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Progrès dans les tests de biomarqueurs du cancer du poumon

De nouvelles méthodes améliorent les tests de biomarqueurs pour le traitement du cancer du poumon.

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Le test des biomarqueurs est une étape cruciale pour traiter les patients atteints d'un type spécifique de cancer du poumon appelé cancer du poumon non à petites cellules métastatique (NSCLC). Ce test aide les médecins à choisir les meilleures options de traitement disponibles. Avec plus de changements ciblables dans la génétique du cancer du poumon, l'utilisation de médicaments spécialisés appelés inhibiteurs de la tyrosine kinase (TKI) est devenue plus courante, ce qui rend les tests complets de la composition moléculaire du cancer très importants.

Quand il n’y a pas de traitement spécifique disponible pour l’état d’un patient, un autre test appelé test PD-L1 aide à déterminer le meilleur plan d’action. De plus, des recherches montrent que le test des biomarqueurs pourrait aussi être important pour les patients à des stades plus précoces du NSCLC. Cela met en avant pourquoi tous les patients atteints de NSCLC devraient passer un profil moléculaire complet.

Défis de l'analyse moléculaire

Cependant, le test de ces biomarqueurs dans le cancer du poumon rencontre plusieurs défis. Un problème majeur est que les biopsies tumorales, qui consistent à prélever un échantillon de la tumeur, peuvent être invasives et causer des complications. En plus, ces biopsies ne fournissent souvent que de petites quantités de tissu. Étant donné que plusieurs tests sont nécessaires pour vérifier différentes modifications moléculaires, cette petite taille d’échantillon peut poser problème.

De plus, réaliser plusieurs tests nécessite de préparer le tissu plusieurs fois, ce qui peut entraîner une perte supplémentaire de tissu. Parfois, il n'y a pas assez de matériel de bonne qualité pour les tests, et les procédures de diagnostic standard ne couvrent souvent pas tous les cibles moléculaires nécessaires. Bien que des recherches antérieures montrent que les taux de tests pour ces biomarqueurs augmentent, il reste encore beaucoup de place pour des améliorations.

Avancées dans l'analyse CtDNA

Récemment, de nouvelles méthodes comme le test de l'ADN tumoral circulant (ctDNA) ont fait de grands progrès. Ce test sanguin est moins invasif et plus facile pour les patients, et fournit potentiellement des informations pouvant compléter les tests de profilage moléculaire existants. Cependant, l'efficacité clinique de ce test pour le NSCLC est encore à l'étude.

Objectif et conception de l'étude

Cette étude visait à voir à quel point les diagnostics moléculaires pouvaient s'améliorer en normalisant le processus de test. Au départ, seuls les tests pour deux marqueurs spécifiques, EGFR et ALK, étaient considérés comme pratiques standards pour les patients de stade IV NSCLC aux Pays-Bas. L'étude a aussi proposé d'inclure d'autres biomarqueurs importants comme KRAS, BRAF, ERBB2, ROS1, RET, MET et PD-L1. Les chercheurs pensaient que le profilage des maladies à un stade précoce deviendrait également significatif dans les milieux cliniques.

L'étude a été menée dans dix hôpitaux à travers les Pays-Bas. Les patients soupçonnés d'avoir un NSCLC ou déjà diagnostiqués mais en attente de traitement ont été inclus dans l'étude. Les données ont été collectées pendant la période de recrutement du 1er août 2016 au 31 décembre 2019. Tous les patients ont participé volontairement après avoir donné leur consentement, et un ensemble strict de critères a été utilisé pour déterminer l'éligibilité.

Procédures de l'étude

La phase initiale de l'étude a examiné comment les pratiques cliniques actuelles fonctionnaient et comment une sensibilisation au profilage moléculaire pouvait affecter les résultats. Les centres participants pouvaient réaliser un profilage moléculaire selon leurs normes locales pendant un maximum de six mois.

Dans la deuxième phase, des protocoles pour un profilage moléculaire complet ont été établis pour tous les patients atteints de NSCLC, quel que soit leur stade de maladie ou leur histologie. Des échantillons de tissu ont été préparés pour permettre des tests simultanés pour tous les biomarqueurs afin de réduire la perte de matériel. Le test de certaines modifications oncogéniques était obligatoire, tout comme l'évaluation de l'expression de PD-L1. Tous les tests ont été effectués dans des centres locaux.

Au cours des deux phases, des échantillons de sang ont été prélevés sur les patients avant qu'ils ne commencent à recevoir un traitement. Ces échantillons ont été stockés pour une analyse ultérieure. L'étude a utilisé une méthode spécifique appelée PCR digitale en gouttelettes (ddPCR) pour analyser le ctDNA, qui incluait la vérification de mutations spécifiques dans le matériel génétique du cancer.

Considérations statistiques

L'étude LEMA est unique en tant que premier effort à grande échelle pour améliorer les diagnostics moléculaires dans le NSCLC aux Pays-Bas. Les premiers calculs pour les tailles d'échantillons et les effets attendus ont dû se baser sur des hypothèses en raison de paramètres inconnus. On espérait que des ajustements pourraient être réalisés à partir des données collectées lors de l'étude.

Pour évaluer l'efficacité des nouveaux protocoles de test, les chercheurs ont établi qu'au moins 55 % des patients devraient passer des tests EGFR et ALK pour être considérés comme cliniquement significatifs. Une analyse statistique a été utilisée pour mesurer toute augmentation significative des taux de test entre les différentes phases de l'étude.

Déclaration éthique

L'étude LEMA a été réalisée sous des directives éthiques strictes. Elle a été examinée et approuvée par un comité d'éthique médicale, assurant que la recherche respectait les normes éthiques établies dans le domaine de la santé.

Sources de financement

Cette étude a été conçue de manière indépendante par l'équipe de recherche et a été financée par diverses entreprises pharmaceutiques. Bien que les sponsors aient approuvé le manuscrit, ils n'ont pas influencé les aspects de la conception, de l'implémentation ou de l'analyse de l'étude.

Caractéristiques de la cohorte de patients

Dans l'étude, un total de 1108 patients a été évalué, dont 230 ont été exclus pour diverses raisons. Au cours de la phase initiale, 136 patients ont participé, tandis que la deuxième phase a inclus 742 patients. Ce recrutement s'est étalé sur plus de 40 mois.

Résultats du profilage moléculaire basé sur les tissus

Au cours de la phase initiale, 69,9 % des patients ont subi un test combiné pour EGFR et ALK, ce qui était significativement plus élevé que ce qui était prévu auparavant. Le taux global est passé à 77,0 % dans la deuxième phase. Les deux phases ont montré que des altérations d'EGFR ou d'ALK ont été détectées à des taux significatifs, supérieurs au seuil précédemment établi pour la pertinence clinique.

Pour les deux stades du NSCLC-précoce et métastatique-les taux de test se sont améliorés. Cependant, la probabilité de détecter des mutations ciblables était plus faible dans le carcinome épidermoïde par rapport aux types non épidermoïdes.

Résultats du profilage moléculaire complet (CMP)

Le profilage moléculaire complet visait à identifier des mutations conductrices spécifiques et a réussi dans 68,7 % des patients dans la deuxième phase. Chez les patients de stade IV, les taux de réussite ont considérablement augmenté, montrant des taux de profilage améliorés par rapport à la phase initiale.

L'étude a trouvé des niveaux élevés d'expression de PD-L1 et de mutations ciblables dans plusieurs sous-types de NSCLC. La prévalence globale de mutations et de fusions spécifiques a été enregistrée, ajoutant de la profondeur à la compréhension des caractéristiques moléculaires dans cette population de patients.

Résultats du profilage moléculaire basé sur le plasma

Les échantillons de sang prélevés sur les patients ont montré que l'analyse du ctDNA était faisable pour presque tous les participants. Cette méthode a détecté plusieurs mutations, y compris celles qui étaient absentes dans le profilage basé sur les tissus. Elle a offert des informations supplémentaires qui pourraient améliorer l'image diagnostique globale.

Conclusion et implications futures

L'étude a établi que la normalisation des tests de biomarqueurs a considérablement augmenté le taux de profilage moléculaire. Elle a également indiqué que l'analyse du ctDNA pourrait servir d'outil précieux aux côtés du test traditionnel basé sur les tissus, en particulier dans le NSCLC de stade IV.

Bien que les résultats soulignent la nécessité d'améliorer les pratiques de test, des recherches futures sont nécessaires pour déterminer les avantages cliniques du profilage au stade précoce du NSCLC. La combinaison des analyses basées sur les tissus et sur le sang représente une approche prometteuse pour élargir le profilage moléculaire, garantissant que plus de patients reçoivent le traitement le plus efficace adapté à leurs caractéristiques spécifiques du cancer.

Alors que le paysage du traitement du cancer du poumon continue d'évoluer, des améliorations et des innovations continues dans les méthodologies de test seront essentielles pour optimiser les soins aux patients.

Source originale

Titre: Optimising primary molecular profiling in non-small cell lung cancer

Résumé: IntroductionMolecular profiling of NSCLC is essential for optimising treatment decisions, but often incomplete. We assessed the efficacy of protocolised molecular profiling in the current standard-of-care (SoC) in a prospective observational study in the Netherlands and measured the effect of providing standardised diagnostic procedures. We also explored the potential of plasma-based molecular profiling in the primary diagnostic setting. MethodsThis multi-centre prospective study was designed to explore the performance of current clinical practice during the run-in phase using local SoC tissue profiling procedures. The subsequent phase was designed to investigate the extent to which comprehensive molecular profiling (CMP) can be maximized by protocolising tumour profiling. Successful molecular profiling was defined as completion of at least EGFR and ALK testing. Additionally, PD-L1 tumour proportions scores were explored. Lastly, the additional value of centralised plasma-based testing for EGFR and KRAS mutations using droplet digital PCR was evaluated. ResultsTotal accrual was 878 patients, 22.0% had squamous cell carcinoma and 78.0% had non-squamous NSCLC. Stage I-III was seen in 54.0%, stage IV in 46.0%. Profiling of EGFR and ALK was performed in 69.9% of 136 patients included in the run-in phase, significantly more than real-world data estimates of 55% (p

Auteurs: Robert Dirk Schouten, M. Schuurbiers, V. Van der Noort, R. Damhuis, E. Van der Heijden, S. Burgers, N. Barlo, A. Van Lindert, K. Maas, J. Van den Brand, A. Smit, J.-M. Van Haarst, B. Van der Maat, E. Schuuring, H. Blaauwgeers, S. Willems, K. Monkhorst, D. Van den Broek, M. Van den Heuvel

Dernière mise à jour: 2023-08-21 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.08.20.23294346

Source PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.08.20.23294346.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

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