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# 生物学# 微生物学

リボソーム:成長指標以上のもの

リボソームのレベルと細胞成長の複雑な関係を探る。

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リボソームのレベルと細胞のリボソームのレベルと細胞の成長の難しい見解。リボソームの細胞成長における役割について
目次

細胞は成長と分裂の速さが違って、その成長は持っているリボソームの数と関係があることが多いんだ。リボソームは、細胞が成長して機能するために必要なタンパク質を作るのに欠かせないものだよ。一般的に、成長が早い細胞は多くのリボソームを持ってて、素早くたくさんのタンパク質を生産する必要があるからだと考えられている。でも、リボソームの数と成長の関係は、見た目よりも複雑なんだ。

リボソームと細胞成長

研究によると、細胞が速く成長すると、通常はリボソームも多く含まれているみたい。リボソームが細胞成長にとって重要だから、これは一見単純に見えるけど、リボソームを作るのは細胞にとってコストがかかるんだ。多くの成分で構成されていて、作るのにたくさんのエネルギーと資源が必要なんだよ。だから、細胞は利用可能な栄養素や成長の速さに応じてリボソームのレベルを調整しようとする。

細胞は環境の変化に素早く反応して、時には数分のうちにリボソームのレベルを調整することもある。こうした調整は、多くの種類の細胞や様々な成長条件の下で観察されている。一般的には、細胞集団の成長率が上がると、その集団の平均リボソームレベルも上がるんだ。

リボソームレベルの重要性

成長率とリボソームレベルの関連は、いくつかの分野で重要な発見をもたらしている。リボソームレベルを知ることで、細胞がどれくらいよく成長するかを予測できるんだ。研究者たちは、利用可能な資源に基づいて細胞の成長を調整するための制御システムについても学んできた。また、これらの知見は、細胞が時間とともにリボソームをより効果的に使うためにどのように変化するかについての手がかりも提供している。

とはいえ、この理解にもかかわらず、多くの研究は細胞の集団における平均リボソームレベルに焦点を当てている。個々の細胞におけるリボソームの研究は、その小さなサイズのために難しいんだ。代わりに、科学者たちはしばしば大規模な細胞群を分析して、総リボソーム量を測定し、異なる成長条件下での変化を観察する。しかし、平均だけを見ると、個々の細胞間の違いが隠れてしまうことがある。いくつかの細胞は高いリボソームレベルを持ちながらゆっくり成長し、他の細胞はリボソームが少なくても速く成長するかもしれない。この変動は、細胞が資源を管理し、環境に適応するための異なる方法があることを意味しているかもしれない。

単一細胞におけるリボソームレベルの調査

個々の細胞のリボソームレベルの違いを研究するために、最近研究者たちは単一微生物細胞からRNAを調べる新しい方法を使った。この方法では、個々の細胞から多くのRNA分子を捕捉できるから、単一細胞のレベルでリボソームレベルがどう変わるかを見ることができるんだ。

この研究では、科学者たちは成長の異なる時間に数千の酵母と細菌の細胞を調べた。平均のリボソームレベルは全体の成長率に合致していたけど、個々の細胞ははるかに幅広いリボソームレベルを示していた。つまり、単一細胞のレベルでは、リボソームの豊富さが成長を予測するのにはあまり役立たなかったってことだ。

細胞間の異質性

同じ条件で育てられた遺伝的に同一の細胞の中でリボソームレベルにバラツキがあったのは予想外だった。科学者たちが速く成長していることが知られている細胞を詳しく見ると、すべての細胞が高いリボソームレベルを持っているわけでも、高成長の兆候を示しているわけでもないことがわかった。リボソームがたくさんある細胞の中には、成長の信号ではなくストレスに関連する反応を示すものもあった。これは、リボソームの量が細胞がどれだけ早く成長しているかの最良の指標ではないかもしれないことを示唆している。

これらの発見は、リボソームレベルが集団レベルで成長率を予測できる一方、個々の細胞にはそうではないことを示している。これは、細胞が資源を管理し、成長する方法についての現在の理解に疑問を提起する。

成長率とリボソームレベル

リボソームレベルのバラツキを説明する一つの理論は、それが個々の細胞の成長率の違いに関連しているかもしれないということ。しかし、データは、成長が速い細胞が実際にはリボソーム量の変動が一番大きいことを示している。つまり、細胞の成長率がリボソームレベルに直接的に影響するわけではないということなんだ。

個々の細胞の成長率を調べると、成長が最も速い細胞は成長率の変動が少ないことが分かった。一方、成長が遅い細胞は、成長率の変動が大きくて、リボソームレベルが成長率にしっかり結びついているという期待とは逆だった。

他の要因の調査

リボソームレベルが単一細胞間で変わる理由を深く掘り下げるために、研究者たちは細胞内の他のRNA分子を調べた。細胞集団が安定して見えるときでも、遺伝子発現においてはまだ大きな違いがあることが分かった。ある細胞は速い成長の兆候を示し、他の細胞はストレス反応に関連する遺伝子を発現していた。

この発見は、細胞が見た目には真に安定した成長状態にあるわけではないかもしれないことを示唆している。代わりに、異なる将来の条件に備えている細胞の混合が存在する可能性があり、異なる進化戦略を反映しているかもしれない。

リボソームの豊富さと成長信号

リボソームの豊富さと成長信号との関係をさらに調査するために、科学者たちはリボソームレベルに基づいて細胞を分けた。そして、それらの分けた細胞の遺伝子発現を分析した。期待されていたのは、高いリボソームレベルの細胞が一貫した成長信号を示す一方、低いリボソームレベルの細胞がストレス反応を示すということだった。

しかし、結果はどちらのカテゴリーの細胞も遺伝子発現パターンが異なり、高いリボソームレベルと低いリボソームレベルを持つ細胞がストレスや成長の兆候を示したことを示した。これにより、リボソームの量が細胞の成長ポテンシャルと直接的には相関しないことが示唆された。

発見の意味

これらの結果は、細胞が成長条件に基づいて最適化されたリボソームレベルを持っているという従来の見方に挑戦しているんだ。むしろ、これらの発見はリボソームレベルと細胞の行動との間により複雑な関係があることを示している。細胞は環境に適応するためのさまざまな戦略を示し、個々の細胞が同じ成長を目指す戦略を追求しているわけではないことを示唆している。この多様性は、環境の変化に対する緩衝材として機能し、集団が変動する条件に適応できるようにするかもしれない。

まとめ

要するに、リボソームレベルは細胞の成長に関する集団レベルの洞察を提供することができるけど、個々の細胞の成長を正確に予測することはできない。遺伝的に同一の細胞間のリボソームの豊富さの変動は、成長と資源管理に関して複数の戦略が働いていることを示唆している。この複雑さは、従来の成長法則と観察された単一細胞の異質性を調和させるためのさらなる研究の必要性を浮き彫りにしている。これらのニュアンスを理解することで、細胞の行動や適応についての新しい洞察が得られるかもしれない。

オリジナルソース

タイトル: Single-cell heterogeneity in ribosome content and the consequences for the growth laws

概要: Across species and environments, the ribosome content of cell populations correlates with population growth rate. The robustness and universality of this correlation have led to its classification as a "growth law." This law has fueled theories about how evolution selects for microbial organisms that maximize their growth rate based on nutrient availability, and it has informed models about how individual cells regulate their growth rates and ribosomal content. However, due to methodological limitations, this growth law has rarely been studied at the level of individual cells. While populations of fast-growing cells tend to have more ribosomes than populations of slow-growing cells, it is unclear whether individual cells tightly regulate their ribosome content to match their environment. Here, we employ recent groundbreaking single-cell RNA sequencing techniques to study this growth law at the single-cell level in two different microbes, S. cerevisiae (a single-celled yeast and eukaryote) and B. subtilis (a bacterium and prokaryote). In both species, we observe significant variation in the ribosomal content of single cells that is not predictive of growth rate. Fast-growing populations include cells exhibiting transcriptional signatures of slow growth and stress, as do cells with the highest ribosome content we survey. Broadening our focus to non-ribosomal transcripts reveals subpopulations of cells in unique transcriptional states suggestive that they have evolved to do things other than maximize their rate of growth. Overall, these results indicate that single-cell ribosome levels are not finely tuned to match population growth rates or nutrient availability and cannot be predicted by a Gaussian process model that assumes measurements are sampled from a normal distribution centered on the population average. This work encourages the expansion of growth law and other models that predict how growth rates are regulated or how they evolve to consider single-cell heterogeneity. To this end, we provide extensive data and analysis of ribosomal and transcriptomic variation across thousands of single cells from multiple conditions, replicates, and species.

著者: Leandra M Brettner, K. Geiler-Samerotte

最終更新: 2024-10-08 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.19.590370

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.19.590370.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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