要だ。これらの要因を理解することは、害虫管理だけでなく、より広範な生態学や進化に関する研究にも必要不可欠だ。

Z. indianusがさらにその範囲を広げ続ける中で、その遺伝的ダイナミクスをより明確にするために ongoingな研究が必要だ。より包括的で多様なサンプリング戦略を用いることで、研究者たちはZ. indianusやその他の侵入生物の進化過程についてより深い洞察を提供できることを期待している。

オリジナルソース

タイトル: Limited population structure but signals of recent selection in introduced African Fig Fly (Zaprionus indianus) in North America

概要: Invasive species have devastating consequences for human health, food security, and the environment. Many invasive species adapt to new ecological niches following invasion, but little is known about the early steps of adaptation. Here we examine population genomics of a recently introduced drosophilid in North America, the African Fig Fly, Zaprionus indianus. This species is likely intolerant of subfreezing temperatures and recolonizes temperate environments yearly. We generated a new chromosome-level genome assembly for Z. indianus. Using resequencing of over 200 North American individuals collected over four years in temperate Virginia, plus a single collection from subtropical Florida, we tested for signatures of recolonization, population structure, and adaptation within invasive populations. We show founding populations are sometimes small and contain close genetic relatives, yet temporal population structure and differentiation of populations is mostly absent across recurrent recolonization events. Although we find limited signals of genome-wide spatial or temporal population structure, we identify haplotypes on the X chromosome that are repeatedly differentiated between Virginia and Florida populations. These haplotypes show signatures of natural selection and are not found in African populations. We also find evidence for several large structural polymorphisms segregating within North America populations and show X chromosome evolution in invasive populations is strikingly different from the autosomes. These results show that despite limited population structure, populations may rapidly evolve genetic differences early in an invasion. Further uncovering how these genomic regions influence invasive potential and success in new environments will advance our understanding of how organisms evolve in changing environments. Article SummaryInvasive species (organisms that have been moved outside their natural range by human activities) can cause problems for both humans and the environment. We studied the genomes of over 200 individuals of a newly invasive fruit fly in North America, the African Fig Fly. We found genetic evidence that these recently introduced flies may be evolving in their new environments, which could make them stronger competitors and more likely to become pests.

著者: Priscilla A. Erickson, A. Bangerter, A. Gunter, N. T. Polizos, A. O. Bergland

最終更新: 2024-09-24 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.20.614190

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.20.614190.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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