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# 生物学# 微生物学

E. coliが酸性環境でどうやって繁殖するか

低pH条件下でのE. coliの成長戦略は、適応力とチームワークの大切さを示してるよ。

Victor Sourjik, R. R. Segura Munoz

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E. coliの酸生存戦略E. coliの酸生存戦略coliは酸性条件での適応力がすごいよ。E.
目次

バイ菌ってめっちゃ小さい生き物で、私たちの体や環境のあちこちにいるんだよね。バイ菌の成長に大事なのが、周りのpHレベルで、これは液体がどれだけ酸性かアルカリ性かを測るもの。中性菌みたいなE. coliは、pHが約7.0の中性に近いときが一番成長するんだ。ちょっと酸性の条件(pH 5.0から7.0)でも生き残る方法を持ってるよ。

E. coliと酸耐性

E. coliは、たまに人間を病気にする一般的なバイ菌なんだ。E. coliが酸性の環境、例えば胃や特定の食べ物の中にいるときは、いろんな戦略を使って生き延びるんだよ。これが酸耐性メカニズムって呼ばれるもの。これらのシステムの中には、酸の影響を和らげるために、タンパク質のもとになるアミノ酸を使うものもあるよ。

E. coliにはいくつかの酸耐性システムがあって、一番大事なのはGadシステム、Adiシステム、Cadシステムだ。それぞれのシステムは特定のタンパク質に依存していて、バイ菌が酸性の条件に対処できるように細胞内をあまり酸性にしないように助けるんだ。

酸性条件でのE. coliの成長

E. coliを酸性の環境に置くと、成長がいくつかのフェーズで測定できるよ。まず、細胞分裂なしにサイズが急激に増える。そして成長が一時ストップして、これを中間遅延期って呼ぶんだけど、その後に通常の成長が再開される。中間遅延期の長さは、培養にいるバイ菌の数によって変わるんだ。密度が高い培養では成長の中断は短いけど、密度が低いと長く続くよ。

最近の研究で、E. coliは周りの酸性を下げるために協力して働くことができるってわかった。つまり、どれかのバイ菌が他のより酸に強くても、隣のバイ菌を助けることができるってわけ。これがチームワークになって、E. coliは低pHの環境で繁栄できるんだ。

人口密度の役割

人口密度、つまり一定のスペースにいるバイ菌の数は、E. coliが酸性条件でどれだけうまく成長できるかに重要な役割を果たすよ。研究者たちが異なるpHレベルでE. coliを育てたとき、バイ菌の数によって特定の成長パターンが見られたんだ。

中性のpHレベルでは、E. coliの成長は細胞密度に影響されなかったんだけど、pHが下がると、密度と成長の関係がはっきりしてきた。pH 4.4のような低pH環境では、低密度の培養が多相的な成長パターンを示した一方で、高密度の培養は成長を続けた。つまり、バイ菌が多ければ多いほど、酸性条件での成長と回復が早いってことだ。

酸ストレス下での成長のダイナミクス

E. coliがほぼ致死的な酸性pHにさらされた実験では、成長プロセスがもっと複雑になることが観察されたよ。最初は、バイ菌が分裂せずに伸びて、質量が増えるんだ。これが成長の停止に続き、バイ菌が周りのpHを上げるために働いてから正常な成長が再開される。

周りのpHを上げる能力は、バイ菌の数だけじゃなくて、培地のバッファーにも依存する。バッファーはpHを安定させるのを助けて、異なるバッファーを使うと、E. coliの成長パターンが変わるんだ。

細胞サイズの変化

研究者たちは、E. coliの成長プロセス中に細胞のサイズがどう変わるかも調べたんだ。酸性条件にさらされると、E. coliの細胞はかなり伸びてから元のサイズに戻るんだ。このサイズの変化は、低pHのストレスに適応し管理する能力にとって重要なんだ。

研究者たちは、この成長や細胞サイズの変化がE. coliが厳しい環境で生き残るのに役立つことを指摘した。一部の株では、この細胞の伸びが特に顕著だったけど、他の株は異なる成長パターンを示したよ。

前処理と翻訳阻害の影響

酸性条件でのE. coliの前処理は、後でさらに低いpHレベルにさらされたときの生存能力を高めるみたいだ。研究者たちが細胞のタンパク質生成を阻害したとき、前処理された細胞でも周囲のpHを上げることができることがわかった。これは、酸ストレスを管理する能力が、ストレスが起こる前に正しい準備が整っていることに依存していることを示しているよ。

酸耐性システムの役割

E. coliが酸性条件で成長する効率は、さまざまな酸耐性システムに大きく依存してるんだ。研究者たちは、これらのシステムがそれぞれバイ菌の生存と低pH環境での成長にどのように寄与するかを理解するために、異なるE. coli株をテストしたよ。

特定の酸耐性成分が欠けている株は、低pHレベルで成長が減少したけど、特定の基質を追加することで酸耐性が強化された株は、成長が大きく改善された。このことは、E. coliが繁栄するためには異なる酸耐性システムが協力して働くことが重要だってことを示しているよ。

他のバイ菌との類似点

研究者たちは、他のE. coli株やサルモネラなどの関連バイ菌も調べて、低pHで似たような密度依存の成長パターンが見られるか確認したんだ。いくつかの株がこうした特性を共有していることがわかったけど、目立った違いもあったよ。

ある株は、他の株に比べて低pHに対する成長反応がもっと顕著で、つまり異なるバイ菌株が酸性環境への対処能力にばらつきがあるってことだ。

集団行動と交差保護的成長

この研究の面白い点は、バイ菌の集団行動のアイデアなんだ。E. coliは、より酸耐性の細胞がいることで恩恵を受けることができるんだ、たとえそれが別の株でもね。異なる株の混合培養では、研究者たちは酸に敏感な細胞が、より酸耐性の細胞がいるときにうまく成長できることを発見した。この相互作用は交差保護って呼ばれ、バイ菌同士が厳しい環境でお互いを支え合うことが示唆されてるんだ。

結論

酸性条件でのバイ菌の成長ダイナミクスは複雑で、pHや人口密度などさまざまな要因に影響されるんだ。E. coliや関連するバイ菌は、こうした厳しい環境で生き延びるために多くの戦略を開発してきて、チームワークやさまざまな酸耐性システムを通じて驚くべき適応力を示してる。これらのバイ菌が酸ストレスをどう管理するかを理解することで、自然環境、例えば人間の体の中での彼らの行動についての洞察が得られ、バイ菌の生存戦略についての知識も深まるんだ。

オリジナルソース

タイトル: Collective dynamics of Escherichia coli growth under near-lethal acid stress

概要: Many neutralophilic bacteria, including Escherichia coli, can withstand acidic conditions due to the action of several protective mechanisms. While the survival of E. coli under growth-inhibitory extreme acid stress is well understood, less is known about the physiology of E. coli growth under severe but permissive acidity. Here, we observed that growth of E. coli MG1655 in a rich medium with pH of 4.1 to 4.4 exhibits a characteristic multi-phasic growth pattern, consisting of an initial exponential elongation in the absence of cell division, followed by growth arrest and subsequent resumption of exponential growth. The duration of the growth arrest phase was strongly dependent on the pH of the medium, but also on the initial cell density of the culture, suggesting the collective nature of this phenomenon. Cell-density dependent multiphasic growth at the near-lethal pH, including the initial increase in cell volume associated with either elongation or widening of the cell body, was also observed for all tested natural E. coli isolates and for Salmonella enterica serovar Typhimurium. Such transient increase in volume apparently enables bacteria to induce acid resistance systems, including the lysine-dependent Cad system, to subsequently modify pH of the medium in the density-dependent manner. Consistent with the collective recovery, even a minor fraction of acid-tolerant cells could fully cross-protect acid-sensitive cells enabling them to resume growth in coculture. Thus, collective dynamics plays a central role in bacterial growth under near-lethal acid stress. ImportanceSince many E. coli and other Enterobacteriaceae isolates are gastrointestinal pathogens for humans, it is important to understand their growth under acidic conditions imposed by the host physiology in the stomach, colon, and inside macrophages. Here we show that E. coli growth under near-lethal acidic conditions is a collective phenomenon that critically depends on cell density. This collective behavior is favored by changes in cell morphology as a response to high acidity. The observed density dependence might have implications for pathogen proliferation in the acidic environment of the human gastrointestinal tract and possibly also for their interactions with immune cells.

著者: Victor Sourjik, R. R. Segura Munoz

最終更新: 2024-10-18 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.17.618973

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.17.618973.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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