Simple Science

La science de pointe expliquée simplement

# Sciences de la santé# Radiologie et imagerie

Cerebrum-7T : Avancer les techniques d'imagerie cérébrale

Un nouvel outil améliore la précision de segmentation des images cérébrales en IRM 7T.

― 7 min lire


Cerebrum-7T pour laCerebrum-7T pour lasegmentation IRMla précision des IRM cérébrales.Un nouvel outil améliore l'analyse et
Table des matières

Les avancées récentes en imagerie médicale ont fait du scanner IRM 7 Tesla (7T) un outil courant. Cette machine super puissante fonctionne à une force de champ magnétique bien plus élevée que les machines 1,5T et 3T plus répandues. Les avantages du 7T incluent des images plus claires et détaillées, permettant aux médecins de voir des structures minuscules dans le corps plus efficacement. Cette visibilité améliorée est particulièrement utile pour examiner le cerveau.

Cependant, le scanner 7T a aussi ses défis. La haute force de champ peut entraîner plus d'artefacts, c'est-à-dire des distorsions indésirables dans les images. Ces artefacts peuvent apparaître aux bords des tissus et là où les tissus rencontrent l'air, comme autour du crâne et des yeux. De plus, le champ magnétique peut être inégal, ce qui peut affecter la qualité de l'image. Tout ça complique l'analyse des images cérébrales.

L'Importance d'une Segmentation Précise

Dans l'imagerie cérébrale, l'une des tâches clés est de segmenter les images. La segmentation consiste à diviser les images en différentes parties ou zones pour l'analyse. Une segmentation précise est essentielle parce que les résultats issus de ces images dépendent beaucoup de la qualité de la segmentation.

Traditionnellement, les outils développés pour segmenter des images provenant d'IRM de plus faible intensité ne fonctionnent pas aussi bien avec les images 7T à cause des défis uniques qu'elles posent. Donc, il faut de nouvelles méthodes pour assurer une segmentation précise dans cet environnement d'imagerie avancé.

Présentation de Cerebrum-7T

Pour relever ces défis, un nouvel outil de segmentation automatique appelé Cerebrum-7T a été développé. Cet outil utilise l'apprentissage profond, un type d'intelligence artificielle, pour diviser rapidement et précisément les images cérébrales en régions importantes. Cerebrum-7T a été spécifiquement conçu pour les images IRM 7T et a montré de bonnes performances par rapport à d'autres techniques existantes.

L'efficacité de Cerebrum-7T a été évaluée en comparant ses résultats de segmentation à un standard de référence qui combine des corrections manuelles par des experts et d'autres méthodes automatisées. Cette évaluation vise à voir à quel point Cerebrum-7T peut performer avec précision et constance par rapport à d'autres outils.

Caractéristiques Radiomiques et Leur Importance

Lors de l'analyse des images IRM, les chercheurs se concentrent souvent sur les caractéristiques radiomiques. Ces caractéristiques aident à comprendre les caractéristiques des tissus examinés. Par exemple, elles peuvent donner des aperçus sur la texture et la forme des structures cérébrales. Le choix de la méthode de segmentation peut grandement influencer les résultats de ces caractéristiques.

Si la segmentation n'est pas faite correctement, cela peut mener à des caractéristiques radiomiques trompeuses, ce qui pourrait influencer les décisions cliniques. Donc, il est crucial d'évaluer comment différentes techniques de segmentation impactent la fiabilité de ces caractéristiques dans les images IRM 7T.

Aperçu de l'Étude

Dans une étude récente, les chercheurs ont examiné plusieurs IRM cérébrales obtenues à partir d'un ensemble de données accessible au public. Le principal objectif était de comparer la fiabilité des caractéristiques radiomiques extraites des Segmentations produites par Cerebrum-7T et deux autres outils de segmentation par rapport à une méthode de référence.

IRM et Protocole

Les IRM utilisées dans l'étude ont été prises à l'aide d'une séquence spécifique conçue pour améliorer la qualité d'image à 7T. Cette séquence aide à réduire certains des problèmes causés par le champ magnétique élevé, permettant ainsi de meilleures détails et clarté dans les images.

Processus d'Analyse d'Image

L'équipe a utilisé un outil logiciel pour analyser les images IRM et segmenter différentes structures cérébrales. Ils se sont concentrés sur six zones clés du cerveau : matière grise, matière blanche, noyaux de la base, ventricules, cervelet, et tronc cérébral. Différentes techniques de segmentation ont été appliquées pour voir comment elles se débrouillaient pour extraire les caractéristiques pertinentes de ces zones.

Les méthodes de segmentation incluaient :

  1. Véritable de Base Inexacte (iGT) : Une méthode standard qui implique des corrections manuelles pour assurer l'exactitude.
  2. Cerebrum-7T : La nouvelle méthode d'apprentissage profond conçue pour les images 7T.
  3. Freesurfer : Un outil largement utilisé en neuroimagerie qui fournit une bonne segmentation mais qui peut ne pas être adapté pour 7T.
  4. Nighres : Un nouvel outil visant à traiter les images IRM haute résolution.

Résultats et Conclusions

Après l'analyse, les chercheurs ont évalué les résultats de segmentation. Ils ont cherché des similitudes et des différences dans les caractéristiques extraites de chaque méthode. Les résultats ont montré que Cerebrum-7T produisait les mesures les plus cohérentes et fiables à travers différentes régions du cerveau.

Reproductibilité des Caractéristiques

L'étude a mesuré à quel point les caractéristiques radiomiques étaient cohérentes lorsqu'elles étaient dérivées de différentes méthodes de segmentation. Cette cohérence est appelée reproductibilité. On a constaté que les mesures de Cerebrum-7T avaient une excellente reproductibilité, en particulier pour les caractéristiques de texture et d'histogramme.

En revanche, Freesurfer et Nighres produisaient souvent une mauvaise reproductibilité, surtout pour les caractéristiques de la matière grise et blanche. Cela a mis en lumière l'importance de choisir le bon outil de segmentation, car de petites différences dans la segmentation peuvent entraîner des variations significatives dans les valeurs des caractéristiques.

Implications des Résultats

Les résultats suggèrent qu'utiliser un outil spécialisé comme Cerebrum-7T est essentiel pour obtenir une segmentation de haute qualité des images IRM 7T. Les résultats soulignent que la méthode de segmentation peut grandement impacter l'analyse des tissus cérébraux, ce qui est crucial dans les contextes cliniques.

De plus, l'étude a souligné que différents types de caractéristiques-comme la texture, la forme, et les caractéristiques d'histogramme-sont très sensibles au choix de l'algorithme de segmentation. Cette sensibilité signifie que les chercheurs devraient bien réfléchir à leurs méthodes de segmentation lorsqu'ils interprètent les résultats.

Limites de l'Étude

Les chercheurs ont noté certaines limites dans leur étude. Une grande limite était la dépendance au iGT comme standard de référence. Étant donné que Cerebrum-7T a été entraîné en utilisant des données iGT, ses résultats peuvent étroitement correspondre à ceux du iGT. Cela pourrait affecter la comparaison avec d'autres méthodes de segmentation, qui ne s'appuyaient pas sur le iGT.

En plus, l'étude n'a regardé qu'un seul type de séquence IRM. En pratique, les protocoles cliniques utilisent souvent diverses séquences pour recueillir des données plus complètes sur le cerveau.

Conclusion

En conclusion, l'étude met en évidence l'importance de l'outil Cerebrum-7T pour segmenter les images IRM cérébrales prises à 7T. Elle démontre que cette nouvelle approche offre une fiabilité supérieure pour extraire les caractéristiques radiomiques par rapport aux méthodes traditionnelles. Les résultats indiquent que pour une analyse IRM de haute qualité, surtout dans des contextes cliniques, utiliser des outils spécifiques adaptés au type d'imagerie est nécessaire. La sensibilité des caractéristiques radiomiques au choix de la méthode de segmentation signifie que les chercheurs et cliniciens doivent prêter une attention particulière à ces détails pour assurer des interprétations précises des données d'imagerie cérébrale.

Source originale

Titre: Reproducibility of radiomic features of the brain on ultrahigh-resolution MRI at 7 Tesla: a comparison of different segmentation techniques

Résumé: ObjectivesTo determine the impact of segmentation techniques on radiomic features extracted from ultrahigh-field (UHF) MRI of the brain. Materials and MethodsTwenty-one 7T MRI scans of the brain, including a 3D magnetization-prepared two rapid acquisition gradient echo (MP2RAGE) T1-weighted sequence with an isotropic 0.63 mm3 voxel size, were analyzed. Radiomic features (histogram, texture, and shape; total n=101) from six brain regions -cerebral gray and white matter, basal ganglia, ventricles, cerebellum, and brainstem-were extracted from segmentation masks constructed with four different techniques: the iGT (reference standard), based on a custom pipeline that combined automatic segmentation tools and expert reader correction; the deep-learning algorithm Cerebrum-7T; the Freesurfer-v7 software suite; and the Nighres algorithm. Principal components (PCs) were calculated for histogram and texture features. To test the reproducibility of radiomic features, intraclass correlation coefficients (ICC) were used to compare Cerebrum-7, Freesurfer-v7, and Nighres to the iGT, respectively. ResultsFor histogram PCs, median ICCs for Cerebrum-7T, Freesurfer-v7, and Nighres were 0.99, 0.42, and 0.11 for the gray matter; 0.84, 0.25, and 0.43 for the basal ganglia; 0.89, 0.063, and 0.036 for the white matter; 0.84, 0.21, and 0.33 for the ventricles; 0.94, 0.64, and 0.93 for the cerebellum; and 0.78, 0.21, and 0.53 for the brainstem. For texture PCs, median ICCs for Cerebrum-7T, Freesurfer-v7, and Nighres were 0.95, 0.21, and 0.15 for the gray matter; 0.70, 0.36, and 0.023 for the basal ganglia; 0.91, 0.25, and 0.023 for the white matter; 0.80, 0.75, and 0.59 for the ventricles; 0.95, 0.43, and 0.86 for the cerebellum; and 0.72, 0.39, and 0.46 for the brainstem. For shape features, median ICCs for Cerebrum-7T, FreeSurfer-v7, and Nighres were 0.99, 0.91, and 0.36 for the gray matter; 0.89, 0.90, and 0.13 for the basal ganglia; 0.98, 0.91, and 0.027 for the white matter; 0.91, 0.91, and 0.36 for the ventricles; 0.80, 0.68, and 0.47 for the cerebellum; and 0.79, 0.17, and 0.15 for the brainstem. ConclusionsRadiomic features in UHF MRI of the brain show substantial variability depending on the segmentation algorithm. The deep learning algorithm Cerebrum-7T enabled the highest reproducibility. Dedicated software tools for UHF MRI may be needed to achieve more stable results.

Auteurs: Marius E. Mayerhoefer, J. Klinger, D. Leithner, S. Woo, M. Weber, H. A. Vargas

Dernière mise à jour: 2024-06-24 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.06.24.24308597

Source PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.06.24.24308597.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

Merci à medrxiv pour l'utilisation de son interopérabilité en libre accès.

Plus d'auteurs

Articles similaires