Fattori genetici nel cambiamento di sesso della trota arcobaleno
La ricerca identifica i geni che influenzano il cambio di sesso nella trota iridescente per migliorare l'acquacoltura.
Florence Phocas, A. Dehaullon, C. Fraslin, A. Bestin, C. Poncet, Y. Guiguen, E. Quillet
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Indice
- Come i pesci determinano il loro sesso
- Il ruolo della reversibilità del sesso nell'acquacoltura
- Identificazione dei geni determinanti il sesso nella trota iridea
- Metodologia dello studio
- Raccolta dei campioni
- Analisi dei dati
- Risultati: scoperte sui QTL (loci di carattere quantitativo)
- Geni candidati e i loro possibili ruoli
- Geni su Omy1
- Geni su Omy20
- Altri fattori importanti
- Implicazioni per l'allevamento ittico
- Conclusione
- Fonte originale
- Link di riferimento
La reversibilità del sesso nei pesci significa che c'è una differenza tra il sesso fisico e quello genetico dei pesci. Questo può succedere in modo naturale, ma anche gli esseri umani possono causarlo attraverso trattamenti ormonali. Questi trattamenti vengono somministrati durante specifiche fasi di crescita dei giovani pesci. Cambiando il sesso dei pesci, gli allevatori possono prevenire che maturino troppo presto, il che può essere un problema per l'allevamento ittico. Questo può aiutare ad aumentare il numero di pesci prodotti o creare pesci che non possono riprodursi, utile per gestire le popolazioni selvatiche.
Un pesce molto popolare è la Trota Iridea. Gli allevatori preferiscono spesso allevare solo trote iridee femmine perché i maschi maturano più velocemente. Quando i maschi maturano presto, smettono di crescere, diventano più suscettibili alle malattie e la qualità della loro carne può diminuire. Pertanto, produrre stock di sole femmine è un obiettivo importante per l'allevamento ittico.
Attualmente, alcune fattorie di trote iridee creano stock di sole femmine incrociando maschi reversibili con femmine. Tuttavia, l'uso di ormoni per creare questi maschi reversibili solleva preoccupazioni per la salute umana e ambientale. Trovare un metodo più sicuro per controllare il sesso di questi pesci è una grande sfida.
Come i pesci determinano il loro sesso
I pesci hanno vari modi per determinare il loro sesso. Alcune specie sono gonocoristiche, il che significa che gli individui sono maschi o femmine per tutta la vita. La determinazione del sesso può dipendere da fattori genetici, condizioni ambientali o una combinazione di entrambi. Durante il processo di differenziazione sessuale, le vie per diventare maschio o femmina possono influenzare lo sviluppo del pesce.
Se la gonade di un pesce, l'organo che produce le cellule sessuali, si impegna a diventare maschio o femmina, inizia generalmente a produrre ormoni specifici per quel sesso. Questi ormoni influenzano anche altre parti del corpo del pesce per svilupparsi in un modo che corrisponde al suo sesso. Il controllo genetico di questi processi coinvolge numerosi geni e interazioni complesse.
Nei pesci teleostei, un grande gruppo di pesci ossei, le Cellule Germinali primordiali si sviluppano presto e si spostano dove si formeranno le gonadi. Le cellule germinali sono le cellule che diventeranno eventualmente uova o spermatozoi.
Il ruolo della reversibilità del sesso nell'acquacoltura
La maggior parte delle specie di pesci subisce la determinazione del sesso attraverso sistemi genetici o ambientali. Nei sistemi genetici, specifici geni sui cromosomi controllano se un pesce diventa maschio o femmina. Negli sistemi ambientali, fattori come la temperatura possono influenzare il sesso.
Tuttavia, in alcuni casi, un pesce può passare da un sesso all'altro. Questo cambiamento avviene spesso quando un pesce non riesce a mantenere il suo attuale percorso sessuale o a controllare il percorso opposto. Una volta che la gonade ha scelto un sesso, produrrà ormoni specifici per quel sesso, che poi influenzeranno il resto dello sviluppo del pesce.
Le ricerche dimostrano che sia le cellule germinali che le cellule somatiche circostanti sono vitali per determinare il sesso. Le cellule germinali possono percepire segnali interni ed esterni e svilupparsi direttamente in uova o spermatozoi. Allo stesso tempo, le cellule somatiche possono ricevere segnali dalle cellule germinali per svilupparsi in un modo che supporti il sistema riproduttivo generale del pesce.
Identificazione dei geni determinanti il sesso nella trota iridea
Nella trota iridea, il sistema principale di determinazione del sesso si basa su fattori genetici. Ci sono molti geni identificati coinvolti in questo processo. Il Gene principale per la determinazione del sesso nella trota iridea non è come i tipici geni principali trovati in altre specie. Questo gene interagisce con fattori conosciuti coinvolti nella differenziazione femminile.
Sebbene il fattore genetico principale sia critico, inversioni di sesso spontanee si verificano in alcune popolazioni di trote iridee. Questo significa che anche alcuni pesci geneticamente femminili possono trasformarsi in maschi a basse frequenze. La ricerca ha scoperto diverse regioni genomiche collegate a questo tratto, indicando che altri geni minori potrebbero avere un ruolo nella determinazione del sesso.
Per comprendere meglio questi geni della reversibilità sessuale, sono state studiate specifiche popolazioni di trote iridee per trovare marcatori genetici distinti associati a questo tratto. Questi studi mirano a convalidare questi marcatori in varie popolazioni.
Metodologia dello studio
Raccolta dei campioni
I pesci utilizzati per la ricerca provenivano da una fattoria di trote iridee in Francia. Lo studio ha incluso campioni di pesci femmine per analizzare il loro patrimonio genetico. Questi campioni sono stati sequenziati e allineati con genomi di riferimento per identificare varianti genetiche.
Analisi dei dati
Utilizzando diversi strumenti genetici, è stata valutata un'ampia gamma di varianti genetiche. Queste varianti hanno aiutato i ricercatori a determinare quali geni erano associati al tratto della reversibilità del sesso. È stato impiegato un metodo statistico noto come test esatto di Fisher per analizzare la relazione tra variazioni genetiche e rapporti sessuali osservati nella prole.
Tecniche di apprendimento automatico sono state utilizzate anche per perfezionare le posizioni dei geni legati alla reversibilità del sesso. Diverse regioni genomiche sono state analizzate, e l'importanza di vari marcatori genetici è stata classificata in base a quanto bene prevedevano la reversibilità del sesso.
Risultati: scoperte sui QTL (loci di carattere quantitativo)
La ricerca ha identificato specifiche regioni nel genoma collegate alla reversibilità del sesso in più popolazioni di trote iridee. Questo ha incluso:
Cromosoma Omy1: Specifici geni e le loro varianti erano fortemente associati a qtl legati alla reversibilità del sesso. Questi includevano diversi geni candidati che mostrano potenziale significato nell'influenzare la determinazione sessuale.
Cromosoma Omy12: Anche se meno significativo di Omy1, alcuni marcatori genetici erano associati a tratti di reversibilità del sesso.
Cromosoma Omy20: Questo cromosoma aveva più regioni collegate alla reversibilità del sesso spontanea. Qui sono stati identificati diversi geni ben classificati, mostrando il loro potenziale impatto sulla determinazione del sesso.
Lo studio ha evidenziato variazioni che erano statisticamente significative in relazione ai rapporti sessuali della prole.
Geni candidati e i loro possibili ruoli
Geni su Omy1
Syndig1:
- Questo gene ha un ruolo cruciale nello sviluppo delle sinapsi e potrebbe essere importante per la differenziazione delle gonadi nei pesci.
Tlx1:
- Un fattore di trascrizione che potrebbe avere un ruolo nella sopravvivenza cellulare durante lo sviluppo, influenzando possibilmente la differenziazione sessuale.
Hells:
- Coinvolto nel rimodellamento del DNA, questo gene ha implicazioni per lo sviluppo delle cellule germinali e potrebbe influenzare la determinazione del sesso.
GbF1:
- Coinvolto in processi cellulari, il ruolo di questo gene nella determinazione del sesso non è ancora completamente compreso, ma mostra promesse come candidato.
Geni su Omy20
Arfgef3:
- Questo gene gioca un ruolo nell'attivazione della via di segnalazione degli estrogeni, fondamentale per lo sviluppo delle caratteristiche femminili.
Khdrbs2:
- Questo gene è legato a funzioni di legame dell'RNA e potrebbe influenzare lo sviluppo dei gameti.
Dystonin (Dst):
- Sebbene non fosse stato precedentemente associato alla determinazione del sesso, recenti scoperte suggeriscono che potrebbe avere un ruolo nell'influenzare la reversibilità del sesso.
Caskin2:
- La sua proteina potrebbe interagire con altre che influenzano le condizioni di crescita e lo sviluppo, indicando la sua importanza nella differenziazione sessuale.
Altri fattori importanti
È stato riconosciuto anche il ruolo della temperatura e di altri Fattori Ambientali. Temperature elevate possono portare a un aumento delle istanze di reversibilità del sesso nei pesci. Questo implica un'interazione complessa tra genetica e condizioni ambientali, rivelando come entrambi gli aspetti possano influenzare il processo di determinazione del sesso nei pesci come la trota iridea.
Implicazioni per l'allevamento ittico
Comprendere questi fattori genetici è cruciale per le pratiche di allevamento ittico. Può aiutare gli allevatori a ideare strategie per gestire efficacemente le popolazioni, mantenere i rapporti sessuali desiderati negli stock e migliorare la qualità del prodotto.
I risultati dello studio forniscono una base per sviluppare strategie di breeding che potrebbero ridurre le istanze di pesci maschi indesiderati che compaiono negli stock di sole femmine. Inoltre, con i fattori ambientali che giocano un ruolo significativo, ulteriori ricerche sono necessarie per esplorare le condizioni di allevamento ottimali per minimizzare la reversibilità del sesso spontanea.
Combinando tecniche di gestione genetica con il controllo ambientale, gli allevatori di pesci potrebbero riuscire a ottenere popolazioni più stabili e rese migliori.
Conclusione
In sintesi, la ricerca getta luce sulle complessità genetiche che circondano la determinazione del sesso e la reversibilità del sesso nella trota iridea. Identificando geni specifici e comprendendo come interagiscono con fattori ambientali, l'industria dell'acquacoltura può lavorare verso pratiche di allevamento ittico più sostenibili ed efficienti. Futuri studi saranno essenziali per approfondire la nostra comprensione di questi processi e assistere nello sviluppo di soluzioni su misura per la produzione itticia.
Titolo: In-depth investigation of genome to refine QTL positions for spontaneous sex-reversal in XX rainbow trout
Estratto: Sex determination is a flexible process in fish, controlled by genetics or environmental factors or a combination of both depending on the species. Revealing the underlying molecular mechanisms may have important implications for research on reproductive development in vertebrates, as well as sex-ratio control and selective breeding in fish. Phenotypic sex in rainbow trout is primarily controlled by a XX/XY male heterogametic sex determination system. Unexpectedly in genetically XX all-female farmed populations, a small proportion of males or intersex individuals are regularly observed. This spontaneous masculinisation is a highly heritable trait, controlled by minor sex-modifier genes that remain unknown, although several QTL regions were detected in previous studies. In this work we used genome-based approaches and various statistical methods to investigate these QTL regions. We validated in six different French farmed populations DNA markers we had previously identified in a different commercial population on chromosomes Omy1, Omy12 and Omy20. We also identified functional candidate genes located that may be involved in spontaneous masculinisation by reducing germ cell proliferation and repressing oogenesis of XX-rainbow trout in the absence of the master sex determining gene. In particular, syndig1, tlx1 and hells on Omy1, as well as khdrbs2 and csmd1 on Omy20 deserve further investigation as potential sex-modifier genes to precise their functional roles as well as their interaction with rearing temperature. Those findings could be used to produce all-female populations that are preferred by farmers due to a delayed maturation of females and higher susceptibility of male trout to diseases.
Autori: Florence Phocas, A. Dehaullon, C. Fraslin, A. Bestin, C. Poncet, Y. Guiguen, E. Quillet
Ultimo aggiornamento: 2024-10-29 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.26.620424
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.26.620424.full.pdf
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.
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