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# Biologie# Microbiologie

Le rôle caché des levures sur les graines

Explorer l'importance des levures associées aux graines et leur impact sur la santé des plantes.

Muriel Marchi, Anaïs Bosc-Bierne, Thomas Lerenard, Josiane Le Corff, Sophie Aligon, Aurélia Rolland, Marie Simonin, Coralie Marais, Martial Briand, Viviane Cordovez, Linda Gouka, Thomas Guillemette, Philippe Simoneau, Natalia Guschinskaya

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Les plantes ne vivent pas en isolement. Tout comme nous, elles ont des amis et même quelques ennemis qui façonnent leur vie. Ces "amis" sont de minuscules Microorganismes, surtout ceux qui se trouvent autour des racines et des feuilles. Ces petits aides peuvent rendre une plante plus saine, l'aider à obtenir plus de nutriments, mieux gérer le stress et même se défendre contre les maladies. Récemment, les scientifiques ont commencé à s'intéresser à la foule moins populaire : les microorganismes qui traînent sur les Graines.

Qu'est-ce qui est si spécial avec les graines ?

Les graines sont le point de départ de la plupart des plantes. Elles ressemblent à un kit de démarrage pour faire pousser des cultures et assurer la production alimentaire. Malgré leur importance, peu de scientifiques se sont penchés de près sur ce qui se passe avec les microorganismes associés aux graines. Il y a pas mal de recherches précédentes sur les microorganismes des racines et des feuilles, mais les amis des graines restent sous le radar. Seules quelques études ont exploré comment ces petits copains influencent la germination, la croissance et la résistance à certaines maladies.

Eh, où sont les Champignons ?

La plupart des recherches sur les microorganismes des graines se sont concentrées sur les bactéries, laissant de côté les champignons. Pourtant, les graines ressemblent à une petite fête microbienne, hébergeant à la fois des champignons et des bactéries en nombre à peu près égal. Une étude récente a révélé qu'il y a plus de 2000 types de champignons vivant sur les graines de diverses espèces de plantes. Certains de ces champignons sont assez communs, apparaissant dans plusieurs types de plantes. Fait intéressant, une poignée de ces champignons sont en fait des LEVURES.

Levure : les héros méconnus

Tu connais peut-être la levure comme le truc qui fait lever le pain et aide à produire de la bière. Mais ces petites bestioles peuvent aussi être bénéfiques pour les plantes. Malgré leur potentiel, il n'y a pas eu beaucoup d'études sur la levure en agriculture. La plupart des recherches se sont concentrées sur le rôle de la levure dans la nourriture et la médecine. Il est grand temps de donner à ces petits organismes la reconnaissance qu'ils méritent dans l'agriculture.

Enquêter sur la levure associée aux graines

Cette étude a examiné la diversité des levures présentes sur les graines de diverses plantes. Les scientifiques ont cherché à répondre à quelques questions clés : Quels types de levures traînent sur les graines ? Y a-t-il des types de levures particuliers uniques à certaines plantes ? Et comment nos résultats se comparent-ils à ce qui a été trouvé dans les recherches précédentes ?

Pour enquêter sur ces questions, les scientifiques ont recueilli des graines d'un mélange de plantes sauvages et de cultures. Ils ont utilisé diverses méthodes, y compris des techniques de culture traditionnelles et une analyse génétique moderne, pour identifier les levures présentes.

Au boulot : isolation de la levure

L'équipe a isolé des levures à partir des graines en utilisant deux méthodes principales. La première était une technique classique où ils ont placé des graines sur des plaques d'agar spéciales et ont attendu que les levures se développent. La seconde méthode impliquait de faire tremper les graines et les semis dans une solution pour collecter les microorganismes plus efficacement. Cette combinaison de méthodes a permis aux chercheurs de capturer une plus grande variété de levures.

Trier les levures

Pour identifier les levures, les scientifiques ont analysé leur ADN. Cela impliquait d'utiliser des marqueurs spécifiques qui leur ont permis de localiser les types de levures présents. Ils ont comparé leurs résultats à une base de données plus large d'informations sur les levures de graines pour voir comment leurs échantillons se comparaient aux souches identifiées précédemment.

Collection de levures diversifiée

Après tout ce travail acharné, les scientifiques ont réussi à isoler un incroyable 219 souches de levures différentes. Ils ont identifié ces levures comme faisant partie de deux grands groupes : Ascomycota et Basidiomycota. Notamment, la plupart des levures provenaient du groupe Basidiomycota, qui était assez commun.

Parmi les souches trouvées, quelques types se sont distingués parce qu'ils étaient particulièrement abondants. Certains genres comme Holtermaniella, Vishniacozyma, Naganishia et Filobasidium avaient des dizaines d'isolats. Cependant, certaines levures étaient rares et n'apparaissaient qu'une ou deux fois dans les échantillons.

Un regard plus proche sur la morphologie des levures

Les scientifiques ne voulaient pas simplement savoir quelles levures étaient présentes ; ils voulaient aussi voir à quoi elles ressemblaient. Ils ont examiné les colonies de levures au microscope, notant leur texture, leur taille et leur couleur. La plupart des colonies de levures étaient lisses, certaines affichant des couleurs vives, comme des rouges et des jaunes.

Spécificité de l'habitat des levures

Intéressant, la plupart des levures provenaient de graines plutôt que de semis. Certains types de levures n'étaient trouvés que sur des plantes spécifiques, comme Naganishia et Rhodotorula, qui étaient exclusifs à un type de culture. Ce genre de spécificité suggère que certaines levures se sont bien adaptées à leurs hôtes végétaux.

Le trésor de la microbiote des graines

En comparant leurs résultats à une base de données plus large, les chercheurs ont découvert que beaucoup de leurs isolats de levures correspondaient à des taxa centraux identifiés précédemment. Certaines de ces levures étaient communes à de nombreuses espèces de plantes, indiquant que ces microorganismes jouent des rôles significatifs dans la santé des graines.

Levures : les changeurs de jeu agricoles

Les résultats de cette étude mettent en lumière un trésor d'opportunités dans le monde de l'agriculture. Les levures peuvent être considérées comme les alliées sous-estimées de l'agriculture. Avec le bon focus et les bonnes recherches, on pourrait apprendre à utiliser ces microorganismes pour aider les cultures à mieux pousser, résister aux maladies et devenir plus résilientes face aux défis environnementaux.

Le chemin à suivre

Les résultats de l'étude ouvrent la voie à de futures recherches sur le rôle de ces levures dans la santé et la croissance des plantes. Comprendre comment les levures interagissent avec les plantes pourrait mener à de nouvelles façons d'améliorer les rendements des cultures et de protéger les plantes contre les ravageurs et les maladies. Pense à ça comme donner aux plantes leurs propres petits gardes du corps.

En fin de compte, le potentiel d'utilisation des levures en agriculture est immense. Avec plus d'attention et de recherche, on pourrait explorer comment améliorer la Santé des plantes grâce à l'inoculation des graines avec des souches de levures bénéfiques. Il est temps d'ouvrir les yeux sur ces petits amis et de voir l'énorme impact qu'ils peuvent avoir sur le monde de l'agriculture.

En résumé

Le monde des microorganismes autour des plantes est riche et diversifié. Alors que les bactéries ont pris le devant de la scène pendant un certain temps, les levures méritent aussi leur moment. Cette étude met en lumière les levures uniques et variées trouvées sur les graines, soulignant leurs rôles possibles dans la santé des plantes. En explorant davantage ces petites champignons, on pourrait bien trouver de nouvelles façons de bénéficier aux cultures et, finalement, à notre approvisionnement alimentaire. Qui aurait cru que de si petits organismes pouvaient être si puissants ?

Alors, la prochaine fois que tu fais du pain ou que tu profites d'une bière, souviens-toi qu'il y a tout un monde de levures là-bas, faisant des vagues en agriculture, une graine à la fois !

Source originale

Titre: Unexplored Yeast diversity in Seed Microbiota

Résumé: Yeasts are known to be fantastic biotechnological resources for medical, food, and industrial applications, but their potential remains untapped in agriculture, especially for plant biostimulation and biocontrol. In particular, yeasts have been reported as part of the core microbiome of seeds using next generation sequencing methods, but their diversity and functional roles remain largely undescribed. This study aimed to fill this knowledge gap by characterizing the diversity of seed-associated yeasts across nine plant species (crops and non-cultivated species) using culturomics, microscopy, and metabarcoding. Our results show that seed-associated yeasts largely belong to Basidiomycota phylum and more particularly to the Tremellomycetes class. This yeast collection covers 15 genera (2 of Ascomycota and 13 of Basidiomycota). Out of the 219 isolates described, the most frequently isolated yeasts were Holtermaniella, Vishniacozyma, Filobasidium, Naganishia and Sporobolomyces. The yeasts from these dominant genera were isolated from multiple plant species (4 to 8), except for Naganishia which only originated from Solanum lycopersicum L.. These results are also consistent with the fact that these dominant taxa were recently identified as members of the core seed microbiome, indicating their high prevalence and abundance across diverse plant hosts and environments. Compared to previous plant yeast diversity surveys, the members from Ascomycota are less frequent in seeds and only represented here by the Aureobasidium and Taphrina genera. Altogether, these results suggest that yeasts are generally well-adapted to the aboveground habitats of plants, but seeds represent a specific habitat that diverse Basidiomycota yeasts can colonize. Take away messageO_LI219 yeasts isolated from seeds and seedlings of diverse plant species C_LIO_LIMost isolates are Basidiomycota yeasts, especially of the Tremellomycetes class C_LIO_LIAscomycota yeasts are rarely isolated from the seed environment C_LIO_LIThe most frequently isolated yeasts belong to Holtermaniella, Vishniacozyma, Filobasidium and Sporobolomyces genera C_LIO_LIThe collection is representative of taxa found in seed microbiota of multiple plant species C_LI

Auteurs: Muriel Marchi, Anaïs Bosc-Bierne, Thomas Lerenard, Josiane Le Corff, Sophie Aligon, Aurélia Rolland, Marie Simonin, Coralie Marais, Martial Briand, Viviane Cordovez, Linda Gouka, Thomas Guillemette, Philippe Simoneau, Natalia Guschinskaya

Dernière mise à jour: 2024-11-27 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.11.27.625647

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.11.27.625647.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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