Simple Science

最先端の科学をわかりやすく解説

# 生物学# 細胞生物学

SERF2とG-クアドラプルックスのストレス顆粒における役割

SERF2のストレス顆粒やG-四重鎖との相互作用への影響を探る。

James CA Bardwell, B. R. Sahoo, X. Deng, E. L. Wong, N. Clark, H. Yang, V. Subramanian, B. B. Guzman, S. E. Harris, B. Dehury, E. Miyashita, J. D. Hoff, V. Kocman, H. Saito, D. Dominguez, J. Plavec

― 1 分で読む


SERF2のストレス顆粒にSERF2のストレス顆粒における役割G-四重鎖との相互作用を調べている。ストレスを受けた細胞におけるSERF2の
目次

細胞は、機能を果たすためにさまざまな構造やプロセスに依存する複雑なシステムだよ。細胞の組織の面白いところは、膜を持たない区画が形成されることなんだ。こうした区画、例えば核小体やストレス顆粒は、液-液相分離と呼ばれるプロセスを通じて形成される。これは細胞内のタンパク質やRNAによって影響を受けるんだ。

タンパク質とRNAの役割

タンパク質は、細胞内で多くのタスクを実行する重要な分子だよ。機能によって、安定で構造的なものもあれば、柔軟で無秩序なものもある。RNA分子も同じように、遺伝子のコーディング、デコーディング、調節、発現を助けたり、いろんな構造を形成したりする。特にG-クワドリプレックスっていう特別な形を取るRNAもあって、これは多くの細胞機能にとって重要なんだ。

細胞が酸化ストレスや浸透圧ストレスなどのストレスに直面すると、翻訳プロセスが崩れることがある。これがストレス顆粒の形成につながり、未使用のRNAやタンパク質を隔離して状況を管理する助けになるんだ。

ストレス顆粒とその機能

ストレス顆粒は、細胞がストレスを受けているときに形成される。未使用のmRNAやタンパク質を集めて、細胞を損傷から守る役割があるんだ。また、遺伝子発現の調節にも関与している。G3BP1みたいなタンパク質は、これらの顆粒を形成するのに重要な役割を果たしているよ。細胞がストレスを受けると、G3BP1が形を変えてmRNAに結合し、他の成分を集めてストレス顆粒を作るのを手助けするんだ。

特定のタンパク質、例えばキャプリン-1やTIA1の存在も、G3BP1の挙動に影響を与えて、顆粒の組み立てをさらに助けるんだ。

ストレス顆粒のG-クワドリプレックス

G-クワドリプレックスは、グアニンが豊富なRNA配列から形成される特別な構造なんだ。これらの構造は、G3BP1を含む特定のタンパク質によって認識され、mRNAをストレス顆粒に取り込む助けをする。ストレスがなくなるとストレス顆粒が解散することができるので、mRNAはすぐに翻訳のために放出され、細胞機能を維持できるんだ。

G-クワドリプレックスは進化の過程で見られ、特に真核生物に関連している。遺伝子調節、転写、DNA複製やテロメアの維持といったさまざまなプロセスに関与しているんだ。

SERF2タンパク質

SERF2は、小さなタンパク質で、アミロイドの生成に関連付けられている。アミロイドは有害なタンパク質の塊で、加齢に関連する病気と結びついているんだ。でも、健康な細胞におけるSERF2の主な機能はまだ完全には理解されていないんだ。特定のアミノ酸が豊富で、特にG-クワドリプレックスと相互作用することが見つかっている。

SERF2は主に核小体に存在していて、細胞がストレスを受けているときにストレス顆粒に見られる。ストレス時にはSERF2がクラスターを形成し、ストレス顆粒に関連する他のタンパク質と共に局所化することで、これらの区画を形成する役割を示唆しているんだ。

ストレス顆粒におけるSERF2の調査

SERF2の役割を理解するために、研究者たちはストレスを受けている細胞のSERF2のレベルを下げる方法を使った。そうしたら、ストレス顆粒の形成がかなり減少したんだ。SERF2がノックダウンされると、ストレス顆粒が少なく見られたので、SERF2がその組み立てに重要だってことが示唆されたよ。

さらに実験では、SERF2が存在すると、ストレス顆粒はより効果的に形成され、流体のような性質を保っていて、乱された後でもすぐに回復できることがわかったんだ。

SERF2とG-クワドリプレックス

研究によると、SERF2はG-クワドリプレックスに強く結合するんだ。この相互作用は、ストレス顆粒をG-クワドリプレックスRNAで豊かにするSERF2の役割をサポートしているよ。SERF2とG-クワドリプレックスが一緒になると、お互いに流体のような液滴を形成するのを助けられるんだ。

特定のアッセイを使って、研究者はSERF2がG-クワドリプレックスを形成することが知られているRNA配列に選択的に結合することを見つけた。この結合能力は、SERF2がストレス顆粒内でrG4配列を濃縮するのを助け、形成と安定性を強化することを意味しているよ。

細胞における相分離

相分離は、細胞内に異なる区画を形成する現象なんだ。無秩序な領域を持つタンパク質がこのプロセスで重要な役割を果たす。SERF2のようなタンパク質がRNA、特にrG4と相互作用すると、液体のような区画を作り、成分が自由に混ざり合ったり分散したりできるんだ。

混雑因子の存在によって、この相分離がさらに影響を受けることがあって、タンパク質やRNAが濃縮されて特定の液滴を形成しやすくなる。SERF2はrG4と一緒に、混雑条件下でin vitroで相分離できることが示されていて、細胞でどのように起こるかのモデルを示しているよ。

SERF2-RNA濃縮体の動態と安定性

G-クワドリプレックスが存在する場合のSERF2の動態を調査した結果、彼らの相互作用は静的ではなくて、変動することで可逆的な液滴を形成することがわかったんだ。

混雑した細胞環境を模した実験では、SERF2とG-クワドリプレックスが安定した液滴を形成する様子が観察された。これらの液滴は他の種類の濃縮体と比べて拡散速度が遅く、相互作用によって影響を受けたより複雑な構造を示しているよ。

SERF2とG-クワドリプレックス相互作用の構造的洞察

NMRや分子動力学シミュレーションのような技術を使って、研究者たちはSERF2とG-クワドリプレックスの詳細な相互作用を理解し始めているんだ。これらの研究は、SERF2がG-クワドリプレックスに特定の帯電残基を介して結合し、明確な構造的インターフェースを形成することを示しているよ。SERF2の結合は、G-クワドリプレックスの構造にわずかな歪みを引き起こすこともあって、両者の間のダイナミックな関係を示唆しているんだ。

構造研究は、これらのタンパク質とRNAが結合した後、より大きな液体構造を形成するのを支える相互作用のネットワークを作り出すことを明らかにしているよ。

SERF2機能における変異の影響

SERF2の機能に関する理解は、変異研究を通じて少しずつ深まってきたよ。SERF2タンパク質の特定の重要な残基を変えることで、研究者たちはこれらの変化がG-クワドリプレックスに結合する能力や相分離に参加する能力にどのように影響するかを観察できるんだ。

重要な残基を取り除いたり変えたりすると、G-クワドリプレックスへの結合が弱まり、液滴を形成する能力が妨げられることが多い。これらの研究は、SERF2がRNAと相互作用し、ストレス顆粒の形成に影響を与えるための特定の領域の重要性を強調しているよ。

結論

SERF2とG-クワドリプレックスの相互作用に関する研究は、細胞における液-液相分離の理解に大きく貢献しているんだ。この研究は、ストレス顆粒の形成のメカニズムや、タンパク質やRNAが細胞の組織の中で果たす重要な役割に光を当てているよ。

科学者たちがこれらのメカニズムの複雑さを探求し続ける中で、さらなる洞察が生まれ、細胞がストレスを管理し、常に変化する環境の中で機能を維持する方法をよりよく理解できるようになることが期待されているんだ。これらの区画における凝集と流動性のバランスは、細胞の健康にとって重要で、この領域での継続的な研究の重要性を強調しているよ。

SERF2とG-クワドリプレックスの相互作用に関する発見は、タンパク質の凝集や誤折りたたみに関連する病気のメカニズムを理解する新たな道を開くかもしれなくて、治療戦略において革新的なアプローチにつながる可能性があるんだ。

オリジナルソース

タイトル: Visualizing liquid-liquid phase transitions

概要: Liquid-liquid phase condensation governs a wide range of protein-protein and protein-RNA interactions in vivo and drives the formation of membrane-less compartments such as the nucleolus and stress granules. We have a broad overview of the importance of multivalency and protein disorder in driving liquid-liquid phase transitions. However, the large and complex nature of key proteins and RNA components involved in forming condensates such as stress granules has inhibited a detailed understanding of how condensates form and the structural interactions that take place within them. In this work, we focused on the small human SERF2 protein. We show here that SERF2 contributes to the formation of stress granules. We also show that SERF2 specifically interacts with non-canonical tetrahelical RNA structures called G-quadruplexes, structures which have previously been linked to stress granule formation. The excellent biophysical amenability of both SERF2 and RNA G4 quadruplexes has allowed us to obtain a high-resolution visualization of the multivalent protein-RNA interactions involved in liquid-liquid phase transitions. Our visualization has enabled us to characterize the role that protein disorder plays in these transitions, identify the specific contacts involved, and describe how these interactions impact the structural dynamics of the components involved in liquid-liquid phase transitions, thus enabling a detailed understanding of the structural transitions involved in early stages of ribonucleoprotein condensate formation.

著者: James CA Bardwell, B. R. Sahoo, X. Deng, E. L. Wong, N. Clark, H. Yang, V. Subramanian, B. B. Guzman, S. E. Harris, B. Dehury, E. Miyashita, J. D. Hoff, V. Kocman, H. Saito, D. Dominguez, J. Plavec

最終更新: 2024-10-28 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.10.09.561572

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.10.09.561572.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

著者たちからもっと読む

類似の記事