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# Biologie# Biologie du cancer

Aperçus génétiques sur le développement du cancer du sang

La recherche révèle comment les mutations dans les cellules souches sanguines mènent à la LMA.

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Au cours des deux dernières décennies, les chercheurs ont beaucoup appris sur les changements génétiques qui conduisent au cancer. La plupart des cancers commencent par plusieurs Mutations clés dans l'ADN d'une seule cellule. Ces mutations peuvent se développer des années avant l'apparition de la première cellule cancéreuse. Cependant, les scientifiques essaient toujours de comprendre comment toutes ces mutations s'accumulent dans une cellule tout au long de la vie d'une personne.

Les premières théories sur le cancer suggéraient que l'accumulation de mutations était la principale raison pour laquelle les gens développent un cancer en vieillissant. Pourtant, ces théories peinent à expliquer à quelle fréquence les cancers surviennent réellement en fonction des estimations de la rapidité avec laquelle les mutations se produisent et combien de cellules souches se trouvent dans le corps.

Des recherches récentes ont montré que certaines mutations sont favorisées dans le corps, ce qui signifie que les cellules avec ces mutations ont un avantage et sont plus susceptibles de survivre. Cette Sélection semble se produire non seulement au début du cancer, mais tout au long de son développement. Mesurer ces changements précoces dans les cellules qui pourraient conduire au cancer peut être difficile, donc les scientifiques n'ont pas encore confirmé ces idées avec des calculs précis.

Le Rôle du Séquençage à Une Seule Cellule dans la Recherche sur le Cancer

Une manière prometteuse d'étudier comment le cancer se développe est le séquençage à une seule cellule. Cette méthode permet aux scientifiques d’examiner de près la composition génétique des cellules individuelles et de comprendre leur histoire. En examinant les mutations dans un groupe de cellules apparentées, les chercheurs peuvent créer une carte montrant comment le cancer pourrait évoluer au fil du temps.

Le système sanguin est un excellent domaine pour cette recherche parce que les scientifiques peuvent facilement trouver et analyser les Cellules souches sanguines. Ces recherches ont montré que les individus en bonne santé ont beaucoup de cellules souches sanguines qui soutiennent leur production de sang. Dans certains cancers du sang, des mutations clés peuvent même commencer avant la naissance. De plus, il y a une grande variété de ces cellules souches dans des conditions comme la leucémie aiguë myéloïde (LAM).

Une nouvelle approche consiste à prélever des cellules souches sanguines chez des patients diagnostiqués avec une LAM et à les étudier de plus près en utilisant le séquençage à une seule cellule. Cela permet aux scientifiques d'observer comment les mutations se développent au fil du temps et comment certaines d'entre elles peuvent mener à un retour du cancer après un traitement.

Construire un Portrait de l'Évolution Préleucémique

Dans cette recherche, les scientifiques se sont concentrés sur 16 patients atteints de LAM et ont analysé leurs échantillons sanguins. Pour garantir des résultats précis, ils ont choisi des échantillons avec un arrière-plan génétique similaire. Après avoir isolé les cellules souches sanguines, ils ont séquencé leur ADN pour rechercher des mutations dans des gènes importants liés aux cancers du sang. Ce processus leur a permis d'identifier des milliers de cellules souches sanguines individuelles et de reconstruire un tableau des mutations génétiques pour chaque patient.

L'analyse a révélé que la plupart des cas de LAM possèdent typiquement trois ou quatre mutations clés. Parmi ces mutations, certains gènes apparaissaient fréquemment aux côtés des mutations connues. Les chercheurs ont systématiquement constaté qu'une mutation survenait souvent avant les autres, montrant un schéma dans le développement de ces mutations.

L'étude des changements génétiques dans les cellules souches sanguines a montré qu'il existe différentes façons pour ces cellules d'évoluer vers le cancer. Dans environ un tiers des cas, les chercheurs ont observé des chemins d'évolution divergents, suggérant que plusieurs lignées de cellules mutantes pourraient exister simultanément. Dans les cas restants, l'évolution semblait suivre un chemin unique. Il y avait aussi des différences notables dans le nombre de cellules avec différentes mutations, indiquant que certaines mutations étaient plus avantageuses que d'autres.

Comprendre la Concurrence entre les Cellules

Ces découvertes sur l'évolution des cellules souches sanguines suggèrent que la taille et la composition des différentes lignées cellulaires changent en raison de la concurrence entre elles, des mutations aléatoires, et des événements fortuits. En modélisant ces processus, les chercheurs pourraient mieux comprendre comment les divers schémas d'évolution dans ces cas de LAM émergent.

L'étude a essayé de simuler comment les cellules souches sanguines pourraient changer au fil du temps, en tenant compte de divers facteurs tout en ignorant les identités spécifiques de chaque mutation. Les chercheurs ont défini un point où ils considéraient qu'un patient avait un cancer en fonction du nombre de mutations clés trouvées dans ses cellules. Cette modélisation pourrait aider à comparer les séquences réelles observées chez les patients avec celles créées dans les simulations.

Pour améliorer l'analyse, les scientifiques ont comparé les tailles de clones dans les données réelles des patients par rapport à de nombreux scénarios simulés pour voir comment les pressions de sélection pourraient différer parmi les divers cas. Il semblerait que des avantages sélectifs modérés à forts conduisent à des schémas d'évolution plus complexes, ce qui a aidé à clarifier pourquoi certains patients avaient des formes de cancer plus agressives.

Validation des Résultats avec Plus de Données

Pour s'assurer que leurs résultats étaient applicables à d'autres cas de LAM, les chercheurs ont analysé des données supplémentaires provenant de 27 autres cas de LAM. Ils ont de nouveau examiné comment la taille et la composition des lignées cellulaires changeaient. Leurs résultats ont résonné avec ceux des 16 cas initiaux, montrant que l'évolution de la LAM ne pouvait pas être expliquée uniquement par des mutations aléatoires. En fait, des niveaux modérés de sélection positive étaient à l'œuvre dans de nombreux cas.

L'analyse a indiqué que la plupart des schémas observés pouvaient être expliqués par des forces de sélection similaires, ce qui signifie que la présence de certaines mutations augmentait les chances que les cellules survivent et se multiplient. Ainsi, les cas dans lesquels quelques mutations dominaient le paysage étaient liés à une sélection plus faible, tandis que ceux montrant un mélange de plusieurs mutations indiquaient des pressions de sélection plus fortes.

Examiner les Risques Futurs de LAM

L'idée que beaucoup de ces arbres de clones préleucémiques montrent des preuves de sélection positive amène les chercheurs à penser que ces clones pourraient se développer sur de nombreuses années, offrant une longue période pour prédire qui pourrait être à risque de développer une LAM. Cependant, il est crucial de comprendre à quel point certains marqueurs sont communs chez les personnes qui ne développent pas la maladie.

Les simulations ont montré que les chemins évolutifs menant à la LAM pourraient différer considérablement de ceux des personnes qui ne développent pas de cancer. D'habitude, les individus avec des mutations uniques étaient communs, rendant ces mutations moins utiles comme indicateurs de risque futur de cancer. En revanche, la présence de cellules avec deux mutations avant l'âge de 30 ans était beaucoup plus rare chez les individus en bonne santé, mais plus commune chez ceux destinés à développer une LAM. Le même schéma s'applique aux individus acquérant trois mutations avant 50 ans, montrant un risque notable de transformation en cancer.

Conclusion

Cette étude souligne que les cellules souches sanguines peuvent contenir des preuves de changements précoces menant au cancer. En étudiant ces changements en détail, les scientifiques peuvent créer un tableau plus clair de comment la LAM évolue et identifier les individus qui pourraient être à risque plus élevé de développer la maladie. Bien que certaines simplifications aient été faites durant la recherche, les résultats mettent en évidence les interactions complexes entre les mutations génétiques et les pressions sélectives dans l'évolution préleucémique. L'espoir est qu'en détectant certaines combinaisons de mutations tôt, les chercheurs puissent mieux prédire qui pourrait avoir besoin d'une surveillance plus attentive pour le développement de la LAM à l'avenir.

Source originale

Titre: Single-cell DNA sequencing reveals pervasive positive selection throughout preleukemic evolution

Résumé: The representation of driver mutations in preleukemic haematopoietic stem cells (pHSCs) provides a window into the somatic evolution that precedes Acute Myeloid Leukemia (AML). Here, we isolate pHSCs from the bone marrow of 16 patients diagnosed with AML and perform single-cell DNA sequencing on thousands of cells to reconstruct phylogenetic trees of the major driver clones in each patient. We develop a computational framework that can infer levels of positive selection operating during preleukemic evolution from the statistical properties of these phylogenetic trees. Combining these data with 67 previously published phylogenetic trees, we find that the highly variable structures of preleukemic trees emerge naturally from a simple model of somatic evolution in which there is pervasive positive selection acting throughout the disease trajectory. We infer that selective advantages of preleukemic clones are typically in the range of 9%-24% per year, but vary considerably between individuals. At these level of positive selection, we show that the identification of early multiple-mutant clones identifies individuals at risk of future AML.

Auteurs: Gladys Y.P. Poon, J. R. Blundell, A. Vedi, E. Laurenti, M. A. Sanders, P. Valk

Dernière mise à jour: 2024-05-22 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.12.15.571872

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.12.15.571872.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

Merci à biorxiv pour l'utilisation de son interopérabilité en libre accès.

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