Prevedere l'attività cerebrale nei pazienti con tumore
Il fingerprinting del connettoma sembra promettente nel prevedere le funzioni cerebrali per la pianificazione chirurgica.
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Indice
- Differenze Individuali nella Funzione Cerebrale
- Il Ruolo della fMRI a Riposo
- Fingerprinting del Connettoma: Un Nuovo Approccio
- Panoramica dello Studio
- Analisi dei Fattori che Influenzano le Previsioni
- Previsioni Cross-Scanner
- Previsioni e Risultati per i Pazienti
- Conclusione e Direzioni Future
- Fonte originale
La Risonanza Magnetica Funzionale (fMRI) è uno strumento che aiuta i dottori a capire quali parti del cervello sono responsabili di diverse funzioni come il movimento e il linguaggio. Queste informazioni sono particolarmente importanti prima di interventi chirurgici per rimuovere tumori cerebrali, in quanto aiutano i chirurghi a operare minimizzando il rischio di danneggiare aree cerebrali critiche. Ci sono vari modi di usare la fMRI: uno è chiamato FMRI basata su compiti (t-fMRI), dove i pazienti svolgono compiti specifici per rivelare come funziona il cervello durante quelle attività. Un altro metodo, chiamato FMRI a riposo (rs-fMRI), guarda a come funziona il cervello quando una persona non sta facendo nulla.
Tuttavia, non tutti i pazienti possono svolgere compiti durante la t-fMRI. Per chi ha difficoltà, la rs-fMRI può comunque fornire informazioni preziose sulle reti cerebrali senza richiedere un coinvolgimento attivo. Ma ci sono discussioni in corso nella comunità medica su quanto sia efficace la rs-fMRI per mappare le reti cerebrali da sola. Alcuni esperti pensano che dovrebbe essere combinata con la t-fMRI per risultati migliori.
Differenze Individuali nella Funzione Cerebrale
Ogni cervello è unico, e queste differenze individuali possono essere trascurate quando i ricercatori fanno la media dei risultati da più soggetti. Recenti progressi nello studio di queste differenze hanno mostrato che è possibile identificare funzioni cerebrali specifiche in singoli individui che spesso vengono perse negli studi su grandi gruppi. Concentrandosi sulla mappatura cerebrale individuale, i dottori possono ottenere un quadro più chiaro delle reti cerebrali di un paziente, che è cruciale per la pianificazione chirurgica.
Il Ruolo della fMRI a Riposo
Utilizzando la rs-fMRI, i ricercatori possono analizzare le reti cerebrali sia in individui sani che in pazienti che necessitano di intervento. Questo metodo misura l'attività cerebrale in diverse aree mentre la persona è a riposo. Varie tecniche permettono agli esperti di stimare le reti cerebrali basate sui dati della rs-fMRI, e alcuni studi hanno dimostrato che queste reti possono fornire informazioni utili, in particolare riguardo alle aree responsabili del movimento.
Fingerprinting del Connettoma: Un Nuovo Approccio
Una nuova tecnica chiamata Fingerprinting del Connettoma (CF) mira a prevedere quanto attive saranno determinate parti del cervello durante compiti specifici analizzando la connettività cerebrale individuale. Questo modello esamina le connessioni nel cervello e le usa per fare previsioni su come diverse aree reagiranno durante compiti come muovere una mano o parlare. Il CF potrebbe aiutare a migliorare la precisione della mappatura cerebrale in pazienti che non possono partecipare facilmente a studi basati su compiti.
Panoramica dello Studio
In questo studio, abbiamo analizzato quanto bene il CF poteva identificare le funzioni cerebrali in pazienti in preparazione per interventi. Abbiamo usato dati esistenti sia da individui sani che da pazienti tumorali per vedere se il CF poteva prevedere accuratamente come diverse parti del cervello vengono attivate durante compiti.
Raccolta Dati
Abbiamo raccolto dati di fMRI da due fonti principali. La prima era un grande database contenente scansioni cerebrali di 1.200 volontari sani, che ha permesso un esame approfondito della struttura e funzione cerebrale. Questi dati hanno fornito una base per comprendere l'attività cerebrale tipica. La seconda fonte era un dataset clinico da pazienti con tumori cerebrali, che includeva sia volontari sani che pazienti in fase di intervento.
Abbiamo esaminato i dati fMRI di questi gruppi per applicare i modelli CF e confrontare le previsioni. Progettando il nostro studio in questo modo, miravamo a valutare quanto fosse efficace la tecnica CF per prevedere l'attività cerebrale basata sulle scansioni a riposo.
Analisi dei Fattori che Influenzano le Previsioni
Per ottenere i migliori risultati, dovevamo capire diversi fattori che potevano influenzare le performance dei nostri modelli CF. Abbiamo esaminato le seguenti aree:
- Diversi tipi di contrasti di compito (compiti specifici contro riposo generale).
- Il livello di dettaglio nella mappatura cerebrale (come il cervello è diviso in aree).
- La dimensione dell'area esaminata (spazio di ricerca).
- La quantità di dati raccolti per l'addestramento e il test del modello.
Dovevamo trovare la migliore combinazione di questi fattori per ottenere le previsioni più accurate per l'attività cerebrale durante i compiti motori.
Specificità del Contrasto di Compito
Abbiamo scoperto che utilizzare contrasti di compito più specifici ha fatto una grande differenza nell'accuratezza delle previsioni. Ad esempio, confrontare condizioni motorie attive rispetto alla media di altre condizioni motorie ha dato risultati migliori che confrontarle con uno stato di riposo. Questa intuizione suggerisce che raccogliere dati completi legati ai compiti può migliorare la comprensione delle reti cerebrali.
Impatto degli Schemi di Mappatura Cerebrale
Abbiamo anche esplorato diversi metodi per mappare la struttura del cervello. Alcune tecniche di mappatura cerebrale forniscono suddivisioni più dettagliate delle aree cerebrali rispetto ad altre. Abbiamo scoperto che lo schema di mappatura di Schaefer, che divide il cervello in 400 o 1.000 regioni più piccole, ha dato risultati migliori rispetto a un altro schema comune. Questo dimostra che la scelta della mappatura cerebrale influisce su quanto accuratamente possiamo prevedere l'attività cerebrale.
Importanza dello Spazio di Ricerca
Quando abbiamo regolato l'area su cui ci siamo concentrati per le previsioni, abbiamo visto anche differenze nei nostri risultati. Utilizzando un focus più ristretto solo sulle aree motorie, anziché includere anche aree sensoriali, abbiamo migliorato l'accuratezza delle nostre previsioni. Questa scoperta indica che comprendere i confini funzionali nel cervello può aiutare a creare modelli più efficaci.
Dati di Addestramento e Test
Abbiamo indagato su quanto fosse necessario raccogliere per creare previsioni affidabili. La nostra analisi ha rivelato che avere circa 20-30 soggetti con sufficienti dati di fMRI a riposo ha portato a una buona accuratezza nelle previsioni. Inoltre, la quantità di dati a riposo raccolti da singoli soggetti è risultata fondamentale per l'accuratezza delle nostre previsioni durante i test.
Effetti del Movimento della Testa
Il movimento durante le scansioni può influenzare negativamente la qualità dei dati raccolti. Abbiamo trovato che quando i pazienti si muovevano troppo durante le scansioni, ciò portava a previsioni meno accurate. Questo sottolinea l'importanza di minimizzare il movimento del paziente durante la scansione fMRI per garantire dati di alta qualità.
Previsioni Cross-Scanner
Un aspetto essenziale del nostro studio era determinare se i modelli addestrati su un set di dati potessero essere applicati a un altro, specialmente su macchine e impostazioni diverse. È fondamentale che questi modelli funzionino in modo affidabile in vari ambienti clinici. I nostri risultati hanno mostrato che i modelli addestrati su dati da soggetti sani potevano fare previsioni accurate quando testati su pazienti provenienti da diverse località.
Nonostante le differenze nella qualità dello scanner e nei metodi di raccolta dei dati, i modelli CF si sono trasferiti con successo tra i due ambienti. Questa scoperta supporta l'idea che la tecnica CF possa essere adattata per un uso clinico diffuso.
Previsioni e Risultati per i Pazienti
Abbiamo poi applicato i modelli CF per prevedere l'attività cerebrale in pazienti con tumori. Concentrandoci sui dati raccolti da pazienti che hanno completato con successo la pre-elaborazione, siamo stati in grado di vedere se il CF poteva prevedere con precisione compiti motori basati sui dati disponibili.
In alcuni casi, come nel paziente #10, il modello ha previsto i compiti motori molto bene, indicando che anche nei pazienti con tumori, il modello CF può fornire informazioni utili. Tuttavia, per altri pazienti, le previsioni non erano altrettanto forti, in particolare se il tumore era situato vicino a aree motorie critiche o se i pazienti avevano dati di attivazione dei compiti meno affidabili.
Per i pazienti con dati sui compiti motori mancanti, potevamo comunque generare previsioni basate solo sui loro dati di fMRI a riposo. Questo aspetto del modello CF è particolarmente vantaggioso, poiché apre possibilità per pazienti che non possono completare compiti motori standard a causa delle loro condizioni.
Conclusione e Direzioni Future
Questo studio ha messo in luce il potenziale dell'uso del Fingerprinting del Connettoma per prevedere la funzione cerebrale in pazienti tumorali sottoposti a intervento. Abbiamo scoperto che selezionando con attenzione i contrasti di compiti, utilizzando le giuste tecniche di mappatura cerebrale e garantendo una raccolta di dati adeguata, potevamo migliorare significativamente l'accuratezza delle previsioni.
I risultati sottolineano l'importanza delle differenze individuali nella funzione cerebrale e suggeriscono che il CF potrebbe servire come uno strumento prezioso per la pianificazione chirurgica. Con l'aumento della disponibilità di dati, studi futuri potrebbero affinare questi modelli e ampliare la loro applicabilità ad altre funzioni cognitive, migliorando in definitiva i risultati clinici per i pazienti con tumori cerebrali.
Titolo: Utilizing Connectome Fingerprinting functional MRI models for motor activity prediction in presurgical planning: a feasibility study
Estratto: Presurgical planning prior to brain tumor resection is critical for the preservation of neurologic function post-operatively. Neurosurgeons increasingly use advanced brain mapping techniques pre- and intra-operatively to delineate brain regions which are "eloquent" and should be spared during resection. Functional MRI (fMRI) has emerged as a commonly used non-invasive modality for individual patient mapping of critical cortical regions such as motor, language, and visual cortices. To map motor function, patients are scanned using fMRI while they perform various motor tasks to identify brain networks critical for motor performance, but it may be difficult for some patients to perform tasks in the scanner due to pre-existing deficits. Connectome Fingerprinting (CF) is a machine-learning approach that learns associations between resting-state functional networks of a brain region and the activations in the region for specific tasks; once a CF model is constructed, individualized predictions of task activation can be generated from resting-state data. Here we utilized CF to train models on high-quality data from 208 subjects in the Human Connectome Project (HCP) and used this to predict task activations in our cohort of healthy control subjects (n=15) and presurgical patients (n=16) using resting-state fMRI (rs-fMRI) data. The prediction quality was validated with task fMRI data in the healthy controls and patients. We found that the task predictions for motor areas are on par with actual task activations in most healthy subjects (model accuracy around 90-100% of task reliability) and some patients suggesting the CF models can be reliably substituted where task data is either not possible to collect or hard for subjects to perform. We were also able to make robust predictions in cases in which there were no task-related activations elicited. The findings demonstrate the utility of the CF approach for predicting activations in out-of-sample subjects, across sites and scanners, and in patient populations. This work supports the feasibility of the application of CF models to presurgical planning, while also revealing challenges to be addressed in future developments.
Autori: Vaibhav Tripathi, L. Rigolo, B. Bracken, C. P. Galvin, A. J. Golby, Y. Tie, D. C. Somers
Ultimo aggiornamento: 2024-02-20 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.02.16.24302895
Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.02.16.24302895.full.pdf
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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