Il Ruolo di CTCF nell'Infezione da HTLV-1
La ricerca evidenzia l'impatto di CTCF sulla progressione della malattia HTLV-1 e sulla risposta immunitaria.
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Indice
- Struttura di HTLV-1
- Integrazione virale ed espressione genica
- Il ruolo di CTCF nell'infezione da HTLV-1
- Studio di HTLV-1 nei topi
- Osservazioni dagli esperimenti
- Carico provirale ed espressione genica
- Cambiamenti patologici nei topi infetti
- L'importanza delle risposte delle cellule T
- Effetti sull'espansione dei linfociti
- Riepilogo dei risultati
- Fonte originale
HTLV-1, o virus della leucemia a Cellule T umane di tipo 1, è un virus che può portare a una grave condizione nota come leucemia/linfoma a cellule T adulte (ATLL). Questo virus appartiene a una categoria di virus chiamati retrovirus, noti per la loro capacità di integrarsi nel materiale genetico dell'ospite. HTLV-1 ha certi geni che lo aiutano a replicarsi e diffondersi, oltre a geni che possono portare a crescita cancerosa nelle cellule infette.
Struttura di HTLV-1
HTLV-1 contiene un insieme di geni essenziali:
- Gag, Pol, e Env: Questi geni sono comuni nei retrovirus e sono responsabili della formazione del virus e della sua replicazione.
- Tax e Rex: Questi sono geni regolatori che giocano un ruolo nella capacità del virus di replicarsi e interagire con il sistema immunitario dell'ospite.
- Geni ausiliari: Questi includono p12, p30, e p13, che aiutano il virus a persistere e ad evitare la risposta immunitaria.
- Hbz: Questo gene ha un ruolo nella promozione della crescita delle cellule T.
Sia la proteina Tax che il prodotto hbz possono innescare la crescita cancerosa in laboratorio e nei modelli murini. Interessante notare che la proteina Tax non è sempre attiva in tutte le cellule infette, il che complica il modo in cui il virus opera nel corpo.
Integrazione virale ed espressione genica
La maggior parte delle cellule infette da HTLV-1 ospita una singola copia del DNA virale integrato nei loro cromosomi. Il DNA virale incorporato non è espresso in modo uniforme; alcune parti mostrano una forte metilazione del DNA, che è un modo in cui il corpo sopprime l'attività genica. Tuttavia, altre parti del DNA virale rimangono attive, consentendo un certo grado di espressione genica.
Un elemento speciale in questo processo è un sito di legame noto come sito CTCF, che è cruciale nel controllare come il virus interagisce con la macchina cellulare dell'ospite. Questo sito di legame aiuta a regolare l'attività del virus e la risposta delle cellule dell'ospite all'infezione.
Il ruolo di CTCF nell'infezione da HTLV-1
CTCF è una proteina che si lega a sequenze di DNA specifiche e gioca un ruolo fondamentale nell'organizzare la struttura del genoma. Influenza come i geni siano attivati o disattivati e regola il DNA virale quando si integra nel genoma dell'ospite. Alcuni virus, incluso HTLV-1, sfruttano questa proteina per mantenere un'infezione persistente e modificare la risposta immunitaria dell'ospite.
CTCF è anche noto per aiutare a gestire la latenza dei virus, che è la capacità di un virus di rimanere dormiente in un ospite senza causare malattie immediate. Comprendere come opera CTCF può fornire informazioni su perché alcune infezioni portano a malattie come il cancro mentre altre no.
Studio di HTLV-1 nei topi
Per capire meglio come funziona HTLV-1, i ricercatori hanno utilizzato un tipo speciale di modello murino chiamato topi umanizzati. Questi topi sono stati progettati per ospitare cellule immunitarie umane, rendendoli uno strumento prezioso per studiare le malattie umane.
In questi esperimenti, i ricercatori hanno esaminato come le mutazioni nel sito di legame CTCF influenzassero la capacità di HTLV-1 di replicarsi e causare malattie. Hanno utilizzato cellule infette specifiche e valutato come queste modifiche influenzassero vari indicatori di salute nel tempo.
Osservazioni dagli esperimenti
Negli esperimenti con topi umanizzati infettati da diversi ceppi di HTLV-1, sono emerse differenze notevoli. I topi infettati con una versione di HTLV-1 che può legarsi a CTCF mostravano sintomi di malattia più gravi e tassi di sopravvivenza più bassi rispetto a quelli infettati con una versione priva di questo sito di legame.
I risultati hanno indicato che la presenza del sito di legame CTCF era legata a una forma più severa della malattia. I topi che avevano mutazioni in questo sito mostravano dimensioni della milza ridotte e livelli complessivi più bassi di cellule immunitarie, suggerendo che la capacità del virus di mantenere l'infezione e guidare la malattia ha una relazione con il modo in cui interagisce con CTCF.
Carico provirale ed espressione genica
Utilizzando un metodo chiamato PCR a goccia digitale, i ricercatori hanno misurato la quantità di DNA virale presente nel sangue dei topi infetti in vari momenti durante lo studio. Hanno scoperto che il carico virale era significativamente più basso nei topi infettati con il virus privo del sito di legame CTCF. Questo suggerisce che CTCF gioca un ruolo nella promozione della Replicazione virale.
Come previsto, l'espressione genica complessiva del virus è stata influenzata dalla presenza o assenza di CTCF. Nelle splenociti infette (un tipo di cellula immunitaria), i ricercatori hanno trovato che i livelli di molecole di mRNA virale erano più alti in quelle infette con il ceppo standard di HTLV-1, mentre quelle con mutazioni nel sito di legame CTCF mostravano un'espressione genica virale ridotta.
Cambiamenti patologici nei topi infetti
L'esame dei tessuti dei topi infetti ha rivelato che quelli con infezioni attive da HTLV-1 mostravano segni di disturbi linfoproliferativi, il che significa che le loro cellule immunitarie stavano crescendo in modo incontrollabile. Questa proliferazione dei Linfociti era particolarmente evidente in organi specifici come la milza e il fegato.
Utilizzando tecniche di colorazione speciali, i ricercatori sono stati in grado di visualizzare questi cambiamenti e confermare che la maggior parte delle cellule infiltranti era un tipo di cellula immunitaria chiamata linfociti CD4+. Lo studio ha messo in evidenza le somiglianze patologiche tra i tessuti umani infetti e i topi umanizzati, il che rafforza la pertinenza di questi modelli animali.
L'importanza delle risposte delle cellule T
La risposta immunitaria nei topi infetti è stata anche un focus significativo dello studio. Il livello di attivazione delle cellule immunitarie, in particolare nelle popolazioni di cellule T, è stato osservato. La presenza di alcuni marcatori su queste cellule indicava che stavano rispondendo attivamente all'infezione virale.
Le differenze nella risposta immunitaria basate sul fatto che il virus potesse legarsi efficacemente a CTCF suggerivano che CTCF non fosse solo importante per la sopravvivenza del virus, ma anche per plasmare il panorama immunitario dell'ospite.
Effetti sull'espansione dei linfociti
I ricercatori hanno ulteriormente indagato come il sito di legame influisse sulla crescita dei linfociti (un tipo di globuli bianchi). Hanno notato che l'assenza del sito di legame CTCF portava a una minore velocità di espansione delle cellule T, in particolare delle cellule T CD8+, che sono cruciali per eliminare le cellule infette. Lo studio ha evidenziato che in assenza di CTCF, c'era non solo una riduzione del numero totale di cellule T, ma anche meno attività in quelle presenti.
Questo sottolinea un potenziale meccanismo attraverso il quale HTLV-1 può evitare la risposta immunitaria, portando a un'infezione cronica e allo sviluppo della malattia nel tempo.
Riepilogo dei risultati
In conclusione, la ricerca mostra che il legame di CTCF al provirus di HTLV-1 è un elemento cruciale nella progressione della malattia. La capacità del virus di manipolare gli strumenti genetici dell'ospite tramite CTCF influisce sia sulla replicazione virale che sulla risposta del sistema immunitario all'infezione.
Utilizzando topi umanizzati e studiando attentamente gli effetti di CTCF, i ricercatori possono ottenere informazioni critiche su come opera HTLV-1 e potenzialmente identificare strategie che potrebbero essere impiegate nel trattare o prevenire la malattia negli esseri umani.
Comprendere questi meccanismi apre la porta a ulteriori ricerche e potrebbe portare a nuove terapie che mirano a queste interazioni, riducendo potenzialmente l'impatto delle infezioni da HTLV-1 e delle malattie correlate.
Titolo: Role of the CTCF Binding Site in Human T-Cell Leukemia Virus-1 Pathogenesis
Estratto: During HTLV-1 infection, the virus integrates into the host cell genome as a provirus with a single CCCTC binding protein (CTCF) binding site (vCTCF-BS), which acts as an insulator between transcriptionally active and inactive regions. Previous studies have shown that the vCTCF-BS is important for maintenance of chromatin structure, regulation of viral expression, and DNA and histone methylation. Here, we show that the vCTCF-BS also regulates viral infection and pathogenesis in vivo in a humanized (Hu) mouse model of adult T-cell leukemia/lymphoma. Three cell lines were used to initiate infection of the Hu-mice, i) HTLV-1-WT which carries an intact HTLV-1 provirus genome, ii) HTLV-1-CTCF, which contains a provirus with a mutated vCTCF-BS which abolishes CTCF binding, and a stop codon immediate upstream of the mutated vCTCF-BS which deletes the last 23 amino acids of p12, and iii) HTLV-1-p12stop that contains the intact vCTCF-BS, but retains the same stop codon in p12 as in the HTLV-1-CTCF cell line. Hu-mice were infected with mitomycin treated or irradiated HTLV-1 producing cell lines. There was a delay in pathogenicity when Hu-mice were infected with the CTCF virus compared to mice infected with either p12 stop or WT virus. Proviral load (PVL), spleen weights, and CD4 T cell counts were significantly lower in HTLV-1-CTCF infected mice compared to HTLV-1-p12stop infected mice. Furthermore, we found a direct correlation between the PVL in peripheral blood and death of HTLV-1-CTCF infected mice. In cell lines, we found that the vCTCF-BS regulates Tax expression in a time-dependent manner. The scRNAseq analysis of splenocytes from infected mice suggests that the vCTCF-BS plays an important role in activation and expansion of T lymphocytes in vivo. Overall, these findings indicate that the vCTCF-BS regulates Tax expression, proviral load, and HTLV pathogenicity in vivo. Author SummaryHuman T-cell leukemia virus type 1 (HTLV-1) is a cause of leukemia and lymphoma, and several inflammatory medical disorders. The virus integrates in the host cell DNA, and it includes a single binding site for a cellular protein designated CTCF. This protein is important in regulation of many viruses, as well as properties of normal and malignant cells. In order to define the role of CTCF in HTLV-1 pathogenesis in vivo, we analyzed a mutant virus lacking the binding site in humanized mice. We found that this mutation slowed virus spread and attenuated the development of disease. Gene expression studies demonstrated a dynamic role of CTCF in regulating viral gene expression and T lymphocyte activation.
Autori: Lee Ratner, A. Joseph, X. Cheng, J. Harding, J. Al-Saleem, P. Green, D. Veis, D. A. Rauch
Ultimo aggiornamento: 2024-05-28 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.28.596170
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.28.596170.full.pdf
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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