Simple Science

La science de pointe expliquée simplement

# Sciences de la santé# Informatique de santé

Étudier la multimorbidité avec des outils avancés

Un aperçu de PheMIME et son impact sur la recherche sur la multimorbidité.

― 7 min lire


PheMIME : Un nouvel outilPheMIME : Un nouvel outilde multimorbiditéplusieurs problèmes de santé.Approche innovante pour étudier
Table des matières

La multimorbidité, c'est quand une personne a plusieurs problèmes de santé en même temps. Cette tendance qui monte, c'est un vrai défi pour les systèmes de santé partout dans le monde. Comprendre comment ces différentes maladies interagissent peut nous aider à mieux traiter et gérer les patients avec plusieurs conditions. Les maladies peuvent influencer les symptômes, la gravité et les réactions aux traitements des autres. En étudiant ces interactions, on peut découvrir des facteurs communs qui contribuent à plusieurs maladies, ce qui pourrait mener à de meilleures options de prévention et de traitement.

Le Rôle des Dossiers Médicaux Électroniques

Les dossiers médicaux électroniques (DME) sont des versions numériques des dossiers papier des patients. Ils contiennent des infos santé détaillées, ce qui facilite l'accès et l'analyse des données pour les docs et les chercheurs. Les systèmes DME sont devenus des outils précieux pour étudier la multimorbidité. Ils permettent aux chercheurs d'explorer de grandes quantités de données du monde réel, aidant à identifier des schémas de co-occurrence des maladies dans différentes populations.

Analyser les Schémas de Multimorbidité

Une méthode utilisée pour étudier la multimorbidité, c'est l'Analyse de réseau. Cette approche aide à visualiser et comprendre les connexions entre différentes maladies. Dans des travaux récents, les chercheurs ont découvert que combiner des données de différents systèmes DME peut confirmer des résultats sur les schémas de multimorbidité. En comparant les résultats entre différents hôpitaux ou institutions, les chercheurs peuvent obtenir une image plus complète de l'interaction entre les maladies.

Malgré les avantages des DME, il reste des défis pour mesurer et analyser les schémas de multimorbidité. Les standards actuels pour définir et étudier ces schémas ont besoin d'évoluer. L'absence de directives claires complique la comparaison des résultats de différentes études.

Introduction de PheMIME

Pour répondre à ces défis, un nouvel outil en ligne appelé le Phenome-wide Multi-Institutional Multimorbidity Explorer (PheMIME) a été développé. PheMIME est conçu pour aider les chercheurs à explorer et comparer les schémas de multimorbidité en utilisant des infos de plusieurs grandes bases de données DME. Cet outil permet aux utilisateurs d'accéder et d'analyser des données provenant de trois grandes sources : le Vanderbilt University Medical Center, le Massachusetts General Brigham Hospital et l'UK Biobank.

Avec PheMIME, les chercheurs peuvent choisir une condition de santé spécifique à étudier, comme le diabète ou les maladies cardiaques. Ils peuvent ensuite comparer comment cette condition interagit avec d'autres maladies dans différentes institutions. L'outil montre non seulement ces relations mais s'assure aussi que les résultats sont statistiquement significatifs.

Fonctionnalités de PheMIME

PheMIME est interactif et facile à utiliser, avec plusieurs fonctionnalités clés :

  1. Sélection de Maladie : Les utilisateurs peuvent rechercher des codes de maladies spécifiques liés à différentes conditions de santé. Ce module facilite l'exploration des maladies.

  2. Inspection de la Cohérence en Multimorbidité : Cette fonctionnalité aide les utilisateurs à évaluer à quel point les résultats sont cohérents entre plusieurs institutions. Les chercheurs peuvent voir quelles combinaisons de maladies sont les plus significatives.

  3. Visualisation des Réseaux de Multimorbidité : Les utilisateurs peuvent voir des représentations visuelles des relations entre les maladies. Cette fonctionnalité permet d'explorer des sous-groupes et des clusters de maladies selon leurs interactions.

  4. Exploration des Multimorbidités Reproductibles : Ici, les utilisateurs peuvent se concentrer sur des combinaisons de maladies spécifiques montrant des schémas cohérents entre les institutions. De cette façon, les chercheurs peuvent identifier quels paires de maladies sont plus communes.

  5. Exploration des Similarités en Multimorbidité : Semblable au module précédent, cette fonctionnalité aide à visualiser les connexions entre les maladies basées sur des mesures de similarité. Les utilisateurs peuvent comparer les résultats entre différentes institutions.

Étude de Cas : Schizophrénie

Pour démontrer l'utilité de PheMIME, une étude de cas centrée sur la schizophrénie a été réalisée. Les chercheurs ont exploré comment la schizophrénie interagit avec d'autres maladies. Quand les chercheurs ont sélectionné le code de maladie schizophrénie, ils ont eu accès à des outils visuels comme un diagramme de Manhattan. Ce diagramme montre la force de la relation entre la schizophrénie et d'autres maladies.

Les utilisateurs peuvent aussi générer des nuages de points pour comparer les résultats de différents systèmes de santé. Ces outils visuels aident à mettre en avant quelles paires de maladies montrent des connexions fortes et des schémas cohérents entre les institutions.

En plus, l'outil génère un tableau de données affichant des détails sur d'autres maladies liées à la schizophrénie, y compris leur force d'interaction. Les utilisateurs peuvent interagir avec ce tableau, sélectionnant et mettant en avant des maladies spécifiques qui les intéressent.

Analyse Dynamique des Réseaux

Une des fonctionnalités les plus intéressantes de PheMIME, c'est ses capacités d'analyse dynamique des réseaux. En utilisant une méthode appelée associationSubgraphs, les utilisateurs peuvent examiner des sous-groupes de maladies liées à la schizophrénie. L'analyse de réseau présente visuellement quelles maladies sont étroitement connectées et lesquelles appartiennent à des catégories plus larges, comme la santé mentale ou les maladies infectieuses.

Par exemple, les chercheurs ont trouvé que la schizophrénie a des connexions notables avec l'hépatite virale B et C. Cette découverte est en accord avec des recherches antérieures. Cependant, en plongeant plus profond dans les données, il est devenu clair que la force de ces connexions varie entre les différentes populations. Les schémas étaient plus forts chez les patients du Vanderbilt University Medical Center et du Massachusetts General Brigham comparé à la population plus large représentée par l'UK Biobank.

Implications des Résultats

Les différences dans les interactions des maladies observées parmi divers groupes de patients donnent un aperçu de la complexité de la multimorbidité. Des facteurs comme la démographie et le mode de vie peuvent influencer comment les maladies se relient entre elles. Comprendre ces différences est crucial pour adapter les traitements et interventions efficaces.

Même si le lien entre la schizophrénie et l'hépatite virale n'est pas encore totalement compris, les schémas observés peuvent mener à plus de recherches. Ces insights peuvent aider les scientifiques et les prestataires de santé à développer de nouvelles stratégies de prévention et de traitement.

Conclusion

PheMIME est un outil novateur qui facilite l'étude de la multimorbidité à travers différentes institutions. En fournissant un accès à une grande base de connaissances sur la multimorbidité et à des outils visuels interactifs, il permet aux chercheurs de détecter des relations significatives entre les maladies et de comparer les résultats efficacement. C'est une avancée significative dans notre compréhension de la façon dont les maladies interagissent et comment cette connaissance peut améliorer les soins aux patients.

Le développement de PheMIME met en lumière le potentiel des DME et des analyses avancées dans la santé moderne. À mesure que les chercheurs continuent d'étudier et d'analyser les schémas de multimorbidité, des outils comme PheMIME joueront un rôle clé dans la manière dont nous allons façonner les futures investigations, en favorisant de meilleurs résultats de santé pour les patients avec plusieurs conditions.

Source originale

Titre: PheMIME: An Interactive Web App and Knowledge Base for Phenome-Wide, Multi-Institutional Multimorbidity Analysis

Résumé: MotivationMultimorbidity, characterized by the simultaneous occurrence of multiple diseases in an individual, is an increasing global health concern, posing substantial challenges to healthcare systems. Comprehensive understanding of disease-disease interactions and intrinsic mechanisms behind multimorbidity can offer opportunities for innovative prevention strategies, targeted interventions, and personalized treatments. Yet, there exist limited tools and datasets that characterize multimorbidity patterns across different populations. To bridge this gap, we used large-scale electronic health record (EHR) systems to develop the Phenome-wide Multi-Institutional Multimorbidity Explorer (PheMIME), which facilitates research in exploring and comparing multimorbidity patterns among multiple institutions, potentially leading to the discovery of novel and robust disease associations and patterns that are interoperable across different systems and organizations. ResultsPheMIME integrates summary statistics from phenome-wide analyses of disease multimorbidities. These are currently derived from three major institutions: Vanderbilt University Medical Center, Mass General Brigham, and the UK Biobank. PheMIME offers interactive exploration of multimorbidity through multi-faceted visualization. Incorporating an enhanced version of associationSubgraphs, PheMIME enables dynamic analysis and inference of disease clusters, promoting the discovery of multimorbidity patterns. Once a disease of interest is selected, the tool generates interactive visualizations and tables that users can delve into multimorbidities or multimorbidity networks within a single system or compare across multiple systems. The utility of PheMIME is demonstrated through a case study on schizophrenia. Availability and implementationThe PheMIME knowledge base and web application are accessible at https://prod.tbilab.org/PheMIME/. A comprehensive tutorial, including a use-case example, is available at https://prod.tbilab.org/PheMIME_supplementary_materials/. Furthermore, the source code for PheMIME can be freely downloaded from https://github.com/tbilab/PheMIME. Data availability statementThe data underlying this article are available in the article and in its online web application or supplementary material.

Auteurs: Yaomin Xu, S. Zhang, N. Strayer, T. Vessels, K. Choi, G. W. Wang, Y. Li, C. A. Bejan, R. S. Hsi, A. G. Bick, D. R. Velez Edwards, M. R. Savona, E. J. Philips, J. Pulley, W. H. Self, W. C. Hopkins, D. M. Roden, J. Smoller, D. M. Ruderfer

Dernière mise à jour: 2023-07-30 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.07.23.23293047

Source PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.07.23.23293047.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

Merci à medrxiv pour l'utilisation de son interopérabilité en libre accès.

Plus d'auteurs

Articles similaires

NeurosciencesChangements cérébraux après une blessure à la moelle épinière : une étude sur le contrôle musculaire

Des recherches montrent des schémas d'activité cérébrale influençant la récupération des membres supérieurs chez les patients ayant subi une lésion de la moelle épinière.

― 8 min lire