新しい方法が心臓欠損症に光を当てる
研究者たちが心臓の構造や血流の変動を分析する方法を開発した。
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先天性心疾患(CHD)は、赤ちゃんに最も多い出生時の欠陥の一つだよ。アメリカでは、約100人に1人の赤ちゃんに発生してるんだ。こんなに頻繁に起きるのに、遺伝や環境要因に結びつくのはごく一部なんだって。科学者たちは、心臓や血管の形成に問題があるとこれらの欠陥が生じることに気づき始めているんだ。
研究者たちは、モデル生物の発達中の心臓の血流を操作することで、人間に見られる心疾患に似た心の欠陥を作り出せることを発見したんだ。これから、異常な血流が心臓の発展や機能に大きな影響を与えることが示唆されているよ。心臓発達に関わる大切な要因の一つは、剪断応力(せんだんおうりょく)で、血流が血管の壁にかかる力なんだ。研究によると、剪断応力は物理的な変化に敏感に反応して、心臓の発展のさまざまな側面に影響を与えるんだって。
血流の測定の課題
剪断応力が心臓の発達にとって不可欠だってわかっているけど、胚で正確に測るのは難しいんだ。胚の心臓は小さくて繊細で、常にポンプのように動いているから、血流や剪断応力の正確な測定が難しいんだ。だから、研究者たちは血流の変動が心臓や血管の発達にどう影響するかを直接研究できていないんだ。
この問題に対処するために、科学者たちはコンピューターモデルを使って血流をシミュレートし、心臓内の力を分析しているんだ。これらのコンピュータシミュレーションは、計算流体力学(CFD)として知られていて、直接的な測定の代替手段を提供しているよ。でも、胚の心臓の詳細な解剖モデルを作成する明確な方法が不足しているんだ。
この研究では、胚の心臓での血流力学を詳しくシミュレートできる方法を作ることを目指しているんだ。胚のグループから正確なデータを集めて分析することで、構造の違いが血流や欠陥の発展にどうつながるかをよりよく理解できるようになるんだ。
形態計測と新しい方法の必要性
胚の正確な三次元モデルを作るのは難しいんだ。従来のイメージング手法では、標本間のジオメトリの違いを理解するための偏りのないデータを提供できないことが多いんだ。胚の形や大きさを定量化する標準的なアプローチがないため、違いを体系的に分析するのが難しいんだよ。
でも、古生物学や人類学などの他の分野の研究者たちは、三次元データを分析するために形態計測という統計的アプローチを使ってきたんだ。この方法は、長さや角度のような測定を使って標本の形や大きさを見ていくものだよ。幾何学的形態計測は、従来の形態計測から進化して、特定の参照点やランドマークに焦点を当てながら、より複雑な構造を研究できるようにしているんだ。
幾何学的形態計測は一部の生物学の研究で使われてきたけど、発生生物学、特に心臓の研究では広く使われていなかったんだ。この研究では、この方法を使って一群の胚のひよこの心臓の形を分析し、自然な変異やジオメトリの違いに対する感度を強調することを目指しているんだ。
なぜひよこの胚?
ひよこの胚は、心臓の発達を研究するのに役立つモデルなんだ。人間の心臓と発達が似ていて、研究のために操作しやすいからなんだ。以前の研究では、CFD技術を使ってひよこの胚をモデル化してきたけど、多くの研究は胚間の個々の変異を完全に捉えたわけではなかったんだ。
各ひよこの胚のユニークな解剖特徴を再構築することで、これらの変異が局所的な血流や剪断応力にどう影響するかを調べることができるようになるよ。大動脈弓は、心臓と体の他の部分をつなぐ主要な血管だから特に重要なんだ。ここでは多くの先天性心疾患が発生するから、血流がこれらの領域をどう通るかを理解するのは心疾患対策にとって重要なんだ。
分析のための新しい方法の開発
この研究の目標は、心臓解剖の変動とそれに伴う血流を効果的に捉える新しい方法を作ることなんだ。研究者たちは、先進的なイメージング技術と血流の数値シミュレーションを組み合わせたパイプラインを設計しているよ。
最初のステップは、ひよこの胚の血管に蛍光染料を使ってラベリングして、血管構造の複雑な詳細を可視化できるようにすることなんだ。このラベル付きの組織は、背景の材料を取り除いてイメージングの質を向上させるよ。その後、ライトシート蛍光顕微鏡という技術を使って高解像度の画像をキャッチするんだ。この技術は、フォトブリーチングのような望ましくない影響を最小限に抑えながら画像を取得できるんだ。
画像が集まったら、研究者たちは心臓や血管構造を分析するためにセグメント分けを行うんだ。このプロセスでは、大動脈弓や心臓の流出路など、特定の関心領域を特定してアウトラインを描くんだ。セグメンテーションの後、構造の形や大きさを比較するために高度な技術を使って分析を行うんだ。
幾何学的形態計測の使用
研究者たちは、胚グループの解剖変異を評価するために幾何学的形態計測を適用するんだ。構造にランドマークを置いて、標本間のジオメトリの類似点や違いを比較できるようにするんだ。変異は、プロクルステス分析という手法を使って調べられる。この手法では、ランドマークの位置を合わせた後、形の違いを定量化することができるんだ。
この分析を通じて、研究者たちは異なる胚の解剖がどのように重要な違いを持つかを可視化できるようになるんだ。結果は、特定の構造的特徴が他のものよりも変異を持っていることを示していて、どの部分が先天性の欠陥に影響されやすいかについての洞察を提供しているよ。
血流力学の理解
血流力学を研究するために、研究者たちはイメージングデータを使用してひよこの胚の心臓の詳細なコンピュータモデルを作成するんだ。血流は、これらの複雑な構造を通って流れる流体としてモデル化され、解剖の変異が剪断応力パターンにどう影響するかを観察するためにシミュレーションが実行されるよ。
血管のジオメトリ、特に大動脈弓の形や大きさは、血液が心臓を通してどのように流れるかを決定する重要な役割を果たしているんだ。研究者たちは、中心の大動脈弓が隣接するアーチよりも短いにもかかわらず、最も高いレベルの剪断応力を受ける傾向があることを見出したんだ。この発見は、血流やストレスの集中に影響を与える要因が、単に動脈のサイズを超えることを示唆しているよ。
コンピュータモデルを使うことで、研究者たちはリアルタイムで血流力学を可視化し定量化できるようになって、各解剖特徴が心臓全体の機能にどう寄与するかのより明確なイメージが得られるんだ。異なる解剖構成を見れることで、特定の変化が先天性欠陥につながる可能性をより良く理解できるようになるんだ。
未来の研究への影響
この研究で開発された新しいパイプラインは、将来の研究の可能性を広げるよ。先進的なイメージング技術とコンピュータモデリングを組み合わせることで、研究者たちは遺伝要因や他の介入が心臓発達にどう影響するかをリアルタイムで研究できるようになるんだ。これにより、より多くの胚を含む高スループット研究が可能になって、結果の統計的な力を高められるよ。
さらに、これらの方法は、心臓の発達や欠陥の形成における環境要因がどう関与するかを調べるために適応できるかもしれないんだ。遺伝操作とこのイメージング・モデリングアプローチを組み合わせることで、心臓の発達が最も影響を受けやすい重要な時期の新しい洞察を見つけることができるんだよ。
結論
先天性心疾患は多くの新生児に影響を与える重大な健康課題なんだ。心臓の発達中の解剖と血流の複雑な相互作用を理解することは、より良い予防や治療戦略を開発するために重要なんだ。この研究で開発された方法は、胚のひよこにおけるこれらの要素を評価するための強力な新しい手段を提供しているよ。
先進的なイメージング技術、幾何学的分析、コンピュータモデリングを組み合わせることで、研究者たちは心臓の構造の変化が血流力学や先天性の欠陥のリスクにどう関連するかを調べることができるようになったんだ。この研究から得られた洞察は、心臓の発達をより深く理解するのに役立ち、医療科学における画期的な進展につながる可能性があるんだ。
タイトル: A Combined Computational Fluid Dynamics Modeling and Geometric Morphometrics Methods Approach to Quantifying Hemodynamic and Anatomical Features of Embryonic Chick Heart Anatomies Reconstructed from Light Sheet Fluorescence Microscopy Imaging
概要: Although congenital heart defects occur in approximately 1% of newborns in the US annually, their pathogenesis remains largely unknown. Less than a third of congenital heart defects are traced a known genetic or environmental cause. It has been demonstrated that hemodynamic forces such as wall shear stress are critical for heart development. However, measuring these hemodynamic factors in vivo is infeasible due to physical limitations, such as the small size and constant motion of the embryonic heart. An alternative approach is to recapitulate the hemodynamic environment by simulating blood flow and calculating the resulting hemodynamic forces through computational fluid dynamics modeling. We use computational fluid dynamics modeling to quantify hemodynamics in a cohort of cell-accurate embryonic chick heart anatomies reconstructed using light sheet fluorescent microscopy. Additionally, we perform a quantitative analysis on geometric features using geometric morphometric methods. Together, the high-resolution but accessible imaging technique of light sheet fluorescence microscopy to reconstruct the anatomies paired with computational fluid dynamics modeling and geometric morphometrics methods produces a fast and accessible pipeline for quantitative hemodynamic and anatomical analysis in embryonic heart development.
著者: Michael Bressan, K. Giesbrecht, B. Griffith
最終更新: 2024-10-12 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.08.611246
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.08.611246.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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