Il ruolo del microbioma intestinale nella febbre tifoidea
La ricerca rivela che il microbioma intestinale influisce sulla suscettibilità alla febbre tifoide.
Philip M. Ashton, L. Mageiros, J. E. Meiring, A. C. Chirambo, F. Khanam, S. Dongol, H. Banda, A. Karkey, L. P. Llanes, H. Thomaides-Brears, M. Gibani, N. H. Rajib, N. Rahman, P. K. Biswas, M. A. I. Bhuiyan, S. Kay, K. Auger, O. Seret, N. R. Thomson, A. J. Pollard, S. Baker, B. Basnyat, J. D. Clemens, C. Dolecek, S. J. Dunstan, G. Dougan, R. S. Heyderman, V. E. Pitzer, F. Qadri, M. A. Gordon, K. E. Holt, T. C. Darton, Strategic Typhoid Alliance Across Asia and Africa Consortium
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Indice
- Il Ruolo del Microbiota intestinale
- Mancanza di Studi su S. Typhi e il Microbioma Intestinale
- Studio di Ricerca
- Partecipanti e Raccolta di Campioni
- Approvazione Etica della Ricerca
- Elaborazione e Analisi dei Campioni
- Analisi Statistica
- Risultati Chiave
- Panoramica dei Partecipanti
- Firme Microbiche
- Partecipanti High-Vi
- Genetica della Resistenza Antimicrobica
- Implicazioni dello Studio
- Conclusione
- Fonte originale
- Link di riferimento
La Febbre tifoide è una malattia seria causata da un tipo di batterio chiamato Salmonella enterica serovar Typhi, meglio conosciuto come S. Typhi. Ogni anno, questa malattia porta a circa 10,9 milioni di malattie e circa 116.800 morti. Colpisce soprattutto persone in regioni come il Sud e il Sudest asiatico e alcune parti dell'Africa subsahariana. L'introduzione di vaccini progettati per prevenire la febbre tifoide dovrebbe aiutare a ridurre il numero di casi. Miglioramenti nella qualità dell'acqua, nelle condizioni igieniche e nella sanità sono anche parte di questo sforzo. Tuttavia, ci sono ancora sfide a causa dell'alto numero di casi, del ruolo delle persone che portano il batterio senza mostrare sintomi e del fatto che la malattia colpisce spesso comunità povere e marginalizzate.
Microbiota intestinale
Il Ruolo delL'intestino umano ospita trilioni di microrganismi, che insieme formano una comunità complessa conosciuta come microbiota intestinale. Questa comunità gioca un ruolo cruciale nel mantenere la nostra salute e influisce su come i nostri corpi rispondono alle malattie. Il microbiota intestinale aiuta nella digestione e nell'assorbimento dei nutrienti ed è strettamente legato al nostro sistema immunitario, influenzando come reagisce a diverse sfide.
Il microbioma intestinale può prevenire le infezioni attraverso un processo chiamato "resistenza alla colonizzazione". Questo significa che i batteri benefici competono con quelli dannosi per nutrienti e spazio, producono sostanze che possono inibire i batteri nocivi e modulano la risposta del sistema immunitario. Le ricerche hanno dimostrato che quando il microbioma intestinale è disturbato, ad esempio per via degli antibiotici, può facilitare l'instaurarsi di infezioni da parte di batteri dannosi come la Salmonella. Studi recenti hanno fatto significativi progressi nel scoprire come la Salmonella interagisce con il microbioma intestinale.
Gli acidi grassi a catena corta (SCFA), che vengono prodotti dai batteri intestinali durante la fermentazione delle fibre alimentari, giocano anche un ruolo importante nella prevenzione delle infezioni da Salmonella. Gli SCFA possono ridurre la disponibilità di ossigeno nell'intestino e creare un ambiente acido che inibisce la crescita della Salmonella. Nonostante ciò che sappiamo sulla capacità del microbioma intestinale di prevenire le infezioni da Salmonella, non è ancora del tutto chiaro come influenzi l'esito dell'esposizione a S. Typhi, soprattutto perché S. Typhi infetta solo gli esseri umani.
Mancanza di Studi su S. Typhi e il Microbioma Intestinale
Sebbene siano stati condotti alcuni studi sull'interazione tra il microbioma intestinale e altri tipi di Salmonella, c'è ancora una mancanza di studi incentrati specificamente su S. Typhi. Gli studi su modelli di infezione umana controllati consentono ai ricercatori di indagare come le infezioni influenzano direttamente gli esseri umani, integrando gli studi osservazionali. Studi recenti hanno trovato che le persone con febbre tifoide hanno un microbioma intestinale diverso rispetto agli individui sani, mostrando una ridotta diversità e meno batteri produttori di SCFA.
Comprendere meglio la relazione tra il microbioma intestinale e la febbre tifoide potrebbe portare a nuovi modi per prevenire la malattia e migliorare la nostra comprensione di come il microbioma intestinale offre protezione contro infezioni gravi, specialmente in aree dove la febbre tifoide è comune.
Studio di Ricerca
Per colmare le lacune nella conoscenza su come S. Typhi interagisce con il microbioma intestinale, i ricercatori hanno raccolto campioni di feci da 258 Partecipanti in tre regioni dell'Asia e dell'Africa dove la febbre tifoide è comune. Questi campioni sono stati analizzati per identificare schemi nel microbioma intestinale.
Partecipanti e Raccolta di Campioni
Nello studio, circa 100.000 persone sono state intervistate in ciascuna area. I pazienti con febbre sono stati reclutati e quelli diagnosticati con "febbre tifoide acuta" sono stati identificati tramite colture di sangue positive per S. Typhi. Quando possibile, sono stati raccolti campioni di feci da questi pazienti prima che iniziasse qualsiasi trattamento. I campioni sono stati conservati a temperature molto basse per preservarli. Sono state registrate informazioni su eventuali antibiotici utilizzati prima dell'arruolamento. Dopo aver seguito i pazienti confermati di febbre tifoide, sono stati raccolti campioni di feci dai loro contatti domestici, inclusi individui sani.
Approvazione Etica della Ricerca
Lo studio è stato approvato dai comitati etici di ciascun paese e nel Regno Unito, assicurando che tutte le regole e linee guida necessarie fossero seguite.
Elaborazione e Analisi dei Campioni
Per analizzare i campioni di feci, è stato estratto e sequenziato il DNA per capire la composizione del microbioma intestinale. I dati sono stati poi puliti e organizzati per l'analisi. I ricercatori si sono concentrati sull'identificazione dei tipi di batteri presenti e delle loro funzioni metaboliche.
Analisi Statistica
Sono stati impiegati diversi metodi statistici per confrontare i microbiomi intestinali di diversi gruppi di partecipanti, come i pazienti con febbre tifoide acuta e i contatti domestici sani.
Risultati Chiave
Panoramica dei Partecipanti
I dati sul microbioma fecale sono stati raccolti con successo da 258 partecipanti provenienti da Bangladesh, Malawi e Nepal. Questi partecipanti includevano 92 pazienti con febbre tifoide acuta, 97 contatti domestici sani e 69 individui con alti livelli di anticorpi specifici (titoli anti-Vi).
Firme Microbiche
Confrontando i microbiomi intestinali dei pazienti con febbre tifoide acuta e dei contatti sani, i ricercatori hanno trovato differenze distinte nella composizione batterica. Sebbene la diversità complessiva dei batteri non fosse significativamente diversa tra i pazienti acuti e i contatti sani, i tipi di batteri presenti variavano notevolmente tra i gruppi. Alcuni batteri, in particolare alcune specie produttrici di SCFA, sono risultati meno abbondanti nei pazienti tifoidi.
In Bangladesh e Malawi, i ricercatori hanno identificato quattro specie microbiche che erano costantemente meno prevalenti nei pazienti con febbre tifoide rispetto agli individui sani. Questi risultati suggeriscono che questi batteri specifici potrebbero giocare un ruolo nella protezione contro la febbre tifoide.
Partecipanti High-Vi
Gli individui con alti titoli anti-Vi potrebbero rappresentare persone che sono portatori asintomatici di S. Typhi o coloro che hanno avuto infezioni non diagnosticate. Studiare questo gruppo è essenziale per capire la trasmissione della febbre tifoide. I risultati hanno rivelato che i microbiomi intestinali degli individui high-Vi erano distinti sia da quelli dei pazienti con febbre tifoide acuta che dai contatti domestici, indicando una potenziale differenza in come questi gruppi reagiscono a S. Typhi.
Genetica della Resistenza Antimicrobica
I ricercatori hanno anche esaminato i Geni di Resistenza Antimicrobica (AMR) nei microbiomi intestinali dei partecipanti. Hanno trovato che la presenza di geni AMR era più alta in quelli con febbre tifoide acuta rispetto ai contatti domestici sani. Questo suggerisce che l'uso precedente di antibiotici potrebbe influenzare il microbioma intestinale e la sua capacità di combattere le infezioni.
Implicazioni dello Studio
I risultati di questa ricerca hanno importanti implicazioni per comprendere l'interazione tra la febbre tifoide e il microbioma intestinale. Le scoperte indicano che il microbiota intestinale potrebbe avere un ruolo protettivo contro la febbre tifoide influenzando le risposte immunitarie e possibilmente riducendo la suscettibilità alla malattia.
Inoltre, le differenze nella composizione del microbioma tra le diverse popolazioni geografiche illustrano come fattori locali come dieta, ambiente e pratiche sanitarie possano influenzare la salute. Riconoscere queste variazioni può aiutare a personalizzare le interventi di salute pubblica per combattere efficacemente la febbre tifoide e altre malattie.
Conclusione
Questo studio migliora la nostra comprensione della complessa relazione tra il microbioma intestinale e la febbre tifoide. Sebbene sia necessaria ulteriore ricerca per comprendere appieno queste interazioni, l'identificazione di firme microbiche specifiche associate alla suscettibilità alla febbre tifoide pone le basi per futuri studi che esplorano strategie di prevenzione e trattamento. Comprendere il ruolo protettivo del microbioma intestinale può portare a approcci innovativi per migliorare la salute pubblica, in particolare nelle regioni colpite dalla febbre tifoide e da malattie simili.
Fonte originale
Titolo: Interplay Between the Gut Microbiome and Typhoid Fever: Insights from Endemic Countries and a Controlled Human Infection Model
Estratto: Typhoid fever is a systemic infection caused by Salmonella enterica serovar Typhi (S. Typhi) invasion from the gut lumen. Transmission between people occurs through ingestion of contaminated food and water, particularly in settings with poor water and sanitation infrastructure, resulting in over 10 million illnesses annually. As the pathogen invades via the gastrointestinal tract, it is plausible that the gut microbiome may influence the outcome of S. Typhi exposure. There is some evidence that bacteria producing short-chain fatty acids (SCFAs) may create an environment unfavourable to invasive Salmonella, but data from humans is limited. To investigate the association between gut microbiome and typhoid fever, we analysed samples collected from three all-age cohorts enrolled in a prospective surveillance study conducted across three settings where typhoid fever is endemic (Dhaka, Bangladesh; Blantyre, Malawi; and Kathmandu, Nepal). Cohorts consisted of acute typhoid fever patients (n=92), asymptomatic household contacts of typhoid fever patients (representing individuals who were likely exposed to S. Typhi but did not develop disease, n=97), and asymptomatic serosurvey participants with high Vi antibody titres (representing individuals who were exposed to S. Typhi and may be carriers, n=69). The stool microbiomes of each cohort were characterised using shotgun metagenomics, and bacterial diversity, composition, and function were compared. We identified 4 bacterial species that were significantly lower in abundance in typhoid fever patients compared with household contacts (i.e. probably exposed), in two of the three participant populations (Bangladesh and Malawi). These bacteria may represent taxa that provide protection against development of clinical infection upon exposure to S. Typhi, and include the inflammation-associated species Prevotella copri clade A and Haemophilus parainfluenzae. Our functional analysis identified 28 specific metabolic gene clusters (MGCs) negatively associated with typhoid fever in Bangladesh and Malawi, including seven MGCs involved in SCFA metabolism. The putative protection provided by microbiome SCFA metabolism was supported by data from a controlled human infection model conducted in a UK population, in which participants who did not develop typhoid fever following ingestion of S. Typhi had higher abundance of a putative SCFA-metabolising MGC (q-value = 0.22). This study identified the same protective associations between taxonomic and functional microbiota characteristics and non-susceptibility to typhoid fever across multiple human populations. Future research should explore the potential functional role of SCFAs and inflammation-associated bacteria in resistance to S. Typhi and other enteric infections.
Autori: Philip M. Ashton, L. Mageiros, J. E. Meiring, A. C. Chirambo, F. Khanam, S. Dongol, H. Banda, A. Karkey, L. P. Llanes, H. Thomaides-Brears, M. Gibani, N. H. Rajib, N. Rahman, P. K. Biswas, M. A. I. Bhuiyan, S. Kay, K. Auger, O. Seret, N. R. Thomson, A. J. Pollard, S. Baker, B. Basnyat, J. D. Clemens, C. Dolecek, S. J. Dunstan, G. Dougan, R. S. Heyderman, V. E. Pitzer, F. Qadri, M. A. Gordon, K. E. Holt, T. C. Darton, Strategic Typhoid Alliance Across Asia and Africa Consortium
Ultimo aggiornamento: 2024-11-29 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.09.02.24312347
Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.09.02.24312347.full.pdf
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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