Mpoxの発生が増えてる理由を理解する
世界中でMpoxの症例が急増していて、ナイジェリアでの遺伝子変化と広がりを追跡してるよ。
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Mpoxはmpoxウイルスが原因の病気だよ。このウイルスはOrthopoxvirusってグループに属してる。主に二つのタイプがあって、一つは中央アフリカの動物に多く見られ、もう一つは西アフリカの動物にいるんだ。
初期のケース
mpoxの最初の人間のケースは1970年にコンゴ民主共和国で確認された。その後、長い間あまりケースは報告されなかったし、感染者は少なかった。アウトブレイクは小規模で、ウイルスが人から人へ広がることはほとんどなかった。ほとんどのケースはアフリカの田舎に住む子供たちに見られたよ。
でも2017年9月にナイジェリアが約40年ぶりのmpoxのアウトブレイクを報告したんだ。この時のアウトブレイクは以前とは違って、30~40歳の大人が多く感染してて、彼らは都市部に住んでた。これは主に村の子供たちに影響を与えてた以前のケースとは変化があったんだ。
世界的なアウトブレイク
2022年5月、特定のウイルス株、Clade IIb B.1が世界中に急速に広がり、mpoxのグローバルアウトブレイクを引き起こした。この新しい株は人から人へ簡単に広がるようだった。科学者たちがこの新しい株と以前の株を比較したところ、多くの違いがあることがわかった。これらの違いは、ウイルスが急速に変化していることを示していて、たぶん人間の体がウイルスと戦おうとしているせいだね。
研究者たちはこの2022年のアウトブレイクが単なる偶然の出来事ではなく、長期間にわたって人々の間でウイルスが広がっていた結果だと考えた。彼らは、ウイルスが2016年ごろにナイジェリアで人間の間を循環し始め、静かに広がって進化していたと見込んでいるよ。
ゾーノティック起源
ウイルスは人間に見られる一方で、元々動物から来たと考えられている。でも、研究者たちはこのウイルスの正確な動物の特定はまだできていないんだ。人間のウイルスと古い動物からのサンプルとの間には密接な関係がある証拠は見つかっているけど、ウイルスが人間に到達する経路はまだ不明なんだ。
ナイジェリアのアウトブレイクの時、研究者たちはmpoxのケースから202のゲノムサンプルを集めた。これらのほとんどは、病気が最初に現れたナイジェリアの南部地域から取られた。研究者たちはウイルスがどのように広がり、進化したのかを理解することを目指していたよ。
遺伝的変化
研究者たちはウイルスの遺伝的変化の多くが、人間の体の中のAPOBEC3というプロセスに関連していることを発見した。このプロセスはウイルスに対抗するのを助けるけど、同時にウイルスのDNAを変えることもできる。彼らはこのメカニズムによって引き起こされたウイルスの遺伝情報における多数の変異を観察したんだ。
分析の結果、ウイルスの変異の約74%がAPOBEC3の影響を受けているようだった。一方、動物で見つかったウイルス系統の変異のうち、このパターンを示したのはごく少数だった。これから、ウイルスが長期間にわたって主に人間の間で広がり、この環境に適応してきたことが示唆されているよ。
拡散のパターン
ナイジェリアでは、mpoxのケースが特定の地域に集中しているようだった。科学者たちは、南部の州が病気の最初の発生源だったことを発見した。特にリバーズ州はウイルスが近隣地域に広がるハブとして重要だった。別の州でアウトブレイクが起こると、研究者たちはウイルスが既に感染者がいた地域に再導入されるパターンを確認したんだ。
研究者たちは、ウイルスが長距離を移動できることを見つけた。最初のケースが報告される前に、すでに何州にも広がっていたんだ。多くの州では正式にアウトブレイクが宣言される前に地元のケースがあったよ。
ウイルスの持続性
研究者たちは、ウイルスが単に偶然に発生しているわけではなく、様々な地域で継続的な感染チェーンを確立していることも指摘した。ウイルスは、ケースが報告されていなくても、何年もいくつかの地域に留まっているようだった。これは、ウイルスが静かに循環していることを示唆していて、診断されていない人たちの中に存在していた可能性があるよ。
いくつかの地域では、感染チェーンが強く続いていた。研究者たちは、ウイルスがリバーズ州で最初の公的な報告が行われる2年以上前から循環していたことを見つけたんだ。
社会経済的要因
ウイルスの拡散にはいくつかの要因が関与してた。人々の移動、都市化、特定の地域の人口密度が大きな役割を果たしていたよ。研究者たちは、行動、人口統計、地域のつながりの組み合わせがウイルスの継続的な感染を助長している可能性が高いと指摘した。
加えて、アウトブレイクに対する健康システムの対応は均一ではなかった。リソースや対応努力が他の地域より優れたところもあったから、ウイルスがよりつながりのある地域から他の地域に広がるのが容易になっていたんだ。
公衆衛生への影響
これらの発見を踏まえて、公衆衛生当局は特に南ナイジェリアに焦点を当ててウイルスを効果的に制御する必要がある。継続的な感染とさらなるアウトブレイクの可能性があるから、監視を強化することが必要だよ。
研究者たちは、診断、ワクチン、治療のためのリソースの重要性を強調した。これらのリソースへのアクセスは、特にアフリカの国々で不平等だった。適切なサポートがなければ、さらなる拡散やアウトブレイクが起こり、病気や合併症が増える可能性がある。
監視の必要性
この研究は、ウイルスの拡散についての理解には限界があることを強調した。かなりの情報が集まったけど、サンプル収集は必ずしも包括的または代表的ではなかった。影響を受けた地域で健康システムと監視方法を改善して、ウイルスの拡散のより明確な状況を把握する必要があるよ。
公衆衛生介入は、ウイルスが活発な地域をターゲットに調整されるべきだ。早期の発見と対応が、大規模なアウトブレイクを防ぎ、病気を効果的に制御するのに役立つよ。
結論
mpoxは人間の間で進化して広がることを示している。ウイルスの旅とそれが異なる人口にどのように影響を与えるかを理解することは、その将来の影響を管理するために重要だね。継続的な研究、より良い健康リソース、強力な公衆衛生の対応が、この継続する挑戦に立ち向かうためには必要なんだ。
コミュニティの健康に焦点をあて、重要なリソースへのアクセスを改善することで、ナイジェリアやそれ以外の地域でmpoxを制御できる希望があるよ。
タイトル: Genomic epidemiology uncovers the timing and origin of the emergence of mpox in humans
概要: Five years before the 2022-2023 global mpox outbreak Nigeria reported its first cases in nearly 40 years, with the ongoing epidemic since driven by sustained human-to-human transmission. However, limited genomic data has left questions about the timing and origin of the mpox virus (MPXV) emergence. Here we generated 112 MPXV genomes from Nigeria from 2021-2023. We identify the closest zoonotic outgroup to the human epidemic in southern Nigeria, and estimate that the lineage transmitting from human-to-human emerged around July 2014, circulating cryptically until detected in September 2017. The epidemic originated in Southern Nigeria, particularly Rivers State, which also acted as a persistent and dominant source of viral dissemination to other states. We show that APOBEC3 activity increased MPXVs evolutionary rate twenty-fold during human-to-human transmission. We also show how Delphy, a tool for near-real-time Bayesian phylogenetics, can aid rapid outbreak analytics. Our study sheds light on MPXVs establishment in West Africa before the 2022-2023 global outbreak and highlights the need for improved pathogen surveillance and response.
著者: Edyth Parker, I. Omah, P. Varilly, A. Magee, A. O. Ayinla, A. E. Sijuwola, M. I. Ahmed, O. O. Ope-Ewe, O. A. Ogunsanya, A. Olono, P. Eromon, C. H. Tomkins-Tinch, J. R. Otieno, O. Akanbi, A. Egwuenu, O. Ehiakhamen, C. Chukwu, K. Suleiman, A. Akinpelu, A. Ahmad, K. I. Imam, R. Ojedele, V. Oripenaye, K. Ikeata, S. Adelakun, B. Olajumoke, L. L. M. Essengue, D. D. Djuicy, M. H. M. Yifomnjou, M. Zeller, K. Gangavarapu, A. O'Toole, D. Park, G. Mbowa, S. Kiffle Tessema, Y. K. Tebeje, O. Folarin, A. Happi, P. Lemey, M. A. Suchard, K. G. Andersen, P. Sabeti, Rambau
最終更新: 2024-06-19 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.06.18.24309104
ソースPDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.06.18.24309104.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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