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# 健康科学# 遺伝学・ゲノム医学

慢性腎疾患の理解とその影響

CKDの進行と早期発見方法に関する研究。

pablo Meyer, S. Rabinovici-Cohen, D. E. Platt, T. Iwamori, I. Guez, S. DEY, A. BOSE, M. KUDO, L. Cosmai, C. Porta, A. Koseki

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CKD: 静かな殺人者CKD: 静かな殺人者慢性腎疾患の初期兆候と進行を特定すること
目次

慢性腎疾患(CKD)は、世界中で多くの人に影響を与えてるんだ。実際、約8億人、つまり世界人口の10%がこの病気にかかってる。アメリカだけでも約3700万人がCKDを抱えてるみたい。これは死因のトップに入るけど、多くの人は自分がかかってることに気づいてないんだ。CKDのある大人の約90%、重度のCKDの人の40%が、病気に気づいていないんだって。

CKDは主に腎臓の機能がどれだけ良いかで定義される。病気はしばしばいくつかの段階を経て進行して、軽度の腎障害から最終段階の腎不全(ESRD)へ進むこともある。ESRDになると、透析や腎移植が必要になるんだ。

CKDはよくある病気だけど、見過ごされがち。腎臓の健康をモニタリングする方法や、早期の腎障害のサインを見つける必要があるんだ。CKDのリスクファクターや進行の理由は完全には理解されていないけど、2型糖尿病、高血圧、心不全などはいくつかの条件がCKDと関連していることがわかってる。ほとんどの研究はCKDの後期段階に焦点を当てていて、早期段階からの病気の進行を遅らせる方法に関する理解が欠けてるんだ。

これを変えるためには、腎機能の低下を早期に検出することが重要なんだ。それがCKDを悪化させる他の健康問題を特定する助けになり、病気の管理をより良くすることができる。

かなりの腎障害は、すぐには目に見える効果を生まないことが多い。残っている健康なネフロン(腎臓の機能単位)が他のネフロンの喪失を補うことができるからで、特に年を取るにつれてそうなることがある。残念ながら、この補償は時間とともにさらなるネフロンの喪失を引き起こすことになるんだ。画像診断技術は腎臓の変化を検出するのに役立つけど、これらの方法が安全で実用的になるような進展が必要なんだ。特定の画像診断法は腎臓の大きさを測定できて、これもCKDの進行の重要な指標なんだ。

現在のCKDの定義は、主にクレアチニン値を通じて腎機能を推定する血液検査を使用してる。この検査は、かなりの損傷が起きた後でしか問題を見逃さないから、早期の腎問題のサインを見逃すことがある。最近、遺伝子研究では、遺伝子が腎疾患にどのように寄与するかを探求していて、CKDに関連するいくつかの一般的な遺伝的変異が見つかってる。これらの研究では、さまざまな集団においてCKDに影響を与える遺伝的因子の約20%が特定されたんだ。

私たちの研究では、CKDがESRDに進行する予測をしようとした。人口調査、健康記録、遺伝子分析、全身MRI画像からの情報を収集して、50万人の参加者からの大規模データベースを使ったんだ。多くの研究が人工知能を使ってCKDを検出しようとしたけど、早期段階からの進行を予測することに焦点を当てたものは少なかった。

私たちは、CKDの進行に影響を与える要因が、遺伝子データと臨床データ、画像データを組み合わせることで見つかるかどうかを調べようとした。これにより、早期の治療計画を立てたり、より集中したモニタリングが必要な患者を特定したりする助けになるかもしれない。私たちのアプローチでは、CKDの進行に関与する可能性のある遺伝子のセットが示されて、特にMRI分析から抽出された画像特徴と関連しているんだ。

CKDは今、少なくとも3ヶ月続く腎構造または機能の異常として定義されてる。CKDの重症度を分類するために、腎機能(GFRで測定)や尿中のタンパク質のレベルなど、さまざまな要因が使われてる。ただし、腎機能の評価は、通常の加齢に伴う変化や個々の状況による違いのために難しいことがあるんだ。これが、実際には必要ない人に不必要な治療を行うことにつながることがある。だから、CKDとそのESRDへの進行を予測するためのより良い方法を開発することは、医療システムにとって医療的にも経済的にも大きな利益となる可能性があるんだ。

私たちの研究では、CKDの患者49,744人を調べた結果、これらの患者の平均年齢は約67歳だった。私たちは、ゲノムデータとMRIデータがある2,151人の患者に焦点を当てた。目標は、これらの初期段階のCKD患者が5年以内にESRDに進行するかどうかを予測することだった。この5年の期間の開始は、最初のMRIスキャンが行われた日付として定義したんだ。

この結果を予測するためのモデルを開発するために、ロジスティック回帰、ランダムフォレスト、XGBoostの3つの方法を使った。人口データ、臨床データコード、MRIデータ、ゲノムデータからの特徴を分析した結果、年齢と性別が結果を中程度の精度で予測できることが分かって、MRIからの放射線的特徴が最も良い予測を提供した。すべての方法を1つのモデルに統合することで、最高の精度が得られたんだ。

興味深いことに、私たちが集めた遺伝子データは、病気の進行予測をあまり改善しなかった。予測をより良く説明するために、どの特徴が予測に影響を与えているかを強調する技術を使った。分析の結果、モデルは腎臓と心臓に重点を置いていて、重要な特徴には患者の年齢と性別、特定の画像特性が含まれていたんだ。

私たちの発見は、小さい腎臓のサイズと低い画像変動性がESRDへの進行の重要な予測因子であることを示した。また、CKDに関連する遺伝子も発見し、病気のメカニズムに対する洞察を提供するかもしれない。

私たちの研究はCKD進行の予測に関連する重要な要因を特定することには成功したけど、利用可能な画像データを持つ患者の数が比較的小さく、遺伝子分析が制限されたんだ。これを解決するために、より大きなCKD集団を含めて分析を拡張した。この拡張により、MRIデータがなくても臨床データを持つ患者に基づいてさらなる遺伝的関連研究を行うことができたんだ。

これらの研究から、心臓に関連する問題もCKDの重要なリスク要因であることがわかった。追加の分析では、他の健康状態とCKDおよび心疾患に関連する遺伝的要因との関連が見つかった。特に、ミトコンドリアに関連する細胞機能に関与するいくつかの遺伝子が私たちの分析で頻繁に見つかったのが注目すべき点で、これがCKDの重症度にどのように関連しているかを示しているかもしれない。

最終的に、私たちの研究は、CKDの早期発見とESRDへの進行をより良く予測する方法の必要性を強調した。遺伝子や画像特徴を含む多様なデータタイプを使用することで、タイムリーな介入やより個別化された治療戦略に役立つモデルを達成したんだ。この結果は、腎不全への病気の進行を遅らせるための新しい治療ターゲットとしての特定の遺伝子を指し示している。

要するに、CKDは何百万もの人々に影響を与える深刻な世界的健康問題なんだ。早期発見と病気の進行の理解が改善されれば、より良い患者の結果につながり、医療システムへの負担を減らすことができる。私たちの研究を通じて、腎疾患との戦いにおける臨床実践の向上と進展への道を切り開くことを願ってるんだ。

オリジナルソース

タイトル: Multimodal predictions of end stage chronic kidney disease from asymptomatic individuals for discovery of genomic biomarkers

概要: Chronic kidney disease (CKD) is a complex condition where the kidneys are damaged and progressively lose their ability to filter blood, 10% of the world population have the disease that often goes undetected until it is too late for intervention. Using the UK Biobank (UKBB) we constructed a CKD cohort of patients (n=46,986) with genomic, clinical and demographic data available, a subset (n=2,151) having also whole body Magnetic Resonance Imaging (MRI) scans. We used this multimodal cohort to successfully predict, from initially healthy patients, their 5-year outcomes for End-Stage Renal Disease (ESRD, n=210, AUC=0.804 {+/-} 0.03 with 5 fold cross-validation) and the larger cohort for validation to predict time-to ESRD and perform Genome-wide association studies (GWAS). Extracting important clinical, phenotypic and genetic features from the models, we were able to stratify the cohorts based on a novel set of significant previously unreported SNPs related to mitochondria/cell death, kidney development and function. In particular, we show that the risk allele of SNP rs1383063 present in 30% of the population irrespective of ancestry and putatively regulating MAGI-1, a gene expressed in the podocyte slit diaphragm, is a strong predictor of ESRD and stratifies male populations of older age.

著者: pablo Meyer, S. Rabinovici-Cohen, D. E. Platt, T. Iwamori, I. Guez, S. DEY, A. BOSE, M. KUDO, L. Cosmai, C. Porta, A. Koseki

最終更新: 2024-10-16 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.10.15.24315251

ソースPDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.10.15.24315251.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた medrxiv に感謝します。

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