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Aperçus génétiques sur le risque de cancer pédiatrique

Une nouvelle étude révèle des variants hérités chez des jeunes patients atteints de cancer.

Mark Pinese, N. A. Fuentes-Bolanos, E. Courtney, C. Mayoh, M. Warby, L. M. S. Lau, M. Wong-Erasmus, D.-A. Khuong-Quang, P. Barahona, B. Padhye, S. El-Kamand, S. Nunag, P. Ajuyah, A. Sherstyuk, A.-K. Altekoester, A. Sullivan, N. Poplawski, C. Kiraly-Borri, S. O'Sullivan, H. Marfan, R. Alli, L. Curnow, K. Bhatia, A. Anazodo, T. N. Trahair, M. Mateos, J. R. Hansford, H. Dholaria, S. Josephi-Taylor, A. S. Moore, W. Nicholls, N. G. Gottardo, P. Downie, S.-L. Khaw, H. Tapp, G. McCowage, L. Dalla-Pozza, F. Alvaro, P. J. Wood, V. Tyrrell, M. Haber, M. J. Cowley, P. G Ekert

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Le cancer chez les enfants et les jeunes adultes, c'est un gros souci de santé, surtout quand on parle des facteurs génétiques qui peuvent jouer un rôle dans la maladie. La prédisposition au cancer germinale désigne les changements génétiques hérités qui pourraient augmenter le risque de développer un cancer. Des études ont montré que beaucoup de jeunes patients atteints de cancer ont ces variantes génétiques héritées, mais on a encore plein de choses à apprendre sur leur fréquence, les types de variantes présentes et comment elles sont liées à la formation des Tumeurs.

Besoin de Tests Génétiques

Pour l’instant, il y a un manque de tests génétiques systématiques pour les enfants et les jeunes adultes diagnostiqués avec un cancer. Ce manque limite la possibilité d’utiliser l’information génétique pour gérer le risque de cancer. On estime qu’entre 8 % et 16 % des patients pédiatriques atteints de cancer portent des variantes génétiques qui pourraient mener à la maladie. Cette variation dans les estimations est probablement due aux différences entre les groupes de patients, aux méthodes de test et aux critères d'évaluation des changements génétiques.

Pour avoir des estimations précises sur la fréquence de ces variantes génétiques, il faut examiner de près à la fois les tumeurs cancéreuses et la composition génétique des patients. Malheureusement, il n’y a pas encore eu d'étude complète qui examine à la fois les caractéristiques des tumeurs et les variantes génétiques héritées chez les jeunes patients. Ce manque de recherche a conduit à une incertitude sur la prévalence de ces variantes et leur importance dans la gestion du risque de cancer chez les jeunes.

Méthodes Actuelles de Test génétique

Différentes méthodes sont actuellement utilisées pour identifier les variantes génétiques chez les jeunes patients atteints de cancer. Beaucoup d'études se concentrent sur des tests génétiques qui examinent uniquement l'ADN germinal, tandis que d'autres analysent à la fois l'ADN tumoral et l'ADN germinal. Cependant, l'efficacité et la praticité de ces approches en milieu clinique n'ont pas encore été complètement évaluées.

Une méthode appelée séquençage du génome entier (WGS) offre le potentiel d'identifier les variantes génétiques de manière plus fiable. Néanmoins, son rôle dans les soins cliniques de routine pour les patients pédiatriques atteints de cancer reste flou.

L'Étude PRISM : Une Approche Multi-Modal

Pour aborder ces problèmes et évaluer comment la médecine de précision pourrait être appliquée en génétique du cancer, une étude connue sous le nom d'étude PRISM a été menée. Cette étude visait à fournir un vaste aperçu des variantes génétiques héritées chez les jeunes patients avec des cancers ayant de mauvais résultats. L'étude a utilisé des techniques avancées, y compris le WGS tumoral et germinal, le séquençage de l'ARN et l'analyse de méthylation. En appliquant les directives actuelles sur les gènes de prédisposition au cancer, les chercheurs ont visé à obtenir une image claire de la prévalence des variantes génétiques et de leurs implications pour les soins aux patients.

Détails des Participants et Méthodologie

L'étude PRISM a recruté 496 patients diagnostiqués avec des formes agressives de cancer, définies comme ayant un taux de survie estimé de moins de 30 %. Le séquençage tumoral et germinal a été effectué sur tous les participants pour identifier les variantes génétiques héritées et comprendre comment ces variantes étaient corrélées à d'autres informations cliniques et caractéristiques tumorales.

Résultats sur les Variantes Germinales

L'analyse des participants à l'étude a identifié 85 variantes germinales chez 77 patients, représentant un taux de 15,5 %. Certains patients avaient plus d'une variante. L'étude a trouvé que les patients avec des antécédents familiaux de cancer étaient plus susceptibles d'avoir des variantes germinales exploitables. Fait intéressant, une grande proportion des patients avec des variantes germinales n'avaient aucun antécédent familial de cancer pertinent.

Aucun lien significatif n'a été trouvé entre le fait d'avoir une variante germinale et des facteurs comme le type de cancer, le sexe ou l'âge au diagnostic. Cependant, certains types de cancer avaient des associations établies avec certaines variantes génétiques, ce qui suggère que certains types de cancer peuvent être plus étroitement liés au risque génétique hérité que d'autres.

Types de Variantes Germinales Identifiées

L'étude a identifié des variantes germinales à travers 32 gènes. Les gènes les plus fréquemment affectés étaient TP53, CHEK2 et NF1, qui sont connus pour jouer des rôles dans le développement du cancer. Il y avait des associations claires entre le type de variante et le type de cancer des patients. Par exemple, les variantes liées à la réparation des mésappariements n'étaient trouvées que chez des patients avec des tumeurs du système nerveux central, indiquant que certains risques génétiques sont étroitement liés à des types de cancer spécifiques.

Valeur Clinique des Résultats Germinaux

La signification clinique de l'identification des variantes germinales peut varier. Dans l'étude PRISM, 14,1 % des patients avaient des variantes considérées comme ayant une haute valeur clinique ; ces variantes étaient susceptibles de représenter un risque de cancer significatif. La plupart de ces variantes à haute valeur étaient liées à des conditions cancéreuses héréditaires connues pour avoir une pénétrance élevée ou modérée.

Cette étude a révélé que beaucoup de patients n'auraient pas été identifiés par des méthodes de test génétique standard, soulignant l'importance d'un dépistage génétique large pour les enfants ayant des cancers agressifs. Plus de 40 % des variantes germinales rapportées ont été trouvées chez des patients dont le type de cancer n'était pas traditionnellement associé à ces variantes génétiques, mettant en évidence la nécessité de réévaluer comment le test génétique est réalisé pour ces patients.

L'Impact de l'Analyse Tumorale sur l'Interprétation Germinale

L'intégration de l'analyse tumorale avec le test génétique a prouvé son utilité pour comprendre le rôle des variantes germinales dans le développement des tumeurs. Pour beaucoup de patients, les caractéristiques tumorales indiquaient si une variante germinale était susceptible de jouer un rôle dans la progression du cancer. Ce type d'analyse complète était crucial pour confirmer la présence et la signification de certaines variantes génétiques.

Dans de nombreux cas, des caractéristiques moléculaires spécifiques dans les tumeurs correspondaient à la présence de variantes germinales, indiquant que ces changements génétiques contribuaient au développement des tumeurs. L'étude a révélé que plus de la moitié des variantes germinales montraient une association avec des caractéristiques tumorales suggérant un rôle causal dans le cancer.

Gestion Clinique et Conseil génétique

Les résultats de l'étude PRISM ont des implications significatives pour la gestion clinique. Les professionnels de santé ont pu utiliser les informations sur les variantes germinales pour informer les décisions de traitement et la gestion des risques pour les patients et leurs familles. L'étude a montré que presque tous les patients avec des variantes exploitables avaient leurs résultats communiqués à leurs oncologues traitants.

À travers ce processus, beaucoup de patients ont été référés à des services de génétique du cancer pour une évaluation et des tests supplémentaires. Les retours des oncologues ont indiqué que les résultats du test génétique avaient amélioré leur compréhension des cancers des patients et influencé leurs décisions de traitement.

Forte Acceptation des Tests Génétiques

Les familles des patients avec des cancers agressifs étaient généralement très réceptives à passer des tests génétiques et des évaluations de suivi basées sur les résultats. La plupart des familles ont complété des tests de confirmation et étaient ouvertes à discuter des options reproductives si pertinent. Cette volonté souligne les avantages potentiels des tests génétiques pour les familles avec des enfants diagnostiqués avec un cancer.

Défis et Directions Futures

Bien que l'étude ait fourni des informations précieuses, il y a encore des défis à traduire ces résultats en pratique clinique de routine. L'accent mis sur les cancers à pronostic défavorable signifie que les résultats peuvent ne pas s'appliquer à tous les jeunes patients atteints de cancer. D'autres recherches sont nécessaires pour explorer les implications des tests génétiques pour un éventail plus large de cancers et pour évaluer les bénéfices à long terme de ces résultats pour les soins aux patients.

Conclusion

L'étude PRISM représente une avancée significative dans la compréhension du rôle des variantes germinales chez les jeunes patients atteints de cancer, en particulier ceux avec des cancers à pronostic défavorable. La haute prévalence des variantes germinales exploitables souligne la nécessité d'un dépistage génétique complet dans cette population. En intégrant les profils tumoraux avec l'analyse génétique, les professionnels de la santé peuvent mieux comprendre le rôle que jouent les gènes hérités dans le risque de cancer, améliorant ainsi la gestion et les résultats des patients. Les résultats de cette étude soulignent l'importance de continuer à affiner les stratégies de test génétique et d'élargir la compréhension de la façon dont les facteurs génétiques contribuent au cancer chez les jeunes.

Source originale

Titre: Integrated germline and somatic molecular profiling to detect cancer predisposition has a high clinical impact in poor-prognosis paediatric cancer

Résumé: Germline predisposition has a significant role in paediatric cancer. However, the optimal approach to identifying cancer-causing germline pathogenic variants (GPV) in children, and even the prevalence of GPV among children with cancer, remain unclear. Here we report our findings from a comprehensive survey of GPV in 496 children with poor-prognosis cancer. By integrating tumour and germline molecular profiling we identified GPV in 15.5% of patients, 48.1% of whom had not met clinical genetic testing criteria. Although the cancer type was outside the recognised phenotypic spectrum for 43.7% of reported GPV, 63.2% of these were clinically actionable for cancer risk. Integrated germline-tumour analysis increased the GPV detection rate by 8.5%, and informed germline interpretation in 14.3% of patients with GPV, highlighting the value of integrated analyses. Our findings establish the benefit of broad integrated tumour-germline screening, over phenotype-guided testing, to detect GPV in children with poor prognosis cancers.

Auteurs: Mark Pinese, N. A. Fuentes-Bolanos, E. Courtney, C. Mayoh, M. Warby, L. M. S. Lau, M. Wong-Erasmus, D.-A. Khuong-Quang, P. Barahona, B. Padhye, S. El-Kamand, S. Nunag, P. Ajuyah, A. Sherstyuk, A.-K. Altekoester, A. Sullivan, N. Poplawski, C. Kiraly-Borri, S. O'Sullivan, H. Marfan, R. Alli, L. Curnow, K. Bhatia, A. Anazodo, T. N. Trahair, M. Mateos, J. R. Hansford, H. Dholaria, S. Josephi-Taylor, A. S. Moore, W. Nicholls, N. G. Gottardo, P. Downie, S.-L. Khaw, H. Tapp, G. McCowage, L. Dalla-Pozza, F. Alvaro, P. J. Wood, V. Tyrrell, M. Haber, M. J. Cowley, P. G Ekert

Dernière mise à jour: 2024-08-09 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.08.08.24311493

Source PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.08.08.24311493.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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