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ARHGAP9 : Un Marqueur Potentiel pour le ccRCC

Des recherches montrent qu'ARHGAP9 est un marqueur prometteur pour le carcinoma rénal à cellules claires.

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Table des matières

Le carcinome rénal à cellules claires (CcRCC) est l'un des cancers les plus courants dans le monde. Parmi eux, le ccRCC est le type le plus fréquemment diagnostiqué, contribuant à de nombreux décès liés au cancer. Environ 30 % des patients atteints de ccRCC ont un cancer qui s'est étendu à d'autres parties du corps au moment du diagnostic. Le mauvais pronostic pour le ccRCC est en partie dû à cette propagation du cancer. Malgré les différents traitements disponibles pour le ccRCC, les cas avancés restent très graves, avec seulement environ 10 % des patients survivant cinq ans après le diagnostic. Ce type de cancer a tendance à résister aux traitements courants comme la chimiothérapie et la radiothérapie. Cette situation souligne l'urgence de trouver de meilleures options de traitement et de nouveaux marqueurs qui peuvent aider à diagnostiquer et prédire les résultats pour les patients atteints de ccRCC.

ARHGAP9 et son importance

ARHGAP9 est un gène qui joue un rôle dans la régulation de plusieurs processus importants au sein des cellules, y compris la croissance, le mouvement et la communication. Il appartient à une famille de protéines connues sous le nom de Rho GTPases, qui fonctionnent comme des interrupteurs pour aider à contrôler le comportement cellulaire. Lorsque ces protéines sont déséquilibrées, cela peut conduire à la croissance et à la propagation du cancer. Des études récentes ont suggéré que les changements dans les niveaux d'ARHGAP9 pourraient être liés à divers types de cancer. Cependant, son rôle spécifique dans le ccRCC n'avait pas été exploré en profondeur jusqu'à présent. Cette étude se concentre sur l'examen du potentiel d'ARHGAP9 en tant que marqueur significatif pour le ccRCC et sur la compréhension de son impact potentiel sur les résultats des patients.

Objectifs de la recherche

Les principaux objectifs de cette recherche sont :

  • Analyser l'expression d'ARHGAP9 chez les patients atteints de ccRCC et sa relation avec les résultats des patients.
  • Rassembler des données sur les gènes co-exprimés d'ARHGAP9 et leurs rôles possibles dans le ccRCC.
  • Étudier comment l'expression d'ARHGAP9 est corrélée à la présence de Cellules immunitaires dans le ccRCC.

Sources de données

Les chercheurs ont utilisé diverses bases de données pour rassembler des informations :

  • TCGA Datasets : Cette base de données contient des données provenant de nombreux patients atteints de cancer, y compris l'expression des gènes et des informations cliniques, qui ont été analysées pour ARHGAP9.
  • TIMER 2.0 Database : Cette ressource aide à analyser l'expression des gènes et la présence de cellules immunitaires dans les tumeurs.
  • UALCAN et CPTAC : Ces bases de données ont été utilisées pour étudier les niveaux de protéines d'ARHGAP9 dans les tissus normaux et ccRCC.
  • STRING Database : Cela a été utilisé pour trouver des gènes qui interagissent avec ARHGAP9 et créer des réseaux d'interaction.
  • TISIDB : Cette base de données a été utilisée pour explorer comment ARHGAP9 est lié aux cellules immunitaires dans les tumeurs.
  • GEPIA2 : Cette ressource a été utilisée pour étudier la connexion entre les niveaux d'ARHGAP9 et les Taux de survie des patients atteints de ccRCC.
  • Kaplan-Meier Plotter : Cet outil a aidé à évaluer comment l'expression d'ARHGAP9 affecte la survie globale dans le ccRCC.

Résultats

Niveaux d'expression d'ARHGAP9

L'analyse a révélé que les niveaux d'ARHGAP9 étaient significativement plus élevés dans les tissus ccRCC par rapport aux tissus normaux. Cela était vrai pour les niveaux de gènes et de protéines. Plus spécifiquement, des preuves ont montré qu'à mesure que les cancers progressaient, les niveaux d'ARHGAP9 augmentaient. Cela suggère qu'ARHGAP9 pourrait jouer un rôle dans le développement et l'aggravation du ccRCC.

Associations cliniques

Des niveaux élevés d'ARHGAP9 étaient liés à des stades avancés de la maladie, ce qui signifie que le cancer s'était propagé plus loin ou était plus agressif. On a découvert que l'expression d'ARHGAP9 était corrélée à des facteurs tels que la taille de la tumeur, la propagation aux ganglions lymphatiques et le stade général du cancer. Cependant, aucune connexion significative n'a été trouvée entre les niveaux d'ARHGAP9 et d'autres facteurs comme l'âge ou le sexe.

Valeur diagnostique

L'étude a évalué le potentiel d'ARHGAP9 en tant qu'outil de diagnostic en utilisant une technique appelée analyse ROC (Receiver Operating Characteristic). Les résultats ont montré qu'ARHGAP9 a un excellent potentiel pour distinguer entre ccRCC et tissus normaux, avec une grande sensibilité et spécificité. Cela indique qu'ARHGAP9 pourrait être un marqueur précieux pour identifier le ccRCC.

Analyse de survie

Une analyse plus approfondie a montré que les patients avec des niveaux élevés d'ARHGAP9 avaient des taux de survie plus courts par rapport à ceux avec des niveaux plus bas. Cela a été confirmé en utilisant plusieurs outils d'analyse. Les résultats ont indiqué qu'ARHGAP9 est un facteur de risque pour des résultats moins bons.

Rôle dans l'infiltration immunitaire

Les niveaux d'ARHGAP9 ont également été analysés en relation avec les cellules immunitaires présentes dans les tumeurs. Les résultats ont indiqué une forte corrélation positive entre l'expression d'ARHGAP9 et divers types de cellules immunitaires, telles que les cellules B, les cellules T CD8+ et les macrophages. Cela suggère qu'ARHGAP9 pourrait jouer un rôle dans l'interaction du système immunitaire avec le ccRCC, influençant potentiellement les résultats des patients.

Conclusion

Cette étude met en lumière l'importance d'ARHGAP9 dans le carcinome rénal à cellules claires. Les résultats indiquent qu'ARHGAP9 est surexprimé dans les tissus ccRCC par rapport aux tissus normaux et est associé à une maladie plus avancée. Ses niveaux peuvent servir de marqueur diagnostique utile et aider à prédire les taux de survie des patients. De plus, le lien d'ARHGAP9 avec la présence de cellules immunitaires dans les tumeurs ouvre de nouvelles avenues pour comprendre comment le ccRCC interagit avec le système immunitaire.

La recherche souligne le potentiel d'ARHGAP9 en tant que biomarqueur et cible pour de futurs traitements du ccRCC. D'autres études sont nécessaires pour explorer ces résultats et leur application dans des contextes cliniques afin d'améliorer les soins et les résultats des patients.

Source originale

Titre: Upregulation of ARHGAP9 is correlated with poor prognosis and immune infiltration in clear cell renal cell carcinoma

Résumé: BackgroundRho GTPase Activating Protein (ARHGAP) family genes play critical roles in the onset and progression of human cancer. Rho GTPase Activating Protein 9 (ARHGAP9) is upregulated in various tumors. However, far too little attention has been paid to the prognostic value of ARHGAP9 and correlation with immune infiltration in clear cell renal cell carcinoma. Our aim is to evaluate the prognostic significance of ARHGAP9 expression and its correlation with immune infiltration in clear cell renal cell carcinoma. MethodsTranscriptional expression profiles of ARHGAP9 between clear cell renal cell carcinoma tissues and normal tissues were downloaded from the Cancer Genome Atlas (TCGA). The ARHGAP9 protein expression was assessed by the Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium (CPTAC). Receiver operating characteristic (ROC) curve was used to differentiate clear cell renal cell carcinoma from adjacent normal tissues. The Kaplan-Meier method was conducted to assess the effect of ARHGAP9 on survival. Protein-protein interaction (PPI) networks were constructed by the STRING. Functional enrichment analyses were performed using the "ClusterProfiler" package. The immune infiltration patterns were evaluated via the tumor immune estimation resource 2.0 (TIMER 2.0) and TISIDB database. ResultsARHGAP9 expression was substantially higher in clear cell renal cell carcinoma tissues than in adjacent normal tissues. Increased ARHGAP9 mRNA expression was shown to be linked to high TNM stage and lymph node metastases. The diagnostic value of ARHGAP9 gene expression data was assessed using ROC curve analysis. The survival analysis module of GEPIA2 and the Kaplan-Meier plotter both showed clear cell renal cell carcinoma patients with high-ARHGAP9 had a worse prognosis than those with low-ARHGAP9. Correlation analysis indicated ARHGAP9 mRNA expression was significantly correlated with tumor purity and immune infiltrates. ConclusionThese findings demonstrate that up-regulated ARHGAP9 indicates poor prognosis and immune infiltration in clear cell renal cell carcinoma. The current findings suggest that ARHGAP9 can be an effective biomarker and potential therapeutic strategy for ccRCC.

Auteurs: Yue Tian, Y.-l. Xiong, C. Peng

Dernière mise à jour: 2023-09-03 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.08.31.23294890

Source PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.08.31.23294890.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

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