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大腸癌の進行における遺伝的変化

大腸癌の発症における異常数 chromosome と遺伝的変化の概要。

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大腸がんの遺伝子の洞察大腸がんの遺伝子の洞察る。大腸がんの進行における遺伝的な状況を調べ
目次

癌は複雑な病気で、細胞の遺伝物質に変化がよく見られるんだ。癌のゲノムの一般的な特徴の一つは、異常な染色体数を持っている「異数体性」っていう状態なんだ。これは細胞分裂の間違いやDNA修復のエラー、ゲノムの二重化など、いろんな理由で起こることがあるよ。

大腸癌(CRC)では、約85%のケースが染色体不安定性を示していて、これが異数体性につながってるんだ。残りのケースは遺伝子レベルで変異があるけど、染色体の構造変化は少ないんだ。

異数体性は癌の発展に大きな役割を果たすと考えられてるよ。まず、癌の中に異数体性が広く存在することは、癌細胞が特定の遺伝的変化を好むことを示唆してる。次に、異常な染色体数は、バレット食道や潰瘍性大腸炎のような前癌状態で癌を発症するリスクが高いことを示してるんだ。三つ目は、染色体の特定の遺伝的変化が、癌と診断された患者の予想される結果についての洞察を提供できるってこと。最後に、腫瘍の異なる領域での染色体数の変動は、重要な予後情報を示すかもしれない。

でも、異数体性が常に癌細胞にとって良いわけではないんだ。ゲノムの大部分を追加したり失ったりすると、遺伝子発現のバランスが崩れたり、時には細胞死につながることもある。だから、いくつかの遺伝的変化は有利だけど、他は有害で、特定のレベルの異数体性が癌細胞に共存できるバランスを生むと考えられてるんだ。

大腸癌の進行のダイナミクス

CRCの研究は、腫瘍が時間と空間で進化する様子を研究するユニークなチャンスを提供してくれるよ。たとえば、アデノーマと呼ばれる早期の前癌性の成長が、早期の癌発生と一緒に見つかることがあるんだ。これらの初期の癌は時々肝臓などの他の臓器に広がることがあって、その遺伝的変化を時間をかけて研究することができるんだ。

最近の研究では、良性のアデノーマと悪性の癌を含む大腸の病変のグループ内での異数体性の変化に焦点を当てたんだ。研究者たちは、ゲノムの変更された割合によって測定した異数体性のレベルが、良性のアデノーマからより進行した癌の段階へと増加していくことを発見した。初期の癌では、染色体パターンの変化が腫瘍の段階によって異なることにも気づいたよ。

研究は、ゲノムの変更された割合がアデノーマでは最も低く、進行した癌では最も高いことを示し、腫瘍の進行に伴う明確な変化を示したんだ。さらに、癌が発展するにつれて、遺伝的変化の多様性が減少することを示唆している。簡単に言うと、良性腫瘍は遺伝的変化のバリエーションが多いけど、進行した腫瘍はより少なく、一貫した変化が見られるってこと。

アデノーマから癌への移行は、遺伝的多様性の狭まりを通じて起こるようで、腫瘍が悪性になるにつれて、特定の遺伝的変化を好む重要な選択プロセスが行われることを示してるんだ。

遺伝データからの初期の洞察

研究はさらに、遺伝的背景が似た小さな細胞グループである癌腺のコレクションを調べたんだ。これらの腺を分析することで、研究者たちは異数体性があっても、ほとんどの遺伝的変化が特定の腫瘍内の細胞間で一貫していることを発見したよ。これは遺伝的変動がある一方で、各腫瘍を定義する安定した遺伝的変化のコアが残っていることを示唆しているんだ。

より詳細な分析を通じて、このコアの遺伝的構成が癌が進行しても維持されることが多いってことが確認されたよ。単一細胞レベルでデータを調べると、多くの遺伝的変化が相当安定していることがわかったんだ。

追加の実験では、研究者たちは個別の癌細胞の遺伝的構成を調べるための高度な技術を使ったんだ。多くのこれらの細胞が進行中の遺伝的不安定性を持っていて、新しい遺伝的変化が定期的に起こっていることがわかった。これは、癌細胞が初期の腫瘍が形成された後も進化し続ける可能性があることを示しているんだ。

癌ダイナミクスの数学的モデル化

CRCにおける遺伝的変化のパターンを理解するために、研究者たちは数学的モデルを開発したよ。このモデルは、癌の成長中に遺伝的変化がどのように起こるか、これらの変化に対する自然選択の影響を説明することを目的としてるんだ。結果は、悪影響のある選択が腫瘍内の遺伝的変化の多様性を制限する重要な役割を果たしている可能性を示している。

モデルによると、腫瘍が特定の「最適な」遺伝的構成を持っているなら、この構成から逸脱した変化は積極的に選択されない可能性があるんだ。その結果、癌細胞が遺伝的変化を蓄積できても、この悪影響のある選択プロセスによってその変化の速度が抑制されるかもしれない。

さらに、シミュレーションは、悪影響のある選択がない場合、成長する腫瘍が高い遺伝的多様性を経験すると示唆している。一方で、悪影響のある選択が働くと、遺伝的変化の多様性が大幅に減少するんだ。これは、癌の遺伝的風景が単に突如変異によって形成されるのではなく、これらの変異が腫瘍環境の選択圧とどのように相互作用するかによって形作られていることを示してる。

癌モデルにおける進行中の進化

研究者たちはまた、確立された癌モデルからの癌細胞における遺伝的変化のダイナミクスを調査したんだ。これには、大腸癌の細胞株からの個々の癌細胞を調べることが含まれてるよ。データは、これらの個々の細胞が複数の新しい遺伝的変化を生成できることを示したんだ。

これらの変化を探る中で、研究者たちは特定の遺伝的変化がゲノム全体に広がっていることに気づいた。これは、進行中の遺伝的不安定性が一般的なテーマであることを示唆しているよ。これは、癌細胞が遺伝的変化を継続的に行っており、腫瘍の進化に寄与している可能性があるんだ。

理解を深めるために、研究者たちは患者由来の癌オルガノイド、つまり腫瘍の実験室で育てられたバージョンも分析したよ。これらのオルガノイドも進行中の遺伝的変化のパターンを示し、癌細胞内に存在する遺伝的変化のメカニズムが細胞株に特有のものではなく、実際の腫瘍生物学にも関連していることを確認したんだ。

治療と転移の影響

研究はまた、癌が他の組織に広がるときや治療中に遺伝的変化がどのように進化するかについても調べたよ。転移、つまり癌の広がりは、腫瘍の遺伝的構成を変える可能性のある新しい選択圧を導入することができるんだ。研究者たちは、転移中に遺伝的変化が起こることもあったけど、多くの腫瘍のコアの遺伝的構造は時間とともに一貫していることを観察したんだ。

原発腫瘍とその転移腫瘍を比較すると、全体的な遺伝的多様性のレベルは比較的低いことがわかったんだ。これは、転移や治療によって複雑さが増すにもかかわらず、多くの腫瘍が安定した遺伝的アイデンティティを維持していることを示してる。

ただし、一部のケースでは原発腫瘍と転移腫瘍の間で顕著な遺伝的構造の違いが見られたんだ。これは、たとえ多くの腫瘍が安定性を示しても、他の腫瘍は新しい環境に適応するにあたって大きな変化を遂げることがあり得るっていうことを示唆してる。こうした違いを理解することは、遺伝的変化が治療反応や患者の結果にどのように影響するかを判断するのに重要なんだ。

結論:大腸癌の進化の性質

要するに、異数体性と大腸癌における遺伝的変化の研究は、遺伝的不安定性と選択圧の間の複雑な相互作用を明らかにしているよ。癌の初期段階では遺伝的変化の多様性が大きいけど、進行した癌はコアの変化セットの周りに安定する傾向があるんだ。

これらの発見は、異常な遺伝的構成が悪性腫瘍の初期形成に不可欠かもしれないけど、この基盤が築かれると、悪影響のある選択が癌の寿命中、転移や治療中に安定した核型を維持するのを助けるってことを示してる。

この研究の影響は大きくて、個々の腫瘍の遺伝的風景を理解することが、患者の結果を予測し、治療を調整するのに重要になるかもしれないんだ。革新的な技術が癌の遺伝的複雑性を明らかにし続ける中、今後の研究は、これらの動態がさまざまな癌の種類やステージでどのように展開するかを明確にするために重要になるね。

オリジナルソース

タイトル: Negative selection may cause grossly altered but broadly stable karyotypes in metastatic colorectal cancer

概要: Aneuploidy, the loss and gain of whole and part chromosomes, is near-ubiquitous in cancer genomes and likely defines cancer cell biology. However, the temporal evolutionary dynamics that select for aneuploidy remain uncharacterised. Here we perform longitudinal genomic analysis of 755 samples from a total of 167 patients with colorectal-derived neoplastic lesions that represent distinct stages of tumour evolution through metastasis and treatment. Adenomas typically had few copy number alterations (CNAs) and most were subclonal, whereas cancers had many clonal CNAs, suggesting that progression goes through a CNA bottleneck. Individual CRC glands from the same tumour typically had very similar karyotypes, despite evidence of ongoing instability at the cell level in patient tumours, cell lines and organoids. CNAs in metastatic lesions sampled from liver and other organs, after chemotherapy or targeted therapies, and in late recurrences were typically similar to the primary tumour. Mathematical modelling and statistical inference indicated that these data are consistent with the action of negative selection on CNAs that traps cancer cell genomes on a fitness peak defined by the specific pattern of chromosomal aberrations. These data suggest that the initial progression of colorectal cancer requires the traversal of a rugged fitness landscape and subsequent CNA evolution, including metastatic dissemination and therapeutic resistance, is constrained by negative selection.

著者: Trevor A Graham, W. Cross, S. Nowinski, G. Cresswell, M. Mossner, A. Banerjee, B. Lu, M. Williams, G. Vlachogiannis, L. Gay, A.-M. Baker, C. Kimberley, F. Whiting, H. Belnoue-Davis, P. Martinez, M. Traki, V. Walther, K. Smith, J. Fernandez-Mateos, E. Yara, E. Oliveira, S. Milite, G. Caravagna, C. James, G. Elia, A. M. Berner, R. C. Choi, P. Ramagiri, R. Chauhan, N. Matthews, J. Murphy, A. Antoniou, S. Clark, M. Mitchison, J.-A. C. Aleong, E. Domingo, I. S. Spiteri, S. McDonald, D. Shibata, M. M. Lacle, L. M. Wang, M. Moorghen, I. Tomlinson, M. Novelli, M. Jansen, Wat

最終更新: 2024-10-13 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.26.007138

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.26.007138.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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