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腸内細菌叢のチフス熱における役割

研究によれば、腸内細菌叢がチフスの感受性に影響を与えることがわかった。

Philip M. Ashton, L. Mageiros, J. E. Meiring, A. C. Chirambo, F. Khanam, S. Dongol, H. Banda, A. Karkey, L. P. Llanes, H. Thomaides-Brears, M. Gibani, N. H. Rajib, N. Rahman, P. K. Biswas, M. A. I. Bhuiyan, S. Kay, K. Auger, O. Seret, N. R. Thomson, A. J. Pollard, S. Baker, B. Basnyat, J. D. Clemens, C. Dolecek, S. J. Dunstan, G. Dougan, R. S. Heyderman, V. E. Pitzer, F. Qadri, M. A. Gordon, K. E. Holt, T. C. Darton, Strategic Typhoid Alliance Across Asia and Africa Consortium

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腸の健康とチフス 腸の健康とチフス 影響を与えることがわかった。 研究によると、腸内細菌がチフスの感受性に
目次

チフスは、サルモネラ・エンテリカ・セロバー・チフィ(S. Typhi)という種類の細菌が原因で起こる深刻な病気だよ。毎年、約1090万件の感染と約116,800件の死者を出している。主に南アジアや東南アジア、サハラ以南のアフリカの地域で人々に影響を与えているんだ。チフスを予防するワクチンが導入されることで、感染者数が減少することが期待されている。水質や衛生、衛生管理の改善もこの取り組みの一部だよ。でも、症状を示さない細菌の保菌者がいることや、貧困層や社会的に疎外されたコミュニティが特に影響を受けることから、課題は残っているんだ。

腸内細菌叢の役割

人間の腸には数兆の微生物が住んでいて、これが腸内細菌叢と呼ばれる複雑なコミュニティを形成している。このコミュニティは健康維持に重要な役割を果たしていて、病気に対する体の反応にも影響を与えるんだ。腸内細菌叢は消化や栄養素の吸収を助けていて、免疫システムとも密接に関連していて、異なる脅威に対する反応に影響を与える。

腸内細菌叢は「定着抵抗性」というプロセスを通じて感染を防ぐことができる。これは、有益な細菌が有害な細菌と栄養素やスペースを競争したり、有害な細菌を抑制する物質を生成したり、免疫システムの反応を調整したりすることを意味してるんだ。研究によって、腸内細菌叢が乱れると、たとえば抗生物質の使用などにより、サルモネラのような有害な細菌が感染を引き起こしやすくなることがわかってきた。最近の研究では、サルモネラが腸内細菌叢とどのように相互作用するかについて重要な進展があったよ。

短鎖脂肪酸(SCFAs)は、腸内の細菌が食物繊維を発酵させることで生成されるもので、サルモネラ感染を防ぐ上でも重要な役割を果たしている。SCFAsは腸内の酸素量を減らし、サルモネラの成長を抑制する酸性環境を作り出すんだ。でも、腸内細菌叢がサルモネラ感染を防ぐ能力についてはわかっていることが多い一方で、S. Typhiの感染の結果にどのように影響するかはまだ完全には理解されていない。特にS. Typhiは人間だけを感染させるからね。

S. Typhiと腸内細菌叢に関する研究の不足

腸内細菌叢と他のタイプのサルモネラとの相互作用に関する研究もいくつか行われているけど、S. Typhiに特化した研究はまだ不足している。人間の感染モデル研究だと、感染が人間に直接どのように影響を与えるかを調査できるから、観察研究を補完できるんだ。最近の研究では、チフス患者の腸内細菌叢が健康な人とは異なり、多様性が低くてSCFAを生成する細菌が少ないことがわかった。

腸内細菌叢とチフスの関係をよりよく理解できれば、病気を予防する新しい方法や、腸内細菌叢が深刻な感染からどのように保護を提供するかを理解する手助けになるかもしれない。特にチフスが一般的な地域ではね。

研究の概要

S. Typhiが腸内細菌叢とどのように相互作用するかについての知識のギャップを埋めるために、研究者たちはチフスが一般的なアジアとアフリカの3つの地域から258人の参加者の便サンプルを集めたんだ。これらのサンプルは腸内細菌叢のパターンを特定するために分析されたよ。

参加者とサンプル収集

この研究では、各地域で約100,000人に調査が行われた。発熱のある患者がリクルートされ、S. Typhiの血液培養が陽性の「急性チフス」に診断された人が特定されたんだ。可能な限り、治療が始まる前にこれらの患者から便サンプルが収集された。サンプルは非常に低い温度で保存された。研究参加前に使用された抗生物質に関する情報も記録されたよ。確認されたチフス患者のフォローアップとして、健康な家庭の接触者からも便サンプルが収集された。

研究倫理の承認

この研究は各国とイギリスの倫理委員会によって承認されていて、必要なルールやガイドラインが遵守されていることが確認されている。

サンプルの処理と分析

便サンプルを分析するために、DNAを抽出して腸内細菌叢の構成を理解するためにシーケンシングされた。データはその後、分析のためにクリーンアップされ、整理された。研究者たちは存在する細菌の種類やそれらの代謝機能を特定することに集中したんだ。

統計分析

異なる統計的手法が、急性チフス患者と健康な家庭接触者など、参加者の異なるグループの腸内細菌叢を比較するために用いられたよ。

主な発見

参加者の概要

バングラデシュ、マラウイ、ネパールから258人の参加者の便微生物データが成功裏に収集された。参加者には急性チフス患者92人、健康な家庭接触者97人、高レベルの特定抗体(抗-Viタイトル)を持つ69人が含まれていた。

微生物の特徴

急性チフス患者と健康な接触者の腸内細菌叢を比較したところ、細菌の構成に明確な違いがあることがわかった。全体的な細菌の多様性は急性患者と健康な接触者の間で大きな違いはなかったけど、存在する細菌の種類はグループ間で大きく異なっていたよ。一部のSCFAを生成する細菌は、チフス患者では少ない傾向があったんだ。

バングラデシュとマラウイでは、チフス患者において健康な人と比較して常に少ない4つの微生物種が特定された。この発見は、これらの特定の細菌がチフスからの保護に関与している可能性を示唆している。

高-Vi参加者

高い抗-Viタイトルを持つ人々は、無症状のS. Typhiの保菌者か、未診断の感染を持っている人かもしれない。このグループを研究することは、チフスの伝播を理解する上で重要だよ。結果として、高-Vi個体の腸内細菌叢は急性チフス患者や家庭接触者とは異なることが示され、これらのグループがS. Typhiにどのように反応するかに潜在的な違いがあることを示している。

抗菌薬耐性遺伝子

研究者たちは、参加者の腸内細菌叢における抗菌薬耐性(AMR)遺伝子も調べた。その結果、急性チフス患者の腸内細菌叢では、健康な家庭接触者と比べてAMR遺伝子の存在が高かったんだ。これは、以前の抗生物質の使用が腸内細菌叢や感染に対する抵抗能力に影響を与える可能性を示唆しているよ。

研究の影響

この研究の結果は、チフスと腸内細菌叢の相互作用を理解する上で重要な影響を持っている。この発見は、腸内細菌叢が免疫反応に影響を与え、チフスに対する感受性を減少させることで、保護的役割を果たす可能性があることを示している。

さらに、異なる地理的な集団間の腸内細菌叢の組成の違いは、食事、環境、医療慣行などの地域的な要因が健康にどのように影響するかを示している。これらの変動を認識することで、チフスや他の病気と効果的に戦うための公衆衛生介入をカスタマイズする手助けになるかもしれないね。

結論

この研究は、腸内細菌叢とチフスの複雑な関係についての理解を深めるものだよ。これらの相互作用を完全に理解するためにはさらに研究が必要だけど、チフス感受性に関連する特定の微生物の特徴を特定することは、今後の予防や治療戦略を探るための土台を築くことになる。腸内細菌叢の保護的役割を理解することで、特にチフスや似た病気が深刻な影響を与えている地域での公衆衛生を強化するための革新的なアプローチが生まれるかもしれないね。

オリジナルソース

タイトル: Interplay Between the Gut Microbiome and Typhoid Fever: Insights from Endemic Countries and a Controlled Human Infection Model

概要: Typhoid fever is a systemic infection caused by Salmonella enterica serovar Typhi (S. Typhi) invasion from the gut lumen. Transmission between people occurs through ingestion of contaminated food and water, particularly in settings with poor water and sanitation infrastructure, resulting in over 10 million illnesses annually. As the pathogen invades via the gastrointestinal tract, it is plausible that the gut microbiome may influence the outcome of S. Typhi exposure. There is some evidence that bacteria producing short-chain fatty acids (SCFAs) may create an environment unfavourable to invasive Salmonella, but data from humans is limited. To investigate the association between gut microbiome and typhoid fever, we analysed samples collected from three all-age cohorts enrolled in a prospective surveillance study conducted across three settings where typhoid fever is endemic (Dhaka, Bangladesh; Blantyre, Malawi; and Kathmandu, Nepal). Cohorts consisted of acute typhoid fever patients (n=92), asymptomatic household contacts of typhoid fever patients (representing individuals who were likely exposed to S. Typhi but did not develop disease, n=97), and asymptomatic serosurvey participants with high Vi antibody titres (representing individuals who were exposed to S. Typhi and may be carriers, n=69). The stool microbiomes of each cohort were characterised using shotgun metagenomics, and bacterial diversity, composition, and function were compared. We identified 4 bacterial species that were significantly lower in abundance in typhoid fever patients compared with household contacts (i.e. probably exposed), in two of the three participant populations (Bangladesh and Malawi). These bacteria may represent taxa that provide protection against development of clinical infection upon exposure to S. Typhi, and include the inflammation-associated species Prevotella copri clade A and Haemophilus parainfluenzae. Our functional analysis identified 28 specific metabolic gene clusters (MGCs) negatively associated with typhoid fever in Bangladesh and Malawi, including seven MGCs involved in SCFA metabolism. The putative protection provided by microbiome SCFA metabolism was supported by data from a controlled human infection model conducted in a UK population, in which participants who did not develop typhoid fever following ingestion of S. Typhi had higher abundance of a putative SCFA-metabolising MGC (q-value = 0.22). This study identified the same protective associations between taxonomic and functional microbiota characteristics and non-susceptibility to typhoid fever across multiple human populations. Future research should explore the potential functional role of SCFAs and inflammation-associated bacteria in resistance to S. Typhi and other enteric infections.

著者: Philip M. Ashton, L. Mageiros, J. E. Meiring, A. C. Chirambo, F. Khanam, S. Dongol, H. Banda, A. Karkey, L. P. Llanes, H. Thomaides-Brears, M. Gibani, N. H. Rajib, N. Rahman, P. K. Biswas, M. A. I. Bhuiyan, S. Kay, K. Auger, O. Seret, N. R. Thomson, A. J. Pollard, S. Baker, B. Basnyat, J. D. Clemens, C. Dolecek, S. J. Dunstan, G. Dougan, R. S. Heyderman, V. E. Pitzer, F. Qadri, M. A. Gordon, K. E. Holt, T. C. Darton, Strategic Typhoid Alliance Across Asia and Africa Consortium

最終更新: 2024-11-29 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.09.02.24312347

ソースPDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.09.02.24312347.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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