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# Biologie# Microbiologie

L'impact environnemental de la dégradation de l'ibuprofène

Des recherches montrent comment les bactéries transforment l'ibuprofène et ses effets sur l'écosystème.

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Les médicaments sont faits pour aider les gens à traiter des maladies, mais ils peuvent aussi avoir des effets secondaires négatifs. Ces drogues peuvent non seulement affecter les humains, mais aussi nuire à l'environnement. Un antidouleur couramment utilisé est l'Ibuprofène, qui est très populaire en Allemagne et dans le monde entier. Malgré le fait que les stations d'épuration éliminent une grande partie de l'ibuprofène de l'eau, des traces peuvent encore être trouvées dans les rivières et les lacs, et même dans des endroits extrêmes comme l'Antarctique.

Ibuprofène et l'environnement

L'ibuprofène est largement utilisé pour soulager la douleur et réduire l'inflammation, mais c'est inquiétant qu'il apparaisse dans les systèmes d'eau. Les stations d'épuration peuvent enlever environ 90 % de l'ibuprofène, mais il finit quand même dans les rivières et les lacs. Ça soulève des questions sur son impact sur la faune et les écosystèmes. Comprendre comment l'ibuprofène se décompose dans la nature est important pour déterminer son impact sur les humains et l'environnement.

Dégradation microbienne de l'ibuprofène

Les chercheurs s'intéressent beaucoup à la façon dont certains micro-organismes peuvent décomposer l'ibuprofène. Cependant, les manières spécifiques dont ces microbes transforment l'ibuprofène ne sont pas complètement connues. Certaines études se sont penchées sur la façon dont diverses bactéries peuvent dégrader l'ibuprofène dans des environnements contrôlés, comme des bioréacteurs ou des communautés de boues activées.

Plusieurs types de bactéries ont été identifiés comme capables de décomposer l'ibuprofène. Parmi elles, différentes souches de bactéries ont montré la capacité de transformer le médicament. Alors que certaines de ces bactéries peuvent dégrader l'ibuprofène efficacement, les effets de l'ibuprofène sur les bactéries elles-mêmes restent flous.

Méthodes de recherche

Pour en savoir plus sur la manière dont les bactéries peuvent décomposer l'ibuprofène, les chercheurs ont effectué des tests sur plusieurs souches bactériennes. Sept souches ont été choisies en fonction de leurs capacités connues à dégrader les polluants. Les chercheurs ont découvert qu'une souche, Priestia megaterium, était particulièrement efficace pour transformer l'ibuprofène. Cela a conduit à des études plus détaillées axées sur cette souche.

Les chercheurs ont analysé comment P. megaterium a changé l'ibuprofène et ont étudié la façon dont ses protéines réagissaient à la présence de la drogue.

Résultats clés sur la transformation

La recherche a révélé que P. megaterium convertit l'ibuprofène de quelques manières spécifiques. L'un des principaux processus implique l'ajout d'un groupe hydroxyle à la molécule d'ibuprofène, ce qui est une manière courante pour les bactéries de modifier des médicaments et d'autres produits chimiques. Les bactéries attachent aussi des molécules de sucre à l'ibuprofène et à ses produits de transformation.

Fait intéressant, l'attachement du sucre est réversible, ce qui signifie que les bactéries pourraient potentiellement l'enlever plus tard. Ce processus réversible pourrait expliquer pourquoi l'ibuprofène peut encore être trouvé dans l'environnement, même après les processus de traitement.

Impact sur la physiologie bactérienne

L'étude a également révélé des changements dans les protéines de P. megaterium lorsqu'il était exposé à l'ibuprofène. Un groupe spécifique de protéines connu sous le nom d'enzymes Cytochrome P450 était plus abondant dans les bactéries en présence d'ibuprofène. Ces enzymes jouent probablement un rôle significatif dans le processus de modification de l'ibuprofène.

En plus, la présence de l'ibuprofène a affecté la croissance de P. megaterium et sa gestion du stress. Par exemple, certaines protéines liées à la survie et à la croissance étaient moins abondantes lorsque les bactéries étaient exposées à l'ibuprofène, suggérant que la drogue pourrait entraver les processus normaux de croissance des bactéries.

Aperçu des méthodes expérimentales

Pour les expériences, les scientifiques ont utilisé des conditions de culture spécifiques pour faire croître les bactéries. Ils ont réalisé une série de Transformations pour voir comment les souches bactériennes géraient l'ibuprofène. Cela incluait la culture des bactéries dans des environnements contrôlés, puis l'ajout d'ibuprofène pour observer comment les bactéries réagissaient au fil du temps.

Des échantillonnages à différents intervalles ont permis aux chercheurs de suivre les changements dans les niveaux d'ibuprofène et la formation de produits de transformation. Des techniques avancées comme la chromatographie liquide à haute performance ont été utilisées pour analyser les échantillons et identifier de nouveaux composés.

Produits de transformation clés

Au cours des expériences, plusieurs produits de transformation de l'ibuprofène ont été identifiés. L'un des principaux produits était une forme hydroxylée de l'ibuprofène. Un autre produit impliquait une molécule de sucre attachée à l'ibuprofène. La présence de glucose dans le milieu de culture semblait améliorer la capacité des bactéries à former ces produits conjugués avec du sucre.

Les taux de transformation variaient selon que les bactéries étaient en phase stationnaire ou logarithmique. Les cellules en phase stationnaire, qui ne se divisent pas activement, transformaient l'ibuprofène à un taux plus élevé par rapport aux cellules en division active.

Effets du glucose sur la transformation

La présence de glucose a eu un impact significatif sur la manière dont P. megaterium a transformé l'ibuprofène. Lorsque le glucose a été ajouté, les bactéries ont produit plus de produits de transformation qui comprenaient des conjugués de sucre. Cela suggère que le glucose fournit non seulement de l'énergie, mais facilite aussi le processus de transformation de l'ibuprofène.

Dans les expériences sans glucose, les bactéries ont quand même transformé l'ibuprofène mais ont produit moins de produits au total. Cela indique que le glucose joue un rôle crucial dans l'optimisation de l'efficacité de transformation de l'ibuprofène chez les bactéries.

Comparaison des phases de croissance

L'étude a comparé comment les bactéries dans différentes phases de croissance géraient l'ibuprofène. Les cellules en phase stationnaire montraient de meilleures capacités de transformation que les cellules en phase logarithmique. La transformation rapide initiale de l'ibuprofène s'est principalement produite au cours des quatre premières heures, quelle que soit la phase de croissance, mais après ça, les cellules en phase stationnaire ont continué à surpasser leurs homologues logarithmiques.

Les résultats suggèrent que le temps de croissance et la présence de sources d'énergie comme le glucose peuvent avoir une influence significative sur la manière dont les bactéries peuvent décomposer des produits chimiques complexes comme l'ibuprofène.

Toxicité et croissance bactérienne

Un autre aspect important de la recherche était de comprendre comment l'ibuprofène affectait la croissance de P. megaterium. De fortes concentrations d'ibuprofène inhibaient la croissance des bactéries, indiquant un effet toxique. Cependant, la forme conjuguée de l'ibuprofène avec du sucre montrait une toxicité significativement moindre, permettant aux bactéries de continuer à croître avec un délai minimal.

Cela suggère que lorsque les bactéries modifient l'ibuprofène en ajoutant du sucre, elles peuvent être capables de le détoxifier et d'éviter des effets néfastes sur leur croissance.

Cytochrome P450 et mécanisme de transformation

Les enzymes cytochrome P450 ont été mises en avant comme des acteurs clés dans la transformation de l'ibuprofène chez P. megaterium. Ces enzymes sont impliquées dans l'ajout de groupes hydroxyles à diverses substances, y compris des médicaments. Des études d'inhibition ont montré que bloquer ces enzymes entraînait une réduction significative de la formation de certains métabolites, confirmant leur rôle dans la transformation de l'ibuprofène.

De plus, différents types de déshydrogénases alcooliques ont été trouvés en plus grande abondance lorsque l'ibuprofène était présent, indiquant qu'elles pourraient aussi contribuer à la modification de l'ibuprofène.

Réponses bactériennes et changements protéomiques

L'étude a examiné comment P. megaterium changeait son expression protéique en réponse à l'ibuprofène. Après avoir été exposé à la drogue, certaines protéines impliquées dans la réparation de l'ADN et les réponses au stress étaient plus abondantes, suggérant que l'ibuprofène pourrait causer des dommages à l'ADN bactérien.

En outre, les protéines nécessaires à la sporulation étaient moins abondantes, indiquant que l'ibuprofène pourrait interférer avec la capacité des bactéries à se reproduire et à former des spores. Cela pourrait avoir un impact significatif sur la survie à long terme des bactéries, surtout dans les environnements où les sources de nourriture peuvent devenir limitées.

Conclusion

Dans l'ensemble, l'étude montre que P. megaterium peut transformer efficacement l'ibuprofène, offrant des voies potentielles pour détoxifier ce produit pharmaceutique courant dans l'environnement. Les résultats donnent un aperçu de la manière dont les bactéries interagissent avec les produits chimiques et comment elles peuvent modifier des substances nocives.

Cette recherche a des implications pour comprendre comment les processus de gestion des déchets peuvent devoir prendre en compte la présence continue de médicaments comme l'ibuprofène, et elle ouvre la voie à d'autres études pour explorer comment ces micro-organismes pourraient être utilisés pour des efforts de bioremédiation. À mesure que la recherche progresse, on s'attend à en apprendre davantage sur les conséquences écologiques des produits pharmaceutiques et comment nous pouvons atténuer leurs impacts sur notre environnement.

Source originale

Titre: Transformation of the drug ibuprofen by Priestia megaterium: Reversible glycosylation and generation of hydroxylated metabolites

Résumé: As one of the most-consumed drugs worldwide, ibuprofen (IBU) reaches the environment in considerable amounts as environmental pollutant, necessitating studies of its further biotransformation as potential removal mechanism. Therefore, we screened bacteria with known capabilities to degrade aromatic environmental pollutants, belonging to the genera Bacillus, Priestia (formerly also Bacillus) Paenibacillus, Mycobacterium, and Cupriavidus, for their ability to transform ibuprofen. We identified five transformation products, namely 2-hydroxyibuprofen, carboxyibuprofen, ibuprofen pyranoside, 2-hydroxyibuprofen pyranoside, and 4-carboxy--methylbenzene-acetic acid. Based on our screening results, we focused on ibuprofen biotransformation by Priestia megaterium SBUG 518 with regard to structure of transformation products and bacterial physiology. Biotransformation reactions by P. megaterium involved (A) the hydroxylation of the isobutyl side chain at two positions, and (B) conjugate formation via esterification with a sugar molecule of the carboxylic group of ibuprofen and an ibuprofen hydroxylation product. Glycosylation seems to be a detoxification process, since the ibuprofen conjugate (ibuprofen pyranoside) was considerably less toxic than the parent compound to P. megaterium SBUG 518. Based on proteome profile changes and inhibition assays, cytochrome P450 systems are likely crucial for ibuprofen transformation in P. megaterium SBUG 518. The toxic effect of ibuprofen appears to be caused by interference of the drug with different physiological pathways, including especially sporulation, as well as amino acid and fatty acid metabolism. ImportanceIbuprofen is a highly consumed drug, and, as it reaches the environment in high quantities, also an environmental pollutant. It is therefore of great interest how microorganisms transform this drug and react to it. Here, we screened several bacteria for their ability to transform ibuprofen. Priestia megaterium SBUG 518 emerged as highly capable and was therefore studied in greater detail. We show that P. megaterium transforms ibuprofen via two main pathways, hydrolyzation and reversible conjugation. These pathways bear resemblance to those in humans. Ibuprofen likely impacts the physiology of P. megaterium on several levels, including spore formation. Taken together, P. megaterium SBUG 518 is well suited as a model organism to study bacterial ibuprofen metabolism.

Auteurs: Tjorven Hinzke, R. Schlüter, A. Mikolasch, D. Zühlke, P. Müller, K. Riedel, M. Lalk, D. Becher, H. Sheikany, F. Schauer

Dernière mise à jour: 2024-03-19 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.18.585558

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.18.585558.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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