Mirare agli enzimi per combattere i tripanosomati
Nuovi approcci per affrontare le malattie causate dai trypanosomatidi sembrano promettenti.
Yann G.-J. Sterckx, J. E. Pinto Torres, M. Claes, R. Hendrickx, M. Yuan, N. Smiejkowska, P. Van Wielendaele, H. De Winter, S. Muyldermans, P. A. M. Michels, M. D. Walkinshaw, W. Versees, G. Caljon, S. Magez
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Indice
Le malattie tropicali dimenticate (MTD) sono un gruppo di malattie comuni nelle zone calde del mondo. Queste malattie colpiscono più di 1 miliardo di persone a livello globale. Rappresentano un serio rischio per la salute non solo nei paesi più poveri, ma anche nelle nazioni più ricche, soprattutto per chi vive in condizioni difficili. Le MTD di solito non uccidono le persone rapidamente, ma causano molta sofferenza e possono influenzare seriamente la vita quotidiana e la capacità di lavorare.
Negli ultimi anni, il controllo delle MTD è diventato più difficile a causa di fattori come i viaggi globali, il cambiamento climatico e il movimento di animali che portano malattie. Questo significa che posti che un tempo erano sicuri da queste malattie ora sono a rischio. L'Organizzazione Mondiale della Sanità (OMS) ha identificato 20 MTD specifiche che necessitano di attenzione per il bene della salute globale.
Tre di queste malattie sono causate da un gruppo di organismi microscopici chiamati Tripanosomati, che includono i parassiti Trypanosoma e Leishmania.
Approcci per Combattere i Tripanosomati
Per combattere efficacemente questi parassiti, è necessaria una strategia combinata che prevede vaccini, farmaci e il controllo degli insetti che diffondono le malattie. Purtroppo, creare un vaccino efficace è complicato a causa dei modi complessi in cui questi parassiti evitano il sistema immunitario. Controllare gli insetti può anche essere difficile perché alcuni insetti sono diventati resistenti ai pesticidi usati contro di loro. Per questo motivo, i farmaci rimangono un metodo chiave per trattare e controllare queste malattie.
Tuttavia, ci sono preoccupanti segnalazioni di farmaci che falliscono o dei parassiti che diventano resistenti agli antibiotici disponibili. Questo crea un bisogno urgente di nuovi trattamenti che funzionino in modo diverso o siano basati su una migliore comprensione del funzionamento dei parassiti.
I tripanosomi africani sono responsabili di due tipi di malattie negli esseri umani e negli animali. Vivono in due ospiti: le mosche tse-tse e i mammiferi. All'interno dei mammiferi, la forma del parassita più comune è conosciuta come forma ematica (BSF). Questa forma vive principalmente nel sangue ma può anche spostarsi ad altre parti del corpo come la pelle, il cervello e i polmoni.
La BSF di questi parassiti ha accesso a livelli elevati di glucosio nel sangue e fa affidamento pesantemente su un processo chiamato Glicolisi per ottenere energia. Questo rende gli Enzimi coinvolti nella glicolisi obiettivi interessanti per nuovi farmaci. La ricerca mostra che abbassare l'attività di questi enzimi può rallentare la crescita dei parassiti e persino ucciderli.
Sviluppi Recenti nella Ricerca
Recentemente, i ricercatori hanno scoperto un nuovo tipo di piccola molecola che può inibire uno degli enzimi chiave nel processo di glicolisi chiamato fosfofruttochinasi (PFK). Questo composto si è dimostrato efficace nell'uccidere i parassiti in test di laboratorio e in modelli mouse.
Un'ulteriore analisi delle piruvato chinasi (PYKs) dei tripanosomati ha rivelato di più su come funzionano questi enzimi. Un Anticorpo specifico, noto come sdAb42, è stato sviluppato per inibire efficacemente TcoPYK. Questo anticorpo può bloccare TcoPYK in uno stato inattivo e impedire che aiuti il parassita a crescere.
La struttura di TcoPYK fornisce intuizioni su come funziona sdAb42. Si lega a determinate aree dell'enzima, impedendogli di cambiare forma e diventare attivo. Questo significa che anche quando sono presenti le molecole necessarie per l'attività dell'enzima, sdAb42 ferma l'enzima dall'agire. Studi mostrano che questo legame stabilizza la forma inattiva dell'enzima, cosa cruciale per interrompere il ciclo vitale del parassita.
L'Importanza dello Stato Inattivo
I ricercatori hanno scoperto che quando sdAb42 si lega a TcoPYK, si blocca in una forma inattiva. Questo impedisce all'enzima di svolgere le sue funzioni necessarie nel processo di glicolisi. All'interno dell'enzima, regioni specifiche sono cruciali per la comunicazione tra le sue parti quando cambia da inattivo ad attivo.
L'epitopo sdAb42 si trova in un luogo dove può influenzare questa comunicazione. I risultati rivelano che alcuni amminoacidi in questa regione sono particolarmente importanti per l'attività dell'enzima. Comprendere queste interazioni aiuta a creare nuove terapie che potrebbero mirare a questi enzimi in altri parassiti correlati.
Il Potenziale di sdAb42
L'anticorpo sdAb42 non è solo efficace contro TcoPYK, ma dimostra anche una certa abilità di inibire enzimi simili in altri parassiti come TbrPYK e LmePYK. Tuttavia, funziona meglio contro TcoPYK. Le variazioni nella struttura dell'enzima tra le diverse specie influiscono su quanto bene sdAb42 può legarsi e inibire l'attività.
La ricerca indica che anche se sdAb42 può legarsi ad altre versioni di questi enzimi, potrebbe richiedere quantità maggiori di sdAb42 per raggiungere lo stesso livello di inibizione visto con TcoPYK. Questo suggerisce che colpire efficacemente l'enzima dipenderà non solo dalla capacità di legarsi dell'anticorpo, ma anche da come gli enzimi cambiano forma durante la loro attività.
Cinetiche di Inibizione a Lenta Binds
Quando hanno testato come sdAb42 lavora nel tempo, i ricercatori hanno scoperto che mostrava quello che è chiamato inibizione a lenta bind. Questo significa che sdAb42 impiega un po' di tempo per legarsi e inibire completamente l'enzima una volta presente.
In termini pratici, questo suggerisce che durante condizioni reali, dove l'enzima sarebbe già in interazione con glucosio e altre molecole, il processo di sdAb42 che ferma l'attività dell'enzima potrebbe richiedere tempo. Negli esperimenti, quando l'enzima è saturo di altre molecole prima di aggiungere sdAb42, il processo di legame mostra caratteristiche di ritardo.
Questo comportamento di lenta bind è importante da considerare per sviluppare trattamenti. Quando si progetta un farmaco, è cruciale sapere come il farmaco interagirà con l'enzima target in presenza di altre sostanze e quanto tempo impiegherà per funzionare efficacemente.
Test nei Tripanosomi
In un esperimento, sdAb42 è stato anche testato all'interno di parassiti vivi creando linee transgeniche di T. brucei che potevano produrre sdAb42 all'interno delle loro cellule. Controllando quanto sdAb42 i parassiti producevano, i ricercatori potevano osservare come questo influenzasse la loro crescita.
I risultati hanno indicato che livelli più alti di sdAb42 portavano a una crescita più lenta dei parassiti. Questo mostra che la presenza di sdAb42 all'interno del parassita disturba la sua capacità di prosperare. Interessante è notare che, sebbene ci fosse un impatto negativo sulla crescita, i parassiti non sono morti completamente.
Questo potrebbe significare che, mentre sdAb42 è una promettente opzione per il trattamento, raggiungere l'eliminazione completa dei parassiti potrebbe richiedere di combinare sdAb42 con altri trattamenti. La necessità di concentrazioni più elevate di sdAb42 per essere efficace è un altro ostacolo che i ricercatori dovranno affrontare nel lavoro futuro.
Implicazioni per la Scoperta di Farmaci
Le intuizioni ottenute dallo studio di sdAb42 puntano verso il potenziale di utilizzare anticorpi nello sviluppo di farmaci. Gli anticorpi, in particolare quelli dei camelidi come sdAb42, possono essere progettati per legarsi a forme specifiche delle proteine, consentendo loro di interrompere funzioni critiche.
I risultati incoraggiano ad esplorare ulteriormente questi tipi di anticorpi come modi per colpire efficacemente gli enzimi all'interno dei parassiti. La capacità di sdAb42 di inibire selettivamente TcoPYK suggerisce che potrebbe essere usato come modello per sviluppare trattamenti simili.
Considerazioni Finali
In sintesi, la lotta contro le malattie tropicali dimenticate, in particolare quelle causate dai tripanosomati, è in corso e complicata. Tuttavia, i progressi nella comprensione del metabolismo di questi parassiti e di come possono essere inibiti enzimi specifici aprono nuove strade per il trattamento. Lo sviluppo di sdAb42 mostra promesse non solo come potenziale terapia, ma anche come strumento per rivelare nuove strategie nella scoperta di farmaci.
Concentrandosi su come colpire efficacemente enzimi specifici in questi patogeni, i ricercatori possono lavorare per creare trattamenti efficaci che possano migliorare la qualità della vita per i milioni di persone colpite da queste malattie.
Fonte originale
Titolo: Allosteric inhibition of trypanosomatid pyruvate kinases by a camelid single-domain antibody
Estratto: African trypanosomes are the causative agents of neglected tropical diseases affecting both humans and livestock. Disease control is highly challenging due to an increasing number of drug treatment failures. African trypanosomes are extracellular, blood-borne parasites that mainly rely on glycolysis for their energy metabolism within the mammalian host. Trypanosomal glycolytic enzymes are therefore of interest for the development of trypanocidal drugs. Here, we report the serendipitous discovery of a camelid single-domain antibody (sdAb aka Nanobody) that selectively inhibits the enzymatic activity of trypanosomatid (but not host) pyruvate kinases through an allosteric mechanism. By combining enzyme kinetics, biophysics, structural biology, and transgenic parasite survival assays, we provide a proof-of-principle that the sdAb-mediated enzyme inhibition negatively impacts parasite fitness and growth.
Autori: Yann G.-J. Sterckx, J. E. Pinto Torres, M. Claes, R. Hendrickx, M. Yuan, N. Smiejkowska, P. Van Wielendaele, H. De Winter, S. Muyldermans, P. A. M. Michels, M. D. Walkinshaw, W. Versees, G. Caljon, S. Magez
Ultimo aggiornamento: 2024-12-12 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.14.598993
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.14.598993.full.pdf
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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