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L'importance des acides gras et de la synthase

Les acides gras jouent un rôle essentiel dans la santé et la maladie via la synthase des acides gras.

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Les acides gras sont super importants pour les êtres vivants. Ils aident à envoyer des signaux dans le corps, font partie des membranes cellulaires, stockent de l'énergie et aident à différentes fonctions cellulaires. Le corps fabrique des acides gras grâce à un processus qui combine des petites molécules appelées Acétyl-CoA et Malonyl-CoA en utilisant une enzyme appelée Synthase d'acides gras (FAS). Les acides gras les plus courants fabriqués sont l'acide palmitique et l'acide stéarique, qui ont respectivement 16 et 18 atomes de carbone.

Comprendre la FAS est crucial car elle joue un rôle clé dans la façon dont le corps traite la nourriture. La FAS pourrait aussi être une cible pour traiter des maladies comme l'obésité et le cancer. En comprenant mieux comment la FAS fonctionne, on peut trouver de nouvelles façons de créer des traitements.

Types de Synthase d'Acides Gras

Les enzymes FAS viennent en deux types principaux : type I et type II. La FAS de type II se trouve généralement dans les bactéries, les plantes et certaines parties des cellules d'origine procaryote. Ce type a des protéines spécialisées uniques régulées par des gènes spécifiques. En revanche, la FAS de type I est une protéine plus grande et plus complexe composée de plusieurs parties reliées entre elles. Cette structure est similaire à des enzymes apparentées appelées synthases de polykétides, qui produisent une plus grande variété de produits.

La structure multi-enzymatique a ses avantages. Elle peut créer de fortes concentrations de molécules intermédiaires, ce qui entraîne des réactions plus rapides et moins de réactions secondaires, puisque les Substrats se déplacent directement entre les parties de l'enzyme.

Comment Fonctionne la Synthèse des Acides Gras

La synthèse des acides gras commence par le transfert d'un groupe acétyle d'acétyl-CoA à une protéine appelée acyl carrier protein (ACP). Ce processus implique une autre protéine appelée malonyl-acetyl transferase (MAT). Ensuite, le groupe acétyle est transféré à une partie de l'enzyme appelée β-ketoacyl synthase (KS). L'ACP libre est associé à malonyl-CoA, et le groupe malonyl est ensuite converti en enolate. Cet enolate réagit avec le groupe acétyle dans une réaction de condensation.

Le composé résultant passe par plusieurs étapes de modification avec différentes protéines-β-ketoacyl réductase (KR), déshydratase (DH) et enoyl réductase (ER)-avant de répéter le cycle jusqu'à ce qu'une chaîne de 16 carbones soit fabriquée. Une protéine appelée thioestérase (TE) retire ensuite l'acide gras fini de l'ACP, le libérant pour utilisation.

Structure et Mécanisme de la Synthase d'Acides Gras

La structure de la FAS des porcs a été déterminée pour la première fois en 2006, révélant une forme complexe. Depuis, des études plus détaillées de sa structure ont été menées. Ces études montrent que la FAS fonctionne beaucoup plus vite que les enzymes apparentées et soulignent l'importance de la partie KS de la FAS. Le domaine KS est crucial car il est responsable de la formation du lien carbone principal durant la synthèse des acides gras.

Le mécanisme KS implique deux étapes principales. La première étape consiste à transférer un groupe acyle au cystéine du site actif de KS. La seconde étape est celle où le groupe malonyl subit une réaction, entraînant une condensation avec le groupe acyle attaché à KS. Cependant, beaucoup de détails sur la façon dont ces étapes fonctionnent ensemble restent flous.

Le Rôle de la Synthèse des Acides Gras dans la Santé Humaine

La FAS est essentielle pour le développement des acides gras à chaîne longue, fabriqués à partir d'unités plus petites, acétyl-CoA et malonyl-CoA. Le domaine KS joue un rôle central dans le processus, assurant les bonnes connexions entre les atomes de carbone.

Des recherches ont montré que la FAS et ses parties, comme KS, pourraient être ciblées pour créer des traitements pour des maladies comme l'obésité et le cancer. Comprendre mieux comment la FAS fonctionne aidera à concevoir des thérapies efficaces.

Étudier la Cinétique de l’Enzyme

Pour mieux étudier KS, des scientifiques ont examiné à quelle vitesse il fonctionne et comment il choisit ses substrats. Ils ont mené des expériences avec différents types de substrats et mesuré leurs effets sur l'activité de KS. Ils ont découvert que KS montre une réponse coopérative, ce qui signifie que l'activité d'une partie de la protéine influence les autres.

Les chercheurs ont remarqué que changer le type de substrat influençait l'efficacité de KS. Cette découverte est essentielle pour comprendre comment l'enzyme choisit les bons substrats pour la synthèse des acides gras.

L’Impact de la Longueur du Substrat

La longueur de la chaîne d'acides gras a également influencé l'activité de KS. L'équipe a découvert qu'à mesure que la longueur de la chaîne augmentait, l'efficacité de l'enzyme augmentait aussi. Cela suggère que des chaînes plus longues pourraient être mieux acceptées par KS lors de la réaction de condensation.

L'équipe a effectué d'autres tests pour identifier le comportement de l'enzyme avec différentes longueurs de chaîne. Ils ont découvert que KS avait une préférence pour certaines longueurs et que cela affectait la rapidité avec laquelle il pouvait produire des acides gras.

Le Rôle de la Structure Protéique dans la Coopération

Pour voir comment la structure protéique affecte la coopération, les chercheurs se sont penchés sur la façon dont les domaines de KS communiquent entre eux durant la réaction. Ils se sont concentrés sur un réseau de liaisons hydrogène au sein de la protéine, qui semblait nécessaire pour le comportement coopératif observé dans l'activité de KS.

Muter certaines parties de ce réseau a révélé des résultats intéressants sur la façon dont la communication affecte l'activité globale de KS. Cette compréhension est cruciale pour saisir comment l'enzyme gère l'attachement et le traitement simultanés.

Cycle des Acides Gras et Intermédiaires

L'étude a également examiné comment KS interagit avec les intermédiaires du cycle des acides gras. Les chercheurs ont testé différents intermédiaires pour voir à quel point l'enzyme pouvait bien travailler avec eux. Le KS n'a pas pu utiliser certains intermédiaires, ce qui a mis en évidence sa sélectivité et a assuré une production d'acides gras de haute qualité.

Les résultats ont montré que KS est plus enclin à condenser des acides gras avec des chaînes complètement saturées plutôt qu'avec ceux qui ont des doubles liaisons ou des groupes hydroxyles. Ces résultats soulignent l'importance pour le corps de maintenir la précision durant la création des acides gras.

L’Avenir de la Recherche sur la Synthase d’Acides Gras

Alors que les scientifiques continuent d'en apprendre davantage sur la synthase d'acides gras, ils visent à développer de nouvelles méthodes pour étudier et modifier ces enzymes. L'objectif est de créer de nouvelles voies biosynthétiques qui peuvent mener à des traitements innovants pour diverses conditions de santé.

Comprendre les propriétés spécifiques de KS et son rôle dans la synthèse des acides gras peut guider la conception de médicaments visant à inhiber sa fonction, potentiellement pour aider à lutter contre l'obésité et le cancer.

Dans l'ensemble, cette recherche offre des aperçus précieux sur les complexités de la synthèse des acides gras et souligne l'importance des acides gras dans la santé et la maladie. En continuant d'explorer les mécanismes sous-jacents, les scientifiques espèrent améliorer notre capacité à cibler ces voies dans le traitement des maladies.

Source originale

Titre: The Kinetics of Carbon-Carbon-Bond Formation in Metazoan Fatty Acid Synthase and its Impact on Product Fidelity

Résumé: Fatty acid synthase (FAS) multienzymes are responsible for de novo fatty acid biosynthesis and crucial in primary metabolism. Despite extensive research, the molecular details of the FAS catalytic mechanisms are still poorly understood. For example, the {beta}-ketoacyl synthase (KS) catalyzes the fatty acid elongating carbon-carbon-bond formation, which is the key catalytic step in biosynthesis, but factors that determine the speed and accuracy of his reaction are still unclear. Here we report enzyme kinetics of the KS-mediated carbon-carbon bond formation, enabled by a continuous fluorometric activity assay. We observe that the KS kinetics are adapted to the length of the bound fatty acyl chain, and that the KS is also responsible for the fidelity of biosynthesis by preventing intermediates from undergoing KS-mediated elongation. To provide mechanistic insight into KS selectivity, we performed computational molecular dynamics (MD) simulations. Intriguingly, the KS protomers within the dimer exhibit positive cooperativity, investigated by mutational studies and acyl-carrier analysis, which likely serves the regulation of biosynthesis. Advancing our knowledge about the KS molecular mechanism will pave the ground for engineering FAS for biotechnology applications and the design of new therapeutics targeting the fatty acid metabolism.

Auteurs: Martin Grininger, C. Gusenda, A. R. Calixto, J. M. R. da Silva, P. A. Fernandes

Dernière mise à jour: 2024-07-03 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.03.601458

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.03.601458.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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