La sfida continua della febbre tifoide
La febbre tifoide presenta seri rischi per la salute a causa della resistenza agli antibiotici e delle fonti contaminate.
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La febbre enterica è una malattia seria causata da batteri noti come Salmonella Enterica Serovar Typhi e Paratyphi. Questa malattia è comune in zone dove cibo e acqua possono essere contaminati. Rimane un problema di salute significativo in molti paesi del Sud Asia, del Sud Est Asiatico e dell'Africa. Ogni anno, milioni di persone si ammalano e migliaia muoiono a causa di questa infezione. La maggior parte dei casi si verifica per aver mangiato o bevuto cose contaminate, piuttosto che per contatto con persone infette.
L'impatto della febbre tifoide
Si stima che la febbre tifoide colpisca tra 11 e 20 milioni di persone nel mondo, causando da 28.000 a 161.000 morti all'anno. I paesi del Sud Asia portano il peso maggiore, con circa il 70% dei casi a livello mondiale. Nonostante i continui sforzi per trattare e gestire questa malattia, continua a essere una delle principali cause di malattia e morte in queste regioni.
Sfide nel trattamento
In passato, gli antibiotici erano un modo efficace per trattare la febbre tifoide. Tuttavia, l'aumento di ceppi resistenti agli antibiotici ha reso tutto più difficile. A partire dalla fine degli anni '70, alcuni ceppi di S. Typhi resistenti a più farmaci sono diventati un grande problema. In risposta, i medici hanno iniziato a usare fluoroquinoloni, un tipo di antibiotico. Purtroppo, alcuni ceppi di S. Typhi sono diventati resistenti anche a questi farmaci, portando a un cambio verso azitromicina e cefalosporine di terza generazione come principali opzioni di trattamento.
Un recente focolaio in Pakistan ha rivelato l'esistenza di ceppi resistenti a molti antibiotici, costringendo a un cambiamento nelle raccomandazioni di trattamento ancora una volta. La situazione è complicata dall'emergere di ceppi resistenti all'azitromicina, che rappresentano una sfida significativa per i professionisti medici.
Progressi nella comprensione del tifo
Recenti progressi nella ricerca genetica hanno fornito migliori informazioni sulle fonti e la diffusione di S. Typhi. Gli scienziati hanno identificato 85 diversi tipi genetici di S. Typhi, con un tipo particolarmente preoccupante a causa della sua resistenza a più farmaci. Questo specifico lignaggio è diventato dominante a livello globale, dimostrando quanto possa diffondersi tra le persone.
Un fattore che ha contribuito alla diffusione di questi ceppi resistenti è l'acquisizione di certi elementi genetici noti come Plasmidi. Questi plasmidi possono trasportare geni che conferiscono resistenza, facilitando la sopravvivenza dei batteri in presenza di antibiotici. Il movimento di questi plasmidi tra diversi batteri è stato un fattore chiave nell'aumento della resistenza.
La situazione in India
In India, uno studio focalizzato sul monitoraggio della resistenza agli antibiotici in S. Typhi ha rivelato una tendenza preoccupante. In un certo periodo, sono stati segnalati diversi casi di S. Typhi resistente a ceftriaxone, indicando un cambiamento nei ceppi circolanti nel paese. Un buon numero di questi casi proveniva da due città, Ahmedabad e Vadodara.
Per analizzare la situazione, i ricercatori hanno raccolto vari campioni da strutture sanitarie e laboratori. Hanno confermato l'identità dei batteri utilizzando test specifici e monitorato la loro resistenza a diversi antibiotici. I risultati hanno mostrato che una grande maggioranza dei ceppi analizzati mostrava resistenza a più antibiotici, pur essendo ancora suscettibili ad altri.
Analisi genetica dei ceppi
Esaminando il patrimonio genetico di questi ceppi di S. Typhi, gli scienziati hanno scoperto che la maggior parte apparteneva a un gruppo specifico, noto come genotipo 4.3.1.2, già segnalato in altri studi nella regione. Questo suggerisce che questo tipo genetico sia prevalente in India e potrebbe essersi adattato nel tempo.
La ricerca ha anche esaminato i plasmidi portati dai batteri. Sono stati trovati plasmidi precedentemente non identificati che giocano un ruolo nella resistenza, specialmente a ceftriaxone. Questo ha sollevato allarmi poiché indicava che anche ceppi precedentemente considerati stabili potrebbero evolversi rapidamente acquisendo nuove caratteristiche di resistenza.
Evoluzione della resistenza
Lo studio evidenzia come S. Typhi possa cambiare nel tempo. I batteri hanno subito vari cambiamenti nella loro struttura genetica, permettendo loro di sopravvivere nonostante l'uso di antibiotici. L'aumento dei ceppi multi-resistenti ha cambiato il panorama delle opzioni di trattamento, rendendo essenziale comprendere la loro evoluzione.
Tradizionalmente, si pensava che i cambiamenti genetici in S. Typhi derivassero dalla perdita di DNA piuttosto che dall'acquisizione di nuovi geni. Tuttavia, l'emergere di ceppi resistenti mostra un cambiamento in questo modello. La capacità di acquisire plasmidi ha permesso ad alcuni ceppi di ottenere tratti che migliorano la loro sopravvivenza nonostante il trattamento antibiotico.
L'importanza dei plasmidi
I plasmidi sono piccole molecole di DNA che possono trasportare geni di resistenza tra i batteri. In questo caso, i ceppi di S. Typhi resistenti a ceftriaxone sono stati trovati in possesso di diversi plasmidi, portando alla loro resistenza. Questa scoperta indica una tendenza preoccupante poiché mostra che questi batteri possono facilmente condividere tratti di resistenza tra loro.
I ricercatori sospettano che l'emergere di questi ceppi resistenti a ceftriaxone in India possa derivare da recenti scambi di plasmidi tra i batteri. Questo scambio genetico sottolinea l'importanza di monitorare e comprendere come la resistenza agli antibiotici si diffonde tra diversi gruppi batterici.
Rimanere vigili
Data l'aumentata resistenza agli antibiotici, i professionisti medici si trovano ad affrontare una sfida difficile nella gestione della febbre tifoide. Anche se l'azitromicina rimane un'opzione di trattamento efficace, già emergono segnalazioni di resistenza. Questa situazione sottolinea la necessità di ricerche continue e vigilanza nella lotta contro i batteri resistenti ai farmaci.
Una soluzione chiave per combattere l'epidemia di febbre tifoide potrebbe risiedere nella vaccinazione. A giugno 2022, le autorità sanitarie in India hanno raccomandato l'introduzione di vaccini coniugati contro il tifo a livello nazionale, specialmente nelle aree dove la resistenza è più prevalente. L'obiettivo è migliorare la protezione della comunità e ridurre il carico di questa malattia.
Direzioni future
Mentre gli scienziati continuano a studiare gli aspetti genetici di S. Typhi e i suoi modelli di resistenza, mirano a fornire strategie migliori per gestire la malattia. Comprendere come questi batteri evolvono e si diffondono è fondamentale. Con queste conoscenze, i sistemi sanitari possono sviluppare linee guida di trattamento più efficaci e misure preventive.
Inoltre, migliorare le pratiche di acqua, sanità e igiene giocherà un ruolo significativo nel ridurre l'incidenza complessiva della febbre tifoide. Affrontando i fattori che contribuiscono alla diffusione della malattia, le comunità possono lavorare insieme per combattere l'emergere di ceppi resistenti ai farmaci.
Conclusione
La febbre tifoide rimane un problema di salute pubblica critico, in particolare in molte parti dell'Asia e dell'Africa. L'aumento dei ceppi resistenti agli antibiotici rappresenta una reale sfida per la sanità. La ricerca continua sui fattori genetici alla base della resistenza e sulla natura di S. Typhi è cruciale.
Con l'introduzione di vaccini e migliori pratiche sanitarie, ci sono potenzialità per ridurre i casi di tifo in futuro. Nel frattempo, gli sforzi continui per comprendere e combattere la diffusione della resistenza agli antibiotici saranno essenziali per mantenere opzioni di trattamento efficaci per la febbre tifoide.
Titolo: Recent emergence of cephalosporin resistant Salmonella Typhi in India due to the endemic clone acquiring IncFIB(K) plasmid encoding blaCTX-M-15 gene
Estratto: The emergence and spread of Salmonella Typhi (S. Typhi) resistant to third generation cephalosporins are a serious global health concern. In this study, we have genomically characterized 142 cephalosporin resistant S. Typhi strains isolated from Gujarat, India. Comparative genome analysis of study isolates revealed the emergence of a new clone of ceftriaxone-resistant S. Typhi harboring three plasmids of the incompatibility group IncFIB(K), IncX1 and IncFIB(pHCM2). Among the three, IncFIB(K) plasmid confers resistance to third-generation cephalosporins by means of blaCTX-M-15 gene, as well as other resistance determinants such as aph(3''), aph(6'), sul2, dfrA14,qnrS and tetA. Phylogenetic analysis of strains revealed that the isolates from Gujarat (n=140/142) belong to a distinct subclade (genotype 4.3.1.2.2) within genotype 4.3.1.2 (H58 lineage II). SNP-based phylogenetic analysis of the core genes in IncFIB(K) suggested a close relatedness of the plasmid backbone to that of IncFIB(K) from other Enterobacteriales. This implies that H58 lineage II can acquire MDR plasmids from other Enterobacteriales provided compensatory evolution balances the associated fitness costs. Although, as previously reported, exposure to the third generation cephalosporins during treatment may have selected for these variants, this could indicate the potential onset of a new wave of ceftriaxone-resistant S. Typhi in India. The implementation of control measures such as vaccination, improved water, sanitation, etc., could be undertaken in areas where MDR or XDR S. Typhi strains are prevalent.
Autori: Balaji Veeraraghavan, T. P. Thirumoorthy, J. J. Jacob, A. V, M. P. T, B. S. Shah, V. Iyer, G. Maheshwari, U. Trivedi, A. Shah, P. Patel, A. Gaigawale, Y. M, P. Sathya Narayanan, A. Mutreja, M. Carey, J. John, G. Kang
Ultimo aggiornamento: 2024-04-25 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.07.05.547856
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.07.05.547856.full.pdf
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.
Si ringrazia biorxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.
Link di riferimento
- https://www.healthdata.org/results/gbd_summaries/2019/typhoid-fever-level-4-cause
- https://github.com/nanoporetech/duplex-tools
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- https://github.com/DerrickWood/kraken
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