アメリカシロヒゲネズミで新しいウイルスが見つかったよ：ブラリナ・ブレビカウダウイルス

研究者たちは、他の知られているウイルスと関連のある新しいウイルス群「パラヘニパウイルス」を特定したんだ。このウイルスたちは、パラミクソウイルス科のウイルスと共通の特定の遺伝子を持ってる。パラヘニパウイルスのユニークな特徴の一つに、ORF Xという特別な遺伝子があって、これがウイルスが細胞膜を越えて移動するのを助けるたんぱく質を作ってるみたいだ。他のウイルスには見られない特性だよ。

パラヘニパウイルスは主に、ハリネズミやげっ歯類といった動物から発見されてるんだ。これらのウイルスの中には人間の病気に関連しているものもあるよ。たとえば、中国で病気の患者から発見されたウイルス「ランギア」は、ハリネズミが原因だと思われてる。もう一つのウイルス「モジアン」は、ネズミから見つかって、何人かの患者が重症化した地域でも発見されたんだ。すべてのパラヘニパウイルスが人間の病気に結びついているわけじゃないけど、これらの動物と人間の密接な接触が健康リスクを引き起こす可能性があるから気を付けなきゃね。

パラヘニパウイルスにはまだまだわからないことが多いんだ。今のところ、科学者たちは12種類の異なる種を特定してて、分類されてないものもある。しかし、彼らの関係や種類に関する理解には多くのギャップがあって、まだ発見されてないウイルスがたくさんいる可能性を示唆してる。これに対処するために、科学者たちは公共データを調査してもっとウイルスを見つけようとしてる。新しい発見はウイルス関連の病気に対する制御努力に役立つかもしれないね。

#ブラリナ・ブレヴィカウダウイルスの発見

この研究では、科学者たちが以前に収集した公的データの中からパラヘニパウイルスを探して、北部短尾ハリネズミから新しいウイルスを見つけたんだ。この新しく発見されたウイルスは「ブラリナ・ブレヴィカウダウイルス（BbV）」と名付けられた。この調査ではウイルスの遺伝情報を分析して、ウイルスがこの科のウイルスに典型的な遺伝構造を持っていることがわかった。

BbVに関連する遺伝データのほとんどはハリネズミの腎臓サンプルから見つかって、ウイルスが腎臓に住み着くのが好きだということを示唆してる。研究者たちは、BbVが国際ウイルス分類委員会が新しい種として分類するために設けた要件に合致していると信じている。

#研究方法

BbVを特定するために、研究チームは公的データベースからRNA配列データをダウンロードした。特定のツールを使ってデータを処理して、遺伝情報をフィルタリングして組み立てた。その後、既存の遺伝データと比較して、正しい情報を見ているか確認したんだ。

見つけた遺伝配列が実際にBbVのものであるか確認するために、データを再分析した。特に、信頼できるデータが十分にある部分に焦点を当てて、最終的に完全な遺伝配列を確認して、公的データベースに保存した。

#BbVゲノムの注釈

BbVを特定した後、次のステップはそのゲノムを分析することだった。ゲノムにはいくつかの遺伝子が含まれていて、チームは十分に長い配列を抽出して、既知のウイルス配列と比較してBbVがどんな遺伝子を持っているかを調べた。さらに、ウイルスの遺伝情報の開始と終了を示す特定の信号も探した。

BbVがどのように機能するか理解するために、彼らは独自の遺伝子ORF Xを調べていて、細胞膜を越えられるたんぱく質を作ると予測した。特定のツールを使ってこれらの膜の領域を見つけて、BbVが他のパラヘニパウイルスといくつかの類似した特性を共有していることをわかった。

#系統解析

BbVが関連するウイルスの中でどの位置にあるのかを理解するために、研究者たちは系統解析を行った。BbVの配列を他の知られているウイルスと比較して、関係を示す樹形図を作った。BbVは小さな哺乳類から来る別のウイルス「ニノレックスウイルス」と密接に関連していることがわかった。

#アミノ酸配列の比較

研究者たちはBbVとニノレックスウイルスのたんぱく質配列を詳しく比較した。彼らはたんぱく質の類似性を測定して、ウイルスの分類に重要な6つの主要なたんぱく質に特に焦点を当てた。これらのたんぱく質の平均的な類似性は、同じ種として分類されるためのしきい値を下回っていた。

#BbVリードのマッピング分析

BbVについてもっと知るために、研究者たちはマッピング分析を行った。306のデータベースを見て、さまざまな動物からのRNA-seqデータを分析した。特にBbV関連の配列が他のサンプルに存在するか見たんだ。

チームはこれらのデータセットのいくつかでBbVのリードを見つけて、主に腎臓のサンプルから確認できた。これでウイルスがこれらの組織に広がっていることが証明された。他の組織からのリードは非常に少なかったので、BbVは北部短尾ハリネズミの腎臓に集中している可能性が高い。

#結論

この研究は北部短尾ハリネズミから新しいウイルスBbVを特定することに成功した。これにより、パラヘニパウイルスの多様性についての知識が広がった。BbVの特性についてはまだギャップがあるけど、北部短尾ハリネズミが主な宿主であることを強く示唆している。今後さらなる研究が必要で、このウイルスが人間の健康にどのように影響するかをもっと学ぶ必要があるね。

データが増えるにつれて、科学者たちはパラヘニパウイルスの全範囲を解明できることを期待している。この研究は、ウイルス性疾患の理解や動物集団間の広がりを理解する新しい道を開いている。野生動物のウイルスと人間の健康リスクとの関連性は、こうした調査を続ける重要性を強調してるよ。