Dinamiche Microbiche nell'Oceano Artico
Uno studio rivela come i microrganismi si adattano ai cambiamenti stagionali nelle acque artiche.
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Indice
Nell'oceano, forme di vita microscopiche come batteri, archea e microeucarioti sono ovunque. Questi microorganismi non solo sono tantissimi, ma anche super diversi per quanto riguarda i loro tipi e funzioni. Giocano ruoli chiave nel modo in cui l'ambiente oceanico cambia e come i nutrienti si muovono attraverso gli ecosistemi. Capire come questi microbi lavorano insieme e rispondono al loro ambiente è fondamentale per sapere come funzionano e si adattano gli ecosistemi oceanici.
Studi a lungo termine hanno mostrato che le Comunità microbiche nell'oceano cambiano col tempo. Questi cambiamenti possono avvenire quotidianamente, stagionalmente o annualmente. In aree con climi temperati, le variazioni stagionali hanno un forte impatto su queste comunità, portando a schemi prevedibili nelle loro popolazioni. Tuttavia, recenti scoperte suggeriscono che i microeucarioti, che sono un tipo di microorganismo, non mostrano gli stessi schemi prevedibili di batteri e archea. Invece, cambiano più rapidamente in brevi periodi. Questo significa che mentre le comunità possono essere prevedibili, sono anche in costante cambiamento, mostrando la natura dinamica della vita nell'oceano.
Nonostante ciò che sappiamo su questi microorganismi, ci sono ancora molte domande senza risposta. La maggior parte degli studi si concentra sui tipi di organismi presenti e spesso guarda a aree con climi temperati o subtropicali. Non comprendiamo completamente come le Condizioni Ambientali in cambiamento influenzano le funzioni delle comunità microbiche, specialmente nelle regioni polari più fredde dove il cambiamento climatico ha un impatto importante.
Per colmare questa lacuna, abbiamo studiato le comunità microbiche nella Corrente di West Spitsbergen, che fa parte dell'Oceano Artico. Questa zona è unica perché è influenzata dalle acque atlantiche più calde e rimane priva di ghiaccio tutto l'anno. Questa posizione ci offre una grande opportunità di osservare come i microorganismi prosperano in condizioni di cambiamento.
Ipotesi
Credevamo che i microorganismi nelle acque artiche sperimentassero cambiamenti che seguono schemi stagionali, influenzati principalmente dai lunghi periodi di luce e buio. Per testare questa idea, abbiamo usato dispositivi che hanno raccolto automaticamente dati sui microorganismi e sul loro ambiente per quattro anni. Guardando il materiale genetico di questi microbii, volevamo creare un quadro dettagliato di come le loro comunità cambiano col tempo.
Cambiamenti Ambientali nell'Artico
Per prima cosa abbiamo esaminato come l'ambiente nella Corrente di West Spitsbergen cambiava durante l'anno. Abbiamo combinato dati da vari sensori che misuravano cose come temperatura, salinità e livelli di ossigeno, insieme a dati satellitari che fornivano informazioni sui livelli di luce che raggiungevano l'acqua. Nei quattro anni di osservazioni, è diventato chiaro che cambiamenti significativi nelle condizioni ambientali si verificavano regolarmente, in particolare durante la transizione dalla notte polare al giorno polare.
Alla fine della notte polare, che si verifica a fine marzo, abbiamo osservato aumenti nei livelli di luce che continuavano a salire fino a raggiungere il picco a giugno. Questo aumento della luce solare ha innescato un riscaldamento dell'acqua, con temperature che raggiungevano circa 7°C a fine estate. Al contrario, durante i mesi invernali, le temperature scendevano sotto i 4°C. La profondità dello strato miscelato, dove le acque più calde e quelle più fredde si mescolano, cambiava significativamente nel corso dell'anno, raggiungendo il suo punto più basso a giugno e la massima profondità durante i mesi invernali. La quantità di clorofilla, che indica la presenza di organismi fotosintetici come il Fitoplancton, raggiungeva il picco durante i mesi estivi, ma questo tempismo variava anno per anno, suggerendo differenze nei modi in cui avvenivano le fioriture di fitoplancton.
In generale, quest'area mostrava chiari Cambiamenti Stagionali nelle condizioni ambientali, rendendola un luogo perfetto per studiare come questi cambiamenti influenzino la vita microbica.
Studio delle Comunità Microbiche
Successivamente, abbiamo esaminato come le comunità microbiche-batteri, archea e microeucarioti-cambiavano nel tempo. Abbiamo raccolto campioni regolarmente per quattro anni per analizzare i tipi di microorganismi presenti. Dai nostri campioni, abbiamo identificato migliaia di microorganismi diversi.
Abbiamo notato che la diversità di queste comunità variava significativamente dentro ogni anno. Per batteri e archea, la diversità era massima durante la notte polare, quando le condizioni erano stabili. Tuttavia, man mano che la luce aumentava e le temperature si riscaldavano in primavera, la diversità scendeva, suggerendo un cambiamento nella composizione della comunità. Questo schema contrastava con i microeucarioti, che mostrava fluttuazioni che raggiungevano picchi sia durante la notte polare che durante il giorno polare, indicando che diversi fattori potrebbero influenzare le loro popolazioni.
Attraverso un'analisi dettagliata, abbiamo scoperto che la struttura della comunità per entrambi i tipi di microorganismi era strettamente allineata con i cambiamenti stagionali. Le comunità campionate nello stesso mese in diversi anni tendevano a essere più simili tra loro. Questo suggerisce che le comunità microbiche seguono una sorta di ritmo annuale, proprio come i cambiamenti stagionali che vediamo nella vita vegetale e animale.
Cambiamenti Stagionali e Struttura della Comunità
I dati hanno anche rivelato differenze tra le comunità procariote (batteri e archea) e microeucariote nel tempo. Mentre i batteri mostravano forti schemi stagionali, i microeucarioti dimostravano strutture comunitarie più variabili. Per i batteri, la composizione della comunità rimaneva più prevedibile durante l'inverno e cambiava più drasticamente in estate. Al contrario, le comunità microeucariote mostravano una maggiore variabilità durante il giorno polare, suggerendo che le loro risposte ai cambiamenti ambientali sono meno uniformi.
Analizzando le variazioni nella composizione della comunità, abbiamo scoperto cinque distinti periodi di tempo, o "moduli", che rappresentano diversi stati stagionali dell'ecosistema. Ogni modulo era caratterizzato da gruppi specifici di microorganismi che prosperavano in determinate condizioni ambientali. Ad esempio, durante la notte polare, abbiamo osservato una comunità ricca di archea ossidanti dell'ammoniaca, che sono noti per essere importanti nel ciclo dei nutrienti. Man mano che le condizioni cambiavano con l'arrivo della primavera, le comunità si spostavano per includere gruppi più diversi di microeucarioti e batteri, in particolare quelli associati alle fioriture di fitoplancton.
Comprendere le Funzioni Microbiche
Per ottenere una comprensione più profonda dei ruoli che giocano questi microorganismi, abbiamo esaminato non solo le loro identità, ma anche le loro funzioni. Abbiamo esaminato da vicino i geni presenti nelle comunità microbiche per capire meglio i tipi di processi che possono svolgere. Questo ci ha portato a scoprire che molti dei geni associati a funzioni specifiche variavano tra i diversi moduli stagionali che abbiamo identificato in precedenza.
Ad esempio, durante la tarda notte polare, determinati geni legati al ciclo dell'azoto erano prevalenti, mentre in primavera, i geni coinvolti nella decomposizione della materia organica e dei nutrienti diventavano più prominenti. Questo riflette un cambiamento da un ambiente stabile e ricco di nutrienti in inverno a un ambiente più dinamico e competitivo in primavera, spinto dalla produttività del fitoplancton.
Connessioni tra Gruppi Microbici
Abbiamo anche scoperto che diversi gruppi di microorganismi non operano isolatamente. Studiando le interazioni tra comunità procariote e microeucariote, potevamo vedere come i cambiamenti in un gruppo influenzassero l'altro. Ad esempio, la crescita di specifici microeucarioti durante la primavera era strettamente legata ai cambiamenti nelle comunità procariote, suggerendo che queste interazioni potrebbero guidare le dinamiche in questi ecosistemi.
Quest'interconnettività mette in risalto la complessità delle comunità microbiche nell'Artico e la loro risposta ai cambiamenti ambientali. Sottolinea anche l'importanza di un approccio olistico nello studio degli ecosistemi, poiché concentrarsi solo su un gruppo di organismi può portare a una comprensione incompleta del sistema.
Conclusioni e Direzioni Future
Il nostro studio getta luce sulle intricate dinamiche delle comunità microbiche nell'Oceano Artico, in particolare nella Corrente di West Spitsbergen. I modelli regolari di assemblaggio microbico e le loro connessioni ai cambiamenti ambientali sottolineano l'importanza di capire come funzionano questi sistemi, specialmente di fronte al cambiamento climatico.
I risultati indicano che i fattori ambientali influenzano significativamente la struttura e le funzioni delle comunità microbiche. Questa comprensione può informare le future ricerche e gli sforzi di monitoraggio, in particolare in regioni in rapido cambiamento come l'Artico. Dato il potenziale impatto del cambiamento climatico sugli ecosistemi oceanici, è fondamentale continuare a indagare come queste comunità microbiche rispondano al loro ambiente.
Integrando varie dimensioni dei dati ecologici-come la diversità tassonomica, le capacità funzionali e le condizioni ambientali-possiamo costruire un quadro più completo della vita nell'oceano. Questa conoscenza non solo approfondirà la nostra comprensione degli ecosistemi microbici, ma aiuterà anche a prevedere come queste comunità cruciali potrebbero rispondere ai cambiamenti in corso nel loro ambiente.
Titolo: Seasonal recurrence and modular assembly of an Arctic pelagic marine microbiome
Estratto: Deciphering how microbial communities are shaped by environmental variability is fundamental for understanding the structure and function of ocean ecosystems. Thus far, we know little about the structuring of community functionality and the coupling between taxonomy and function over seasonal environmental gradients. To address this, we employed autonomous sampling devices and in situ sensors to investigate the taxonomic and functional dynamics of a pelagic Arctic Ocean microbiome over a four-year period. We demonstrate that the dominant prokaryotic and microeukaryotic populations exhibit recurrent, unimodal fluctuations each year, with community gene content following the same trend. The recurrent dynamics within the prokaryotic microbiome are structured into five temporal modules that represent distinct ecological states, characterised by unique taxonomic and metabolic signatures and connections to specific microeukaryotic populations and oceanographic conditions. For instance, Cand. Nitrosopumilus and the machinery to oxidise ammonia and reduce nitrite are signatures of early polar night, along with Radiolarians. In contrast, late summer is characterised by Amylibacter, sulfur compound metabolism and diverse Haptophyta lineages. Exploring the composition of modules further along with their degree of functional redundancy and the structuring of genetic diversity within functions over time revealed seasonal heterogeneity in environmental selection processes. In particular, we observe strong selection pressure on a functional level in spring while late polar night features weaker selection pressure that likely acts on an organismal level. By integrating taxonomic, functional, and environmental information, our study provides fundamental insights into how microbiomes are structured under pronounced environmental variability in understudied, yet rapidly changing polar marine ecosystems.
Autori: Taylor Priest, E. Oldenburg, O. Popa, B. Dede, K. Metfies, W.-J. von Appen, S. Torres-Valdes, C. Bienhold, B. M. Fuchs, R. Amann, A. Boetius, M. Wietz
Ultimo aggiornamento: 2024-05-10 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.10.593482
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.10.593482.full.pdf
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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