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# 生物学# 生態学

オーストラリアの淡水生態系で野生動物をモニタリングする

eDNAの方法は、オーストラリアの淡水環境の健康を追跡するのに有望だね。

Brock Adam Hedges, Perry G Beasley-Hall, Tina E Berry, Kathryn L Dawkins, Andrew D Austin, Philip Weinstein, Michelle T Guzik

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オーストラリアの淡水野生動オーストラリアの淡水野生動物を守る取り組みを強化する。eDNAの方法は、重要な生態系を保護する
目次

淡水の生息地、川や湖みたいなところが、世界中で深刻な問題に直面してるんだ。特に、すでに乾燥してる地域では、ますます健康を失ってる。人間が汚染や土地利用の変化、気候変動の影響で大きなダメージを与えてるから。新鮮な水が既に見つけにくい場所では、これらの環境が変化に更に敏感になってる。これらの地域の小さな水たまりは、雨に依存してるから、時々干上がっちゃうこともあるんだ。

いくつかの地域は回復したり損失が遅れたりするかもしれないけど、問題を解決するには、地域コミュニティから世界中の国々まで、たくさんの人が協力する必要がある。これらの生息地に依存してる植物や動物の様子を観察することが重要で、より良い助け方を考えられるようにしないとね。

オーストラリアの干ばつとその影響

オーストラリアでは、干ばつが気候変動のせいでより一般的で深刻になってきてるんだ。どれだけ汚染があっても、状況は悪化する見込みだし。淡水の生息地は特に影響を受けるのは、温度や水位に依存してるから。オーストラリアの乾燥地域では、野生動物をモニタリングするプログラムがかなり少なくて、消えていく動物たちについてのデータもほとんどないんだ。

これらの遠くの地域にアクセスするのは難しいし、モニタリングのための資金も不足してることが多い。だからこそ、新しいコスト効果の高いツールが必要で、淡水の生態系の健康を評価したり、これらの重要な資源に依存する野生動物のデータを集めたりするのに役立つんだ。

オーストラリアのユニークな野生動物についての懸念

オーストラリアには多くのユニークな動物がいて、その安全が深刻な懸念になってる。ヨーロッパの植民地化以来、国は在来の哺乳類の絶滅危機に直面していて、過去200年で10%を超える種が失われてる。1500年以降の哺乳類の絶滅の3分の1がここで起きてるんだ。小型哺乳類の消失は、特に乾燥地域に特有の動物群を縮小させてる。その損失の大半は、0.035から5.5kgの中型動物から来てる。

この哺乳類の減少は、土壌の撹拌や有害生物の自然な制御を担当する動物たちが提供する重要なサービスにも影響を与えてる。鳥類も良くなくて、植民地化以来いくつかの絶滅が記録されていて、今後20年でさらに増えると予想されてる。爬虫類も危機的なんだけど、データが不足してるから状況があまり分からない。絶滅のケースが次の世紀に増えるんじゃないかと心配されてる。

外来種とその役割

オーストラリアでは、野良猫やキツネなどの外来の捕食者が小型哺乳類の減少の原因としてしばしば責められてる。他にも、環境の変化や病気が問題を引き起こしてるし、そして生息地や気候の変化が鳥や爬虫類にも影響を与えてる。野生動物を保護するための世界的な取り組みだけじゃ足りなくて、オーストラリアではいくつか成功したプロジェクトもあるよ。たとえば、囲いを作ったエリアは特定の地域で絶滅危惧種の生存率を高めるのに役立ってる。

研究者たちは、気候変動が影響を与え続ける中で、在来種と外来種の両方の哺乳類の個体数の変化を理解しようとしてる。現在、モニタリングの取り組みはしばしば個別の種に集中していて、全体のコミュニティに関する理解にギャップが残ってる。

野生動物のモニタリングの課題

野生動物をモニタリングするのは難しいことがある。使用する方法は偏りがあったり、一貫性がなかったりすることが多いんだ。異なる生息地で使える標準化された技術が必要だね。期待されてる解決策の一つは、環境DNA(EDNA)メタバーニングっていう方法なんだ。この方法では、科学者たちは水のサンプルを分析して、そこから複数の動物種を検出することができるよ。

簡単に言うと、eDNAは動物が水の中に残した指紋みたいなもんなんだ。この技術を使えば、あるエリアに住んでるさまざまな動物種を特定できて、生態系の健康状態を明確に把握できるんだ。特に淡水環境でよく機能して、エコシステムを脅かす外来種を見つけるのに役立つ。

今までの多くの研究は魚、両生類、小さな無脊椎動物に焦点を当ててきたけど、eDNAは水を訪れる大きな動物からの信号もキャッチできるんだ。いくつかの研究では、eDNAが従来の野生動物調査、カメラや直接観察に頼ることが多い調査よりも多くの種を検出できることが示されてる。

ヒルタバ自然保護区での研究

eDNAが野生動物のモニタリングにどれだけ効果的かを見るために、研究者たちは南オーストラリアの特別な場所、ヒルタバ自然保護区に注目したんだ。この場所は、新鮮な雨水を集める独特な花崗岩の岩穴で知られてる。これらの岩穴は多くの動物にとって重要で、特に乾燥した気候の中で必要不可欠なんだ。研究は、eDNAが従来のカメラトラップ(動物が訪れる場所を撮影するカメラを使う方法)と比べて、脊椎動物の来訪者をどれだけうまく検出できるかを調べることを目的としたんだ。

研究者たちは4つの主な目標を持ってた:

  1. eDNAが岩穴を訪れる在来種と外来種をどれだけ特定できるか試すこと。
  2. 従来のカメラトラップとeDNAの効果を比較すること。
  3. 異なる種の存在が時間と空間によってどう変わるかを調べること。
  4. これらの重要な淡水生息地の管理と保護についてアドバイスを提供すること。

研究サイトの説明

ヒルタバ自然保護区は大きなエリアに広がっていて、2012年から保護のために管理されてる。花崗岩の丘と森林や草地のパッチが特徴だ。ここには他の場所では減少してる多くの植物や動物がいて、研究にとって重要な場所なんだ。

ヒルタバの管理チームは非在来動物の数を減らし、在来種を保護するなど、生物多様性を向上させるためのプログラムをいくつか実施してる。だから、研究者たちはこの生態的に重要な場所を研究のために選んだんだ。

eDNAサンプリングの実施

研究者たちは2020年の数ヶ月間、岩穴に行って水のサンプルを集めた。さまざまな場所から水を集めて、異なる生息地の良いミックスを確保したよ。サンプルを集めるときは、汚染を防ぐために特別な注意を払ったんだ。

サンプルを集めた後、チームは特定の実験室の方法を使用してeDNAを分析した。これには、サンプルの中の異なる種を特定できるようにするためのいくつかの手順が含まれてた。

eDNA分析の結果

eDNAサンプルの分析では、多くのユニークな脊椎動物種が明らかになった、哺乳類、鳥類、爬虫類、両生類が含まれてた。研究者たちは、eDNAがカメラトラップで検出された種の半分以上を特定できたことを発見したんだ。従来の方法では特定されなかった新しい種の記録も発見したよ。

興味深いことに、多くの哺乳類は両方の方法で簡単に検出できたけど、鳥類と爬虫類の間ではeDNAとカメラトラップの一致度は同じではなかったんだ。つまり、いくつかの鳥や爬虫類の種は、従来の方法や両方のアプローチの組み合わせで監視する方がうまくいくかもしれない。

種の検出におけるコミュニティの変動

研究者たちは、動物コミュニティが時間とともにどう変化するかも調べた。異なる月に岩穴を訪れる種のタイプが変わることに気付いたんだ。たとえば、冬のコミュニティは夏のものよりも似てることが多かった。新鮮な水の利用可能性がどの動物が現れるかに影響を与えて、時間が経つにつれて在来種がこれらの資源により依存するようになってった。

異なる岩穴は動物の異なるグループを引き寄せることが多く、高さやアクセスのしやすさのような要因が影響してるんだ。動物たちは、到達しにくい高い岩穴を避けるかもしれない。この変動性は、モニタリングの取り組みにおける場所や生息地の特徴の重要性を際立たせてる。

外来種への対処が重要な理由

研究は、外来種がeDNAサンプルに頻繁に見られたという懸念すべき傾向も指摘した。これは、こうした動物が岩穴にある新鮮な水を利用していることを示してる。彼らの存在は、これらの資源に依存する在来種に悪影響を与えるかもしれない。

在来動物のための結果を改善するためには、外来種が岩穴にアクセスするのを管理することが不可欠だよ。彼らの水資源の利用を制限することで、バランスを回復させ、在来野生生物を支えることができるんだ。

eDNAのモニタリングツールとしての価値

全体的に、この研究はeDNAが淡水生息地のモニタリングや脊椎動物の訪問者を検出するのに良いツールであることを確認した。従来の方法に比べて良好に機能し、野生動物を評価するためのコスト効果の高い効率的な方法を提供してる。サンプルを集めるのは簡単だから、さまざまな利害関係者が保護活動に参加するのが可能なんだ。

しかし、課題も残っていて、良い種の識別のための高品質なリファレンスライブラリを確保することが必要だね。eDNA方法の効果を高めて、これらの重要な生態系の生物多様性をモニタリングする方法を改善するために、もっと研究が必要なんだ。

研究の将来の方向性

これから、研究者たちはeDNAが異なる環境でどう使えるかを探り続ける予定で、特にオーストラリアの乾燥地域での利用を進めていくつもりだよ。彼らは、発見をよりサポートするためにリファレンスデータベースの質を向上させようと目指してる。eDNAの結果を従来のモニタリング手法と組み合わせることで、地域の野生動物の個体数についてより良い理解が得られるかもしれない。

さまざまな種の生物学や行動について学びが進むにつれて、eDNA技術は精度を高めるために洗練されることができる。これらのギャップに対処することが、オーストラリアのユニークな野生動物の保護と淡水生態系の健康を支えるのに役立つんだ。

結論

要するに、淡水生態系は危険にさらされてるけど、eDNAのようなモニタリング手法がこれらの重要なエリアの理解と保護への希望を提供してる。在来種と外来種の両方を特定することで、研究者たちは生態系全体に利益をもたらす管理戦略を考える手助けができるよ。科学者たちとコミュニティが協力すれば、より大きな保護活動を推進し、オーストラリアのユニークな野生動物の未来を改善することができるんだ。

オリジナルソース

タイトル: Environmental DNA and wildlife camera traps uncover complimentary vertebrate visitation patterns at freshwater granite rock-holes

概要: Freshwater ecosystems are in decline globally. In Australia, threatening processes include invasive species, increasing drought frequency, climate change and changes to land use, all of which have been associated with declining vertebrate diversity, particularly in Australias arid interior. Efficient monitoring tools are required to effectively monitor and conserve freshwater ecosystems and their associated vertebrate communities. Environmental DNA (eDNA) metabarcoding is one tool that shows promise for monitoring these systems, but knowledge of how eDNA data compares to more established ecological assessment techniques is limited. To address this knowledge gap, we sampled vertebrate eDNA from seven freshwater water bodies of proposed conservation importance in the Australian arid-lands, at three timepoints to measure visitation and compare our findings to camera trapping data at the same locations. Using eDNA we detected 19 species of vertebrates, including native species (such as macropods, wombats and emus) and invasive species (such as feral goats, cats and foxes). In contrast, camera traps detected 32 species, and was much more successful at detecting bird visitation than eDNA. These communities varied both spatially between rock-holes, and temporally, with summer collection periods being distinct from winter-spring. Our results demonstrate the success of eDNA metabarcoding as a tool for monitoring vertebrate visitation to arid-lands freshwater ecosystems that is complementary to more traditional survey methods such as wildlife camera trapping. Finally, we provide conservation recommendations for these vertebrate communities and discuss the efficacy of eDNA for monitoring freshwater resources in arid-lands environments.

著者: Brock Adam Hedges, Perry G Beasley-Hall, Tina E Berry, Kathryn L Dawkins, Andrew D Austin, Philip Weinstein, Michelle T Guzik

最終更新: 2024-11-03 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.31.621266

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.31.621266.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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