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Surs d virus dengue en Équateur : une préoccupation croissante

L'augmentation des cas de dengue en Équateur pousse à une réponse urgente en santé publique.

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Le Virus de la dengue (DENV) est un gros souci de santé pour presque la moitié de la population mondiale, surtout dans les régions tropicales et subtropicales. Ce virus se propage par les moustiques, en particulier par l’espèce Aedes Aegypti. Au cours des 50 dernières années, les cas de dengue ont explosé, et on en trouve maintenant dans environ 125 pays. En Amérique, les épidémies de dengue ont tendance à se produire tous les 3 à 5 ans, souvent à cause de quelques souches dominantes. En 2019, il y a eu une augmentation notable des cas, avec plus de 3,1 millions signalés, y compris des cas sévères ayant entraîné plusieurs décès.

En Équateur, les infections par la dengue augmentent. Certaines zones ont connu des niveaux de virus si élevés qu'on les considère désormais hyperendémiques, ce qui signifie que le virus est constamment présent et répandu. Les formes graves de la maladie, qui n'étaient pas fréquentes auparavant, deviennent maintenant plus courantes. Les symptômes de la dengue peuvent aller d'une légère fièvre à des manifestations sévères pouvant mettre la vie en danger, caractérisées par de fortes hémorragies et une perte de liquides.

D’ici 2022, l’Équateur avait signalé plus de 16 000 cas de dengue confirmés, et à la fin de 2023, le nombre avait grimpé à presque 25 000 cas. Cette augmentation souligne l’urgence de comprendre et de contrôler ce virus.

Différentes souches du virus de la dengue

Le virus de la dengue a quatre souches différentes, ou Sérotypes, chacune avec ses propres variations. Les quatre types principaux sont DENV-1, DENV-2, DENV-3 et DENV-4. Chaque sérotype partage environ 70 % de son matériel génétique avec les autres, mais est suffisamment différent pour qu'une infection par un type ne confère pas d'immunité durable contre les autres. Ce manque d'immunité peut entraîner des maladies plus graves si une personne est infectée par une autre souche après s'être remise de la première.

Dans les zones rurales, la propagation de la dengue devient plus compliquée à cause de facteurs comme la croissance de la population, l'augmentation des mouvements de personnes, et la hausse des cas parmi les enfants. Tous ces problèmes contribuent à l'augmentation du nombre d'infections et aux formes sévères observées chez certains patients.

Objectif de la recherche

Notre étude se concentre sur une meilleure compréhension du virus de la dengue en analysant son matériel génétique provenant de moustiques en Équateur. L'objectif est d'identifier la souche du virus et de suivre son évolution au fil du temps.

Lieu de l'étude

La recherche s'est déroulée à Borbon, une zone semi-urbaine dans la province d'Esmeraldas en Équateur. Cette région est un pôle commercial et est activement surveillée pour diverses maladies infectieuses dans le cadre d'un plus grand réseau d'étude des maladies transmises par les moustiques.

Collecte d'échantillons de moustiques

Pour récolter des informations sur le virus de la dengue, des moustiques Aedes aegypti adultes ont été collectés dans environ 300 maisons à Borbon. Les moustiques ont ensuite été envoyés dans un laboratoire pour des tests. Cela a impliqué de séparer les moustiques en groupes pour rendre l'analyse plus gérable.

Analyse du virus

L'ARN des moustiques a été extrait au laboratoire pour vérifier la présence du virus de la dengue. Un test spécial a permis aux chercheurs d'identifier différents virus, y compris le DENV. Une fois que le DENV a été confirmé dans certains échantillons, des tests supplémentaires ont été effectués pour déterminer quel sérotype était présent.

En utilisant des techniques de séquençage avancées, les chercheurs ont analysé l'ensemble de la séquence génétique du DENV trouvé dans un groupe de moustiques. Ces informations aident les scientifiques à comprendre la diversité génétique du virus et comment il pourrait évoluer.

Analyse génétique du virus

L'analyse a révélé que le DENV isolé des moustiques appartenait à une souche spécifique connue sous le nom de génotype III sud-asiatique-américain. Ce type génétique est lié à d'autres souches trouvées en Amérique, notamment dans des pays comme le Venezuela et la Colombie. Cette connexion sugère que le virus pourrait se propager à travers les frontières, facilité par les mouvements humains et le commerce.

L'étude a également comparé le matériel génétique des moustiques aux échantillons collectés à partir de cas humains dans la même région. Les similitudes indiquent une circulation continue du virus dans les communautés locales, soulignant l'importance de surveiller à la fois les populations humaines et de moustiques.

Implications pour la santé publique

Les résultats de la recherche sont cruciaux pour comprendre comment le virus de la dengue se comporte dans des régions spécifiques. Connaître les souches circulantes et leurs variations génétiques permet aux responsables de la santé publique de mettre en place de meilleures mesures de prévention et de contrôle. Par exemple, certaines stratégies peuvent être plus efficaces contre des souches spécifiques du virus.

Dans des zones comme Borbon, où le virus se propage activement, maintenir une surveillance des moustiques et des cas humains peut aider à détecter les épidémies tôt. C'est essentiel pour protéger les communautés contre les cas graves de dengue pouvant entraîner des hospitalisations et des décès.

Conclusion

Le virus de la dengue représente un risque important pour la santé, surtout dans les zones à forte population de moustiques. Comprendre ses différentes souches et comment elles se propagent est clé pour contrôler les épidémies et protéger les gens. Cette étude met en évidence l'importance de la recherche continue sur les maladies transmises par les moustiques, ainsi que la nécessité d'une coopération étroite entre scientifiques, responsables de la santé publique et communautés locales. En travaillant ensemble, on peut mieux gérer les risques liés au virus de la dengue et potentiellement réduire son impact dans le monde.

Source originale

Titre: Whole Genome Sequencing of DENV-2 isolated from Aedes aegypti mosquitoes in Esmeraldas, Ecuador. Genomic epidemiology of genotype III Southern Asian-American in the country.

Résumé: Ecuador is a tropical country reporting Dengue virus (DENV) outbreaks with areas of hyperendemic viral transmission. Entomo-virological surveillance and monitoring effort conducted in the Northwestern border province of Esmeraldas in April 2022, five pools of female Aedes aegypti mosquitoes from a rural community tested positive for DENV serotype 2 by RT-qPCR. One pool was sequenced by Illumina MiSeq, and it corresponded to genotype III Southern Asian-American. Comparison with other genomes revealed genetic similarity to a human DENV genome sequenced in 2021, also from Esmeraldas. Potential introduction events to the country could have originated from Colombia, considering the vicinity of the collection sites to the neighboring country and high human movement. The inclusion of genomic information complements entomo-virological surveillance, providing valuable insights into genetic variants. This contribution enhances our understanding of Dengue virus (DENV) epidemiology in rural areas and guides evidence-based decisions for surveillance and interventions. Author SummaryIn this study, the complete genetic information of the dengue virus isolated from the mosquito vector Aedes aegypti was characterized using molecular biology, sequencing, and bioinformatics analysis. The isolation of the virus from the vector has contributed significantly to our understanding of the transmission dynamics of the disease and its genetic relationship with human cases. Identifying the serotypes and genotypes circulating in Ecuador has enabled us to comprehend the evolution of the virus from 2014 to 2023. Therefore, surveillance of genetic variability would aid in adapting precise prevention and control strategies to the genetic variants present in a specific geographical area. Entomo-virological surveillance is essential for assessing changes in risk and the impact of control measures.

Auteurs: Varsovia Cevallos, A. Carrazco-Montalvo, D. Gutierrez-Pallo, V. Arevalo, P. Ponce, C. Rodriguez-Polit, D. Alarcon, G. Echeverria-Garces, J. Coloma, V. Nipaz

Dernière mise à jour: 2024-02-08 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.06.579255

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.06.579255.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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