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# 生物学 # 微生物学

ストレプトマイセス:適応して繁栄するバイ菌

ストレプトマイセスが栄養が限られた環境にどう適応するか、そしてそれが抗生物質の生産にどう影響するかを探ってみて。

Linda Sandblad, N. Soderholm, H. Tanner

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ストレプトマイセスの生存戦 ストレプトマイセスの生存戦 適応して抗生物質を作るよ。 ストレプトマイセスは栄養が足りないときに
目次

ストレプトマイセスは土壌で重要なバクテリアのグループだよ。彼らは独特な分岐構造を持ってて、環境中のさまざまな物質を分解するのを助けるんだ。この生物たちは、病気と戦うための役立つ化学物質をいろいろ生産することで知られていて、医学でもよく使われるんだ。成長するとき、彼らは小さい胞子から始まって、徐々に大きな細胞のネットワークに成長する。栄養が少なくなるといった条件が変わると、ストレプトマイセスは見た目や振る舞いを変えることができるんだ。

ストレプトマイセスのライフサイクル

ストレプトマイセスは胞子から発芽することでライフサイクルを始める。次に成長があって、糸状の構造である菌糸を作り出して、これが絡み合ってマイセリウムって呼ばれるネットワークを形成する。環境が整うと、特別な構造である空中菌糸と胞子を生成し始めて、これが重要な化学物質である二次代謝物の生産と重なることが多い。この変化は、成長と発達のプロセスを制御する特定の遺伝子によって駆動されるんだ。

栄養条件とその影響

ストレプトマイセスに関する研究のほとんどは栄養が豊富な培地を使って行われてきたけど、栄養が乏しい環境での彼らのパフォーマンスについてはあんまり知られていないんだ。ストレプトマイセス・コエリカラーのゲノムの研究では、条件が限られているときにさまざまな栄養源に適応して利用する驚くべき能力があることが示されてる。特定の条件が重要な化学物質の生産を促進することが観察されてるけど、栄養不足の条件が成長と発達にどのように影響するかについてはもっと研究が必要だね。

探索型表現型

最近の研究では、栄養が乏しい培地でS.コエリカラーを育てるとユニークな成長パターンが観察されたよ。このパターンは「探索成長」と呼ばれ、栄養が枯渇したときに起こるんだ。探索型表現型は、これらのバクテリアが周囲の資源を探るために成長の形を変えることができることを示してる。この行動は、特定の発達遺伝子がオフになっている株でも観察されたから、探索の能力はストレプトマイセスにとって基本的な特性なんだ。

栄養枯渇の役割

S.コエリカラーが栄養の制限に直面すると、形態を変え始めて探索成長へと至るんだ。これは特に0.5x TSA培地で顕著で、数週間後にコロニーの周りに薄くてベールのような成長領域が見られた。この変化は、栄養が少ないときには早く起こったんだよ。環境中のさまざまな代謝物は濃度の異なる傾向を示していて、特定の物質が消費されたり、他の物質が周囲に放出されたりしてるんだ。

限られた栄養源の影響

栄養が限られた炭素供給源でS.コエリカラーを育てた実験では、栄養が豊富な条件で見られる特徴と似たものを示したよ。グルコースを取り除いて、アガーだけを炭素源として提供したとき、バクテリアは探索成長が促進されたんだ。この成長形態は、グルコースや他の特定の栄養素を培地に戻すことで抑制できた。これらの結果は、S.コエリカラーが環境中の複雑な多糖類を利用できるけど、利用できるときはより単純な糖を好むことを示してる。

探索型S.コエリカラーの分泌物

S.コエリカラーの探索成長は、彼らが生産するタンパク質にも影響を与えたんだ。分泌されたタンパク質の研究では、輸送、代謝、信号調節などのさまざまな機能に関与しているタンパク質の範囲が示された。これらのタンパク質の多くは、栄養が豊富な条件で生産されたものとは異なっていて、S.コエリカラーが環境に適応していることを強調してる。特定のタンパク質の存在は、バクテリアが成長を支えるためにアガーを引き続き分解して利用していることを示唆してるよ。

進化の視点

研究によると、探索成長はS.コエリカラーだけの特性じゃなくて、他のストレプトマイセス種にも広がっている可能性があるんだ。さまざまな種をテストしたところ、似た条件下でこの探索行動を示すことができることがわかった。このことは、栄養枯渇に適応するための探索成長の能力が、これらのバクテリアにとって進化した特性である可能性が高いことを示唆してるよ。

メタボロームの変化

栄養が乏しい培地で育てると、S.コエリカラーは代謝物プロファイルに大きな変化を示したんだ。これには、抗菌化合物の生産が増加することが含まれていて、これはバクテリアをカビのような競争相手から守るのに役立つんだ。栄養が乏しい条件でS.コエリカラーを育てたとき、カビの成長を抑制する能力が認められて、これが自然環境での競争優位性を提供する成長行動だと考えられてる。

探索ストレプトマイセスの抗菌特性

栄養が乏しい条件下でのS.コエリカラーのユニークな成長形態は、彼ら自身の成長だけじゃなくて、他の生物の成長を抑制する能力にも影響を与えたんだ。テストしたストレプトマイセスの全系統がこの能力を示したわけじゃないけど、S.コエリカラーは探索型表現型で育てるときに顕著な抗菌効果を示したんだ。これが新しい抗生物質や他の生理活性化合物の発見に役立つ可能性を示唆してるよ。

結論

ストレプトマイセスは、環境に応じて行動を大きく変えることができる魅力的なバクテリアなんだ。栄養が限られているときに探索成長形態に切り替える能力は、彼らの生存を助けるだけじゃなくて、重要な生理活性化合物を生産する可能性を高めるんだ。これらの発見は、これらのバクテリアが自然な生息地でどのように繁栄し、競争することができるかを理解するために重要で、薬剤発見や微生物学に対しても示唆に富んだものだね。これらの生物がさまざまな条件でどのように振る舞うかを研究することの重要性を強調しているんだ。

オリジナルソース

タイトル: A nutrient-dependent foraging phenotype of S. coelicolor exhibits enhanced antimicrobial activity and is common across the genus

概要: Species of the genus Streptomyces are filamentous bacteria mainly residing in soils. The capacity of streptomycetes to adapt to various environments is reflected in the sheer size of their genomes and the number of encoded regulatory proteins. The nutrient-rich laboratory conditions significantly differ from the natural habitat of streptomycetes and fail to stimulate their full range of adaptive behaviors; as a result, the majority of biosynthetic gene clusters remain silent. Moreover, the use of rich media has led to the assumption that nutrient depletion ultimately promotes sporulation. However, we demonstrate that S. coelicolor colonies can respond to nutrient depletion by undergoing a previously unidentified phenotypic transition termed "foraging" due to its submerged and continuous growth on depleted media. The foraging phenotype is distinctly different from conventional phenotypes in terms of colony morphology, genomic stability, and metabolomic profile. This adaptation to nutrient deprivation through foraging is found throughout the Streptomyces phylogeny, indicating that the phenotype is highly conserved. Furthermore, foraging S. coelicolor gains the ability to inhibit molds and enhanced competitive activity against both gram-negative and gram-positive bacteria is detected in other species. These findings highlight how morphological adaptations of streptomycetes in nutrient-limited environments alter secondary metabolite production, enabling the screening of novel antimicrobial activities. These discoveries have implications ranging from the basic biology of streptomycetes to drug discovery and microbial ecology.

著者: Linda Sandblad, N. Soderholm, H. Tanner

最終更新: 2024-12-04 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.15.589617

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.15.589617.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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