Mouvement et adaptation bactérienne : Une étude sur Shewanella putrefaciens
Des recherches montrent comment Shewanella putrefaciens améliore son mouvement grâce à des changements génétiques.
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Table des matières
Les bactéries sont de petites choses vivantes qui peuvent bouger de différentes manières. Un des moyens courants pour certaines bactéries de se déplacer, c'est grâce à des structures appelées Flagelles. Les flagelles sont de longues parties qui sortent de la surface des bactéries et les aident à nager dans des liquides ou à se déplacer sur des surfaces. Cette étude examine de près comment un type de bactéries, appelé Shewanella putrefaciens, utilise ses flagelles pour mieux se déplacer dans certaines conditions.
Pourquoi le mouvement est important
Les bactéries ont besoin de bouger pour trouver de la nourriture et échapper aux mauvaises conditions. Elles peuvent sentir leur environnement et réagir en se déplaçant vers des nutriments ou loin de substances nuisibles. Cette capacité à se déplacer en réponse à des signaux environnementaux s'appelle la chimiotaxie. Les bactéries ont des protéines spéciales qui les aident à détecter ces signaux. Dans S. putrefaciens, il y a beaucoup de ces protéines qui aident les bactéries à comprendre ce qui se passe autour d'elles.
Les flagelles et le mouvement
Les flagelles sont importants pour le mouvement, mais en produire demande de l'énergie. Pour les bactéries, cela signifie qu'elles doivent équilibrer combien d'énergie elles dépensent pour bouger et combien elles peuvent croître. Quand les conditions sont bonnes et qu'il y a plein de nourriture, les bactéries n'ont peut-être pas besoin de dépenser autant d'énergie pour bouger. En revanche, si la nourriture devient rare, elles peuvent changer leur stratégie pour se déplacer davantage pour trouver des nutriments.
Cette étude montre comment les gènes qui contrôlent la fabrication des flagelles sont ajustés selon ce que les bactéries perçoivent dans leur environnement. Par exemple, dans certains milieux où la nourriture est basse, S. putrefaciens peut augmenter son mouvement pour survivre.
Apprendre à connaître Shewanella putrefaciens
Shewanella putrefaciens est un type de bactéries qui peut vivre avec ou sans oxygène. Elle a deux types de flagelles : un qui est à l'extrémité de la cellule (flagelle polaire) et d'autres sur les côtés (flagelles latérales). La façon dont ces flagelles sont arrangés permet aux bactéries de se déplacer de différentes manières. Le flagelle polaire aide les bactéries à avancer, tandis que les flagelles latérales pourraient les aider à pousser contre des surfaces, ce qui facilite leur étalement.
Cette bactérie est plus compliquée en termes de mouvement que E. coli, qui a un système de flagelles plus simple. Comme elle a les deux types de flagelles, S. putrefaciens peut être plus flexible dans sa manière de se déplacer.
L'expérience
Pour comprendre comment S. putrefaciens pouvait mieux se propager et se déplacer à travers différents types d'environnements, les chercheurs ont mené des expériences sur ces bactéries. Ils voulaient découvrir quels changements se produisent dans les bactéries qui leur permettent de mieux se déplacer dans une substance gélatineuse appelée agar mou.
Les chercheurs ont pris des bactéries qui avaient bien poussé et les ont laissé se répandre sur des plaques d'agar mou. Ils ont observé à quel point différents groupes de bactéries pouvaient bouger après plusieurs tours de sélection. Au fil du temps, ils ont trouvé certaines bactéries capables de se propager beaucoup plus loin que d'autres. Ces bactéries ont reçu un nouveau nom, G14.
Résultats de l'expérience
Les nouvelles bactéries évoluées ont montré un avantage clair en mouvement. Elles se sont répandues rapidement sur la surface de l'agar, dépassant les bactéries originales. Cette performance forte était présente dès le début et ne s'est pas développée après qu'elles aient commencé à se répandre.
En examinant les caractéristiques des bactéries, les chercheurs ont découvert que les bactéries G14 n'avaient pas changé en termes de quantité de flagelles. Leurs formes et tailles étaient similaires à celles des bactéries originales, mais elles avaient un petit changement dans une de leurs protéines liées au mouvement.
Trouver la mutation clé
Pour identifier ce qui rendait les bactéries G14 si douées pour se propager, les chercheurs ont examiné les changements dans leurs gènes. Ils ont trouvé une mutation spécifique : un petit morceau d'ADN manquait dans une partie du génome des bactéries liée aux protéines de chimiotaxie. Cette protéine s'appelait MCP_0387, et elle joue un rôle dans la façon dont S. putrefaciens perçoit son environnement.
Les chercheurs ont ensuite vérifié si cette MCP_0387 était cruciale pour le mouvement amélioré. En supprimant le gène, ils ont constaté que les bactéries perdaient leur avantage en matière de propagation. Cela leur a montré que MCP_0387 était directement liée à la capacité améliorée de se déplacer dans l'agar mou.
Le rôle de MCP_0387
MCP_0387 n'est qu'une des nombreuses protéines qui aident les bactéries à percevoir des signaux ; S. putrefaciens en a beaucoup, ce qui lui donne une large variété de façons de comprendre son environnement. Même une petite augmentation de la quantité de cette protéine peut changer considérablement la façon dont les bactéries réagissent à leur environnement et, à son tour, affecter leur mouvement.
En comprenant comment fonctionne MCP_0387, les chercheurs ont gagné des insights sur comment les signaux dans l'environnement peuvent changer le comportement bactérien. Ce changement peut aider les bactéries à se déplacer vers des conditions favorables ou loin du danger.
Observer les motifs de mouvement
Pour mieux comprendre comment les bactéries se déplaçaient à travers l'agar mou, les chercheurs ont suivi des bactéries individuelles. Ils ont découvert que S. putrefaciens montrait un motif de mouvement unique appelé "saut-et-pêche". Cela signifie que, tout en essayant de bouger librement dans l'agar, elles se coinçaient souvent et devaient se tortiller pour trouver des chemins pour avancer.
Les bactéries G14 non seulement parcouraient de plus longues distances, mais avaient aussi des périodes plus courtes où elles restaient coincées. Ce comportement suggère que la présence accrue de MCP_0387 aide effectivement les bactéries à mieux naviguer dans l'environnement de l'agar.
Croissance vs. Mouvement
En général, quand les bactéries évoluent pour être meilleures en mouvement, elles font souvent face à des inconvénients en matière de croissance, ce qui signifie qu'elles pourraient ne pas se multiplier aussi vite. Étonnamment, dans cette étude, les deux types de bactéries (l'originale et G14) croissaient à des rythmes similaires dans des conditions riches en nutriments. Cela indique que les changements menant à une meilleure propagation ne se sont pas fait au détriment d'une croissance plus lente.
Conclusion
Cette étude a révélé comment S. putrefaciens adapte ses capacités de mouvement et de propagation à travers des changements dans l'une de ses protéines de signalisation, MCP_0387. La capacité améliorée des bactéries évoluées à percevoir et à répondre à leur environnement leur permet de naviguer plus efficacement dans des environnements complexes.
Des bactéries comme S. putrefaciens montrent comment les organismes vivants peuvent s'ajuster à leur environnement. Ces découvertes pourraient nous aider à comprendre d'autres espèces bactériennes et leur mouvement également. Explorer les signaux spécifiques qui affectent MCP_0387 et d'autres protéines similaires pourrait ouvrir de nouvelles avenues pour la recherche sur le comportement bactérien et les interactions dans divers environnements. Comprendre ces mécanismes n'est pas seulement important pour la science, mais pourrait aussi conduire à des applications pratiques dans des domaines comme la médecine et la biotechnologie.
Titre: Role of a single MCP in evolutionary adaptation of Shewanella putrefaciens for swimming in planktonic and structured environments
Résumé: Bacteria can adapt to their environments by changing phenotypic traits by mutations. However, improving one trait often results in deterioration of another one, a trade-off which limits the degree of adaption. The gammaproteobacterium Shewanella putrefaciens CN-32 has an elaborate motility machinery comprising two distinct flagellar systems and an extensive chemotaxis array with 36 methyl-accepting chemotaxis sensor proteins (MCPs). In this study we performed experimental selection on S. putrefaciens for increased spreading through a porous environment. We readily obtained a mutant that showed a pronounced increase in covered distance. This phenotype was almost completely caused by a deletion of 24 bp from the chromosome, which leads to a moderately enhanced production of a single MCP. Accordingly, chemotaxis assays under planktonic conditions and cell tracking in soft agar showed that the mutation improved navigation through nutritional gradients. The study demonstrates how differences in the abundance of a single MCP can lead to an efficient upgrade of directed flagella-mediated motility in specific environments at a low expense of cellular resources. ImportanceExperimental evolution experiments have been used to determine the trade-offs occurring in specific environments. Several studies that have used the spreading behavior of bacteria in structured environments identified regulatory mutants that increase the swimming speed of the cells. While this results in a higher chemotaxis drift, the growth fitness decreases as the higher swimming speed requires substantial cellular resources. Here we show that rapid chemotaxis adaptation can also be achieved through modification of the chemotaxis signal input at a low metabolic cost for the cell.
Auteurs: Kai M Thormann, D. B. Edelmann, A. M. Jakob, L. G. Wilson, R. Colin, D. Brandt, F. Eck, J. Kalinowski
Dernière mise à jour: 2024-10-16 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.15.618407
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.15.618407.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.
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