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Nouvelles découvertes sur les RASopathies et le risque de cancer

Une étude révèle des liens génétiques entre les RASopathies et des problèmes de santé inattendus.

Douglas R Stewart, J. Kim, G. Ney, M. N. Frone, J. S. Haley, U. L. Mirshahi, E. Astiazaran-Symonds, M. Shandrina, G. Urban, H. S. Rao, R. Stahl, A. Golden, M. E. Yohe, A. M. Gross, Y. Ding, D. J. Carey, B. D. Gelb

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Table des matières

Les RASopathies sont un groupe de troubles génétiques rares causés par des changements dans des gènes spécifiques liés à la voie RAS/MAPK. Ces changements peuvent entraîner une activité accrue dans la voie, ce qui affecte la façon dont les cellules se développent, se divisent et meurent. En conséquence, les personnes atteintes de RASopathies peuvent présenter une gamme de traits physiques et développementaux.

Les caractéristiques communes des RASopathies incluent :

  • Retards de développement
  • Traits faciaux inhabituels
  • Problèmes de peau
  • Problèmes cardiaques
  • Taille courte

Comme ces troubles sont rares et peuvent montrer des symptômes différents chez différentes personnes, il est difficile de savoir à quelle fréquence ils se produisent. Cela rend la détection de nouveaux cas difficile. Une façon d'améliorer l'identification de ces troubles est d'étudier des informations génétiques provenant de grands groupes de personnes. Cela peut aider à repérer des individus qui pourraient avoir des symptômes légers ou nouveaux de ces troubles.

Les données des dossiers de santé électroniques peuvent aussi aider à identifier des caractéristiques communes, comme la taille courte, qui peuvent ensuite être liées à des informations génétiques. Cette combinaison peut éviter les biais qui pourraient venir d'un focus uniquement sur les personnes déjà diagnostiquées avec une RASopathie.

Résultats de recherche sur les RASopathies

Une étude récente a examiné les Changements génétiques dans plusieurs gènes liés aux RASopathies en utilisant des données de grandes bases de santé. Ils ont analysé plus de 80 000 personnes dans deux grandes biobanques. Étonnamment, seulement un petit nombre des personnes étudiées avaient réellement un diagnostic de RASopathie, même si beaucoup avaient des changements génétiques liés à ces troubles.

L'étude a révélé que certaines caractéristiques communes des RASopathies n'étaient pas aussi fréquentes que prévu. Cependant, d'autres problèmes de santé, comme les problèmes thyroïdiens et les maladies auto-immunes, étaient plus souvent observés que dans la population générale. Cela montre que l'utilisation des données génétiques peut aider à clarifier à quelle fréquence ces troubles se manifestent et révéler des problèmes de santé inattendus.

En plus de ces résultats, des changements génétiques dans les gènes de la voie RAS/MAPK sont courants dans divers Cancers. Certaines RASopathies, comme le syndrome de Costello, ont des liens connus avec un risque accru de cancer, surtout chez les jeunes. D'autres RASopathies, comme le syndrome cardiofaciocutané et le syndrome de Legius, ont des risques de cancer incertains.

Cette recherche a utilisé une approche de génome d'abord pour étudier les données génétiques de grandes populations. Ils visaient à comprendre à quelle fréquence se produisent des variantes génétiques pathogènes et comment elles sont liées au risque de cancer et à la survie des adultes atteints de RASopathies.

Population d'étude et méthodes

L'étude a analysé des données provenant de trois principales sources :

  1. UK Biobank : Une grande étude impliquant des participants âgés de 40 à 69 ans, avec des informations de santé et génétiques étendues provenant de près d'un demi-million d'individus.

  2. DiscovEHR : Un groupe de participants qui ont consenti à partager leurs données génétiques liées aux dossiers de santé, totalisant plus de 170 000 individus.

  3. BioMe Biobank : Une biobanque diverse avec plus de 55 000 participants de New York, liée avec des dossiers de santé électroniques.

Les chercheurs se sont concentrés sur des gènes spécifiques connus pour être impliqués dans les RASopathies, regroupés en syndromes reconnus. Ils ont filtré les données génétiques peu fiables en éliminant les variantes qui ne répondaient pas à des critères stricts, garantissant des résultats de haute qualité.

Résultats sur les variants germinaux

L'étude a examiné à quelle fréquence des changements génétiques spécifiques se produisent chez des personnes sans diagnostic clinique de RASopathie. La prévalence des variantes liées à différents syndromes a été quantifiée.

Ils ont trouvé que les variantes dans les gènes associés au Syndrome de Noonan étaient les plus courantes. D'autres syndromes ont aussi montré divers taux d'occurrence. Notamment, aucun cas de variantes HRAS, qui sont liées au syndrome de Costello, n'a été trouvé dans les groupes étudiés.

Malgré le petit nombre de personnes avec des RASopathies diagnostiquées, les chercheurs ont observé des scores de taille plus bas chez les individus avec des gènes du syndrome de Noonan par rapport aux contrôles. Cela suggère que même quand les gens n'ont pas de diagnostic officiel, ils peuvent toujours avoir des caractéristiques du trouble.

Risque de cancer chez les adultes avec RASopathies

L'étude a évalué les taux de cancer chez les adultes portant des Variantes pathogènes. Dans les groupes analysés, les chercheurs n'ont trouvé aucune augmentation significative du risque de cancer pour ceux avec des gènes du syndrome de Noonan par rapport aux contrôles. Cependant, ceux avec des variantes dans le gène SPRED1 montraient une prévalence du cancer plus élevée, surtout parmi les individus plus âgés.

Les cancers observés incluent des types courants comme le cancer de la peau, le cancer du sein et les cancers gastro-intestinaux. Ce constat met en lumière que les personnes avec ces changements génétiques pourraient être à risque de cancer, et les prestataires de santé devraient envisager de les surveiller de près.

Les chercheurs ont aussi évalué les taux de survie globaux parmi ceux avec des RASopathies. Bien qu'il n'y ait pas de différence significative dans les taux de survie pour la plupart, des individus avec certaines variantes montraient une espérance de vie réduite par rapport aux contrôles.

Implications et directions futures

Cette recherche suggère que beaucoup de personnes avec des facteurs de risque génétiques pour les RASopathies pourraient rester non diagnostiquées, malgré des caractéristiques des syndromes. Les résultats soulignent l'importance des tests génétiques pour identifier ces individus et s'assurer qu'ils reçoivent les soins médicaux appropriés.

Le besoin d'études plus larges et plus diversifiées est crucial pour confirmer ces résultats. Comprendre l'impact total des RASopathies et les risques de cancer associés aidera à guider de meilleures stratégies de gestion de la santé et de dépistage.

Conclusion

En conclusion, les RASopathies représentent un groupe diversifié de troubles génétiques avec des caractéristiques chevauchantes et des risques variés pour les problèmes de santé. Les études génétiques ont le potentiel d'améliorer l'identification et la compréhension de ces conditions. Les liens entre les RASopathies et le cancer soulignent l'importance d'une surveillance médicale régulière pour les individus avec ces variantes génétiques, surtout en vieillissant. Avec la recherche continue et les avancées dans le testing génétique, il y a de l'espoir pour une meilleure stratégie de diagnostic et de traitement pour les personnes touchées par ces troubles.

Source originale

Titre: Genomic ascertainment to quantify prevalence and cancer risk in adults with pathogenic and likely pathogenic germline variants in RASopathy genes

Résumé: PurposeGenomic ascertainment of electronic health record-linked exome data in two large biobanks was used to quantify germline pathogenic/likely pathogenic (P/LP) variant prevalence, cancer prevalence, and survival in adults with non-NF1 RAS/mitogen-activated protein kinase genes (RASopathies). Patients and MethodsGermline RASopathy variants were examined from adult participants in UK Biobank (UKBB; n=469,802), Geisinger MyCode (n=167,050) and Mount Sinai BioMe (n=30,470). Variants were classified as per American College of Medical Genetics/Association for Molecular Pathology criteria and reviewed by a RASopathy variant expert. Heterozygotes harbored a RASopathy pathogenic/likely pathogenic variant; controls harbored wild type or benign/likely benign RASopathy variation. To distinguish germline variants from clonal hematopoiesis, benign tissues were Sanger sequenced. Tumor phenotype and demographic data were retrieved from MyCode and UKBB. ResultsPathogenic variants in Noonan syndrome-associated genes (excluding known Noonan syndrome with multiple lentigines variants) were the most common with an estimated prevalence that ranged between 1:1,772-1:3,330 in the three cohorts. Pathogenic variants in cardiofaciocutaneous syndrome-associated genes had an estimated prevalence of 1:41,762- 1:55,683 in two cohorts. Pathogenic variants in SPRED1 (Legius syndrome) were more frequent in UKBB (1:19,567 [95%CI: 1:13,150-1:29,116]) compared to MyCode (1:41,762 [95%CI: 1:15,185-1:130,367]). In SPRED1-heterozygotes, cancer prevalence was significantly increased in UKBB (OR:3.8 [95% CI: 2.48-8.64]; p=1.2x10-3) but not in the MyCode cohort. Pathogenic variants in HRAS (Costello syndrome) were not identified. In MyCode and UKBB cohorts, there was no significant increase in cancer prevalence in individuals with Noonan-, CBL- and CFC syndrome-associated pathogenic variants. ConclusionGenomic ascertainment from two large biobanks did not show evidence of elevated cancer risk in adult Noonan syndrome heterozygotes. There may be an increased cancer risk for adult SPRED1 heterozygotes.

Auteurs: Douglas R Stewart, J. Kim, G. Ney, M. N. Frone, J. S. Haley, U. L. Mirshahi, E. Astiazaran-Symonds, M. Shandrina, G. Urban, H. S. Rao, R. Stahl, A. Golden, M. E. Yohe, A. M. Gross, Y. Ding, D. J. Carey, B. D. Gelb

Dernière mise à jour: 2024-10-11 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.10.09.24314324

Source PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.10.09.24314324.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/

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