Test genetici nelle malattie cardiache: il ruolo della diversità

Le condizioni cardiache ereditarie, come la Cardiomiopatia ipertrofica (HCM), la Cardiomiopatia dilatativa (DCM) e la cardiomiopatia restrittiva (RCM), colpiscono circa 1 persona ogni 200-500. Queste condizioni vengono spesso trasmesse attraverso le famiglie e i loro sintomi possono variare molto. Alcuni possono sentire solo sintomi lievi, mentre altri possono avere problemi gravi, compresi insufficienza cardiaca o morte cardiaca improvvisa (SCD).

I Test genetici possono aiutare a identificare la causa genetica specifica per queste condizioni in circa metà dei pazienti. Questo tipo di test cerca cambiamenti nei geni che si sa influenzano la funzione cardiaca. Un gene chiave è TNNT2, che codifica per una proteina essenziale per il funzionamento del muscolo cardiaco. Le variazioni in questo gene sono collegate sia all'HCM che alla DCM. Anche se sono stati trovati cambiamenti in TNNT2 in alcuni casi di RCM, non c'è un riconoscimento ufficiale che l'RCM sia causato direttamente da questo gene.

#Sfide dei Test Genetici

Un problema importante è che molti studi genetici non includono persone di background diversi. Questa mancanza di rappresentanza rende più difficile capire il significato di certi cambiamenti genetici in persone di diverse origini. Spesso, il test genetico è meno efficace per quelli non di origine europea perché più cambiamenti genetici vengono etichettati come "incerti".

Quando si tratta di malattie genetiche rare, la frequenza di un cambiamento genetico nella popolazione aiuta a determinare se può causare malattia. Se un cambiamento è comune nella popolazione generale, è meno probabile che sia la causa di una malattia rara. Tuttavia, se l'individuo ha un'ascendenza non ben rappresentata negli studi genetici, può essere fuorviante etichettare un cambiamento genetico come raro.

#Ascendenza e Diversità nella Genomica

C'è uno sforzo globale per includere più ascendenza diversa negli studi genetici. Aggiornamenti recenti ai database genomici hanno aggiunto migliaia di individui provenienti da background precedentemente sottorappresentati. Tuttavia, le persone con ascendenza dall'Oceania-regioni come l'Australia e le Isole del Pacifico-rimangono in gran parte assenti da questi database.

Gli esseri umani moderni in Oceania hanno una storia complessa, con due gruppi ancestrali principali. Il primo gruppo è arrivato nel Sud-est asiatico oltre 40.000 anni fa, contribuendo ai geni degli australiani indigeni e di alcuni isolani del Pacifico. Il secondo gruppo era più strettamente connesso con gli asiatici orientali e si è stabilito in Oceania circa 3.000 anni fa.

#Studio di Caso della Variazione TNNT2

Abbiamo identificato un cambiamento genetico specifico nel gene TNNT2, etichettato c.571-1G>A, in due persone con condizioni cardiache e ascendenza oceanica. Entrambi gli individui hanno acconsentito a far sequenziare i loro genomi come parte di una clinica specializzata in malattie cardiache a Sydney, Australia.

Per raccogliere più dati su questa variazione, abbiamo cercato nella letteratura e consultato laboratori clinici per raccogliere dettagli su altri casi. Abbiamo anche esaminato vari database popolazionali per capire quanto fosse comune o raro questa variazione tra diversi gruppi.

#Profili dei Pazienti

Il primo caso coinvolge un giovane maschio di ascendenza oceanica che ha subito morte cardiaca improvvisa senza una causa chiara. Il secondo caso è un bambino di ascendenza oceanica con RCM che è morto per insufficienza cardiaca a rapida evoluzione; questo bambino aveva anche un altro cambiamento genetico legato a condizioni cardiache.

Esaminando database clinici, abbiamo trovato diversi casi relativi a questo cambiamento genetico. La maggior parte di queste voci classifica la variazione come "incerta", principalmente perché non è stata confermata come causa di condizioni cardiache. Solo pochi rapporti tendono a classificarla come potenzialmente dannosa.

#Analisi della Variazione

La variazione TNNT2 che abbiamo studiato altera un'area critica del gene che influisce su come il gene viene elaborato nel corpo. Questa variazione interrompe un sito specifico nel gene TNNT2, il che può portare a un piccolo cambiamento nella proteina risultante. Tuttavia, basandoci sugli studi, questo piccolo cambiamento probabilmente avrà poco o nessun impatto su come funziona il gene.

Nella nostra ricerca, abbiamo scoperto che questa variazione appare spesso in individui di origini oceaniche. Era presente in una piccola percentuale di individui provenienti da vari database genetici, in particolare quelli focalizzati sull'Oceania. Tra gruppi specifici, la frequenza della variazione ha raggiunto anche il 50% in un paio di individui australiani.

#Implicazioni Più Ampie

Avere una vasta gamma di ascendenze negli studi genetici è fondamentale per interpretare accuratamente i cambiamenti genetici. Quando si testano condizioni cardiache ereditarie, è essenziale includere l'ascendenza del paziente, poiché questo può influenzare significativamente la classificazione delle varianti genetiche. Nel nostro studio, abbiamo scoperto che molti laboratori di test avevano classificato erroneamente la variazione, considerandola potenzialmente dannosa nonostante l'evidenza suggerisse il contrario.

In conclusione, la nostra valutazione indica che la variazione TNNT2 identificata probabilmente non è una causa diretta di condizioni cardiache nella maggior parte degli individui di origine oceanica, poiché è troppo comune per essere responsabile di questi seri problemi di salute. Tuttavia, le complessità che circondano i test genetici evidenziano la necessità di includere popolazioni diverse nella ricerca genetica.

#La Necessità di Una Ricerca Più Inclusiva

Nonostante i progressi, c'è ancora molta strada da fare per raggiungere un approccio completamente rappresentativo nella genomica. Migliorare la diversità dei database genetici richiede tempo, sforzo e collaborazione con varie comunità. È essenziale condividere i dati in modo etico e responsabile per migliorare la comprensione della salute e della malattia tra diverse popolazioni.

Raccogliere informazioni accurate sull'ascendenza durante i test genetici è cruciale. Se gli individui non possono fornire queste informazioni, potrebbe essere necessario dedurre l'ascendenza dai loro dati genetici. Questo passaggio può aiutare a prevenire malintesi riguardo ai rischi associati a specifici cambiamenti genetici e ridurre l'ansia inutile per i pazienti.

#Conclusione

La nostra analisi della variazione TNNT2 mette in evidenza le sfide che sorgono dall'interpretare informazioni genetiche tra individui con ascendenze meno rappresentate. Il lavoro futuro deve concentrarsi sull'aumento dell'accesso a dati genetici diversificati per garantire che tutti possano beneficiare dei progressi nella medicina genomica. Favorendo la collaborazione e il coinvolgimento della comunità, possiamo costruire un approccio più inclusivo per comprendere i disturbi genetici e migliorare l'assistenza ai pazienti per tutti.