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Améliorer l'enregistrement d'images médicales avec des nuages de points

De nouvelles méthodes améliorent la précision de l'alignement des nuages de points médicaux au fil du temps.

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L'enregistrement d'images médicales, c'est le processus où des images de moments ou de sources différentes sont alignées pour se correspondre. Ça aide les médecins à voir comment la condition d'un patient évolue dans le temps. Une manière de faire ça, c'est d'utiliser des Nuages de points, qui sont des collections de points représentant les formes d'objets en 3D. Ces nuages de points peuvent offrir des avantages comme un traitement plus rapide, la protection de l'identité des patients, et étant moins affectés par les variations de luminosité des images.

Ceci dit, utiliser des nuages de points n'est pas sans défis. Les méthodes traditionnelles dépendent souvent d'images avec beaucoup de données, ce qui peut poser problème quand il s'agit d'aligner des nuages de points plus simples. Pour surmonter ça, les chercheurs explorent comment utiliser l'apprentissage machine, notamment les techniques d'Adaptation de domaine, afin d'améliorer le processus d'alignement des nuages de points.

Défis dans l'enregistrement de nuages de points

Les nuages de points n'ont pas de données de vérité terrain, ce qui rend difficile de savoir si l'alignement est précis. Ce manque d'infos complique l'entraînement des modèles avec de l'apprentissage non supervisé, où le modèle apprend à partir de données sans exemples étiquetés. À la place, les chercheurs créent souvent des Données synthétiques qui simulent à quoi ressembleraient les nuages de points dans certaines conditions. Par contre, il y a un écart notable entre les données synthétiques et celles du monde réel, ce qui peut affecter la performance lors de l'alignement des nuages de points de vrais patients.

Utiliser des données synthétiques est une approche courante, mais ça a aussi ses limites. En particulier, le décalage entre les données synthétiques et réelles peut entraîner des résultats moins précis lors de l'alignement des nuages de points. C'est là qu'intervient l'adaptation de domaine. L'adaptation de domaine vise à rendre les modèles meilleurs pour travailler avec des données réelles en les formant sur un mélange d'exemples synthétiques et réels.

L'approche du Mean Teacher

Une méthode qui a été utilisée pour l'adaptation de domaine dans diverses tâches est connue sous le nom d'approche du Mean Teacher. Cette méthode consiste en deux modèles : un modèle étudiant et un modèle enseignant. Le modèle étudiant apprend à partir des données, tandis que le modèle enseignant est une version plus lente de l'étudiant qui fournit des conseils. Les prédictions de l'enseignant devraient être plus stables puisqu'elles se basent sur une moyenne des précédentes prédictions de l'étudiant.

Cependant, cette approche présente une limitation importante : les prédictions faites par l'enseignant peuvent être bruyantes. Si l'enseignant fait une erreur, ça peut induire l'étudiant en erreur, le poussant à apprendre des infos incorrectes. C'est particulièrement problématique dans les applications médicales où la précision est essentielle.

Stratégies d'amélioration

Pour surmonter les défis posés par les prédictions bruyantes du modèle enseignant, de nouvelles stratégies ont été introduites. Le but est d'améliorer la façon dont l'enseignant et l'étudiant interagissent pendant le processus de formation.

Filtrer les prédictions de l'enseignant

La première stratégie consiste à filtrer les prédictions de l'enseignant en fonction de leur qualité. Au lieu de prendre toutes les prédictions de l'enseignant, le système évalue comment les prédictions de l'enseignant correspondent aux résultats réels comparés à celles de l'étudiant. Si la prédiction de l'enseignant est moins bonne que celle de l'étudiant, elle n'est pas utilisée pour guider l'étudiant. Ce filtrage garantit que seules les prédictions les plus précises de l'enseignant sont utilisées pour la supervision, ce qui réduit le risque que l'étudiant apprenne à partir de mauvaises indications.

Cette approche repose sur une mesure appelée distance de Chamfer, qui examine à quel point les nuages de points de l'enseignant et de l'étudiant s'alignent. En utilisant cette mesure, le système peut choisir efficacement les meilleures prédictions de l'enseignant, s'assurant que l'étudiant apprend à partir des infos les plus précises disponibles.

Synthétiser de nouvelles données d'entraînement

La deuxième stratégie introduit un nouveau concept où l'enseignant ne se contente pas de fournir des prédictions mais génère aussi de nouvelles données d'entraînement. Quand l'enseignant fait des prédictions sur comment déplacer les points dans le nuage de points, il peut créer de nouvelles paires de nuages de points qui sont alignées avec des mouvements précis connus. Ces nouvelles paires sont utilisées pour entraîner l'étudiant, lui fournissant des étiquettes sans bruit à partir desquelles apprendre.

Cette approche offre une expérience d'entraînement plus réaliste puisque les nouvelles paires de données sont directement liées aux données originales. L'étudiant peut donc apprendre à partir de ces exemples plus propres, rendant le processus d'entraînement plus efficace.

Évaluation expérimentale

Les méthodes proposées ont été testées sur une tâche médicale spécifique : aligner des nuages de points de vaisseaux pulmonaires pris durant différentes phases de respiration (inhalation et exhalation). Un ensemble de données public largement utilisé de nuages de points de vaisseaux pulmonaires a servi de base pour ces tests. Cet ensemble de données contient une variété de paires de données qui ont été utilisées pour voir comment les méthodes fonctionnaient dans différentes conditions.

Les expériences ont montré que les nouvelles stratégies ont significativement amélioré la performance de l'approche traditionnelle du Mean Teacher. En filtrant les prédictions de l'enseignant et en générant de nouvelles paires de données d'entraînement, la méthode a atteint une meilleure précision dans l'enregistrement des nuages de points. En fait, les améliorations étaient si substantielles que la nouvelle méthode a battu un record de précision dans ce domaine de recherche.

Avantages de la nouvelle méthode

L'approche présentée offre plusieurs avantages. D'abord, elle aborde les limites des méthodes précédentes qui s'appuyaient fortement sur les données synthétiques. En utilisant des stratégies pour filtrer les mauvaises prédictions et générer des données d'entraînement réalistes, la nouvelle méthode comble le fossé entre les données synthétiques et réelles.

De plus, cette méthode élimine le besoin de conceptions compliquées visant à créer des types spécifiques de transformations de données. Au lieu de cela, elle utilise une approche plus générale qui pourrait être appliquée à différentes structures médicales au-delà des vaisseaux pulmonaires.

Directions futures

Bien que la méthode actuelle montre un grand potentiel, il y a encore des domaines à améliorer et à explorer. Une direction intéressante serait d'appliquer ces stratégies à d'autres structures anatomiques. Les techniques apprises de l'enregistrement des vaisseaux pulmonaires pourraient être adaptées de manière bénéfique à d'autres domaines, comme l'abdomen ou le cerveau.

En plus, cette méthode pourrait inspirer des améliorations dans l'enregistrement d'images denses, où des données basées sur des images plus traditionnelles sont utilisées. Combiner les forces des méthodes basées sur des nuages de points avec des approches basées sur des images pourrait mener à de nouvelles avancées dans le domaine de l'imagerie médicale et de l'enregistrement.

Conclusion

En résumé, aligner des nuages de points est une tâche importante dans l'imagerie médicale qui fait face à plusieurs défis. En tirant parti des techniques d'adaptation de domaine, notamment l'approche du Mean Teacher, et en introduisant de nouvelles façons de filtrer les prédictions et de synthétiser des données d'entraînement, des améliorations substantielles peuvent être réalisées. Les résultats des expériences démontrent l'efficacité de ces méthodes, établissant de nouvelles normes en matière de précision tout en maintenant des capacités de traitement rapide.

Alors que le domaine continue d'évoluer, ces avancées ouvrent la voie à des améliorations dans la façon dont les professionnels de la santé analysent et interprètent les données des patients, conduisant finalement à de meilleurs résultats pour les patients.

Source originale

Titre: A denoised Mean Teacher for domain adaptive point cloud registration

Résumé: Point cloud-based medical registration promises increased computational efficiency, robustness to intensity shifts, and anonymity preservation but is limited by the inefficacy of unsupervised learning with similarity metrics. Supervised training on synthetic deformations is an alternative but, in turn, suffers from the domain gap to the real domain. In this work, we aim to tackle this gap through domain adaptation. Self-training with the Mean Teacher is an established approach to this problem but is impaired by the inherent noise of the pseudo labels from the teacher. As a remedy, we present a denoised teacher-student paradigm for point cloud registration, comprising two complementary denoising strategies. First, we propose to filter pseudo labels based on the Chamfer distances of teacher and student registrations, thus preventing detrimental supervision by the teacher. Second, we make the teacher dynamically synthesize novel training pairs with noise-free labels by warping its moving inputs with the predicted deformations. Evaluation is performed for inhale-to-exhale registration of lung vessel trees on the public PVT dataset under two domain shifts. Our method surpasses the baseline Mean Teacher by 13.5/62.8%, consistently outperforms diverse competitors, and sets a new state-of-the-art accuracy (TRE=2.31mm). Code is available at https://github.com/multimodallearning/denoised_mt_pcd_reg.

Auteurs: Alexander Bigalke, Mattias P. Heinrich

Dernière mise à jour: 2023-07-04 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://arxiv.org/abs/2306.14749

Source PDF: https://arxiv.org/pdf/2306.14749

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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