E. coli O157:H7: 牛に関連する感染のバイ菌
研究によると、地域の牛の数がE. coli O157:H7の感染に大きな影響を与えているらしい。
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目次
E. coli O157:H7っていうバイ菌は、人間に深刻な病気を引き起こすことがあるんだ。こいつは主に牛とか他の農場の動物に多く見られるよ。カナダのアルバータ州、スコットランド、アイルランド、アルゼンチンみたいな地域では、このバイ菌による感染がすごく多いんだ。これらの地域は農場の動物、特に牛がいっぱいの場所だから、このバイ菌の主な元になってるんだ。でも、同じくらい牛がいる場所でも、E. coli O157:H7の感染があまり多くないところもあって、その違いの理由はよくわかってないんだ。
E. coli O157:H7の広がり方
E. coli O157:H7は色んな方法で広がることがある。人が汚染された食べ物を食べたり、安全でない水を飲んだり、感染した動物に直接触れたりすると感染しちゃうことがある。こいつを持ってる主な動物は牛、羊、山羊だよ。時々、鹿や豚も感染の原因になってることがあるけど、牛に比べるとどれくらい重要なのかははっきりしてないんだ。
たまに、このバイ菌が人から人に移ることもあるけど、そんなに頻繁には起こらないよ。研究によると、E. coli O157:H7のケースの約15%は人から人への感染かもしれないけど、それだけじゃ人間の間で長い間留まることはないんだ。
E. coli O157:H7感染における牛の役割
牛の近くに住んでると、E. coli O157:H7に感染する確率が高くなるってことがわかってるよ。これは、地元の牛の人口がこのバイ菌が人に広がる重要な要因なんじゃないかって示唆してるんだ。牛と人間の感染の関係をもっと理解するために、研究者たちは、感染が特に多いアルバータ州でのE. coli O157:H7の動きを調べたんだ。
研究の概要
アルバータでの研究は、牛と人間のE. coli O157:H7による感染の関係を理解することを目指してたよ。研究者たちは2007年から2015年の間に病気になった牛と人間からのバイ菌を分析したんだ。この期間中に保健当局に報告された牛からの123のサンプルと人間からの123のサンプルに焦点を当てたんだ。
さらに、研究者たちは2009年から2019年の間にアルバータで集められた追加のバイ菌サンプルや、アメリカや他の国からのサンプルも含めたんだ。異なるソースからのバイ菌がどれくらい関連しているかを遺伝子検査で調べたよ。
研究者たちがバイ菌を分析した方法
研究者たちは、牛と人間からのバイ菌のDNAを先進的な技術でシーケンスして、遺伝子情報の詳細を見たんだ。これによって、どのバイ菌が近い関連があって、牛から人間にどう広がったかがわかったんだ。多くの人間の感染が、地元の牛から来た特定の株に関連していることが明らかになったんだ。
地元の系統についての発見
研究では、多くの人間の感染が「ローカル持続系統」と呼ばれるバイ菌のグループに関連していることがわかったよ。これらは、地元でしばらく存在していて、引き続き病気を引き起こすバイ菌なんだ。アルバータでは、44件の人間のケースがこれらの系統に関連していて、E. coli O157:H7の感染が続いていることが反映されたんだ。
研究の間に、常に感染を引き起こす株がいくつかあったよ。実際、研究では11の系統が特定されて、たくさんの病気のケースの原因になってたんだ。これらのほとんどは直接牛に関連していて、牛の感染を抑えることで人間のケースを減らせるかもしれないってことが示唆されてるんだ。
時間経過によるバイ菌株の変化
研究が進むにつれて、病気を引き起こす株がもっと危険になっていることに研究者たちは気づいたんだ。後の年には、特定の毒素遺伝子stx2aを持つ新しい株が増えてきたよ。この株は、腎不全を含む重篤な病気と関連しているんだ。この危険な株の増加は公共の健康にとって心配で、感染の監視を強化する必要があることを示してるんだ。
地元の源の重要性
研究は、アルバータでのE. coli O157:H7のケースのほとんどが他の地域から来たバイ菌によるものじゃないってことも強調してるよ。輸入されたバイ菌に遡れるのはごく少数のケースだけなんだ。つまり、地元の農業システムがバイ菌の広がりに大きな役割を果たしていて、この地元のシステムを理解することが今後のアウトブレイクを防ぐために重要なんだ。
結論
E. coli O157:H7は、農場の動物、特に牛が多い地域では本当に脅威なんだ。アルバータでは、多くの感染が地元の牛の群れに関連してるよ。研究は、ほとんどの人間の感染が他の地域から輸入されたのではなく、地元で進化したバイ菌から来てることを示してるんだ。これは、公共の健康を守るために牛の感染をコントロールする必要性を指し示してるよ。
もっと多くの人が牛と人間の感染のつながりを意識するようになれば、病気にかかるリスクを最小限に抑える戦略を開発するチャンスが増えるよ。バイ菌の地元の源に焦点を当てることによって、コミュニティはE. coli O157:H7の感染を減らして食の安全を確保するために取り組むことができるんだ。
要するに、牛とE. coli O157:H7の関係を理解することはめっちゃ重要だよ。注意深い研究と監視を通じて、この危険なバイ菌から自分たちやコミュニティを守ることができるんだ。
タイトル: Persistent cross-species transmission systems dominate Shiga toxin-producing Escherichia coli O157:H7 epidemiology in a high incidence region: a genomic epidemiology study
概要: BackgroundSeveral areas of the world suffer notably high incidence of Shiga toxin-producing Escherichia coli, among them Alberta, Canada. We assessed the impact of persistent cross-species transmission systems on the epidemiology of E. coli O157:H7 in Alberta. MethodsWe sequenced and assembled 229 E. coli O157:H7 isolates originating from collocated cattle (n=108) and human (n=121) populations from 2007-2015 in Alberta. We constructed a timed phylogeny using BEAST2 using a structured coalescent model. We then extended the tree with human isolates through 2019 (n=430) to assess the long-term disease impact of locally persistent lineages. Shiga toxin gene (stx) profile was determined for all isolates. ResultsDuring 2007 to 2015, we estimated 108 (95% HPD 104, 112) human lineages arose from cattle lineages, and 14 (95% HPD 5, 23) from other human lineages; i.e., 88.5% of human lineages arose from cattle lineages. We identified 11 persistent lineages local to Alberta, which were associated with 38.0% (95% CI 29.3%, 47.3%) of human isolates. Of 117 isolates in locally persistent lineages, 6.0% carried only the Shiga toxin gene stx2a and the rest both stx1a and stx2a. During the later period, six locally persistent lineages continued to be associated with human illness, including 74.7% (95% CI 68.3%, 80.3%) of reported cases in 2018 and 2019. The stx profile of isolates in locally persistent lineages shifted from the earlier period, with 51.2% encoding only stx2a. ConclusionsOur study identified multiple locally evolving lineages transmitted between cattle and humans persistently associated with E. coli O157:H7 illnesses for up to 13 years. Of concern, there was a dramatic shift in locally persistent lineages toward strains with the more virulent stx2a-only profile. Locally persistent lineages may be a principal cause of the high incidence of E. coli O157:H7 in locations such as Alberta and offer opportunities for understanding the disease ecology supporting E. coli O157:H7 persistence, as well as for local prevention efforts.
著者: Gillian A.M. Tarr, L. Chui, K. Stanford, E. W. Bumunang, R. Zaheer, V. Li, S. Freedman, C. R. Laing, T. A. McAllister
最終更新: 2024-11-01 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.05.588308
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.05.588308.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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