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Avancées de l'IA dans l'imagerie médicale pour la classification des tumeurs

L'IA améliore la précision de la classification des tumeurs en utilisant des IRM et des techniques d'apprentissage par transfert.

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Ces dernières années, l'intelligence artificielle (IA) a fait de gros progrès dans divers domaines, y compris la médecine. Un des domaines où l'IA est particulièrement utile, c'est l'analyse des images médicales, comme les IRM. Les réseaux de neurones convolutifs (CNN) sont une technologie qui peut être formée pour reconnaître et classer différents objets dans les images. Ces réseaux apprennent à partir d'un grand nombre d'images, ce qui leur permet d'identifier des caractéristiques similaires dans de nouvelles images.

Les CNN peuvent aussi utiliser une méthode appelée Apprentissage par transfert. Cette technique permet à un modèle formé pour une tâche d'être adapté pour une autre tâche connexe tout en utilisant ce qu'il a appris au départ. C'est particulièrement utile quand la nouvelle tâche est assez similaire pour que la formation initiale puisse aider dans la nouvelle classification. Par exemple, la Classification des tumeurs à partir d'images est complexe et peut bénéficier des connaissances acquises lors d'autres tâches de reconnaissance d'images.

Détection d'Animaux Camouflés et Classification de Tumeurs

Bien que les tâches de détection d'animaux camouflés et de classification de tumeurs semblent différentes, il y a une similitude dans la façon dont elles reconnaissent les motifs. Un animal caché dans son environnement est comme une tumeur qui se fond dans les tissus sains. Les compétences acquises pour identifier les animaux cachés peuvent améliorer la capacité à classer les tumeurs dans les images médicales. Un CNN formé pour reconnaître des animaux camouflés peut transférer cette compétence pour mieux détecter et classer les tumeurs.

Comprendre les Espaces de Caractéristiques dans les Réseaux de Neurones

Il est essentiel de noter que simplement regarder la performance d'un CNN ne révèle pas comment il traite l'information. Après l'entraînement, on peut voir comment différentes parties du réseau réagissent à diverses images. Cela se fait en créant des espaces de caractéristiques, qui montrent comment le réseau représente et organise les différentes images les unes par rapport aux autres.

Dans un espace de caractéristiques, les images similaires sont plus proches, tandis que les différentes images sont plus éloignées. Cette organisation peut donner des indications sur la capacité du réseau à généraliser ce qu'il a appris. Plus un réseau est précis, mieux il peut classifier les images en fonction des caractéristiques apprises.

Création de Jeux de Données pour l'Entraînement

Pour former des CNN à détecter les tumeurs cérébrales, on a utilisé divers types d'Images IRM. Les jeux de données comprenaient des images de tumeurs comme les astrocytomes et les oligodendrogliomes, ainsi que des images cérébrales normales. Beaucoup de ces scans provenaient de bases de données publiques, et d'autres images cérébrales normales ont été fournies par un centre de santé. Toutes les données ont été collectées en conformité avec les règlements de confidentialité, s'assurant que les informations personnelles n'étaient pas révélées.

Le jeu de données final contenait un total de 264 IRM utilisables, comprenant 73 astrocytomes, 44 oligodendrogliomes et 120 images cérébrales normales. On a aussi utilisé des jeux de données existants de projets précédents axés sur la détection d'animaux camouflés, qui contenaient près de 3 000 images divisées en différentes catégories.

Entraînement des Réseaux de Neurones

Dans ce projet, on a utilisé un CNN spécifique connu sous le nom d'AlexNet, qui compte 25 couches. Ce réseau avait déjà été formé sur un grand jeu de données de plus d'un million d'images dans diverses catégories. On a ajusté nos CNN, appelés T1Net et T2Net, pour classifier les tumeurs cérébrales en utilisant les données IRM collectées.

Les images ont été redimensionnées pour correspondre aux exigences d'entrée du réseau, et on a veillé à ce que les images provenant des mêmes patients ne soient pas mélangées entre les ensembles d'entraînement et de test. Cela a été fait pour garantir la fiabilité de nos résultats.

En plus des réseaux originaux, on a aussi créé deux nouveaux réseaux, ExpT1Net et ExpT2Net. Ces nouveaux réseaux ont utilisé les connaissances acquises des réseaux de détection d'animaux camouflés pour améliorer la performance sur la tâche de classification des tumeurs.

Réduction de Dimensionnalité et Visualisation

Pour analyser encore mieux la performance des réseaux, on a utilisé une méthode appelée Analyse en Composantes Principales (ACP). Cette technique aide à simplifier et visualiser les valeurs d'activation des réseaux, permettant de les représenter dans un espace tridimensionnel. Chaque point de cet espace représente comment le réseau a reconnu et classé une image spécifique.

On a aussi utilisé une technique appelée DeepDreamImage (DDI) pour créer des représentations visuelles de ce que les réseaux ont appris sur différentes catégories d'images. Cette méthode améliore les motifs reconnus par le réseau, permettant de visualiser son état interne.

Cartes de Sensibilité des Images

Pour déterminer quelles caractéristiques étaient cruciales pour les réseaux de neurones lors de la prise de décisions, on a généré des cartes de sensibilité des images. Ces cartes mettent en évidence les zones les plus importantes d'une image sur lesquelles le réseau se concentre lors de sa classification.

Pour les réseaux originaux et ceux formés par apprentissage par transfert, les cartes de sensibilité ont montré que les réseaux mettaient particulièrement l'accent sur les tumeurs et le tissu environnant. Cette approche est similaire à la façon dont les médecins analysent les IRM pour identifier les tumeurs, en examinant non seulement les tumeurs elles-mêmes mais aussi les zones environnantes affectées.

Performance des Réseaux de Neurones

Les performances des réseaux T1Net et T2Net ont montré de bons résultats dans la classification des gliomes. T1Net a atteint une précision moyenne de 85,99 %, tandis que T2Net était légèrement en dessous à 83,85 %. Les deux réseaux ont très bien performé sur les images cérébrales normales, avec des erreurs minimales, soulignant leur capacité à distinguer entre les tissus cancéreux et sains.

Cependant, les réseaux ont rencontré plus de défis pour classifier les différents types de gliomes. Par exemple, T1Net a identifié les astrocytomes avec la meilleure précision à 95,46 % mais a eu des difficultés avec les oligoastrocytomes, ne marquant que 12,50 %. D'un autre côté, T2Net a mieux réussi avec les oligoastrocytomes à 93,33 % mais moins efficacement sur les astrocytomes, avec seulement 74,42 % de précision.

Après avoir utilisé l'apprentissage par transfert, ExpT1Net et ExpT2Net ont montré une performance améliorée. ExpT2Net a montré l'augmentation la plus significative en précision, atteignant une remarquable 92,20 %, tandis qu'ExpT1Net a montré moins d'amélioration.

Comparaison des Espaces de Caractéristiques

Après l'apprentissage par transfert, les espaces de caractéristiques des nouveaux réseaux formés ont montré des changements notables. La distribution des images cérébrales normales est restée distincte des catégories de gliomes, mais une séparation plus claire est apparue au sein des groupes de gliomes. Ce changement indique que les réseaux sont devenus meilleurs pour distinguer les types de tumeurs après avoir transféré les connaissances du réseau de détection de camouflage.

Insights de l'Analyse DeepDreamImage

L'analyse utilisant DeepDreamImage a fourni des aperçus supplémentaires sur la façon dont les réseaux ont reconnu différentes catégories de tumeurs. Les images générées par ExpT1Net et ExpT2Net étaient plus distinctes et définies par rapport à leurs homologues antérieurs. Elles ont pu illustrer des formes spécifiques associées à chaque type de tumeur, illustrant une capacité améliorée à classifier les images avec précision.

Limitations de l'Étude

Cette étude a rencontré certaines limitations. Le déséquilibre dans le jeu de données aurait pu influencer la performance des réseaux, en particulier dans certaines catégories de tumeurs. De plus, les variations dans le formatage des images IRM provenant de différentes sources ont peut-être aussi affecté les résultats de classification.

Conclusion

En résumé, les réseaux de neurones convolutifs ont été formés avec succès pour détecter et classer les gliomes à l'aide des IRM. L'apprentissage par transfert provenant de réseaux précédemment entraînés s'est révélé être une méthode bénéfique, notamment pour les images pondérées T2, où une amélioration significative de la précision a été observée. Les modèles ont montré une capacité d'amélioration de la généralisation, ce qui leur permet de mieux identifier et classer les tumeurs.

Ces résultats montrent le potentiel d'utiliser des techniques avancées d'IA dans l'imagerie médicale, et les modèles développés sont disponibles pour une exploration plus poussée et un éventuel usage clinique dans la détection et la classification des gliomes.

Source originale

Titre: Deep Learning and Transfer Learning for Brain Tumor Detection and Classification

Résumé: Convolutional neural networks (CNNs) are powerful tools that can be trained on image classification tasks and share many structural and functional similarities with biological visual systems and mechanisms of learning. In addition to serving as a model of biological systems, CNNs possess the convenient feature of transfer learning where a network trained on one task may be repurposed for training on another, potentially unrelated, task. In this retrospective study of public domain MRI data, we investigate the ability of neural network models to be trained on brain cancer imaging data while introducing a unique camouflage animal detection transfer learning step as a means of enhancing the networks tumor detection ability. Training on glioma and normal brain MRI data, post-contrast T1-weighted and T2-weighted, we demonstrate the potential success of this training strategy for improving neural network classification accuracy. Qualitative metrics such as feature space and DeepDreamImage analysis of the internal states of trained models were also employed, which show improved generalization ability by the models following camouflage animal transfer learning. Image sensitivity functions further this investigation by allowing us to visualize the most salient image regions from a networks perspective while learning. Such methods demonstrate that the networks not only look at the tumor itself when deciding, but also at the impact on the surrounding tissue in terms of compressions and midline shifts. These results suggest an approach to brain tumor MRIs that is comparatively similar to that of trained radiologists while also exhibiting a high sensitivity to subtle structural changes resulting from the presence of a tumor. These findings present an opportunity for further research and potential use in a clinical setting.

Auteurs: Arash Yazdanbakhsh, F. Rustom, P. Parva, H. Ogmen

Dernière mise à jour: 2024-06-28 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.04.10.536226

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.04.10.536226.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

Merci à biorxiv pour l'utilisation de son interopérabilité en libre accès.

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