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Indagare i cambiamenti cerebrali nei disturbi dello spettro autistico

La ricerca svela differenze chiave negli assoni nell'autismo usando tecniche di machine learning.

Basilis Zikopoulos, A. Yazdanbakhsh, K. Dang, K. Kuang, T. Lian, X. Liu, S. Xie

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Indice

Il Disturbo dello Spettro Autistico (ASD) cambia il modo in cui le connessioni e le comunicazioni neuronali funzionano nel cervello. Gli studi hanno scoperto che ci sono cambiamenti in aree specifiche del cervello legate a questa condizione. Questi cambiamenti includono differenze nelle strutture chiamate assoni, che sono come fili che trasportano segnali in tutto il cervello.

Scoperte Chiave nei Cambiamenti degli Assoni

La ricerca mostra che nelle persone con ASD, c'è spesso un aumento del numero di assoni sottili, mentre gli assoni più spessi tendono ad essere meno densi. Questo potrebbe portare a problemi su come i segnali vengono trasmessi nel cervello. Altri cambiamenti riportati includono un'eccessiva ramificazione degli assoni a causa di specifiche proteine, assottigliamento dello strato protettivo attorno agli assoni chiamato mielina e variazioni nei percorsi degli assoni.

Queste differenze possono influenzare la rapidità con cui viaggiano i segnali e quanto siano forti le connessioni, impattando sulle funzioni cerebrali complessive e sulle comunicazioni. La posizione e le dimensioni di questi assoni possono anche fornire indizi su come si connettono ad altre aree del cervello.

Il Ruolo della Sostanza Bianca

La sostanza bianca nel cervello è importante per le connessioni. La sostanza bianca superficiale (SWM) contiene principalmente connessioni a breve raggio, mentre la sostanza bianca profonda (DWM) contiene connessioni a lungo raggio. Gli assoni nella DWM tendono a essere più spessi di quelli trovati nella SWM.

Studiare la sostanza bianca è fondamentale perché può aiutarci a comprendere i percorsi cerebrali e come possano essere interrotti nell'autismo. I metodi tradizionali per analizzare questi assoni richiedono tempo e competenze esperte, rendendoli difficili per studi più ampi destinati a identificare problemi nell'ASD.

Machine Learning come Soluzione

Il machine learning potrebbe offrire un nuovo modo per analizzare immagini dettagliate degli assoni mielinizzati nella sostanza bianca. Le reti neurali profonde (DNN) sono un tipo di strumento di machine learning che si è dimostrato efficace nella classificazione delle immagini. Possono aiutare a distinguere tra immagini di individui neurotipici e quelli con ASD.

Per questo studio, è stata utilizzata una DNN ben nota chiamata GoogLeNet. Ha fornito un framework per personalizzare un modello che potesse differenziare immagini ad alta risoluzione di assoni nei cervelli di individui con e senza ASD.

Focalizzandosi sulla Corteccia Cingolata Anteriore

Il focus era sulla sostanza bianca sotto la corteccia cingolata anteriore (ACC), una parte del cervello coinvolta nell'attenzione, nelle emozioni e nelle interazioni sociali-aree spesso colpite nell'autismo. L'ACC mostra differenze di attività notevoli nelle persone con ASD, portando i ricercatori a pensare che esaminare la sua sostanza bianca potrebbe rivelare informazioni importanti sul disturbo.

Raccolta e Analisi dei Dati

Per creare il modello, i ricercatori hanno utilizzato grandi set di dati di immagini da campioni cerebrali. Hanno preparato due tipi di immagini: una usando la Microscopia Elettronica, che fornisce immagini strutturali dettagliate, e l'altra usando la microscopia ottica. I campioni di tessuto provenivano da cervelli post-mortem di individui neurotipici e di quelli con autismo.

I campioni sono stati elaborati e immaginati in un modo specifico per garantire una cattura accurata delle caratteristiche. L'obiettivo era creare un dataset che potesse essere utilizzato per addestrare il modello di machine learning in modo efficace.

Preparare le Immagini per il Machine Learning

Per ottimizzare il dataset, sono stati applicati due metodi. Il primo prevedeva di tagliare le immagini originali in sezioni più piccole. In questo modo, il modello poteva apprendere da varie parti di ogni immagine. Il secondo metodo utilizzava una finestra scorrevole per creare sezioni sovrapposte, aumentando il numero di immagini disponibili per l'addestramento.

Prima di essere immesse nel modello, le immagini hanno subito ulteriori elaborazioni per migliorare la qualità e garantire coerenza. Questo includeva aggiustamenti dei contrasti e normalizzazione dei valori, rendendo più facile per il modello imparare in modo efficace.

Addestramento della Rete Neurale Profonda

Per garantire risultati affidabili, i ricercatori hanno suddiviso le immagini in diversi set per l'addestramento, la validazione e il test. Hanno anche utilizzato tecniche per bilanciare il numero di immagini di ciascuna classe per migliorare la capacità del modello di apprendere.

È stato utilizzato il trasferimento di apprendimento, impiegando un modello pre-addestrato per aiutare con il nuovo dataset, migliorando efficienza e accuratezza. Diversi modelli pre-addestrati sono stati testati, e quelli più efficaci sono stati ottimizzati per il compito specifico di classificare le immagini degli assoni.

Valutazione delle Prestazioni del Modello

Sono stati utilizzati più metodi per valutare quanto bene il modello si comportasse. Tecniche di cross-validation hanno garantito che il modello apprendesse efficacemente da diversi gruppi di immagini. Le matrici di confusione hanno aiutato a visualizzare quanto bene il modello classificasse le diverse classi e a identificare aree di miglioramento.

Lo studio ha anche calcolato metriche di precisione e richiamo, fornendo approfondimenti più approfonditi sulle prestazioni del modello. L'area sotto la curva caratteristica operativa di ricezione (AUC) è stata un'altra misura importante per valutare l'efficacia complessiva.

Utilizzo di Mappe di Sensibilità per Approfondimenti

Per analizzare ulteriormente i risultati, sono state generate mappe di sensibilità per evidenziare quali parti delle immagini influenzavano le decisioni del modello. Queste mappe hanno aiutato a identificare caratteristiche specifiche che hanno contribuito a classificazioni corrette e errate, offrendo indizi sulle differenze strutturali nel cervello tra individui neurotipici e quelli con ASD.

Immagini DeepDream per Visualizzare le Caratteristiche

Sono state create immagini DeepDream per illustrare le caratteristiche apprese dal modello. Queste immagini aiutano a visualizzare schemi e caratteristiche importanti per i compiti di classificazione. Migliorando dettagli specifici delle immagini, i ricercatori potevano vedere caratteristiche distinte che aiutavano a distinguere tra diverse classi.

Scoperte e Approfondimenti

I risultati hanno mostrato che il modello riusciva a classificare le immagini dei gruppi ASD e neurotipici con alta precisione. Tuttavia, distinguere tra le diverse profondità della sostanza bianca era più impegnativo. L'analisi ha evidenziato la difficoltà nel classificare correttamente la sostanza bianca superficiale negli individui con ASD, suggerendo una variabilità significativa in queste aree.

Le scoperte hanno indicato una fusione delle aree di sostanza bianca nei cervelli delle persone con ASD. Questo suggerisce che le differenze strutturali negli assoni potrebbero essere più pronunciate sotto l'ACC, mostrando cambiamenti diffusi che influiscono su come il cervello comunica.

Sfide e Direzioni Future

Anche se il modello ha funzionato bene, rimangono varie sfide. La dimensione limitata del dataset e la variabilità delle immagini possono influenzare la capacità del modello di generalizzare a nuovi dati. Gli studi futuri dovrebbero concentrarsi sull'espansione dei dataset ed esplorare altre aree del cervello per identificare ulteriori schemi e approfondimenti relativi all'ASD.

L'approccio adottato in questo studio promette di aiutare a comprendere la connettività cerebrale negli individui neurotipici e in quelli con disturbi mentali. Analizzando sistematicamente le immagini delle strutture cerebrali e utilizzando il machine learning, i ricercatori possono scoprire informazioni vitali che potrebbero guidare future diagnosi e interventi per l'autismo.

Conclusione

L'uso del machine learning per analizzare le immagini cerebrali fornisce nuove intuizioni sulle differenze strutturali nell'ASD. Questo studio dimostra l'efficacia di combinare imaging ad alta risoluzione con metodi analitici avanzati. I risultati evidenziano specifiche caratteristiche assonali che potrebbero essere mirate per ulteriori ricerche, portando potenzialmente a una migliore comprensione e opzioni di trattamento per gli individui con autismo.

Fonte originale

Titolo: Artificial intelligence networks combining histopathology and machine learning can extract axon pathology in autism spectrum disorder

Estratto: Axon features that underlie the structural and functional organization of cortical pathways have distinct patterns in the brains of neurotypical controls (CTR) compared to individuals with Autism Spectrum Disorder (ASD). However, detailed axon study demands labor-intensive surveys and time-consuming analysis of microscopic sections from post-mortem human brain tissue, making it challenging to systematically examine large regions of the brain. To address these challenges, we developed an approach that uses machine learning to automatically classify microscopic sections from ASD and CTR brains, while also considering different white matter regions: superficial white matter (SWM), which contains a majority of axons that connect nearby cortical areas, and deep white matter (DWM), which is comprised exclusively by axons that participate in long-range pathways. The result was a deep neural network that can successfully classify the white matter below the anterior cingulate cortex (ACC) of ASD and CTR groups with 98% accuracy, while also distinguishing between DWM and SWM pathway composition with high average accuracy, up to 80%. Multidimensional scaling analysis and sensitivity maps further underscored the reliability of ASD vs CTR classification, based on the consistency of axon pathology, while highlighting the important role of white matter location that constrains pathway dysfunction, based on several shared anatomical markers. Large datasets that can be used to expand training, validation, and testing of this network have the potential to automate high-resolution microscopic analysis of post-mortem brain tissue, so that it can be used to systematically study white matter across brain regions in health and disease. One Sentence StatementHistopathology-trained AI can identify ASD network disruptions and guide development of diagnostics and targeted therapeutics.

Autori: Basilis Zikopoulos, A. Yazdanbakhsh, K. Dang, K. Kuang, T. Lian, X. Liu, S. Xie

Ultimo aggiornamento: 2024-10-26 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.25.620308

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.25.620308.full.pdf

Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia biorxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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