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Variabilità Regionale negli Astrocyti e Risposta alla SM

Uno studio rivela come diverse aree del cervello rispondono alla sclerosi multipla e all'attivazione degli astrociti.

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Indice

La sclerosi multipla (SM) è una malattia in cui il sistema immunitario attacca la copertura protettiva delle nervi nel cervello e nel midollo spinale, portando a problemi di comunicazione tra il cervello e il resto del corpo. La SM può causare vari sintomi, tra cui affaticamento, difficoltà a camminare e problemi di vista. I ricercatori hanno identificato diverse caratteristiche chiave della SM, come le aree in cui la copertura protettiva delle nervi è danneggiata (chiamate lesioni demielinizzate), infiammazione e cambiamenti in alcune cellule cerebrali chiamate Astrociti e microglia.

Gli astrociti e la microglia aiutano a mantenere la salute del cervello, ma possono anche attivarsi durante la SM, il che può essere sia positivo che negativo. Se da un lato possono proteggere il cervello regolando i livelli di ferro e supportando le cellule nervose, dall'altro possono anche rilasciare sostanze che causano più infiammazione e danni cellulari. Questo rende più difficile per il cervello ripararsi.

Gli scienziati hanno scoperto che esistono diversi tipi di astrociti e microglia in varie regioni del cervello e che le loro risposte alla SM possono variare. Studiando queste cellule in dettaglio, i ricercatori sperano di capire meglio come progredisce la SM e come trattarla efficacemente.

Modello di Cuprizone

Un modo comune per studiare la SM in laboratorio è usare un modello murino chiamato modello di cuprizone. La cuprizone è una sostanza chimica che, se somministrata ai topi, causa danni agli oligodendrociti, che sono le cellule responsabili della produzione della copertura protettiva delle nervi. Questo porta a un processo chiamato demielinizzazione, in cui la copertura protettiva viene persa. Il modello di cuprizone consente ai ricercatori di studiare come il cervello risponde a questo danno e come può recuperare.

In questi studi, i ricercatori possono osservare gli effetti della cuprizone nel tempo. Di solito, iniziano a nutrire i topi con cuprizone per alcune settimane per indurre la demielinizzazione. Dopo questo periodo, possono continuare con lo stesso trattamento o rimuovere la cuprizone dalla loro dieta per vedere come il cervello guarisce durante la remielinizzazione.

Esaminando il tessuto cerebrale dei topi trattati con cuprizone, gli scienziati possono osservare cambiamenti nell'Espressione genica, cioè il processo attraverso il quale i geni vengono attivati o disattivati, durante sia la demielinizzazione che la remielinizzazione. Questo li aiuta a capire come diverse regioni del cervello sono colpite e quale ruolo giocano vari tipi di cellule in questi processi.

Importanza degli studi regionali

Recenti progressi nella tecnologia consentono agli scienziati di analizzare l'espressione genica in regioni specifiche del cervello. Facendo ciò, possono scoprire come diverse aree reagiscono allo stesso trattamento. Per esempio, la corteccia potrebbe rispondere in modo diverso alla cuprizone rispetto all'ippocampo o alle fibre della materia bianca. Questo è cruciale per comprendere la SM perché offre informazioni su perché alcune regioni possano subire più danni di altre.

Molti studi di ricerca si sono concentrati su un'unica area del cervello, ma metodi più recenti ora consentono agli scienziati di analizzare più regioni contemporaneamente. Questo è importante per comprendere appieno come la SM colpisca il cervello e può aiutare a creare terapie mirate per i pazienti.

Metodi per analizzare l'espressione genica

In questo studio, i ricercatori hanno utilizzato il modello murino di cuprizone per indagare sui cambiamenti nell'espressione genica in diverse regioni cerebrali durante la demielinizzazione e la remielinizzazione. Hanno usato una tecnica chiamata trascrittomica spaziale, che consente agli scienziati di vedere dove specifici geni vengono espressi nei tessuti. Questa tecnica fornisce una mappa dell'attività genica attraverso sezioni cerebrali, offrendo insight più chiari su come le regioni cerebrali rispondono ai processi patologici.

Prima di usare la trascrittomica spaziale, i ricercatori hanno raccolto tessuto cerebrale dai topi trattati con cuprizone e lo hanno elaborato con cura per preservare la struttura del tessuto e il materiale genetico. Una volta preparato il tessuto, lo hanno affettato in sezioni sottili e applicato un protocollo specifico per catturare i dati sull'espressione genica.

Osservare i cambiamenti negli astrociti e nella microglia

Uno degli obiettivi dello studio era sugli astrociti, che possono cambiare in risposta a un infortunio cerebrale. Durante le prime fasi del trattamento con cuprizone, i ricercatori hanno notato un aumento significativo di specifici marcatori legati agli astrociti, indicando che queste cellule stavano diventando più attive. Questa attivazione suggerisce che gli astrociti giocano un ruolo cruciale nelle prime risposte alla demielinizzazione.

In particolare, i ricercatori hanno trovato che diverse regioni mostravano risposte diverse nell'attivazione degli astrociti. L'espressione di alcuni geni raggiungeva picchi in momenti specifici, evidenziando la variabilità regionale nelle risposte delle cellule gliali all'infortunio. Per esempio, i marcatori che indicavano astrociti attivi erano notevolmente più alti nelle regioni di materia bianca rispetto a quelle di materia grigia.

Dinamiche dell'espressione genica in risposta alla demielinizzazione

Attraverso l'analisi, gli scienziati hanno identificato vari geni legati agli oligodendrociti, microglia e astrociti. Hanno monitorato come l'espressione di questi geni cambiava nel tempo durante il trattamento con cuprizone. Alcuni geni associati agli oligodendrociti maturi mostravano livelli ridotti di espressione durante le fasi iniziali della demielinizzazione, ma aumentavano di nuovo durante la remielinizzazione.

Interessantemente, i modelli di espressione dei geni degli astrociti reattivi indicavano picchi in momenti diversi attraverso diverse regioni cerebrali. I ricercatori potevano vedere come il processo di demielinizzazione portasse a un chiaro aumento di certi marcatori degli astrociti, seguiti da cambiamenti nei livelli dei marcatori degli oligodendrociti maturi durante la fase di recupero.

Importanza dello studio degli astrociti reattivi

Gli astrociti sono cruciali per mantenere la salute dei neuroni, e la loro attivazione durante un danno è essenziale per rispondere a tale danno. Nel modello di cuprizone, è stato notato un aumento dell'espressione dei geni degli astrociti reattivi, in particolare durante la fase di demielinizzazione. Quando i ricercatori hanno misurato questi cambiamenti a livello proteico, hanno confermato che le aree del cervello mostravano differenze significative nella presenza di astrociti in risposta al trattamento con cuprizone.

Lo studio ha evidenziato che gli astrociti reattivi possono avere un ruolo protettivo o dannoso, a seconda del contesto. Per esempio, possono aiutare a rimodellare l'ambiente a beneficio del processo di recupero, ma potrebbero anche contribuire all'infiammazione continua se attivati in modo eccessivo.

Differenze regionali nell'eterogeneità degli astrociti

Combinando i dati della trascrittomica spaziale e del sequenziamento dell'RNA a cellula singola, i ricercatori sono stati in grado di identificare diverse subpopolazioni di astrociti e i loro ruoli specifici in varie regioni cerebrali. Hanno scoperto che alcuni cluster di astrociti erano più abbondanti in aree specifiche, indicando che le differenze regionali influenzavano come queste cellule rispondevano alla demielinizzazione.

In particolare, il cluster di astrociti 8 è stato trovato significativamente arricchito nelle regioni di materia bianca e ippocampale nei topi trattati con cuprizone, indicando il suo potenziale coinvolgimento nelle risposte immunitarie. Altri cluster mostravano modelli di espressione distinti associati a funzioni come la regolazione dei neurotrasmettitori o la partecipazione alla manutenzione neuronale.

I ricercatori hanno anche notato che l'abondanza relativa di specifici cluster di astrociti cambiava con il trattamento di cuprizone. Questo suggerisce che monitorare queste variazioni possa fornire importanti informazioni sui meccanismi della demielinizzazione e sui potenziali processi di recupero.

Validazione dei risultati attraverso tecniche aggiuntive

Per rafforzare i loro risultati, i ricercatori hanno confrontato i loro risultati dalla trascrittomica spaziale con altri dati disponibili utilizzando tecniche che fornivano immagini ad alta risoluzione del tessuto cerebrale. Questo consente loro di osservare più accuratamente la localizzazione spaziale delle subpopolazioni di astrociti identificate.

Le tecniche ad alta risoluzione hanno rivelato distribuzioni più dettagliate dei cluster di astrociti, mostrando che gli astrociti non sono solo differenziati dalle loro funzioni, ma anche dalle loro posizioni all'interno del cervello. Questa migliore comprensione della distribuzione spaziale è essenziale per studi futuri mirati a indirizzare specifiche risposte cellulari nella SM.

Conclusione

In sintesi, questo studio fornisce preziose informazioni su come diverse regioni del cervello reagiscono alla demielinizzazione e sul ruolo di varie subpopolazioni di astrociti in questo processo. I risultati sottolineano l'importanza di caratterizzare le cellule gliali nel contesto, poiché le loro risposte possono variare notevolmente a seconda del tempo e della posizione.

L'uso di tecniche avanzate come la trascrittomica spaziale e il sequenziamento dell'RNA a cellula singola ha migliorato la comprensione delle differenze regionali nelle risposte cerebrali all'infortunio. La continua ricerca sul comportamento degli astrociti può condurre a nuove strategie per trattare malattie come la SM, concentrandosi sullo sfruttare gli aspetti benefici di queste cellule mentre si minimizzano i potenziali danni.

I risultati sottolineano la necessità di ulteriori esplorazioni delle dinamiche degli astrociti e delle loro interazioni con altri tipi cellulari nel cervello per sviluppare approcci efficaci per riparare e proteggere il sistema nervoso. Mentre gli scienziati continuano a svelare le complessità della SM e di condizioni simili, una maggiore risoluzione e strategie specifiche per regione saranno cruciali per migliorare i trattamenti e i risultati per i pazienti.

Fonte originale

Titolo: Identification of regional astrocyte heterogeneity associated with cuprizone-induced de- and remyelination using spatial transcriptomics

Estratto: The cuprizone model is a well-characterized model to study processes of demyelination and remyelination, which are known features of multiple sclerosis. Cuprizone induces oligodendrocyte loss and severe demyelination in the brain, including the corpus callosum, hippocampus, and cortex. Loss of oligodendrocytes and myelin is accompanied by microgliosis and astrogliosis, wherein microglia and astrocytes partially lose their homeostatic functions and acquire a reactive/activated state. Cuprizone-induced demyelination peaks later in grey matter (GM) than in white matter (WM), and remyelination is more efficient in WM areas. Here, we aim to better understand regional diversity in microglia, astrocytes, and oligodendrocytes and their respective role in remyelination efficiency, by characterizing their response to cuprizone across brain regions. We applied spatial transcriptomics (ST) for unbiased gene activity profiling of multiple brain regions in a single tissue section, to identify region-associated changes in gene activity following cuprizone treatment. Gene activity changes were detected in highly abundant cell types, like neurons, oligodendrocytes, and astrocytes, but challenging to detect in low-abundant cell types such as microglia and oligodendrocyte precursor cells. ST revealed a significant increase in the expression of astrocyte markers Clu, Slc1a3, and Gfap during the demyelination phase in the WM fiber tract. In the cortex, the changes in GFAP expression were less prominent, both at the transcriptional and protein level. By mapping genes obtained from scRNAseq of FACS-sorted ACSA2-positive astrocytes onto the ST data, we observed astrocyte heterogeneity beyond the simple classification of WM- and GM-astrocytes in both control and cuprizone-treated mice. In the future, the characterization of these regional astrocyte populations could aid the development of novel strategies to halt the progression of demyelination and support remyelination. Highlights Astrocyte markers Clu, Slc1a3, and Gfap are increased in WM fiber tracts during demyelination Expression dynamics of astrogliosis markers Gfap and Vim during de-and remyelination depend on the brain region Combining scRNAseq with ST data revealed astrocyte heterogeneity beyond WM- and GM-differences scRNAseq-identified gene sets were differently affected by cuprizone treatment across brain regions

Autori: Susanne M Kooistra, A. Miedema, M. H. C. Wijering, A. Alsema, E. Gerrits, M. Meijer, M. Koster, E. M. Wesseling, W. Baron, B. J. L. Eggen

Ultimo aggiornamento: 2024-03-08 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.04.583308

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.04.583308.full.pdf

Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia biorxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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