Tendances de l'immunité contre le COVID-19 aux États-Unis après l'urgence
Un aperçu des niveaux d'immunité et des variants du virus aux États-Unis après la fin de l'urgence COVID-19.
Nicole Swartwood, F. Klaassen, M. H. Chitwood, R. Lopes, M. Haraguchi, J. A. Salomon, T. Cohen, N. A. Menzies
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Table des matières
- Les niveaux d'Immunité changent avec le temps
- Comment l'immunité impacte la propagation du COVID-19
- Sources de données pour les estimations d'immunité
- Comprendre l'exposition immunologique
- Comment la protection change avec le temps
- Construction du modèle
- Suivi de la progression de la maladie
- Transition vers les variantes Omicron
- Méthodes statistiques utilisées
- Résultats du modèle
- Changements de protection au fil du temps
- Limitations de l'étude
- Conclusion
- Source originale
Le 11 mai 2023, les États-Unis ont mis fin à leur urgence sanitaire liée au COVID-19. Ça voulait dire que beaucoup de systèmes mis en place pour suivre et gérer le virus ont été arrêtés. Les tests, Vaccinations et traitements, qui étaient autrefois accessibles à tous, ont aussi été stoppés. Malgré ça, le virus continue d'évoluer et de produire de nouvelles variantes. Par exemple, une nouvelle variante appelée JN.1 est apparue fin 2023, entraînant plus de cas de COVID-19 et de visites à l'hôpital.
Immunité changent avec le temps
Les niveaux d'Pendant la pandémie, les niveaux d'immunité des gens ont varié. Avec l'apparition de nouvelles variantes, il y avait un risque que l'immunité des Infections précédentes ou des vaccinations s'affaiblisse. C'était surtout vrai après l'arrivée de la variante Omicron fin 2021. La protection que les gens avaient grâce à la vaccination ou à une infection antérieure a commencé à s'estomper avec le temps. Pour faire face à la montée de nouvelles variantes et à la diminution de l'immunité, des vaccins mis à jour ont été introduits afin de maintenir des niveaux de protection solides dans la population.
Comment l'immunité impacte la propagation du COVID-19
La quantité d'immunité dans la population influence la contagiosité du virus et sa propagation. Les personnes ayant une immunité-soit d'une infection précédente ou d'une vaccination-sont mieux protégées contre les maladies graves liées au COVID-19 et contre les symptômes durables appelés long COVID. Cependant, les dernières estimations complètes des niveaux d'immunité ont été rapportées en novembre 2022. De plus, les rapports précédents sur l'immunité n'ont pas totalement capturé les changements entre la variante Omicron et les variantes plus anciennes.
Pour mieux comprendre les niveaux d'immunité aux États-Unis de janvier 2020 à décembre 2023, un modèle a été créé pour évaluer les infections en utilisant des connaissances mises à jour sur le virus et des données collectées pendant la pandémie. Ce modèle a aidé à estimer à quel point la population était protégée contre l'infection et contre les maladies graves liées au COVID-19.
Sources de données pour les estimations d'immunité
Pour rassembler des données pour ce modèle, des rapports quotidiens de cas et de décès liés au COVID-19 ont été collectés auprès du Johns Hopkins Center. Ces données couvraient la période de janvier 2020 à mars 2023. Des données sur les Hospitalisations ont été obtenues auprès du U.S. Health and Human Services, tandis que les dossiers de vaccination ont été pris au CDC. Les chiffres de vaccination incluaient des informations sur les personnes ayant reçu leur première dose ainsi que des rappels. Les données sur la vaccination ont été ajustées pour tenir compte de la chronologie de l'administration des vaccins.
Pour les États où des rapports spécifiques manquaient, des estimations ont été tirées d'autres enquêtes. Cela a permis d'avoir une vue plus complète de la situation dans chaque État et le District de Columbia.
Comprendre l'exposition immunologique
Le modèle a calculé le pourcentage de la population qui avait une certaine protection contre le COVID-19, soit par infection, soit par vaccination. Les gens ont été classés en trois groupes : ceux infectés sans vaccination, ceux vaccinés sans infection précédente, et ceux qui avaient les deux. Cette info était cruciale pour estimer l'immunité globale dans la population.
Comment la protection change avec le temps
On a supposé que le niveau de protection offert par ces groupes d'exposition diminuait avec le temps. Les personnes qui étaient naïves au virus étaient considérées comme entièrement susceptibles. Basé sur des études précédentes, le modèle a fixé des taux spécifiques sur la rapidité de la diminution de la protection. Par exemple, dans les 25 semaines, les personnes initialement protégées étaient censées perdre la moitié de leur immunité contre l'infection. La protection contre les maladies graves diminuait plus lentement.
Une fois la variante Omicron identifiée, les niveaux d'immunité existants étaient supposés chuter considérablement pour les personnes ayant été exposées à des variantes antérieures. Ce changement reflétait la capacité du virus à éviter les réponses immunitaires des infections ou vaccinations passées.
Construction du modèle
Le modèle utilisait une méthode appelée rétro-calcul pour estimer les infections en se basant sur les cas observés, les hospitalisations et les décès. Le modèle prenait en compte comment les individus dans chaque État progressaient à travers différents états de santé, influencés par leur niveau d'immunité. C'était nécessaire pour comprendre comment le virus se propageait dans la communauté.
Suivi de la progression de la maladie
Le modèle prenait aussi en compte l'efficacité de la réponse immunitaire à prévenir les maladies graves parmi les personnes ayant déjà été exposées au virus. Au fur et à mesure que l'immunité des gens changeait, la probabilité qu'ils développent des symptômes plus graves changeait aussi.
Transition vers les variantes Omicron
Les chercheurs ont noté qu'à partir de décembre 2021, la variante Omicron a commencé à dominer les cas. Ils ont donc ajusté le modèle pour tenir compte de ce changement, y compris en réduisant l'immunité de ceux qui avaient été exposés à des variantes antérieures.
Méthodes statistiques utilisées
En utilisant des statistiques bayésiennes, le modèle a fourni des estimations pour chaque État américain basées sur les données collectées. Cette méthode a permis de gérer l'incertitude dans les données, offrant une image plus claire des niveaux d'immunité globale.
Résultats du modèle
Le modèle a montré qu'à la fin de 2022, la plupart de la population américaine avait un certain niveau d'immunité-soit d'une infection avec le virus, soit de vaccinations. D'ici le 30 décembre 2023, on estimait qu'à peu près tous les Américains avaient été exposés au virus. Cependant, la protection réelle contre l'infection était beaucoup plus faible, avec seulement environ la moitié des individus conservant leur immunité.
Les niveaux de protection contre les maladies graves étaient plus élevés, autour de 82%. Les estimations pour différents États variaient, certains ayant des niveaux de protection contre l'infection beaucoup plus bas, tandis que d'autres maintenaient des niveaux plus élevés.
Changements de protection au fil du temps
La baisse d'immunité la plus marquée a eu lieu en décembre 2021, coïncidant avec l'essor de la variante Omicron. D'ici la fin de 2023, il y avait une légère reprise de l'immunité grâce aux infections de la nouvelle variante JN.1.
Cette variante a rapidement gagné en popularité, représentant un pourcentage significatif des cas d'ici la fin de l'année. La combinaison des changements continus du virus et de la diminution de l'immunité des infections et vaccinations passées indique que des vaccinations régulières pourraient être nécessaires pour maintenir la protection contre le COVID-19.
Limitations de l'étude
L'étude avait certaines limitations, y compris des biais potentiels dans les données de vaccination. Bien que les données du CDC aient pu manquer certaines personnes, l'exposition globale par infection a aidé à fournir une image plus claire des niveaux d'immunité. De plus, les hypothèses faites sur les niveaux d'immunité étaient larges et peuvent ne pas refléter l'expérience de chaque individu. Il est aussi important de noter que certains États manquaient de données de vaccination, ce qui pourrait affecter l'exactitude des estimations.
Conclusion
Fin 2023, presque toute la population américaine avait été exposée au SARS-CoV-2, que ce soit par infection ou vaccination. Cependant, il est clair qu'en raison de l'évolution continue du virus et de la baisse de la protection immunitaire, une partie importante des gens encourait encore des risques d'infection et de maladie grave. Cette situation souligne le besoin continu de réponses de santé publique et de potentielles campagnes de rappels pour garantir une protection continue contre le COVID-19.
Titre: National- and state-level SARS-CoV-2 immunity trends from January 2020 to December 2023: a mathematical modeling analysis
Résumé: IntroductionEffective immune protection against SARS-CoV-2 infection and severe COVID-19 disease continues to change due to viral evolution and waning immunity. We estimated population-level immunity to SARS-CoV-2 for each of the fifty United States (U.S.) and the District of Columbia from January 2020 through December 2023. MethodsWe updated a model of SARS-CoV-2 infections to align with the latest evidence on SARS-CoV-2 natural history and waning of immunity, and to integrate various data sources available throughout the pandemic. We used this model to produce population estimates of effective protection against SARS-CoV-2 infection and severe COVID-19 disease. ResultsOn December 30, 2023, 99.9% of the U.S. population had experienced immunological exposure to SARS-CoV-2 through infection and/or vaccination, with 99.4% (95% credible interval (CrI): 92.4-100%) having had at least one SARS-CoV-2 infection. Despite this high exposure, the average population-level protection against infection was 53.6% (95% CrI: 38.7-71.5%). Population-level protection against severe disease was 82.6% (95% CrI: 71.5-91.7%). DiscussionA new wave of SARS-CoV-2 infections and COVID-19-associated hospitalizations began near the end of 2023, with the introduction of the JN.1 variant. This upturn suggests that the U.S. population remains at risk of SARS-CoV-2 infection and severe COVID-19 disease despite the high level of cumulative exposure in the United States. This decline in effective protection is likely due to both waning and continued viral evolution.
Auteurs: Nicole Swartwood, F. Klaassen, M. H. Chitwood, R. Lopes, M. Haraguchi, J. A. Salomon, T. Cohen, N. A. Menzies
Dernière mise à jour: 2024-10-23 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.10.22.24315935
Source PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.10.22.24315935.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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