Le rôle des queues de chat dans la gestion des protéines
Les queues de CAT sont cruciales pour le contrôle de la qualité des protéines dans les cellules.
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Les ribosomes sont les machines dans nos cellules qui aident à fabriquer des Protéines. Parfois, ils peuvent se bloquer ou entrer en collision quand ils essaient de lire les instructions dans une molécule appelée mRNA. Ça peut arriver pour plusieurs raisons, comme si les instructions sont difficiles à lire ou s'il n'y a pas assez d'aide pour le ribosome. Quand les ribosomes s'arrêtent, ils peuvent créer des protéines incomplètes qui pourraient ne pas bien fonctionner ou même être nuisibles pour la cellule.
Pour régler ce problème, les cellules utilisent un système appelé le chemin de Contrôle de qualité associé aux ribosomes, ou RQC pour faire court. Ce système aide la cellule à décomposer les ribosomes bloqués et à les recycler, tout en éliminant les protéines incomplètes qui sont coincées. Le processus commence quand les ribosomes bloqués sont divisés en plus petites parties, ce qui aide la cellule à reconnaître et à gérer le problème.
Le Rôle des CAT Tails
Après qu'un ribosome se bloque, les protéines incomplètes subissent quelques changements. L'un de ces changements est l'ajout de quelque chose appelé CAT tails. Ces CAT tails sont composés de plus petits éléments appelés acides aminés. Dans différents types de cellules, ces queues peuvent être faites de combinaisons différentes d'acides aminés. Par exemple, dans les bactéries, elles sont généralement faites d'Alanine, tandis que dans la levure, elles peuvent inclure à la fois de l'alanine et de la Thréonine.
Ces CAT tails jouent des rôles importants dans la gestion des protéines incomplètes. Elles aident à préparer les protéines pour leur destruction et facilitent l'élimination par la cellule. Cependant, les CAT tails peuvent aussi causer des problèmes. Si elles ne sont pas fabriquées correctement, elles peuvent entraîner l'accumulation de groupes de protéines nuisibles qui peuvent endommager la cellule.
Découverte des CAT Tails
Dans une étude sur la levure, des chercheurs ont examiné comment les CAT tails sont fabriquées et comment elles peuvent varier en taille et en type. Ils ont trouvé que différentes protéines peuvent avoir des CAT tails de longueurs et de compositions variées, ce qui affecte leur efficacité. Des CAT tails plus courtes sont meilleures pour marquer les protéines incomplètes pour la destruction, tandis que des plus longues peuvent causer des problèmes en formant des agrégats nuisibles.
Les chercheurs ont remarqué que dans certains cas, les CAT tails pouvaient être très courtes et faites uniquement d'alanine, tandis que dans d'autres, elles pouvaient être plus longues et inclure de la thréonine. La présence de thréonine semblait conduire à la formation de CAT tails plus grandes et moins efficaces, susceptibles de causer des dommages à la cellule.
Comment Fonctionnent les CAT Tails
Quand les protéines sont fabriquées, elles doivent être libérées du ribosome une fois qu'elles sont complètes. Les CAT tails aident ce processus. Les CAT tails plus courtes, principalement composées d'alanine, sont meilleures pour aider les protéines incomplètes à se détacher du ribosome. En revanche, les CAT tails plus longues qui incluent de la thréonine semblent interférer avec ce processus de libération, rendant plus difficile pour les protéines de sortir du ribosome.
Quand le ribosome est bloqué, la cellule doit trouver un moyen de se débarrasser des protéines incomplètes. Le chemin RQC aide en attachant des marqueurs à ces protéines, signalant qu'elles doivent être recyclées et dégradées. Les CAT tails sont essentielles dans ce processus, agissant comme des drapeaux disant à la cellule : "Cette protéine n'est pas finie, et nous devons l'enlever."
L'Importance des Forces Mécaniques
Les chercheurs ont découvert que les forces mécaniques, qui proviennent de la façon dont les protéines se plient et se déplacent dans la cellule, jouent un rôle majeur dans la façon dont les CAT tails sont fabriquées. Ces forces aident à déterminer si une CAT tail sera courte ou longue. Quand les protéines sont correctement repliées, elles peuvent générer des forces de traction qui aident à contrôler le timing et la longueur des CAT tails.
Quand les protéines tirent sur le ribosome, ça aide à garder leurs CAT tails courtes et efficaces, tandis que si les protéines ne sont pas correctement repliées, les CAT tails peuvent devenir plus longues et problématiques. Cela signifie que l'état de la protéine et son interaction avec le ribosome sont vraiment importants pour contrôler la qualité des protéines.
Équilibrer les CAT Tails
Il y a un bel équilibre dans les fonctions des CAT tails. Les CAT tails courtes, faites principalement d'alanine, aident les protéines à se détacher et signalent qu'elles doivent être recyclées. D'un autre côté, les CAT tails plus longues qui incluent de la thréonine pourraient entraver ce processus et pourraient mener à des agrégats nuisibles. Les chercheurs apprennent que le bon équilibre de la longueur et de la composition des CAT tails est crucial pour maintenir des cellules en bonne santé.
Si une cellule peut réussir à garder les CAT tails courtes et principalement faites d'alanine, elle peut recycler les protéines efficacement et minimiser les dégâts. Cependant, si les CAT tails deviennent trop longues ou contiennent trop de thréonine, elles peuvent causer des problèmes qui entraînent du stress dans la cellule et contribuer à des maladies.
Implications pour les Maladies
L'étude des CAT tails a aussi révélé d'importantes connexions avec des maladies. Par exemple, quand les processus qui contrôlent la longueur et la composition des CAT tails déraillent, cela peut entraîner des maladies neurodégénératives. Ces conditions peuvent survenir lorsque les protéines s'accumulent dans le cerveau et deviennent toxiques, menant à des affections comme la maladie d'Alzheimer ou de Parkinson.
Les cellules qui ont du mal à gérer leur production de protéines pourraient lutter contre l'agrégation de protéines malformées. En comprenant comment fonctionnent les CAT tails et pourquoi elles peuvent devenir problématiques, les scientifiques espèrent trouver de nouvelles façons de cibler ces problèmes dans la prévention et le traitement des maladies.
Directions Futures et Conclusion
Les connaissances acquises grâce à cette recherche offrent une image plus claire de la façon dont les CAT tails fonctionnent et de leur impact sur le contrôle de la qualité des protéines. À mesure que les scientifiques continuent d'étudier ces mécanismes, ils pourraient découvrir de nouvelles stratégies pour promouvoir un fonctionnement cellulaire sain et cibler les maladies associées à l'agrégation des protéines.
En conclusion, le rôle des CAT tails dans la synthèse des protéines, le contrôle de la qualité et les maladies souligne l'importance des processus biologiques fondamentaux dans le maintien de la santé. En comprenant l'équilibre délicat de la composition des CAT tails et ses implications, les chercheurs sont un pas plus près de relever les défis posés par le repliement et l'agrégation des protéines dans la santé humaine.
Titre: Mechanochemical forces regulate the composition and fate of stalled nascent chains
Résumé: The ribosome-associated quality control (RQC) pathway resolves stalled ribosomes. As part of RQC, stalled nascent polypeptide chains (NCs) are appended with CArboxy-Terminal amino acids (CAT tails) in an mRNA-free, non-canonical elongation process. CAT tail composition includes Ala, Thr, and potentially other residues. The relationship between CAT tail composition and function has remained unknown. Using biochemical approaches in yeast, we discovered that mechanochemical forces on the NC regulate CAT tailing. We propose CAT tailing initially operates in an "extrusion mode" that increases NC lysine accessibility for on-ribosome ubiquitination. Thr in CAT tails enhances NC extrusion by preventing formation of polyalanine, which can form -helices that lower extrusion efficiency and disrupt termination of CAT tailing. After NC ubiquitylation, pulling forces on the NC switch CAT tailing to an Ala-only "release mode" which facilitates nascent chain release from large ribosomal subunits and NC degradation. Failure to switch from extrusion to release mode leads to accumulation of NCs on large ribosomal subunits and proteotoxic aggregation of Thr-rich CAT tails. One sentence summaryMechanochemical forces regulate the composition of CAT tails to extrude or release stalled nascent chains and recycle ribosomes.
Auteurs: Onn Brandman, D. Khan, A. A. Vinayak, C. S. Sitron
Dernière mise à jour: 2024-10-14 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.08.02.606406
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.08.02.606406.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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