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# La biologia# Biologia del cancro

Intuizioni genetiche nello sviluppo del cancro del sangue

La ricerca rivela come le mutazioni nelle cellule staminali del sangue portino all'AML.

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Negli ultimi vent'anni, i ricercatori hanno imparato tanto sui cambiamenti genetici che portano al cancro. La maggior parte dei tumori inizia con alcune Mutazioni chiave nel DNA di una singola cellula. Queste mutazioni possono svilupparsi molti anni prima che appaia la prima cellula cancerosa. Tuttavia, gli scienziati stanno ancora tentando di capire come tutte queste mutazioni si accumulino in una cellula nel corso della vita di una persona.

Le prime teorie sul cancro suggerivano che l'acquisizione di mutazioni fosse il motivo principale per cui le persone sviluppano il cancro con l'età. Eppure, queste teorie faticano a spiegare quanto spesso si verifichino realmente i tumori in base alle stime di quanto velocemente avvengono le mutazioni e quante cellule staminali ci siano nel corpo.

Ricerche recenti hanno mostrato che alcune mutazioni vengono selezionate nel corpo, il che significa che le cellule con queste mutazioni hanno un vantaggio e sono più propense a sopravvivere. Questa Selezione sembra avvenire non solo quando inizia il cancro, ma durante l'intero processo di sviluppo. Misurare questi cambiamenti precoci nelle cellule che potrebbero portare al cancro può essere difficile, quindi gli scienziati non hanno ancora confermato queste idee con calcoli precisi.

Il Ruolo del Sequenziamento di Singole Cellule nella Ricerca sul Cancro

Un modo promettente per studiare come si sviluppa il cancro è attraverso il sequenziamento di singole cellule. Questo metodo consente agli scienziati di esaminare da vicino il patrimonio genetico delle cellule individuali e comprendere la loro storia. Analizzando le mutazioni in un gruppo di cellule correlate, i ricercatori possono creare una mappa che mostra come il cancro potrebbe evolversi nel tempo.

Il sistema sanguigno è un’ottima area per questa ricerca perché gli scienziati possono trovare e analizzare facilmente le Cellule staminali del sangue. Questa ricerca ha mostrato che gli individui sani hanno molte cellule staminali del sangue che supportano la produzione di sangue. In alcuni tumori ematici, mutazioni chiave possono addirittura iniziare prima della nascita. Inoltre, c'è una grande varietà di queste cellule staminali in condizioni come la leucemia mieloide acuta (LMA).

Un nuovo approccio prevede di prelevare cellule staminali del sangue da pazienti diagnosticati con LMA e studiarle più da vicino utilizzando il sequenziamento di singole cellule. Questo consente agli scienziati di osservare come le mutazioni si sviluppano nel tempo e come alcune di esse possano portare a una recidiva del cancro dopo il trattamento.

Costruire un'Immagine dell'Evoluzione Preleucemica

In questa ricerca, gli scienziati si sono concentrati su 16 pazienti con LMA e hanno analizzato i loro campioni di sangue. Per garantire risultati accurati, hanno scelto campioni con un background genetico simile. Dopo aver isolato le cellule staminali del sangue, hanno sequenziato il loro DNA per cercare mutazioni in geni importanti legati ai tumori ematici. Questo processo ha consentito loro di identificare migliaia di singole cellule staminali del sangue e ricostruire un'immagine delle mutazioni genetiche per ciascun paziente.

L'analisi ha rivelato che la maggior parte dei casi di LMA ha tipicamente tre o quattro mutazioni chiave. Tra queste mutazioni, alcuni geni sono apparsi frequentemente insieme alle mutazioni note. I ricercatori hanno costantemente trovato che una mutazione si verificava spesso prima delle altre, mostrando un modello in come queste mutazioni si sviluppano.

Lo studio dei cambiamenti genetici nelle cellule staminali del sangue ha mostrato che ci sono diversi modi in cui queste cellule possono evolversi verso il cancro. In circa un terzo dei casi, i ricercatori hanno osservato percorsi evolutivi ramificati, suggerendo che potrebbero esistere più linee cellulari mutate contemporaneamente. Negli altri casi, l'evoluzione sembrava seguire un unico percorso. C'erano anche differenze notevoli nel numero di cellule con diverse mutazioni, il che indica che alcune mutazioni erano più vantaggiose di altre.

Comprendere la Competizione tra Cellule

Questi risultati sull'evoluzione delle cellule staminali del sangue suggeriscono che la dimensione e la composizione delle diverse linee cellulari cambiano a causa della competizione tra esse, mutazioni casuali ed eventi fortuiti. Modellando questi processi, i ricercatori potrebbero capire meglio come emergono i vari modelli di evoluzione in questi casi di LMA.

Lo studio ha cercato di simulare come le cellule staminali del sangue potrebbero cambiare nel tempo, considerando vari fattori mentre ignorava le identità specifiche di ciascuna mutazione. I ricercatori hanno definito un punto in cui consideravano un paziente avere il cancro in base al numero di mutazioni chiave trovate nelle loro cellule. Questo modellamento potrebbe aiutare a confrontare le sequenze effettive osservate nei pazienti con quelle create nelle simulazioni.

Per migliorare l'analisi, gli scienziati hanno confrontato le dimensioni dei cloni nei dati reali dei pazienti rispetto a molti scenari simulati per vedere come le pressioni di selezione potessero differire tra i vari casi. Sembrava che vantaggi selettivi moderati o forti portassero a modelli evolutivi più complessi, il che ha aiutato a chiarire perché alcuni pazienti avessero forme più aggressive di cancro.

Validazione dei Risultati con Maggiori Dati

Per garantire che i loro risultati fossero applicabili a più casi di LMA, i ricercatori hanno analizzato dati aggiuntivi provenienti da altri 27 casi di LMA. Hanno di nuovo esaminato come la dimensione e la composizione delle linee cellulari cambiassero. I loro risultati hanno rispecchiato quelli dei 16 casi originali, dimostrando che l'evoluzione della LMA non poteva essere spiegata solo da mutazioni casuali. Piuttosto, livelli moderati di selezione positiva erano all'opera in molti casi.

L'analisi ha indicato che la maggior parte dei modelli osservati poteva essere spiegata da forze di selezione simili, il che significa che la presenza di certe mutazioni aumentava le possibilità che le cellule sopravvivessero e si moltiplicassero. Così, i casi in cui poche mutazioni dominavano il panorama erano collegati a una selezione più debole, mentre quelli che mostrano una miscela di più mutazioni indicavano pressioni di selezione più forti.

Guardando ai Rischi Futuri per la LMA

L'idea che molti di questi alberi di cloni preleucemici mostrassero segni di selezione positiva porta i ricercatori a pensare che questi cloni potrebbero svilupparsi nel corso di molti anni, fornendo una lunga finestra per prevedere chi potrebbe essere a rischio di sviluppare LMA. Tuttavia, è cruciale capire quanto siano comuni alcuni marcatori nelle persone che non sviluppano poi la malattia.

Le simulazioni hanno mostrato che i percorsi evolutivi che portano alla LMA potrebbero differire significativamente dai percorsi di chi non sviluppa il cancro. Di solito, gli individui con mutazioni singole erano comuni, rendendo queste mutazioni meno utili come indicatori del rischio futuro di cancro. In contrasto, la presenza di cellule con due mutazioni prima dei 30 anni era molto più rara negli individui sani, ma più comune in quelli destinati a sviluppare LMA. Lo stesso schema si osserva per gli individui che acquisiscono tre mutazioni prima dei 50 anni, mostrando un rischio notevole di trasformarsi in cancro.

Conclusione

Questo studio sottolinea che le cellule staminali del sangue possono contenere evidenze di cambiamenti precoci che portano al cancro. Studiando questi cambiamenti in dettaglio, gli scienziati possono creare un quadro più chiaro di come evolve la LMA e identificare le persone che potrebbero essere a maggior rischio di sviluppare la malattia. Anche se sono state fatte alcune semplificazioni durante la ricerca, i risultati evidenziano le complesse interazioni tra mutazioni genetiche e pressioni selettive nell'evoluzione preleucemica. La speranza è che, rilevando certe combinazioni di mutazioni precocemente, i ricercatori possano prevedere meglio chi potrebbe aver bisogno di un monitoraggio più attento per lo sviluppo della LMA in futuro.

Fonte originale

Titolo: Single-cell DNA sequencing reveals pervasive positive selection throughout preleukemic evolution

Estratto: The representation of driver mutations in preleukemic haematopoietic stem cells (pHSCs) provides a window into the somatic evolution that precedes Acute Myeloid Leukemia (AML). Here, we isolate pHSCs from the bone marrow of 16 patients diagnosed with AML and perform single-cell DNA sequencing on thousands of cells to reconstruct phylogenetic trees of the major driver clones in each patient. We develop a computational framework that can infer levels of positive selection operating during preleukemic evolution from the statistical properties of these phylogenetic trees. Combining these data with 67 previously published phylogenetic trees, we find that the highly variable structures of preleukemic trees emerge naturally from a simple model of somatic evolution in which there is pervasive positive selection acting throughout the disease trajectory. We infer that selective advantages of preleukemic clones are typically in the range of 9%-24% per year, but vary considerably between individuals. At these level of positive selection, we show that the identification of early multiple-mutant clones identifies individuals at risk of future AML.

Autori: Gladys Y.P. Poon, J. R. Blundell, A. Vedi, E. Laurenti, M. A. Sanders, P. Valk

Ultimo aggiornamento: 2024-05-22 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.12.15.571872

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.12.15.571872.full.pdf

Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia biorxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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