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新しい方法で細胞発達の力が明らかに!

発達中の細胞内の力を測る新しいアプローチが、組織形成の理解を深めてくれるよ。

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目次

細胞の発達は複雑で、細胞が機能的なシステムにどのように組織されるかを理解することが生物学の大きな焦点の一つだよ。重要なポイントは、細胞が生成する力で、これは細胞や組織の形を作る上で欠かせない役割を果たしているんだ。アクトミオシン皮質は、細胞膜の下にあるアクチンフィラメントとミオシンモーターからなる層で、この力の生成にとって重要なんだ。この皮質は細胞の形を変えたり、細胞の動きや分裂などに必要な構造を生み出したりすることができるんだ。

生物システム内での力の働きを測定する方法はいくつかあるけど、多くは複雑で、細胞の自然な状態を乱すことがあるんだ。従来の技術はしばしば細胞との直接接触を必要としたり、材料に埋め込んだりするから、環境や挙動を変えてしまうことがある。例えば、原子間力顕微鏡のような方法は、細胞同士の相互作用を変えてしまうことがあって、正確な結果が得られないことがある。

有望な代替手段として、細胞の形を使って力を推測する方法がある。提案された方法の一つは、細胞の形を泡のように比較するもので、泡と同じように振る舞うと仮定している。細胞が接する角度や曲率を測ることによって、細胞膜の緊張を推定できるんだ。でも、この手法には限界があって、特に細胞が分裂中や卵殻のような構造に閉じ込められているときには限界があるんだ。

これらの課題に対処するために、シミュレーションベースの新しいアプローチ、力の推定を行う離散要素法シミュレーション(FIDES)が開発されたよ。泡のモデルとは異なり、FIDESは細胞の形の高品質な画像を用いて、そこに作用する物理的な力をシミュレートして、細胞の機械的特性についてより正確な推測を行うんだ。

細胞力の基礎

発展している組織の中の細胞はただそこにいるだけじゃなくて、互いに押したり引いたりしているんだ。これは、細胞が成長して複雑な構造を作る形態形成のプロセスにとって欠かせないことなんだ。アクトミオシン皮質は、これらの機械的相互作用において中心的な役割を果たし、形や動きの変化を可能にしているんだ。

細胞が力を生成する際には、互いにコミュニケーションを取る必要もあるよ。細胞は接着分子を通じてくっついていて、力を伝えることができるんだ。このコミュニケーションは、組織全体の構造と機能を維持するために重要なんだ。

力を測定する現在の方法

細胞力学を研究するためのさまざまな方法があるけど、従来の技術の多くは複雑な問題を引き起こすことがあるんだ。原子間力顕微鏡やマイクロピペット吸引のような技術は、細胞との物理的な接触が必要で、その自然な状態を乱す可能性があるんだ。

3D牽引力顕微鏡のような追加の方法は、細胞が周囲とどのように相互作用するかを測定できるけど、細胞をジェルに埋め込むことが多いんだ。レーザーアブレーションや光トラップのようなより高度な技術も、細胞の力に関する詳細な情報を提供できるけど、複雑な設置が必要で、時間がかかることが多い。

泡力の推定(FFI)

新しいアプローチの一つに、泡力の推定(FFI)がある。これは、細胞を泡の中の気泡に比較するアイデアを使っているんだ。この方法は、細胞構造の力学と泡の物理学の間に類似点を引いて、力の働きを推定するんだ。

FFIは、特に三つの細胞が接するところの細胞の形状の測定に依存しているんだ。これらのポイントでの角度や曲率を見て、細胞膜の相対的な緊張を推測できるんだ。しかし、このアプローチは、細胞が機械的平衡にない場合には重要な制限があるんだ。これは、特に分裂のようなアクティブなプロセス中によく見られることなんだ。

例えば、FFIは特定の条件下での有望さを示したけど、細胞が平衡の泡のように振る舞うという仮定や、緊張が均一であるという仮定が、急速に変化する環境では不正確な結果をもたらすことがあるんだ。特に、常に動いている組織や分裂している組織では、これは問題になることが多いんだ。

FIDESの導入

FFIの限界を克服するために、FIDESはより柔軟で現実的なモデルアプローチを採用しているんだ。実際の細胞形状データに基づいたシミュレーションを取り入れることで、FIDESは組織内の物理的相互作用についてより詳細な視点を提供するんだ。

FIDESは高品質な細胞の画像から始まり、そこにある形状や構造をキャプチャするんだ。これらの画像を使用して、方法は細胞に作用する力をシミュレートし、研究者がさまざまな条件下で細胞がどのように振る舞うかをモデル化できるようにしているんだ。このシミュレーションフレームワークは、局所的な力の生成や卵殻のような物理的な制約、細胞の他のアクティブな挙動を考慮しているんだ。

FIDESの仕組み

  1. 画像取得:研究者はまず、共焦点顕微鏡を使って細胞の画像をキャプチャするよ。この画像は、さらなる分析に使える細胞の形状に関する詳細情報を提供するんだ。

  2. セグメンテーション:画像はセグメンテーションプロセスを経て、細胞の表面を表すメッシュを生成するよ。これにより、シミュレーションに使う細胞形状の3Dモデルが作られるんだ。

  3. シミュレーション:細胞の形状が確立されたら、研究者は変形可能Cellモデル(DCM)を適用して、細胞の機械的挙動をシミュレートするんだ。このモデルは緊張や接着の変化を可能にして、力の働きをより現実的に表現することができるんだ。

  4. 最適化:シミュレーションされた形状が観察された細胞の形状と一致するように、FIDESは最適化プロセスを採用しているんだ。これにより、皮質の緊張や接着の緊張などのパラメーターを調整して、シミュレーションと実際の観察データとの間の不一致を最小限に抑えることができるんだ。

  5. 力の推定:シミュレーションを実行した後、研究者は各細胞に作用する力を推定できるんだ。これには、細胞間の接触での緊張や接着が含まれるんだ。これらの推定は、実験データと対比して検証されるんだ。

FIDESとFFIの比較

FIDESの性能は、さまざまな細胞シナリオを扱う方法としてFFIと比較評価されたよ。泡モデルの仮定が成り立つ単純なケースでは、FIDESもFFIも強いパフォーマンスを示すんだ。

しかし、卵殻の存在や細胞の動きから来る動的な力のような、より複雑な状況に直面すると、FIDESがFFIを上回るんだ。FIDESの柔軟な性質は、発展中の組織で見られる特有の挙動や相互作用をよりよく考慮することができるんだ。

結果の検証

FIDESの方法の正確性を確認するために、研究者は推定された力をレーザーアブレーションを使った直接測定と比較したんだ。特定の細胞の皮質を切り取って、得られた反発効果を観察することで、細胞の緊張レベルを評価したんだ。

その結果、FIDESによる皮質緊張の予測が、アブレーション実験で得られた測定値と正の相関を示したんだ。この検証は、FIDESが細胞の力を調査する信頼できる手段を提供することを裏付けているんだ。

初期胚発生からの洞察

FIDESを使ってC. elegansの胚の初期発生を研究したことで、細胞の力のダイナミクスに関する貴重な洞察が得られたんだ。例えば、細胞が分裂の準備をする際、皮質の緊張が著しく増加することが分かったんだ。これは、胞子の丸みと呼ばれる現象なんだ。

緊張は、異なる細胞間だけでなく、時間によっても変化していて、力が発展を導く重要な役割を果たしていることを示しているんだ。研究は、細胞間の接着力が発達段階ごとに増加する様子を強調していて、これは組織構造を維持する上で重要なんだ。

この分析を通じて、個々の細胞の挙動は内部の力学だけでなく、隣接する細胞との相互作用によっても影響を受けることが明らかになったんだ。この相互接続性は、組織がどのように形成され、形を維持するかを理解する上で重要なんだ。

研究の今後の方向性

FIDESは細胞の力を理解する上で重要な進展を示しているけど、まだ成長や改善の余地があるんだ。一つは、FIDESで使用されるモデルをさらに洗練させて、より広範な細胞の挙動をカバーできるようにすることなんだ。

特に、動的な細胞の動きが全体的な機械的特性にどう影響するかを探求し、これらの変化をシミュレーションでどのように捉えられるかを調べることを目指しているんだ。また、緊張の絶対値を確立し、モデルが細胞の挙動に影響を与えるすべての関連要因を考慮するために、より多くの実験的検証が必要なんだ。

今後の研究のもう一つの重要な側面は、FIDESをC. elegans以外の異なる生物システムに適用することだよ。そうすることで、この方法がどれだけ広く適用可能かを判断できるし、発達生物学や組織工学の他の分野にも効果的に情報を提供できるかどうかを調べられるんだ。

結論

全体として、FIDESは発展中の組織内での力を研究するための強力な新しいツールを提供しているんだ。細胞間の動的な相互作用を正確にモデル化することで、組織がどのように形成され、機能するかについての新しい洞察をもたらすんだ。この知識は、発達生物学の理解を進めるために不可欠で、再生医療や癌研究などの分野で大きな影響を与える可能性があるんだ。

発展は力の相互作用によって駆動される複雑なプロセスだから、FIDESはこれらのメカニズムを解読するのを手助けするだけじゃなく、細胞の相互作用や行動についてのさらなる探求のための基盤を築いているんだ。実験的な方法と計算的な方法を両方取り入れることで、科学コミュニティは細胞レベルでの生命の複雑さを解明し続けることができるんだ。

オリジナルソース

タイトル: Image-based force inference by biomechanical simulation

概要: During morphogenesis, cells precisely generate forces that drive cell shape changes and cellular motion. These forces predominantly arise from contractility of the actomyosin cortex, allowing for cortical tension, protrusion formation, and cell division. Image-based force inference can derive such forces from microscopy images, without complicated and time-consuming experimental set-ups. However, current methods do not account for common effects, such as physical confinement and local force generation. Here we propose a force-inference method based on a biophysical model of cell shape, and assess relative cellular surface tension, adhesive tension between cells, as well as cytokinesis and protrusion formation. We applied our method on fluorescent microscopy images of the early C. elegans embryo. Predictions for cell surface tension at the 7-cell stage were validated by measurements using cortical laser ablation. Our non-invasive method facilitates the accurate tracking of force generation, and offers many new perspectives for studying morphogenesis. Author summaryAn important challenge in understanding morphogenesis is to determine where forces are generated. Force generation, such as differential cortical tension, plays a key role in cellular self-organization. However, measuring these forces experimentally is a big challenge that typically requires complicated experiments and direct access to the cells being investigated. A non-invasive method, such as force inference based on cell shapes, would have important advantages. Unfortunately, current methods can only be applied in certain cases. Here, we describe a more flexible 3D force inference method, FIDES, that can account for physical confinement, cell divisions and protrusions. We applied the method to infer forces throughout early C. elegans embryogenesis. By using cortical laser ablations, we confirmed that FIDES correctly inferred cell surface tensions in a dynamic stage of the nematodes embryogenesis. Our approach offers a route to routinely infer force generation in complex movements during morphogenesis, with microscopy images of cell shapes as the sole experimental input.

著者: Rob Jelier, M. Vanslambrouck, W. Thiels, J. Vangheel, C. van Bavel, B. Smeets

最終更新: 2024-10-05 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.12.01.569682

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.12.01.569682.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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