Comprendere il Disturbo Depressivo Maggiore nelle Popolazioni Africane
Uno studio esamina i punteggi di rischio per la depressione nelle persone di origine africana.
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Indice
I disturbi depressivi sono tra le principali cause di disabilità nel mondo. Il Disturbo Depressivo Maggiore (MDD) è il tipo più comune di depressione che colpisce molte persone. Secondo le stime, oltre 322 milioni di persone soffrono di MDD in tutto il mondo, con un numero significativo di questi casi trovato in Africa. Anche se in Africa sono stati riportati tassi di MDD inferiori rispetto all'Europa e all'America del Nord, molti credono che questi numeri non riflettano la situazione reale, poiché molte persone con depressione in Africa rimangono non diagnosticate.
Genetica e Depressione
Il MDD può essere influenzato dalla genetica. Le ricerche mostrano che tra il 30% e il 40% del rischio di sviluppare MDD può essere ereditato. Capire meglio la genetica dietro il MDD potrebbe aiutare a identificare meglio la condizione e trovare trattamenti più efficaci. Finora, gli studi hanno identificato molte differenze genetiche legate alla depressione, concentrandosi principalmente su persone di discendenza europea. Tuttavia, si è scoperto che gli studi che coinvolgono europei sono più comuni, il che significa che le persone di altre origini potrebbero non beneficiare così tanto dei risultati.
A causa del focus sulle popolazioni europee, i punteggi di rischio creati da questi studi spesso prevedono la depressione meglio negli europei rispetto alle persone di discendenza africana. Ci sono vari motivi per cui ciò può accadere, comprese le differenze nel modo in cui si esprimono i tratti e come ambiente e geni interagiscono. Pochi studi hanno esaminato se questi punteggi di rischio funzionano bene per le persone al di fuori dell'Europa, specialmente per quelle di discendenza africana.
Lo Studio
Questo studio ha cercato di capire quanto bene i punteggi di rischio per il MDD sviluppati dalla ricerca europea si applicano agli individui di discendenza africana. Ha esaminato i partecipanti del UK Biobank, un grande studio sulla salute che coinvolge più di 500.000 persone di diverse origini nel Regno Unito. Lo studio ha raccolto molte informazioni sulla salute da questi partecipanti, inclusi dati genetici e sulla Salute Mentale.
Il team di ricerca ha creato un punteggio legato alla depressione utilizzando dati da studi europei e lo ha confrontato con i risultati di uno studio più piccolo che coinvolgeva afroamericani. Volevano vedere se i punteggi di rischio sviluppati da questi gruppi diversi potessero prevedere il MDD nelle persone di discendenza africana all'interno del UK Biobank.
Valutazione dei Partecipanti
Per valutare i partecipanti, il team ha usato un metodo chiamato analisi delle componenti principali (PCA), che aiuta a raggruppare le persone in base alle loro somiglianze genetiche. Si sono concentrati su quelli che si sono identificati come neri o di discendenza africana e hanno usato dati dal progetto globale 1000 Genomes per identificare i gruppi giusti.
Dal UK Biobank, hanno identificato partecipanti che assomigliavano a un cluster Genetico africano, portando a una selezione di 8.543 individui per ulteriori analisi. Tra questi, 1.090 partecipanti hanno completato un questionario sulla salute mentale, con 190 che mostrano segni di MDD e 671 che fungevano da gruppo di controllo senza depressione.
Calcolo dei Punteggi di Rischio
Per calcolare i punteggi di rischio, i ricercatori hanno usato un programma software che combina dati genetici da molti studi. Si sono concentrati su polimorfismi a singolo nucleotide (SNP), che sono piccole variazioni nel DNA che possono influenzare il rischio di MDD. Hanno filtrato gli SNP meno rilevanti in base alla loro significatività statistica, assicurandosi di analizzare solo i risultati più significativi.
Hanno raccolto dati da studi diversi, inclusi quelli focalizzati sugli afroamericani e vari gruppi dall'Africa. Questo ha permesso loro di vedere come studi diversi influenzassero i loro risultati riguardo al MDD.
Risultati dello Studio
I risultati hanno mostrato che i punteggi di rischio creati dai dati afroamericani prevedevano significativamente il MDD nei partecipanti di discendenza africana nel UK Biobank. La previsione più accurata proveniva da una soglia statistica specifica, spiegando una piccola percentuale di variazione nel rischio di depressione.
Quando hanno confrontato i punteggi di rischio derivati dal campione afroamericano con quelli di uno studio europeo più grande, hanno trovato che il piccolo studio afroamericano aveva un'accuratezza di previsione comparabile. Tuttavia, esaminando i dati di una meta-analisi che includeva diversi studi africani, i risultati sono stati inaspettati. Si aspettavano che quei punteggi funzionassero bene, ma hanno scoperto che non prevedevano efficacemente il MDD.
Perché È Importante?
Capire perché i punteggi derivati dagli africani non hanno avuto buone prestazioni potrebbe indicare vari problemi. Le differenze nel modo in cui la depressione è stata definita e misurata tra gli studi hanno probabilmente giocato un ruolo. Ad esempio, alcuni studi potrebbero aver usato criteri rigidi mentre altri erano più permissivi, portando a incongruenze. Inoltre, il patrimonio genetico dei gruppi nella meta-analisi variava significativamente a causa di ancestrali misti, il che potrebbe aver portato a previsioni meno accurate.
Studi precedenti hanno trovato che la depressione condivide legami genetici con altri tratti, ma le indagini che esaminano questa base genetica condivisa tra diverse popolazioni rimangono limitate. Questo studio mette in evidenza la necessità di ricerche future che si concentrino sullo sviluppo di punteggi di rischio utilizzando dati specifici delle popolazioni africane.
Previsioni Incrociate dei Tratti
Lo studio ha anche esaminato se i tratti noti per essere correlati al MDD negli europei potessero prevedere il MDD negli individui di discendenza africana. L'analisi ha concluso che, mentre i risultati della ricerca europea prevedevano diversi tratti tra i partecipanti africani, non avevano prodotto previsioni riuscite per il MDD utilizzando tratti correlati. Questa scoperta suggerisce che l'uso di dati europei per studiare la depressione in altre popolazioni potrebbe non essere efficiente.
Conclusione
In sintesi, questo studio fa luce sulle differenze nel modo in cui il MDD è compreso e valutato tra diverse popolazioni. Sottolinea l'importanza di utilizzare dati genetici pertinenti che riflettano l'ascendenza degli individui in studio. Ulteriori sforzi per indagare e sviluppare punteggi di rischio specificamente per le popolazioni africane potrebbero portare a una migliore comprensione e trattamento della depressione in queste comunità.
Riconoscendo i limiti della ricerca attuale e promuovendo studi che si spostano su ancestrali diverse, possiamo migliorare la nostra risposta a sfide di salute mentale come la depressione. Anche con i progressi nella genetica, rimane essenziale adattare gli sforzi di ricerca per affrontare le esigenze uniche delle diverse popolazioni. Così facendo, possiamo lavorare verso metodi più efficaci per prevedere, diagnosticare e trattare i disturbi di salute mentale in tutto il mondo.
Titolo: Polygenic prediction of major depressive disorder and related traits in African ancestries UK Biobank participants.
Estratto: IntroductionGenome-Wide Association Studies (GWAS) over-represent European ancestries compared to the global population, neglecting all other ancestry groups and low-income nations. Consequently, polygenic risk scores (PRS) more accurately predict complex traits in Europeans than African Ancestries groups. Very few studies have looked at the transferability of European-derived PRS for behavioural and mental health phenotypes to non-Europeans. We assessed the comparative accuracy of PRS for Major Depressive Disorder (MDD) trained on European and African Ancestries GWAS studies to predict MDD and related traits in African Ancestries participants from the UK Biobank. MethodsUK Biobank participants were selected based on Principal component analysis (PCA) clustering with an African genetic similarity reference population and MDD was assessed with the Composite International Diagnostic Interview (CIDI). Polygenic Risk Scores (PRS) were computed using PRSice2 using either European or African Ancestries GWAS summary statistics. ResultsPRS trained on European ancestry samples (246,363 cases) predicted case control status in Africans of the UK Biobank with similar accuracies (190 cases, R2=2%) to PRS trained on far much smaller samples of African Ancestries participants from 23andMe, Inc. (5045 cases, R2=1.8%). This suggests that prediction of MDD status from Africans to Africans had greater efficiency per unit increase in the discovery sample size than prediction of MDD from Europeans to Africans. Prediction of MDD status in African UK Biobank participants using GWAS findings of causal risk factors from European ancestries was non-significant. ConclusionGWAS studies of MDD in European ancestries are an inefficient means of improving polygenic prediction accuracy in African samples.
Autori: Andrew M McIntosh, S. C. Kanjira, M. C. Adams, Y. Jiang, C. Tian, 23andMe Research Team, C. Lewis, K. Kuchenbaecker
Ultimo aggiornamento: 2023-12-28 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.12.24.23300412
Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.12.24.23300412.full.pdf
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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