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Nuovo metodo per analizzare le radiografie degli animali

Un metodo per controllare la simmetria del torace nelle radiografie degli animali per avere diagnosi migliori.

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Metodo di analisi delleMetodo di analisi delleradiografie PETanimali domestici.l'accuratezza delle radiografie per gliTecnica innovativa migliora
Indice

Le radiografie del torace sono spesso usate per controllare eventuali problemi di salute nei cani e nei gatti. Far rimanere i pet fermi per queste immagini può essere difficile perché non collaborano come gli umani e i loro corpi hanno forme e dimensioni diverse. Se un pet non è posizionato correttamente durante la radiografia, questo può portare a conclusioni sbagliate sulla loro salute. Uno dei segnali che qualcosa potrebbe non andar bene è se i lati sinistro e destro del torace sembrano molto diversi. Stiamo suggerendo un modo per controllare automaticamente questa differenza.

Approccio

Abbiamo progettato un metodo per prima cosa identificare le metà sinistra e destra del torace usando un tipo di programma per computer chiamato Rete Neurale Convoluzionale (CNN). In particolare, abbiamo usato un modello noto come U-Net per trovare le costole e la colonna vertebrale nelle immagini radiografiche. Dopo aver identificato queste strutture, abbiamo usato una tecnica chiamata Contorni Attivi per localizzare i lati sinistro e destro del torace. Abbiamo poi raccolto dati da queste aree per insegnare ai classificatori-strumenti che ci aiutano a prendere decisioni-come Macchine a Vettori di Supporto (SVM), Gradient Boosting e Perceptron Multistrato (MLP). Per assicurarci che il nostro approccio fosse affidabile, lo abbiamo testato più volte e usato diversi metodi per misurare quanto abbiamo fatto bene.

Risultati

Quando abbiamo esaminato 900 immagini radiografiche, abbiamo trovato un buon livello di accuratezza nel determinare se i lati del torace erano simmetrici. Per assicurarci che il nostro metodo funzionasse in condizioni non ideali, abbiamo volutamente rovinato alcune immagini rendendole troppo scure o troppo luminose. I nostri test hanno mostrato che il nostro metodo funzionava ancora abbastanza bene, anche quando le immagini non erano perfette.

Conclusioni

I nostri risultati suggeriscono che il nostro metodo può analizzare efficacemente le immagini radiografiche, anche se non sono state scattate perfettamente. Inoltre, potrebbe essere adattato per funzionare anche per le radiografie umane con solo lievi modifiche.

Importanza delle Radiografie nella Cura degli Animali

Le radiografie giocano un ruolo cruciale nel controllare la salute degli animali. Vengono comunemente usate per diagnosticare problemi cardiaci e polmonari e per la stadiazione dei tumori nei cani e gatti. Tuttavia, la qualità di queste immagini dipende molto dall'esperienza di chi le scatta e dalla collaborazione dell'animale. Gli errori di posizionamento possono capitare spesso, specialmente se il pet non sta dritto. La ricerca mostra che circa il 30% delle radiografie scattate nelle pratiche normali non sono posizionate correttamente. Correggere questi errori può migliorare la qualità delle immagini, rendendo più facile interpretarle correttamente. Tuttavia, controllare ogni immagine per la qualità a occhio può essere una sfida nella pratica quotidiana. Un sistema che potesse riconoscere automaticamente gli errori di posizionamento sarebbe molto utile per i veterinari.

Viste Radiografiche Comuni

Le viste ventrodorsale (VD) e dorsoventrale (DV) sono gli angoli radiografici standard usati quando si esamina il torace di un animale. L'obiettivo è posizionare correttamente l'animale affinché gli organi target siano visibili. Se l'animale è posizionato accuratamente, i lati sinistro e destro del torace appariranno quasi uguali. Qualsiasi grande differenza può indicare che il pet è stato ruotato durante il processo di radiografia. Esempi visivi mostrano chiaramente come possono apparire immagini simmetriche e asimmetriche.

Recenti Progressi nel Deep Learning per le Radiografie degli Animali

Negli ultimi anni, le tecniche di deep learning sono state applicate per analizzare le radiografie dei cani. Ad esempio, alcuni ricercatori hanno usato le CNN per distinguere tra immagini toraciche normali e anormali, concentrandosi sulla dimensione del cuore come segno di problemi. Altri hanno sviluppato un modo per classificare le radiografie dei cani in base a diverse viste e regioni, tenendo conto anche dei limiti di tempo e memoria. Recentemente, uno studio ha utilizzato modelli avanzati per classificare vari risultati da immagini toraciche laterali dei cani.

Anche se sono state condotte ricerche sulla rilevazione della simmetria polmonare nelle radiografie umane, simile attenzione non è stata prestata agli animali. Alcuni ricercatori hanno cercato simmetria nei toraci umani per trovare problemi polmonari, ma non hanno segmentato prima i toraci. Invece, hanno assunto che i segmenti del torace fossero già forniti. I loro studi non hanno nemmeno esaminato da vicino i problemi causati da diverse esposizioni, che possono capitare spesso nella imaging radiografica.

Il Nostro Metodo Proposto

Abbiamo introdotto un nuovo modo per trovare le metà sinistra e destra del torace localizzando prima le costole e la colonna vertebrale nelle immagini radiografiche. Una volta fatto, abbiamo usato le costole segmentate come guida per trovare l'area complessiva del torace. La colonna vertebrale è stata poi utilizzata per dividere il torace in lati sinistro e destro. Abbiamo raccolto diverse caratteristiche da entrambe le metà per la classificazione.

Per quanto ne sappiamo, questo studio è unico nel proporre un metodo focalizzato sulla simmetria delle immagini toraciche in cani e gatti. Abbiamo testato questo metodo su 900 immagini radiografiche con la guida di un radiologo veterinario esperto. Inoltre, abbiamo esaminato come le impostazioni di esposizione abbiano impattato i nostri risultati.

Contributi Chiave

  1. Un nuovo metodo per dividere le aree toraciche trovando prima le costole e la colonna vertebrale, che potrebbe essere utile anche per le radiografie umane.
  2. Un modo per determinare se i lati sinistro e destro del torace sono simmetrici, il che può aiutare a controllare la qualità dell'acquisizione delle immagini.
  3. Uno sguardo completo su come il nostro metodo ha performance sotto diverse condizioni di esposizione, chiarendo la sua capacità di affrontare tali sfide.

Il Processo in Dettaglio

Prima, abbiamo usato un modello U-Net per trovare le costole e la colonna vertebrale. Questo modello elabora le immagini radiografiche a strati per estrarre caratteristiche importanti. Riduce gradualmente la dimensione dell'immagine fino a raggiungere un collo di bottiglia e poi aumenta di nuovo la dimensione fino alle dimensioni originali, mantenendo le informazioni estratte.

Dopo aver trovato le costole e la colonna vertebrale, abbiamo applicato un approccio di contorni attivi per stabilire il confine del torace. Una volta determinata la forma del torace, abbiamo usato la colonna vertebrale come linea di divisione per separare il torace in sezioni sinistra e destra.

Successivamente, abbiamo estratto varie caratteristiche da ciascuna metà del torace. Queste caratteristiche includono l'area (quanti pixel sono riempiti in ciascuna metà), il perimetro (la lunghezza del confine) e la distanza del centro di massa del torace dalla colonna vertebrale. Abbiamo utilizzato queste caratteristiche per addestrare i nostri modelli di classificazione per valutare la simmetria.

Processo di Classificazione

Dopo aver raccolto dati da entrambi i lati, abbiamo usato una combinazione di tre classificatori: SVM, MLP e Gradient Boosting. Ciascun metodo ha il proprio modo di guardare i dati, il che contribuisce a un'analisi più completa. Unendo i loro risultati, abbiamo aumentato l'accuratezza e l'affidabilità delle nostre valutazioni di simmetria.

Poiché non c'era un dataset disponibile per questo compito specifico, abbiamo raccolto 900 immagini radiografiche da un college veterinario e le abbiamo sanificate per l'analisi. Tra queste immagini, una parte mostrava condizioni asimmetriche, mentre il resto appariva simmetrico. Abbiamo volutamente incluso immagini con problemi di qualità per assicurarci che il nostro metodo fosse robusto.

Dettagli di Implementazione

Il nostro metodo è stato costruito utilizzando Python con modelli di deep learning sviluppati tramite una specifica libreria. Abbiamo utilizzato hardware potente per garantire tempi di elaborazione e addestramento rapidi. Durante i nostri test, abbiamo monitorato le prestazioni utilizzando metriche stabilite per garantire l'affidabilità.

Progettazione Sperimentale

Per valutare l'efficacia del nostro metodo in situazioni difficili, lo abbiamo testato sotto diversi sfondi di esposizione. Questo includeva rendere le immagini troppo scure o troppo luminose e ostruire parti del torace in immagini campione.

Valutazione delle Prestazioni

Abbiamo confrontato il nostro metodo con un approccio di segmentazione diretta che aveva alcune limitazioni. È stato evidente che il nostro metodo ha performato meglio nel mantenere le valutazioni di simmetria anche quando parti delle immagini erano oscurate o mal esposte.

Discussione

In sintesi, abbiamo presentato un nuovo metodo per segmentare le aree toraciche nelle radiografie degli animali e classificare la loro simmetria. I risultati supportano l'idea che il metodo funzioni bene in condizioni difficili.

Direzioni Future

Guardando avanti, abbiamo intenzione di utilizzare i risultati sulla simmetria per costruire un sistema che controlli automaticamente la qualità delle radiografie degli animali, focalizzandosi specificamente su quanto bene sono posizionate le immagini. Questo aiuterà a migliorare l'accuratezza delle diagnosi veterinarie.

Fonte originale

Titolo: Automatic Classification of Symmetry of Hemithoraces in Canine and Feline Radiographs

Estratto: Purpose: Thoracic radiographs are commonly used to evaluate patients with confirmed or suspected thoracic pathology. Proper patient positioning is more challenging in canine and feline radiography than in humans due to less patient cooperation and body shape variation. Improper patient positioning during radiograph acquisition has the potential to lead to a misdiagnosis. Asymmetrical hemithoraces are one of the indications of obliquity for which we propose an automatic classification method. Approach: We propose a hemithoraces segmentation method based on Convolutional Neural Networks (CNNs) and active contours. We utilized the U-Net model to segment the ribs and spine and then utilized active contours to find left and right hemithoraces. We then extracted features from the left and right hemithoraces to train an ensemble classifier which includes Support Vector Machine, Gradient Boosting and Multi-Layer Perceptron. Five-fold cross-validation was used, thorax segmentation was evaluated by Intersection over Union (IoU), and symmetry classification was evaluated using Precision, Recall, Area under Curve and F1 score. Results: Classification of symmetry for 900 radiographs reported an F1 score of 82.8% . To test the robustness of the proposed thorax segmentation method to underexposure and overexposure, we synthetically corrupted properly exposed radiographs and evaluated results using IoU. The results showed that the models IoU for underexposure and overexposure dropped by 2.1% and 1.2%, respectively. Conclusions: Our results indicate that the proposed thorax segmentation method is robust to poor exposure radiographs. The proposed thorax segmentation method can be applied to human radiography with minimal changes.

Autori: Peyman Tahghighi, Nicole Norena, Eran Ukwatta, Ryan B Appleby, Amin Komeili

Ultimo aggiornamento: 2023-02-24 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://arxiv.org/abs/2302.12923

Fonte PDF: https://arxiv.org/pdf/2302.12923

Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia arxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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