ストレスへの細胞応答:翻訳の役割
細胞が翻訳を通じてストレスを管理する方法とG3BPの重要性を探る。
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目次
細胞が化学物質や高温、感染といったストレスに直面すると、特別な対処法を持っているんだ。その一つが「統合的ストレス応答(ISR)」と呼ばれるもので、全体的なタンパク質生産を減らしながらも、細胞が生き残るために必要な重要なタンパク質を作るんだ。
ストレス応答における翻訳の役割
翻訳っていうのは、細胞が遺伝子の指示を使ってタンパク質を作り出すプロセスのこと。ストレスがかかると、細胞はこの指示を翻訳する方法を変えられるんだ。翻訳プロセスで重要なのがeIF2αっていう因子。これが修飾されると、タンパク質の生産が減るんだけど、ストレス時にはいくつかのタンパク質の作成指示はまだ活発に翻訳されたりする。このことから、ほとんどのタンパク質生産が遅くなる中で、重要なタンパク質が優先されることが分かるね。
細胞がストレスに適応すると、小さな構造物、ストレス顆粒(SGs)を形成する。これらは特定の種類のタンパク質やRNAを集めるもので、ストレスに対する細胞の反応を管理するのに重要なんだ。
ストレス顆粒って何?
ストレス顆粒は、細胞がストレスを受けているときに形成されるタンパク質とRNAの集まり。膜がないから、細胞が特定の成分を保持する場所となる。ストレス顆粒にはRNAに結合するタンパク質が含まれていて、細胞がストレスに適応するのに役立つんだ。
面白いことに、G3BP1とG3BP2っていうタンパク質がストレス顆粒の形成に必要なんだ。これらのタンパク質は、ストレス時にどのメッセージが翻訳されるかを決める助けをするかもしれないけど、ストレス顆粒が翻訳に与える正確な役割は完全には理解されていない。
G3BPと翻訳の焦点を変える
最初は、ストレス顆粒がストレス時に翻訳を止める重要な役割を果たしていると思われていたけど、新しい研究では、ストレス顆粒を形成しなくても、細胞は翻訳を遅くできることが示された。G3BPが取り除かれた実験でも、細胞は翻訳を減少させたことから、G3BPだけがこのプロセスに関与しているわけではないんだ。
ストレス顆粒は、翻訳が遅くなったときによく形成されるけど、翻訳を完全に止めるために必須ってわけではなさそう。むしろ、ストレスのある状況で特定のRNAが集まる場所に過ぎないかもしれない。
G3BPの機能を調べる
G3BPはストレス顆粒を形成するだけでなく、細胞がストレスを受けていないときでも翻訳に影響を与える重要な存在なんだ。研究によると、G3BPは特定のRNAメッセージの翻訳を増加させる助けをすることが分かっているけど、ストレス時の翻訳への影響の程度は完全には理解されていない。
最近の研究では、G3BPとストレス顆粒が翻訳に与える影響を観察する方法が開発された。より正確な測定を可能にする特別な技術を使用して、ストレス時のタンパク質生産の変化とG3BPの影響を見られた。
翻訳の変化を測定する
ストレス時に翻訳がどう変わるかを理解するために、科学者たちはリボスパイクと呼ばれるRNAの一部を使った特別な方法を導入した。このリボスパイクは、ストレス中の翻訳されたメッセージの絶対的な量を測定するのに役立つ。このアプローチでは、全体的な翻訳は大幅に減少するけど、いくつかの重要なmRNAは翻訳され続けたり、むしろ増加したりしていることが分かった。
面白いことに、これらのmRNAの多くには、ストレス下でより良く機能するための調節要素が含まれている。これから、細胞は全体的なタンパク質生産が減少しても、重要なタンパク質が作られるように進化したメカニズムを持っているってことが示唆されるね。
異なるタイプのストレスへの応答
熱や化学的ストレスなど、さまざまなタイプのストレスをテストしたとき、全てのストレスが翻訳の減少を引き起こすけど、正確な応答は異なることが明らかになった。いくつかのmRNAはたくましくて、ストレス環境でも翻訳が続く一方で、他のmRNAは非常に敏感で、すぐにシャットダウンしてしまう。
ストレスへの応答はmRNAによって異なり、一部のメッセージは細胞の生存にとっての重要度に基づいて優先されていることを示している。
mRNAの半減期の重要性
もう一つ面白い点は、mRNAの持続時間とストレス時の翻訳との関係。短命のmRNA、つまり新しいものは、ストレス時により活発に翻訳される傾向がある。このことは、細胞が厳しい状況で新しい、おそらくより関連性のあるメッセージを優先する方法を示しているね。
翻訳におけるG3BPの役割
さらに深く探るために、科学者たちはG3BPが翻訳にどう影響するかを調べるために、これらのタンパク質を枯渇させるように設計された細胞株を作った。ストレスをかける前にG3BPを取り除くことで、翻訳効率の変化を観察できた。結果、G3BPを取り除いても全体的な翻訳の減少には小さな影響しかなかったけど、G3BPが細胞のストレス応答において支援的な役割を果たしていることが示された。
G3BPの存在によってmRNAがどのように影響を受け、ストレスにどのように応答するかを比較すると、正の相関が観察された。これは、G3BPがISRによっても優先される特定のmRNAの翻訳を促進する手助けをしている可能性があることを示唆しているね。
SGと翻訳の関係
ストレス顆粒と翻訳の関係を探る中で、研究者たちはストレス顆粒に局在するmRNAがより効果的に翻訳される傾向があることを発見した。これは、ストレス顆粒にいることで、mRNAがストレス時に翻訳されるチャンスが増える可能性を示唆している。
しかし、SGが翻訳を助ける正確なメカニズムはまだ不明のままだ。一部の考えでは、SGが特定のmRNAのための支援的な環境を提供したり、SGの一部であることでmRNAが翻訳のためにライセンスを受けられるようになる可能性があるとされている。
実験システムの確立
これらの概念をさらに調べるために、研究者たちはストレスを加えることなく細胞内にSGライクな構造を形成するために異なる実験システムを使用した。オプトジェネティクスと呼ばれる技術を使って、研究者は光でストレス顆粒の形成を制御できた。このアプローチにより、セルがストレスを受けていない時でも、これらの顆粒の存在が翻訳に与える影響を研究できたんだ。
結果、これらのSGライクな構造を形成することは全体的な翻訳を若干減少させたけど、実際のストレス状況で見られる広範囲な変化を模倣するものではなかった。つまり、これらの構造は翻訳に影響を与えるかもしれないけど、ISRの効果を完全には再現していないってことだね。
ストレス時のリクルートにおける必要性
重要な発見は、ストレスが特定のmRNAをストレス顆粒にリクルートするために必要なようだってこと。ストレスがない状態でSGが形成された実験では、望ましいRNAの組成がストレス下で形成された顆粒と一致しなかった。このことから、細胞の文脈やストレス環境がストレス時にmRNAがどう扱われるかを決定する上で重要な役割を果たすことが強調されている。
mRNAをSGにくっつけることの影響
研究者たちは、mRNAをストレス顆粒に結びつけることが翻訳にどんな影響を与えるかを探った。リポータmRNAをストレス顆粒タンパク質に結びつけることで、結びつけられたmRNAはストレス時に失われずに翻訳を維持できることが観察された。この発見は、mRNAがストレス顆粒に関連付けられていることで、ストレス時の全体的な翻訳減少から保護される可能性があることを示唆しているね。
結論
まとめると、この研究は細胞が翻訳調節を通じてストレスに応答する方法についての洞察を与えている。ストレス顆粒は単なるストレスの副産物だと思われていたけど、結果は彼らが特に重要なmRNAの翻訳に積極的に影響を与えていることを示している。特にG3BPはISRを強化する役割を果たしていて、全体的なタンパク質生産が減少している中でも特定のメッセージが翻訳され続ける手助けをしているんだ。
さまざまな実験アプローチを通じて、科学者たちはストレス、翻訳、ストレス顆粒の生物学の間の複雑な相互作用を解き明かし始めている。G3BPとストレス顆粒は、一緒になって厳しい条件下で細胞の応答を最適化し、必要な時に重要なタンパク質が作られるようにしているんだ。
タイトル: The G3BP Stress-Granule Proteins Reinforce the Translation Program of the Integrated Stress Response
概要: When mammalian cells are exposed to extracellular stress, they coordinate the condensation of stress granules (SGs) through the action of key nucleating proteins G3BP1 and G3BP2 (G3BPs) and, simultaneously, undergo a massive reduction in translation.1-5 Although SGs and G3BPs have been linked to this translation response, their overall impact has been unclear. Here, we investigate the longstanding question of how, and indeed whether, G3BPs and SGs shape the stress translation response. We find that SGs are enriched for mRNAs that are resistant to the stress-induced translation shutdown. Although the accurate recruitment of these stress-resistant mRNAs does require the context of stress, a combination of optogenetic tools and spike-normalized ribosome profiling demonstrates that G3BPs and SGs are necessary and sufficient to both help prioritize the translation of their enriched mRNAs and help suppress cytosolic translation. Together these results support a model in which G3BPs and SGs reinforce the stress translation program by prioritizing the translation of their resident mRNAs.
著者: David P Bartel, J. Smith
最終更新: 2024-10-05 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.04.616305
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.04.616305.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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