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# 生物学 # 進化生物学

適応の見直し:進化に関する新しい洞察

最近の発見は、人口がどれくらい速く適応できるかについての従来の信念に疑問を投げかけている。

Joanna Masel, J. D. Matheson, M. Exposito-Alonso

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適応の洞察 チャレンジ 適応の洞察 チャレンジ 規範 いることを明らかにした。 新しい研究が、集団の適応速度が速くなって
目次

自然の中で、生物の集団は時間とともに変化する。このプロセスは適応として知られている。新しい変化が必要なとき、それはしばしば集団の古い特性や遺伝子を新しいものに置き換えることを含む。集団が適応するためには、いくつかの重要な要因が関与している。新しい特性は次の世代に受け継がれなければならず、古い特性は消えていく必要がある。これは、新しい遺伝子が集団に広がる数が限られているため、ゆっくりとしたプロセスになることがある。

このプロセスを研究した科学者の一人がハルデインだった。彼は、適応には良い特性が悪い特性に置き換わる数に制限があるため、スピード制限があることを指摘した。この考えはハルデインのジレンマとして知られている。研究が進むにつれて、他の人もハルデインの考えを調べ、彼の推論の支持と欠陥の両方を見つけた。

主要な概念

適応をよりよく理解するためには、いくつかの重要なアイデア、繁殖過剰と選択的死について見ていく必要がある。

繁殖過剰

繁殖過剰とは、集団の中で最も優れたタイプが、集団を安定させるために必要な以上にどれだけ多くの個体を生み出せるかを指す。例えば、ある植物種が多くの種を生産できるが、実際に育つ新しい植物はほんの数本だけだとしたら、潜在的な種の数と実際の新しい植物の数の違いが繁殖過剰となる。

選択的死

選択的死とは、有益な特性を欠いているために生存または繁殖できない個体の数を指す。集団の平均的な個体が最も優れた個体と比べて適応度が劣っている場合、選択的死が起こり、劣ったバージョンが取り除かれるのを助ける。これらの2つの概念を探ることで、集団がどのように適応できるかを理解するのが助けられる。

ハルデインの考え

ハルデインの基本的な主張は、集団が適応する能力には限界があるということだった。彼は、一定の数の個体が選択的に死ななければならず、それによって有益な特性の増加に寄与するべきだと考えていた。ハルデインは、選択的死は全死者の10%を超えてはならないと提案したが、これは強い証拠に基づいていなかった。

その後の研究者たちは、ハルデインの推論の問題点を指摘した。例えば、ハルデインは平均的な適応度を理想的な集団と比較したが、実際の集団内の最も適応度の高い個体と比較するべきだった。この理解の違いが、新しい特性が集団内でどのように広がるかを正確に予測する改善されたモデルにつながった。

フレームワークの見直し

この研究の次のステップは、集団内の複数のライフステージを考慮に入れたより洗練されたモデルを開発することだった。これを行うには、大人の生存と繁殖だけに焦点を当てるのではなく、考える必要がある。例えば、多くの種では、幼少期は大人よりも繁殖の可能性が高い場合があり、これは重要な要素だ。

また、研究者たちは、遺伝学でよく使われる「適応度」という用語が明確に定義するのが難しいことを発見した。この難しさは、適応度の厳密な定義に焦点を当てるのではなく、さまざまなライフステージで異なる個体がどれだけの子孫を残せるかに目を向ける方が良いかもしれないことを意味している。

ライフヒストリーの移行の重要性

新しいモデルが示す重要な点は、種内のさまざまなライフヒストリーの移行の重要性である。研究者は今や、大人の生存と繁殖だけでなく、幼少期の発達や繁殖のステージも含めている。

例えば、植物が種を生産する能力は、成長して大人になるまでのライフサイクル全体で直面する条件によって影響を受けるかもしれない。これらの移行を理解することは、どれだけの繁殖過剰が利用可能で、どれだけの選択的死が起こるかを計算するために重要だ。

モデルの適用

これらの概念を統合した後、研究者たちはこの改善されたフレームワークを現実のデータに適用することを目指した。彼らは様々な種、特に植物のアラビドプシス・タリアナから情報を集めて、繁殖過剰と選択的死の割合を測定した。

研究者たちは、さまざまな環境条件下で多くの異なる遺伝型(または種のバリエーション)を植えた。これらの植物のパフォーマンスを詳しく調べることで、生存し繁殖できた個体の数、そして有益な特性がないために死んだ個体の数を特定することができた。

結果

研究を通じて、研究者たちは興味深い結果を見つけた:

  1. 多くのケースで、選択的死の割合はハルデインの元々の10%の推定を大幅に超えていた。
  2. 厳しい条件下で、死者の最大95%が選択的であることが観察され、集団が以前考えられていたよりも迅速に適応できる可能性があることを示唆していた。
  3. 観察された繁殖過剰もかなり大きく、適応の能力がおそらく想定以上であることを示している。

これらの結果は、適応のスピード制限が約10%で固定されているという長年の信念に挑戦するものだ。むしろ、特定の状況下で、集団がより早く適応する能力を示すことができるという証拠がある。

結論

集団がどのように適応するかの理解は進化している。繁殖過剰や選択的死のような重要な概念に焦点を当てることで、研究者たちは適応の限界を明確にし始めている。特に、ライフヒストリーの移行に重点を置くことで、適応のモデルに深みが加わり、スピード制限が必ずしも以前考えられていたほど制約が強いわけではないことを示唆している。

今後の研究は、このアプローチの恩恵を受けるだろう。なぜなら、異なる種やそれぞれのユニークな特性に基づいたモデルを作成するためのカスタマイズ可能なフレームワークを提供するからだ。この新しいフレームワークは、適応の理解を拡張するだけでなく、進化生物学の分野でさらに探求の道を開く。

オリジナルソース

タイトル: Substitution load revisited: a high proportion of deaths can be selective

概要: Haldanes Dilemma refers to the concern that the need for many "selective deaths" to complete a substitution (i.e. selective sweep) creates a speed limit to adaptation. However, discussion of this concern has been marked by confusion, especially with respect to the term "substitution load". Here we distinguish different historical lines of reasoning, and identify one, focused on finite reproductive excess and the proportion of deaths that are "selective" (i.e. causally contribute to adaptive allele frequency changes), that has not yet been fully addressed. We develop this into a more general theoretical model that can apply to populations with any life history, even those for which a generation or even an individual are not well defined. The actual speed of adaptive evolution is coupled to the proportion of deaths that are selective. The degree to which reproductive excess enables a high proportion of selective deaths depends on the details of when selection takes place relative to density regulation, and there is therefore no general expression for a speed limit. To make these concepts concrete, we estimate both reproductive excess, and the proportion of deaths that are selective, from a dataset measuring survival of 517 different genotypes of Arabidopsis thaliana grown in eight different environmental conditions. In this dataset, a much higher proportion of deaths contribute to adaptation, in all environmental conditions, than the 10% cap that was anticipated as substantially restricting adaptation during historical discussions of speed limits. LAY SUMMARYThe influential neutral theory of molecular evolution was predicated on theoretical arguments that adaptation is subject to a speed limit. We resolve confusions regarding historical speed limit arguments, which depend on differences in fitness, not variance (differences in fitness squared). We generalize the underlying concepts of selective deaths and reproductive excess to populations with any life cycle, even those for which an "individual" and hence generation and fitness, are poorly defined. We apply the revised theory to Arabidopsis data, demonstrating the potential for future related experiments.

著者: Joanna Masel, J. D. Matheson, M. Exposito-Alonso

最終更新: 2024-12-17 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.11.01.466728

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.11.01.466728.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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